MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012923	AT	3	6	1171	1176	50 %	50 %	0 %	0 %	253750614
2	NC_012923	TA	3	6	2102	2107	50 %	50 %	0 %	0 %	253750616
3	NC_012923	AG	3	6	2716	2721	50 %	0 %	50 %	0 %	253750617
4	NC_012923	TA	3	6	2743	2748	50 %	50 %	0 %	0 %	253750617
5	NC_012923	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	253750617
6	NC_012923	TA	3	6	3632	3637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012923	AC	3	6	3992	3997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012923	AT	3	6	4341	4346	50 %	50 %	0 %	0 %	253750618
9	NC_012923	TA	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012923	CA	3	6	4865	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012923	TC	3	6	5195	5200	0 %	50 %	0 %	50 %	253750619
12	NC_012923	CT	4	8	5664	5671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012923	GA	3	6	5884	5889	50 %	0 %	50 %	0 %	253750620
14	NC_012923	TC	3	6	7214	7219	0 %	50 %	0 %	50 %	253750620
15	NC_012923	CT	3	6	7669	7674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012923	CT	4	8	7788	7795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012923	AT	3	6	8379	8384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012923	AT	3	6	8491	8496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012923	TG	3	6	8515	8520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012923	AT	3	6	8550	8555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012923	TA	3	6	8968	8973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012923	CA	3	6	9190	9195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012923	AT	3	6	9732	9737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012923	TG	3	6	9756	9761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012923	AT	3	6	9791	9796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012923	AT	3	6	10000	10005	50 %	50 %	0 %	0 %	253750621
27	NC_012923	AT	3	6	10259	10264	50 %	50 %	0 %	0 %	253750621
28	NC_012923	AT	3	6	10395	10400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012923	AT	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012923	TG	3	6	11693	11698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012923	AT	3	6	11728	11733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012923	AT	3	6	11939	11944	50 %	50 %	0 %	0 %	253750622
33	NC_012923	TA	4	8	12847	12854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012923	TA	4	8	12914	12921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012923	AT	5	10	13378	13387	50 %	50 %	0 %	0 %	253750623
36	NC_012923	TC	3	6	13438	13443	0 %	50 %	0 %	50 %	253750623
37	NC_012923	AG	3	6	14075	14080	50 %	0 %	50 %	0 %	253750624
38	NC_012923	TA	3	6	14102	14107	50 %	50 %	0 %	0 %	253750624
39	NC_012923	TG	3	6	14371	14376	0 %	50 %	50 %	0 %	253750624
40	NC_012923	TC	3	6	14917	14922	0 %	50 %	0 %	50 %	253750625
41	NC_012923	AG	3	6	16773	16778	50 %	0 %	50 %	0 %	253750625
42	NC_012923	AT	3	6	19840	19845	50 %	50 %	0 %	0 %	253750626
43	NC_012923	GA	3	6	19849	19854	50 %	0 %	50 %	0 %	253750626
44	NC_012923	TC	3	6	19955	19960	0 %	50 %	0 %	50 %	253750626
45	NC_012923	AG	3	6	21694	21699	50 %	0 %	50 %	0 %	253750626
46	NC_012923	CA	3	6	21921	21926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012923	AG	3	6	23646	23651	50 %	0 %	50 %	0 %	253750627
48	NC_012923	TA	3	6	23673	23678	50 %	50 %	0 %	0 %	253750627
49	NC_012923	TG	3	6	23942	23947	0 %	50 %	50 %	0 %	253750627
50	NC_012923	AT	3	6	24447	24452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012923	TA	3	6	24505	24510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.