MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012913	CCGCTT	2	12	1569	1580	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	251791818
2	NC_012913	TTTGGT	2	12	4788	4799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791820
3	NC_012913	ATTGAA	2	12	8626	8637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251791825
4	NC_012913	ACTAAA	2	12	14589	14600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	251791831
5	NC_012913	CCATTA	2	12	17397	17408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791833
6	NC_012913	TGAATA	2	12	17949	17960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251791834
7	NC_012913	TTTGCC	2	12	18080	18091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	251791834
8	NC_012913	TTGCCA	2	12	20563	20574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251791835
9	NC_012913	TTCCGG	2	12	25064	25075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791838
10	NC_012913	CCTTTG	2	12	27544	27555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	251791840
11	NC_012913	CCCTAA	2	12	36721	36732	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	251791852
12	NC_012913	ACCATG	2	12	42729	42740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251791856
13	NC_012913	GAAAAT	2	12	44462	44473	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251791858
14	NC_012913	TGCCGT	2	12	48330	48341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791861
15	NC_012913	TGGTGA	2	12	48742	48753	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	251791861
16	NC_012913	AAGATA	2	12	49059	49070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251791861
17	NC_012913	TGAAAG	2	12	49721	49732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	251791863
18	NC_012913	CACCGC	2	12	50021	50032	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	251791864
19	NC_012913	TCTTTT	2	12	50278	50289	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	251791864
20	NC_012913	CACTGA	2	12	50525	50536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251791864
21	NC_012913	GATCGC	2	12	53837	53848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251791868
22	NC_012913	ATTCGA	2	12	54768	54779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251791868
23	NC_012913	GCGGTG	2	12	62069	62080	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	251791877
24	NC_012913	TTAGCT	2	12	64738	64749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251791878
25	NC_012913	CAATAG	2	12	67682	67693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251791878
26	NC_012913	GTGCCT	2	12	68131	68142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791878
27	NC_012913	CATTAA	2	12	69107	69118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791878
28	NC_012913	TACCTT	2	12	75931	75942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	251791882
29	NC_012913	CTAATT	2	12	76627	76638	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	251791883
30	NC_012913	GCCGGA	2	12	76892	76903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	251791883
31	NC_012913	GGTTTT	2	12	82688	82699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791888
32	NC_012913	GTTGAA	2	12	82832	82843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791888
33	NC_012913	GCAAAA	2	12	88960	88971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251791896
34	NC_012913	CTTTGG	2	12	90942	90953	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	251791898
35	NC_012913	GTTGCA	2	12	91026	91037	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251791898
36	NC_012913	ATGTGA	2	12	91656	91667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791899
37	NC_012913	GGTGAA	2	12	92558	92569	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	251791900
38	NC_012913	CAAGCC	2	12	93788	93799	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	251791901
39	NC_012913	TTTATC	2	12	96128	96139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251791904
40	NC_012913	CGGTGG	2	12	96313	96324	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	251791904
41	NC_012913	TCATCG	2	12	98793	98804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251791906
42	NC_012913	TAAATC	2	12	101536	101547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791909
43	NC_012913	AAACCA	2	12	101612	101623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791909
44	NC_012913	CAATAT	2	12	105350	105361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791914
45	NC_012913	AAACCA	2	12	107958	107969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791917
46	NC_012913	CATGCC	2	12	109268	109279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	251791918
47	NC_012913	GGTCGT	2	12	112261	112272	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	251791922
48	NC_012913	AAAGAT	2	12	113398	113409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251791922
49	NC_012913	AACGTC	2	12	113890	113901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	251791922
50	NC_012913	TACACC	2	12	115543	115554	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	251791926
51	NC_012913	GTATAA	2	12	122223	122234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251791933
52	NC_012913	ACCTGC	2	12	126626	126637	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	251791936
53	NC_012913	GTAAAG	2	12	131609	131620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	251791942
54	NC_012913	CCGGAA	2	12	137880	137891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791948
55	NC_012913	TTCAAA	2	12	146745	146756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791955
56	NC_012913	ACGTTC	2	12	148013	148024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251791957
57	NC_012913	TTATTC	2	12	148836	148847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251791957
58	NC_012913	GTCATG	2	12	149550	149561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251791959
59	NC_012913	ACCGGA	2	12	151709	151720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791960
60	NC_012913	TTCTAA	2	12	154734	154745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	251791963
61	NC_012913	ATCTAA	2	12	158501	158512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791968
62	NC_012913	CGATAT	2	12	158662	158673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251791969
63	NC_012913	AAGCAC	2	12	161683	161694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	251791974
64	NC_012913	CCGCCA	2	12	165901	165912	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	251791977
65	NC_012913	GTTTCT	2	12	166014	166025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	251791977
66	NC_012913	ATCTTT	2	12	167517	167528	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251791980
67	NC_012913	TTCTTT	2	12	168096	168107	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	251791980
68	NC_012913	AACAAA	2	12	168399	168410	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	251791980
69	NC_012913	ACAGTT	2	12	170752	170763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251791981
70	NC_012913	ATATAC	2	12	172026	172037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251791982
71	NC_012913	TGTGAT	2	12	173090	173101	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	251791983
72	NC_012913	TAAGAT	2	12	175130	175141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251791986
73	NC_012913	TCTTCA	2	12	175809	175820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	251791986
74	NC_012913	AAAGAA	2	12	176089	176100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	251791987
75	NC_012913	AATTGT	2	12	179221	179232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251791989
76	NC_012913	TTGCTT	2	12	179536	179547	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	251791990
77	NC_012913	AACAGC	2	12	182579	182590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	251791994
78	NC_012913	TTGAAT	2	12	184859	184870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251791997
79	NC_012913	CATTTT	2	12	188639	188650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251792001
80	NC_012913	ATGCGG	2	12	189214	189225	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	251792001
81	NC_012913	GAGAAA	2	12	193749	193760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251792005
82	NC_012913	CGTTTG	2	12	194552	194563	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	251792006
83	NC_012913	CAATAC	2	12	196178	196189	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	251792008
84	NC_012913	GCTTTA	2	12	196601	196612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251792009
85	NC_012913	TGATAT	2	12	197306	197317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251792010
86	NC_012913	GCAAAA	2	12	197529	197540	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251792011
87	NC_012913	GTTTCA	2	12	201249	201260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251792015
88	NC_012913	AAACAC	2	12	201509	201520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251792015
89	NC_012913	TATGGT	2	12	203508	203519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	251792017
90	NC_012913	TGGCGA	2	12	205562	205573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	251792019
91	NC_012913	CTTGCA	2	12	212236	212247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251792024
92	NC_012913	TATGAT	2	12	213774	213785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251792025
93	NC_012913	ATGAAG	2	12	216030	216041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	251792027
94	NC_012913	AATTTT	2	12	216137	216148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792027
95	NC_012913	CATTTG	2	12	216688	216699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251792028
96	NC_012913	AAATTC	2	12	217264	217275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251792028
97	NC_012913	TTTCTA	2	12	218649	218660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	251792031
98	NC_012913	AGGCGA	2	12	221412	221423	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251792035
99	NC_012913	GGATTT	2	12	222405	222416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	251792035
100	NC_012913	CAAAAA	2	12	231698	231709	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	251792044
101	NC_012913	AAAAAC	2	12	245973	245984	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	251792056
102	NC_012913	TCATAT	2	12	254354	254365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	251792063
103	NC_012913	AGTATG	2	12	256321	256332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792063
104	NC_012913	GTATGA	2	12	257246	257257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251792063
105	NC_012913	AACCGG	2	12	262037	262048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251792069
106	NC_012913	ACAAGA	2	12	279500	279511	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251792081
107	NC_012913	AGCTAT	2	12	279576	279587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251792081
108	NC_012913	ACCATA	2	12	291945	291956	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	251792090
109	NC_012913	AGGCAG	2	12	293423	293434	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	251792091
110	NC_012913	GATATT	2	12	295022	295033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251792092
111	NC_012913	AAATTA	2	12	295615	295626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251792093
112	NC_012913	GACCTT	2	12	296045	296056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251792094
113	NC_012913	ATATTT	2	12	304123	304134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251792101
114	NC_012913	CTAATA	2	12	306943	306954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251792105
115	NC_012913	TTGCAC	2	12	311053	311064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251792111
116	NC_012913	TTTCTG	2	12	313570	313581	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	251792112
117	NC_012913	ATTTTT	2	12	314284	314295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	251792113
118	NC_012913	AAAATG	2	12	315489	315500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251792114
119	NC_012913	CACCAA	2	12	315994	316005	50 %	0 %	0 %	50 %	251792114
120	NC_012913	CGTTGG	2	12	317649	317660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	251792116
121	NC_012913	GCAAAA	2	12	318006	318017	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251792117
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145	NC_012913	ATATTG	2	12	378545	378556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251792160
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223	NC_012913	TGTGGT	2	12	630419	630430	0 %	50 %	50 %	0 %	251792391
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231	NC_012913	ATAAAG	2	12	651490	651501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251792411
232	NC_012913	ATTCGT	2	12	653112	653123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251792414
233	NC_012913	GAAACA	2	12	653226	653237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	251792414
234	NC_012913	ATGTTG	2	12	655870	655881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	251792416
235	NC_012913	CAAATT	2	12	660342	660353	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	251792419
236	NC_012913	CTGCAC	2	12	661195	661206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	251792419
237	NC_012913	CCGATG	2	12	661255	661266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	251792419
238	NC_012913	AGGCTT	2	12	661466	661477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	251792419
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242	NC_012913	CTTGCG	2	12	671311	671322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251792429
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254	NC_012913	ACTTGA	2	12	712550	712561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251792467
255	NC_012913	ACAACC	2	12	716723	716734	50 %	0 %	0 %	50 %	251792470
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257	NC_012913	ATGACG	2	12	719197	719208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	251792472
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259	NC_012913	TGGATG	2	12	720353	720364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	251792473
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261	NC_012913	AAACGT	2	12	726940	726951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251792479
262	NC_012913	TTAGTA	2	12	726988	726999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251792479
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285	NC_012913	GATCAT	2	12	804965	804976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	251792542
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330	NC_012913	GAAATC	2	12	950058	950069	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251792669
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337	NC_012913	TCGGAA	2	12	965565	965576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	251792681
338	NC_012913	TGTTCA	2	12	973980	973991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	251792688
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340	NC_012913	CAAGAT	2	12	978992	979003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251792694
341	NC_012913	ATCGCC	2	12	983766	983777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	251792698
342	NC_012913	TTACAT	2	12	989324	989335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	251792701
343	NC_012913	GTTTTG	2	12	991538	991549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251792702
344	NC_012913	GTGTCG	2	12	998240	998251	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	251792708
345	NC_012913	TTGCGC	2	12	998422	998433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251792708
346	NC_012913	TGAAAA	2	12	1006277	1006288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251792715
347	NC_012913	TTTCAC	2	12	1008786	1008797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	251792718
348	NC_012913	TTTGCC	2	12	1010085	1010096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	251792718
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447	NC_012913	TCAAAG	2	12	1271316	1271327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	251792981
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452	NC_012913	CCAACG	2	12	1287856	1287867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	251792996
453	NC_012913	TTAAAG	2	12	1288051	1288062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	251792996
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455	NC_012913	GGCGCG	2	12	1297496	1297507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251793007
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457	NC_012913	TTAGGT	2	12	1302891	1302902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	251793014
458	NC_012913	TAGTAT	2	12	1308408	1308419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	251793019
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463	NC_012913	TAGAAA	2	12	1317971	1317982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	251793029
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