MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012917	CCCTGT	2	12	42997	43008	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012917	TAAGGT	2	12	128367	128378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012917	AATAAC	2	12	200705	200716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012917	AGTGAG	2	12	203676	203687	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012917	CTCAAT	2	12	257401	257412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012917	TAAAGT	2	12	342095	342106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012917	GTTTTT	2	12	356088	356099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012917	TTGCTA	2	12	448376	448387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012917	TATTTT	2	12	460969	460980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012917	AATTAT	2	12	469725	469736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012917	TTTTTA	2	12	480118	480129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012917	TTTTTA	2	12	518225	518236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012917	TATTTT	2	12	518261	518272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012917	GTCATT	2	12	544618	544629	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012917	TTTTGT	2	12	544638	544649	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012917	AAAGAG	2	12	558993	559004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012917	AGATAT	2	12	561463	561474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012917	AGCTGA	2	12	605633	605644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012917	TGAATA	2	12	611935	611946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012917	ATTCTG	2	12	647189	647200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012917	TTGCTT	2	12	651267	651278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012917	TGATAA	2	12	716595	716606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012917	GATGTT	2	12	747394	747405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012917	GTTGAT	2	12	763508	763519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012917	TAATGA	2	12	809607	809618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012917	TTTTTA	2	12	834379	834390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012917	CAGAAA	2	12	837782	837793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012917	GAAGTT	2	12	885209	885220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012917	ATAGTC	2	12	917996	918007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012917	TGACGC	2	12	958012	958023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012917	TCTTTT	2	12	960575	960586	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012917	GTTTGG	2	12	1013928	1013939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012917	AACGCT	2	12	1080913	1080924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012917	ATTTTT	2	12	1082545	1082556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012917	AGAACG	2	12	1139815	1139826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012917	ACCCAT	2	12	1169006	1169017	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012917	AAAAAT	2	12	1222836	1222847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012917	GCTGCG	2	12	1229962	1229973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012917	TGGTTA	2	12	1241323	1241334	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012917	TAGATA	2	12	1288110	1288121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012917	AAGAAA	2	12	1288283	1288294	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012917	GAGGGG	2	12	1299636	1299647	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012917	GTAGAA	2	12	1369325	1369336	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012917	ATTCAA	2	12	1372899	1372910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012917	CACTAT	2	12	1373821	1373832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012917	GAAATG	2	12	1390192	1390203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012917	ACCAGA	2	12	1396535	1396546	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012917	GTTTGA	2	12	1429622	1429633	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012917	CAAAAT	2	12	1500802	1500813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012917	CGCCAG	2	12	1602510	1602521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012917	GCCCGC	2	12	1679491	1679502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012917	TCCATT	2	12	1753789	1753800	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012917	TTAGCA	2	12	1795695	1795706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012917	TCCATA	2	12	1809837	1809848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012917	ATTTTT	2	12	1818994	1819005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012917	TAAAAA	2	12	1846968	1846979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012917	TTGCAA	2	12	1848282	1848293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012917	AAAGTC	2	12	1848924	1848935	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012917	TGATAT	2	12	1855354	1855365	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012917	CGGGCA	2	12	1857993	1858004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012917	AAACGA	2	12	1896660	1896671	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012917	AGCACG	2	12	1908309	1908320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012917	TCTTTA	2	12	1918012	1918023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012917	TAATGT	2	12	1922855	1922866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012917	TTTATT	2	12	1935607	1935618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012917	ATAATT	2	12	1937998	1938009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012917	ATTAAA	2	12	1969289	1969300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012917	CGAGAA	2	12	1980805	1980816	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012917	AACATT	2	12	2007966	2007977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012917	AAATTT	2	12	2017047	2017058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012917	CAAAAA	2	12	2061150	2061161	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012917	CTGCCA	2	12	2062451	2062462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012917	ATTTCG	2	12	2080046	2080057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012917	AATAAA	2	12	2092969	2092980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012917	TGAATG	2	12	2094403	2094414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012917	TGAATA	2	12	2107803	2107814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012917	ATTATG	2	12	2115039	2115050	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012917	CAATAA	2	12	2157261	2157272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012917	ATAAAA	2	12	2196281	2196292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012917	TAACGG	2	12	2212478	2212489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012917	TTTTTC	2	12	2237519	2237530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012917	AGAGAA	2	12	2251609	2251620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012917	ATAAAT	2	12	2275230	2275241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012917	AAATGA	2	12	2327060	2327071	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012917	GCTAAC	2	12	2359065	2359076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012917	TGTTAT	2	12	2363891	2363902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012917	TTCAAT	2	12	2448691	2448702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012917	AAATAT	2	12	2454629	2454640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012917	AGAAAG	2	12	2480454	2480465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012917	CTCTTT	2	12	2488608	2488619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012917	CGTGAA	2	12	2514571	2514582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012917	TCATTA	2	12	2554299	2554310	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012917	ATAAAA	2	12	2598015	2598026	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012917	TCTGTC	2	12	2638664	2638675	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012917	AGCGCT	2	12	2640925	2640936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012917	TGTTTT	2	12	2644412	2644423	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012917	AACGGC	2	12	2742835	2742846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012917	CTTTCA	2	12	2745620	2745631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012917	AATTCA	2	12	2766728	2766739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012917	TATGAT	2	12	2767626	2767637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012917	ATTTTT	2	12	2793853	2793864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012917	CTTTCA	2	12	2801036	2801047	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012917	ACGTAG	2	12	2853183	2853194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012917	CTTATC	2	12	2880947	2880958	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012917	GCTATT	2	12	2883525	2883536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012917	AAAGAT	2	12	2914756	2914767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012917	TCCGAC	2	12	2917848	2917859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012917	GAATTA	2	12	2955011	2955022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012917	CTTGAG	2	12	2968229	2968240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012917	ATAAAG	2	12	3007944	3007955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012917	TGAACT	2	12	3073926	3073937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012917	CGAAAA	2	12	3074033	3074044	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012917	AAAAAC	2	12	3100356	3100367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012917	TTATAT	2	12	3105413	3105424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012917	AACGTT	2	12	3116124	3116135	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012917	ATTTTA	2	12	3147322	3147333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012917	AAACGC	2	12	3164625	3164636	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012917	TTCTGT	2	12	3184918	3184929	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012917	TATCTT	2	12	3187796	3187807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012917	GCACAG	6	36	3207228	3207263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012917	ACAGCG	2	12	3221716	3221727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012917	CAGATC	2	12	3249690	3249701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012917	AAAATA	2	12	3263572	3263583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012917	TGCATT	2	12	3316830	3316841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012917	TTCCTT	2	12	3326769	3326780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012917	CGCATC	2	12	3337042	3337053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012917	ATCAAA	2	12	3367177	3367188	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012917	ATTTTT	2	12	3367412	3367423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012917	TAACAC	2	12	3440272	3440283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012917	AACCAA	2	12	3490931	3490942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012917	CCATCT	2	12	3529292	3529303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012917	ATAAAA	2	12	3624208	3624219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012917	AAATAA	2	12	3624233	3624244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012917	TAAAAA	2	12	3636104	3636115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012917	TTAATT	2	12	3672861	3672872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_012917	GTTATG	2	12	3977526	3977537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_012917	TGCGTA	2	12	4265738	4265749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.