MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012923	GAAG	2	8	48	55	50 %	0 %	50 %	0 %	253750613
2	NC_012923	GACA	2	8	180	187	50 %	0 %	25 %	25 %	253750613
3	NC_012923	TTGC	2	8	427	434	0 %	50 %	25 %	25 %	253750613
4	NC_012923	ACAA	2	8	571	578	75 %	0 %	0 %	25 %	253750613
5	NC_012923	TGAT	2	8	602	609	25 %	50 %	25 %	0 %	253750613
6	NC_012923	AGTA	2	8	768	775	50 %	25 %	25 %	0 %	253750613
7	NC_012923	AGAA	2	8	977	984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012923	GTGA	2	8	985	992	25 %	25 %	50 %	0 %	253750614
9	NC_012923	TAAA	2	8	1321	1328	75 %	25 %	0 %	0 %	253750615
10	NC_012923	ACAA	2	8	1520	1527	75 %	0 %	0 %	25 %	253750616
11	NC_012923	ATGT	2	8	1915	1922	25 %	50 %	25 %	0 %	253750616
12	NC_012923	GAAA	2	8	2202	2209	75 %	0 %	25 %	0 %	253750616
13	NC_012923	TAAA	2	8	2249	2256	75 %	25 %	0 %	0 %	253750616
14	NC_012923	AATT	2	8	2520	2527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012923	TAAA	2	8	2627	2634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012923	TCAA	2	8	2844	2851	50 %	25 %	0 %	25 %	253750617
17	NC_012923	TGAG	2	8	3787	3794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012923	CTTT	2	8	3858	3865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012923	TTTA	2	8	4087	4094	25 %	75 %	0 %	0 %	253750618
20	NC_012923	AAAG	2	8	4575	4582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012923	CTAC	2	8	4845	4852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012923	ATGC	2	8	5101	5108	25 %	25 %	25 %	25 %	253750619
23	NC_012923	TGAA	2	8	5336	5343	50 %	25 %	25 %	0 %	253750619
24	NC_012923	TCTA	2	8	5525	5532	25 %	50 %	0 %	25 %	253750619
25	NC_012923	TATT	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	253750620
26	NC_012923	CTTA	2	8	5811	5818	25 %	50 %	0 %	25 %	253750620
27	NC_012923	TTTC	2	8	6026	6033	0 %	75 %	0 %	25 %	253750620
28	NC_012923	GTTT	2	8	6063	6070	0 %	75 %	25 %	0 %	253750620
29	NC_012923	GAAT	2	8	6167	6174	50 %	25 %	25 %	0 %	253750620
30	NC_012923	CTGA	2	8	6872	6879	25 %	25 %	25 %	25 %	253750620
31	NC_012923	CCAA	2	8	7932	7939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012923	CATT	2	8	8347	8354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012923	TTTC	2	8	8905	8912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012923	CTTC	2	8	9012	9019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012923	CATT	2	8	9588	9595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012923	ATCA	2	8	9915	9922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012923	AGGT	2	8	10315	10322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012923	ATAA	2	8	11231	11238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012923	ATCA	2	8	11854	11861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012923	CTAC	2	8	11869	11876	25 %	25 %	0 %	50 %	253750622
41	NC_012923	AATC	2	8	12327	12334	50 %	25 %	0 %	25 %	253750622
42	NC_012923	GATA	2	8	12358	12365	50 %	25 %	25 %	0 %	253750622
43	NC_012923	TATT	2	8	12371	12378	25 %	75 %	0 %	0 %	253750622
44	NC_012923	CGAA	2	8	12519	12526	50 %	0 %	25 %	25 %	253750622
45	NC_012923	TCTG	2	8	12543	12550	0 %	50 %	25 %	25 %	253750622
46	NC_012923	TTGA	2	8	12617	12624	25 %	50 %	25 %	0 %	253750622
47	NC_012923	ATCA	2	8	13103	13110	50 %	25 %	0 %	25 %	253750623
48	NC_012923	AGTA	2	8	13163	13170	50 %	25 %	25 %	0 %	253750623
49	NC_012923	TGAT	2	8	13633	13640	25 %	50 %	25 %	0 %	253750623
50	NC_012923	TCTA	2	8	13786	13793	25 %	50 %	0 %	25 %	253750623
51	NC_012923	TAAA	2	8	13986	13993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012923	TCAA	2	8	14203	14210	50 %	25 %	0 %	25 %	253750624
53	NC_012923	ATTT	2	8	14782	14789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012923	ATCT	2	8	14956	14963	25 %	50 %	0 %	25 %	253750625
55	NC_012923	TTGG	2	8	15030	15037	0 %	50 %	50 %	0 %	253750625
56	NC_012923	TGTC	2	8	15045	15052	0 %	50 %	25 %	25 %	253750625
57	NC_012923	GTAG	2	8	15087	15094	25 %	25 %	50 %	0 %	253750625
58	NC_012923	TCTG	2	8	15140	15147	0 %	50 %	25 %	25 %	253750625
59	NC_012923	ACCA	2	8	15314	15321	50 %	0 %	0 %	50 %	253750625
60	NC_012923	CGTT	2	8	15536	15543	0 %	50 %	25 %	25 %	253750625
61	NC_012923	AGGG	2	8	15949	15956	25 %	0 %	75 %	0 %	253750625
62	NC_012923	ATCA	2	8	16219	16226	50 %	25 %	0 %	25 %	253750625
63	NC_012923	CTTG	2	8	16490	16497	0 %	50 %	25 %	25 %	253750625
64	NC_012923	CACC	2	8	17193	17200	25 %	0 %	0 %	75 %	253750625
65	NC_012923	CGTG	2	8	18423	18430	0 %	25 %	50 %	25 %	253750625
66	NC_012923	TCCA	2	8	18565	18572	25 %	25 %	0 %	50 %	253750625
67	NC_012923	CCAG	2	8	18709	18716	25 %	0 %	25 %	50 %	253750626
68	NC_012923	TTGT	2	8	18732	18739	0 %	75 %	25 %	0 %	253750626
69	NC_012923	TGAT	2	8	19093	19100	25 %	50 %	25 %	0 %	253750626
70	NC_012923	GGAT	3	12	19444	19455	25 %	25 %	50 %	0 %	253750626
71	NC_012923	TCAA	2	8	19732	19739	50 %	25 %	0 %	25 %	253750626
72	NC_012923	TGAC	2	8	20064	20071	25 %	25 %	25 %	25 %	253750626
73	NC_012923	TGGC	2	8	20170	20177	0 %	25 %	50 %	25 %	253750626
74	NC_012923	CAAG	2	8	20381	20388	50 %	0 %	25 %	25 %	253750626
75	NC_012923	TCTG	2	8	21475	21482	0 %	50 %	25 %	25 %	253750626
76	NC_012923	GAAA	2	8	21533	21540	75 %	0 %	25 %	0 %	253750626
77	NC_012923	ATCA	2	8	21588	21595	50 %	25 %	0 %	25 %	253750626
78	NC_012923	CAGG	2	8	21653	21660	25 %	0 %	50 %	25 %	253750626
79	NC_012923	CTGT	2	8	21746	21753	0 %	50 %	25 %	25 %	253750626
80	NC_012923	GATT	2	8	22511	22518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012923	GTTA	2	8	22577	22584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012923	GATT	2	8	22919	22926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012923	GTTA	2	8	22985	22992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012923	TAAA	2	8	23557	23564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012923	TCAA	2	8	23774	23781	50 %	25 %	0 %	25 %	253750627

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.