MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 2162

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012913	GC	3	6	2163125	2163130	0 %	0 %	50 %	50 %	251793871
2002	NC_012913	GC	3	6	2164400	2164405	0 %	0 %	50 %	50 %	251793871
2003	NC_012913	GC	3	6	2166115	2166120	0 %	0 %	50 %	50 %	251793872
2004	NC_012913	TG	3	6	2167087	2167092	0 %	50 %	50 %	0 %	251793874
2005	NC_012913	GT	3	6	2167400	2167405	0 %	50 %	50 %	0 %	251793876
2006	NC_012913	TG	3	6	2169792	2169797	0 %	50 %	50 %	0 %	251793878
2007	NC_012913	TA	4	8	2170631	2170638	50 %	50 %	0 %	0 %	251793879
2008	NC_012913	TA	3	6	2171328	2171333	50 %	50 %	0 %	0 %	251793879
2009	NC_012913	GC	3	6	2173791	2173796	0 %	0 %	50 %	50 %	251793882
2010	NC_012913	AG	3	6	2173868	2173873	50 %	0 %	50 %	0 %	251793882
2011	NC_012913	CA	3	6	2173979	2173984	50 %	0 %	0 %	50 %	251793882
2012	NC_012913	AT	3	6	2174319	2174324	50 %	50 %	0 %	0 %	251793882
2013	NC_012913	AG	3	6	2175042	2175047	50 %	0 %	50 %	0 %	251793882
2014	NC_012913	CG	3	6	2176777	2176782	0 %	0 %	50 %	50 %	251793888
2015	NC_012913	AC	3	6	2180158	2180163	50 %	0 %	0 %	50 %	251793892
2016	NC_012913	AG	3	6	2180432	2180437	50 %	0 %	50 %	0 %	251793893
2017	NC_012913	TG	3	6	2180961	2180966	0 %	50 %	50 %	0 %	251793894
2018	NC_012913	TG	3	6	2182605	2182610	0 %	50 %	50 %	0 %	251793895
2019	NC_012913	TG	3	6	2183488	2183493	0 %	50 %	50 %	0 %	251793897
2020	NC_012913	AC	3	6	2188982	2188987	50 %	0 %	0 %	50 %	251793901
2021	NC_012913	AC	3	6	2189060	2189065	50 %	0 %	0 %	50 %	251793901
2022	NC_012913	GT	3	6	2190015	2190020	0 %	50 %	50 %	0 %	251793902
2023	NC_012913	AC	3	6	2191253	2191258	50 %	0 %	0 %	50 %	251793904
2024	NC_012913	CA	3	6	2191539	2191544	50 %	0 %	0 %	50 %	251793905
2025	NC_012913	AT	3	6	2195710	2195715	50 %	50 %	0 %	0 %	251793911
2026	NC_012913	AT	3	6	2196136	2196141	50 %	50 %	0 %	0 %	251793911
2027	NC_012913	TC	3	6	2196300	2196305	0 %	50 %	0 %	50 %	251793911
2028	NC_012913	AT	3	6	2197943	2197948	50 %	50 %	0 %	0 %	251793913
2029	NC_012913	CA	4	8	2198375	2198382	50 %	0 %	0 %	50 %	251793914
2030	NC_012913	GT	3	6	2198983	2198988	0 %	50 %	50 %	0 %	251793915
2031	NC_012913	AG	3	6	2199180	2199185	50 %	0 %	50 %	0 %	251793915
2032	NC_012913	TG	3	6	2199374	2199379	0 %	50 %	50 %	0 %	251793915
2033	NC_012913	AG	3	6	2199415	2199420	50 %	0 %	50 %	0 %	251793915
2034	NC_012913	TA	3	6	2199586	2199591	50 %	50 %	0 %	0 %	251793915
2035	NC_012913	AT	3	6	2199698	2199703	50 %	50 %	0 %	0 %	251793916
2036	NC_012913	TA	3	6	2199765	2199770	50 %	50 %	0 %	0 %	251793916
2037	NC_012913	AT	3	6	2201120	2201125	50 %	50 %	0 %	0 %	251793917
2038	NC_012913	TA	3	6	2201145	2201150	50 %	50 %	0 %	0 %	251793917
2039	NC_012913	TA	3	6	2201428	2201433	50 %	50 %	0 %	0 %	251793918
2040	NC_012913	AT	3	6	2201457	2201462	50 %	50 %	0 %	0 %	251793918
2041	NC_012913	TA	3	6	2201539	2201544	50 %	50 %	0 %	0 %	251793918
2042	NC_012913	CA	3	6	2201778	2201783	50 %	0 %	0 %	50 %	251793918
2043	NC_012913	TA	3	6	2201974	2201979	50 %	50 %	0 %	0 %	251793918
2044	NC_012913	TA	3	6	2202123	2202128	50 %	50 %	0 %	0 %	251793918
2045	NC_012913	AT	3	6	2202882	2202887	50 %	50 %	0 %	0 %	251793919
2046	NC_012913	AT	3	6	2202920	2202925	50 %	50 %	0 %	0 %	251793919
2047	NC_012913	GC	3	6	2205752	2205757	0 %	0 %	50 %	50 %	251793921
2048	NC_012913	AT	3	6	2207734	2207739	50 %	50 %	0 %	0 %	251793923
2049	NC_012913	GC	3	6	2208018	2208023	0 %	0 %	50 %	50 %	251793923
2050	NC_012913	AT	3	6	2209382	2209387	50 %	50 %	0 %	0 %	251793925
2051	NC_012913	TA	3	6	2210039	2210044	50 %	50 %	0 %	0 %	251793925
2052	NC_012913	TA	3	6	2210321	2210326	50 %	50 %	0 %	0 %	251793925
2053	NC_012913	CT	3	6	2210998	2211003	0 %	50 %	0 %	50 %	251793925
2054	NC_012913	TG	3	6	2212142	2212147	0 %	50 %	50 %	0 %	251793925
2055	NC_012913	TC	3	6	2213287	2213292	0 %	50 %	0 %	50 %	251793926
2056	NC_012913	GC	4	8	2214421	2214428	0 %	0 %	50 %	50 %	251793928
2057	NC_012913	GT	3	6	2214863	2214868	0 %	50 %	50 %	0 %	251793929
2058	NC_012913	AT	3	6	2215191	2215196	50 %	50 %	0 %	0 %	251793929
2059	NC_012913	GT	3	6	2215310	2215315	0 %	50 %	50 %	0 %	251793929
2060	NC_012913	AC	3	6	2219982	2219987	50 %	0 %	0 %	50 %	251793935
2061	NC_012913	CG	3	6	2220056	2220061	0 %	0 %	50 %	50 %	251793935
2062	NC_012913	CG	4	8	2220859	2220866	0 %	0 %	50 %	50 %	251793936
2063	NC_012913	GA	3	6	2221232	2221237	50 %	0 %	50 %	0 %	251793936
2064	NC_012913	AC	3	6	2221977	2221982	50 %	0 %	0 %	50 %	251793937
2065	NC_012913	GC	3	6	2224615	2224620	0 %	0 %	50 %	50 %	251793941
2066	NC_012913	CA	3	6	2224624	2224629	50 %	0 %	0 %	50 %	251793941
2067	NC_012913	GC	3	6	2224711	2224716	0 %	0 %	50 %	50 %	251793941
2068	NC_012913	CA	3	6	2226789	2226794	50 %	0 %	0 %	50 %	251793942
2069	NC_012913	TG	3	6	2226825	2226830	0 %	50 %	50 %	0 %	251793942
2070	NC_012913	GT	3	6	2227213	2227218	0 %	50 %	50 %	0 %	251793942
2071	NC_012913	GC	4	8	2227250	2227257	0 %	0 %	50 %	50 %	251793942
2072	NC_012913	TC	3	6	2229169	2229174	0 %	50 %	0 %	50 %	251793945
2073	NC_012913	AG	3	6	2230031	2230036	50 %	0 %	50 %	0 %	251793946
2074	NC_012913	CG	3	6	2230089	2230094	0 %	0 %	50 %	50 %	251793946
2075	NC_012913	AC	3	6	2230360	2230365	50 %	0 %	0 %	50 %	251793947
2076	NC_012913	GT	3	6	2231684	2231689	0 %	50 %	50 %	0 %	251793948
2077	NC_012913	CG	3	6	2232639	2232644	0 %	0 %	50 %	50 %	251793949
2078	NC_012913	AG	3	6	2233360	2233365	50 %	0 %	50 %	0 %	251793951
2079	NC_012913	GT	3	6	2234308	2234313	0 %	50 %	50 %	0 %	251793951
2080	NC_012913	AT	3	6	2235159	2235164	50 %	50 %	0 %	0 %	251793951
2081	NC_012913	GC	3	6	2235843	2235848	0 %	0 %	50 %	50 %	251793952
2082	NC_012913	CG	3	6	2236040	2236045	0 %	0 %	50 %	50 %	251793952
2083	NC_012913	TG	3	6	2236136	2236141	0 %	50 %	50 %	0 %	251793952
2084	NC_012913	GT	3	6	2236329	2236334	0 %	50 %	50 %	0 %	251793952
2085	NC_012913	CA	3	6	2236728	2236733	50 %	0 %	0 %	50 %	251793954
2086	NC_012913	AC	3	6	2237261	2237266	50 %	0 %	0 %	50 %	251793954
2087	NC_012913	GT	3	6	2239404	2239409	0 %	50 %	50 %	0 %	251793955
2088	NC_012913	CG	3	6	2239876	2239881	0 %	0 %	50 %	50 %	251793956
2089	NC_012913	CG	3	6	2242007	2242012	0 %	0 %	50 %	50 %	251793957
2090	NC_012913	GT	3	6	2242481	2242486	0 %	50 %	50 %	0 %	251793957
2091	NC_012913	CT	3	6	2242611	2242616	0 %	50 %	0 %	50 %	251793958
2092	NC_012913	GT	3	6	2243423	2243428	0 %	50 %	50 %	0 %	251793958
2093	NC_012913	TG	3	6	2244033	2244038	0 %	50 %	50 %	0 %	251793959
2094	NC_012913	CG	3	6	2244055	2244060	0 %	0 %	50 %	50 %	251793959
2095	NC_012913	TG	3	6	2244173	2244178	0 %	50 %	50 %	0 %	251793959
2096	NC_012913	CA	3	6	2244851	2244856	50 %	0 %	0 %	50 %	251793961
2097	NC_012913	CG	3	6	2245614	2245619	0 %	0 %	50 %	50 %	251793962
2098	NC_012913	GC	3	6	2245837	2245842	0 %	0 %	50 %	50 %	251793962
2099	NC_012913	AC	3	6	2245989	2245994	50 %	0 %	0 %	50 %	251793962
2100	NC_012913	CA	3	6	2246795	2246800	50 %	0 %	0 %	50 %	251793962
2101	NC_012913	GC	3	6	2247824	2247829	0 %	0 %	50 %	50 %	251793964
2102	NC_012913	GC	3	6	2248330	2248335	0 %	0 %	50 %	50 %	251793965
2103	NC_012913	GT	3	6	2250309	2250314	0 %	50 %	50 %	0 %	251793967
2104	NC_012913	GC	3	6	2251960	2251965	0 %	0 %	50 %	50 %	251793967
2105	NC_012913	AT	3	6	2252473	2252478	50 %	50 %	0 %	0 %	251793967
2106	NC_012913	GC	3	6	2252709	2252714	0 %	0 %	50 %	50 %	251793967
2107	NC_012913	GC	3	6	2253076	2253081	0 %	0 %	50 %	50 %	251793968
2108	NC_012913	CG	3	6	2253235	2253240	0 %	0 %	50 %	50 %	251793968
2109	NC_012913	AC	3	6	2253739	2253744	50 %	0 %	0 %	50 %	251793969
2110	NC_012913	AT	3	6	2253903	2253908	50 %	50 %	0 %	0 %	251793969
2111	NC_012913	CA	3	6	2255620	2255625	50 %	0 %	0 %	50 %	251793972
2112	NC_012913	TA	3	6	2256300	2256305	50 %	50 %	0 %	0 %	251793973
2113	NC_012913	CG	3	6	2258918	2258923	0 %	0 %	50 %	50 %	251793975
2114	NC_012913	CT	3	6	2260336	2260341	0 %	50 %	0 %	50 %	251793978
2115	NC_012913	GT	3	6	2262870	2262875	0 %	50 %	50 %	0 %	251793981
2116	NC_012913	TG	3	6	2263534	2263539	0 %	50 %	50 %	0 %	251793982
2117	NC_012913	GT	3	6	2265720	2265725	0 %	50 %	50 %	0 %	251793983
2118	NC_012913	CG	3	6	2266102	2266107	0 %	0 %	50 %	50 %	251793983
2119	NC_012913	AG	3	6	2266187	2266192	50 %	0 %	50 %	0 %	251793983
2120	NC_012913	GT	3	6	2267180	2267185	0 %	50 %	50 %	0 %	251793984
2121	NC_012913	AC	3	6	2267695	2267700	50 %	0 %	0 %	50 %	251793986
2122	NC_012913	GT	3	6	2270198	2270203	0 %	50 %	50 %	0 %	251793989
2123	NC_012913	GC	3	6	2270515	2270520	0 %	0 %	50 %	50 %	251793989
2124	NC_012913	GC	3	6	2271152	2271157	0 %	0 %	50 %	50 %	251793989
2125	NC_012913	CG	3	6	2271524	2271529	0 %	0 %	50 %	50 %	251793989
2126	NC_012913	AC	3	6	2273371	2273376	50 %	0 %	0 %	50 %	251793991
2127	NC_012913	CA	3	6	2276105	2276110	50 %	0 %	0 %	50 %	251793995
2128	NC_012913	GA	3	6	2278990	2278995	50 %	0 %	50 %	0 %	251793999
2129	NC_012913	CG	3	6	2283171	2283176	0 %	0 %	50 %	50 %	251794003
2130	NC_012913	TG	3	6	2283729	2283734	0 %	50 %	50 %	0 %	251794003
2131	NC_012913	GT	3	6	2284460	2284465	0 %	50 %	50 %	0 %	251794004
2132	NC_012913	CA	3	6	2284514	2284519	50 %	0 %	0 %	50 %	251794004
2133	NC_012913	CG	3	6	2286000	2286005	0 %	0 %	50 %	50 %	251794004
2134	NC_012913	GC	3	6	2286256	2286261	0 %	0 %	50 %	50 %	251794004
2135	NC_012913	AT	3	6	2287014	2287019	50 %	50 %	0 %	0 %	251794005
2136	NC_012913	TG	3	6	2287366	2287371	0 %	50 %	50 %	0 %	251794005
2137	NC_012913	CG	3	6	2287453	2287458	0 %	0 %	50 %	50 %	251794006
2138	NC_012913	AG	3	6	2289086	2289091	50 %	0 %	50 %	0 %	251794009
2139	NC_012913	GC	3	6	2289920	2289925	0 %	0 %	50 %	50 %	251794010
2140	NC_012913	AT	3	6	2291153	2291158	50 %	50 %	0 %	0 %	251794011
2141	NC_012913	GC	3	6	2292324	2292329	0 %	0 %	50 %	50 %	251794013
2142	NC_012913	GT	3	6	2293087	2293092	0 %	50 %	50 %	0 %	251794013
2143	NC_012913	GA	3	6	2294987	2294992	50 %	0 %	50 %	0 %	251794016
2144	NC_012913	GA	3	6	2297305	2297310	50 %	0 %	50 %	0 %	251794018
2145	NC_012913	AT	3	6	2298152	2298157	50 %	50 %	0 %	0 %	251794021
2146	NC_012913	CA	3	6	2301062	2301067	50 %	0 %	0 %	50 %	251794023
2147	NC_012913	TA	3	6	2301338	2301343	50 %	50 %	0 %	0 %	251794023
2148	NC_012913	AC	3	6	2301581	2301586	50 %	0 %	0 %	50 %	251794023
2149	NC_012913	CA	3	6	2302640	2302645	50 %	0 %	0 %	50 %	251794024
2150	NC_012913	GC	3	6	2302727	2302732	0 %	0 %	50 %	50 %	251794024
2151	NC_012913	TG	3	6	2303138	2303143	0 %	50 %	50 %	0 %	251794024
2152	NC_012913	GA	3	6	2303298	2303303	50 %	0 %	50 %	0 %	251794024
2153	NC_012913	CA	3	6	2304293	2304298	50 %	0 %	0 %	50 %	251794025
2154	NC_012913	TC	3	6	2304821	2304826	0 %	50 %	0 %	50 %	251794025
2155	NC_012913	AG	3	6	2307905	2307910	50 %	0 %	50 %	0 %	251794030
2156	NC_012913	GT	3	6	2308357	2308362	0 %	50 %	50 %	0 %	251794031
2157	NC_012913	TG	3	6	2309040	2309045	0 %	50 %	50 %	0 %	251794031
2158	NC_012913	TA	3	6	2310578	2310583	50 %	50 %	0 %	0 %	251794032
2159	NC_012913	GT	3	6	2310697	2310702	0 %	50 %	50 %	0 %	251794032
2160	NC_012913	CG	3	6	2310854	2310859	0 %	0 %	50 %	50 %	251794032
2161	NC_012913	GT	3	6	2310958	2310963	0 %	50 %	50 %	0 %	251794032
2162	NC_012913	AT	3	6	2312179	2312184	50 %	50 %	0 %	0 %	251794034

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.