MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124 chromosome 1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012891	TAACTA	2	12	136	147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012891	GAAGTG	2	12	24231	24242	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012891	ACTAAT	2	12	24261	24272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012891	GAAGTG	2	12	85636	85647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012891	ACTAAT	2	12	85666	85677	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012891	TTCGGG	2	12	86601	86612	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012891	ATAAAA	2	12	124299	124310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012891	GTAGGT	2	12	168055	168066	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012891	AGAGAA	2	12	175219	175230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012891	CATAAA	2	12	211120	211131	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012891	TCTAGC	2	12	219204	219215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012891	CAAGAC	2	12	219645	219656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012891	TAATAT	2	12	256135	256146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012891	AAAATG	2	12	258321	258332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012891	GATAAA	2	12	258958	258969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012891	AAAATT	2	12	273134	273145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012891	GAAGTG	2	12	287211	287222	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012891	ACTAAT	2	12	287241	287252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012891	CTCAGT	2	12	317296	317307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012891	GAAGTG	2	12	341217	341228	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012891	ACTAAT	2	12	341247	341258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012891	AAAAAG	2	12	384229	384240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012891	AAAGGA	2	12	499848	499859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012891	AGAAGG	2	12	501844	501855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012891	AGAAAT	2	12	507681	507692	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012891	AGGACT	2	12	553157	553168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012891	GCCAAA	2	12	559496	559507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012891	AATTAA	2	12	566560	566571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012891	AAAAGA	2	12	573140	573151	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012891	GAAAAA	2	12	618321	618332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012891	ATGTCA	2	12	802347	802358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012891	AGGTAA	2	12	813071	813082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012891	AAATAA	2	12	841515	841526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012891	TCTTTT	2	12	946901	946912	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012891	TATTAA	2	12	949040	949051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012891	TCATGT	2	12	950160	950171	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012891	AAAATG	2	12	953749	953760	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012891	AAACTA	2	12	953837	953848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012891	AAAGAA	2	12	983144	983155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012891	ATGATA	2	12	985777	985788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012891	TAAATT	2	12	995698	995709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012891	CATTAT	2	12	1002223	1002234	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012891	GCTCTT	2	12	1012090	1012101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012891	TTCCTT	2	12	1019835	1019846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012891	ACCTTT	2	12	1038069	1038080	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012891	ACAAAT	2	12	1059716	1059727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012891	TAATAC	2	12	1114039	1114050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012891	AGAGAA	2	12	1118090	1118101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012891	CCCGAA	2	12	1121400	1121411	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012891	TGACAT	2	12	1158984	1158995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012891	CTCCTT	2	12	1173462	1173473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012891	GTTTTC	2	12	1199611	1199622	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012891	GGAACT	2	12	1209859	1209870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012891	TAATCC	2	12	1219423	1219434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012891	ATCCTT	2	12	1268688	1268699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012891	TCTAAT	2	12	1275544	1275555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012891	AAACAT	2	12	1299528	1299539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012891	TTTGAT	2	12	1358875	1358886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012891	TTGCCA	2	12	1361312	1361323	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012891	TTTCAT	2	12	1443258	1443269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012891	TGACTT	2	12	1451905	1451916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012891	ATAATT	2	12	1486277	1486288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012891	GAGATA	2	12	1501969	1501980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012891	CAAGTA	2	12	1524086	1524097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012891	CCTAAA	2	12	1524190	1524201	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012891	TTAGTA	2	12	1524519	1524530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012891	TGGTAT	2	12	1556548	1556559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012891	CCTTAT	2	12	1567109	1567120	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012891	ATTTTC	2	12	1568740	1568751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012891	ATAAAA	2	12	1592991	1593002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012891	TATTAG	2	12	1607516	1607527	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012891	TATTTT	2	12	1633765	1633776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012891	TCCTTT	2	12	1666352	1666363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012891	AACTTC	2	12	1689086	1689097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012891	ATTCCA	2	12	1760891	1760902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012891	TTCCTT	2	12	1769753	1769764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012891	ATCATG	2	12	1794919	1794930	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012891	ACAATA	2	12	1814279	1814290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012891	ACTAGT	2	12	1816904	1816915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012891	TCTTTC	2	12	1832790	1832801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012891	CTGATA	2	12	1932938	1932949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012891	AAAGAG	2	12	1947738	1947749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012891	AGTATA	2	12	1960980	1960991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012891	ACTGTC	2	12	1966540	1966551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012891	TATCCT	2	12	1975613	1975624	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012891	CTTTTT	2	12	1975628	1975639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012891	TTAATA	2	12	2012558	2012569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012891	CTTTCT	2	12	2016874	2016885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012891	TTTTCA	2	12	2030537	2030548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012891	TAGTAT	2	12	2068165	2068176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.