MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012883	AAAACC	2	12	16063	16074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012883	GCATTC	2	12	17561	17572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012883	TTACTT	2	12	24568	24579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012883	TGATAG	2	12	48139	48150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012883	AAAAAT	2	12	67726	67737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012883	TATTTA	2	12	69511	69522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012883	TTTTAC	2	12	128710	128721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012883	TTCATT	2	12	151243	151254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012883	GAGTTA	2	12	151266	151277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012883	TTTTCT	2	12	173872	173883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012883	TGGTGC	2	12	180848	180859	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012883	GGGAGG	2	12	210493	210504	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012883	TACATA	2	12	227737	227748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012883	GAAAAA	2	12	250424	250435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012883	TAAAAT	2	12	316622	316633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012883	AAATCC	2	12	356739	356750	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012883	TTTACA	2	12	405791	405802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012883	AAGATT	2	12	406290	406301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012883	AGTTAA	2	12	410578	410589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012883	ATCTAC	2	12	432544	432555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012883	TAAAAA	2	12	447016	447027	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012883	TTAGGT	2	12	485230	485241	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012883	TATTTT	2	12	485517	485528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012883	GGGGCC	2	12	515869	515880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012883	TAACTA	2	12	551059	551070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012883	CTGGAG	2	12	553593	553604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012883	GGAAAA	2	12	593029	593040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012883	TTTCTT	2	12	593063	593074	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012883	TTTATT	2	12	597925	597936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012883	TTTTAT	2	12	623566	623577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012883	ATTAGG	2	12	628248	628259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012883	GACGTT	2	12	641899	641910	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012883	ACGAGG	2	12	641980	641991	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012883	GAGGAA	2	12	651579	651590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012883	AGTGAG	2	12	652029	652040	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012883	TCCCGG	2	12	679950	679961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012883	CCAAAC	2	12	682765	682776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012883	TAATAT	2	12	690051	690062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012883	TCCATT	2	12	719518	719529	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012883	AAGTAT	2	12	719869	719880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012883	AAAAAG	2	12	761498	761509	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012883	TTTTCA	2	12	770023	770034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012883	TTTAAA	2	12	777140	777151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012883	CAGAAC	2	12	787470	787481	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012883	TTTTAA	2	12	791978	791989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012883	GAGGAA	2	12	795028	795039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012883	AGTGAG	2	12	795478	795489	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012883	AAAAAG	2	12	913778	913789	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012883	CAAGAG	2	12	915265	915276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012883	ATGAAG	2	12	915359	915370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012883	TTCCAA	2	12	916089	916100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012883	TCACCT	2	12	916577	916588	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012883	CATTTT	2	12	932962	932973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012883	AAGAAA	2	12	946049	946060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012883	AAACCA	2	12	972588	972599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012883	ATTTGT	2	12	1011733	1011744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012883	TTTCTA	2	12	1086665	1086676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012883	AATATC	2	12	1092592	1092603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012883	GGCCGA	2	12	1121324	1121335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012883	ACTTTC	2	12	1128799	1128810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012883	GCCCAA	2	12	1158812	1158823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012883	CCCCGC	2	12	1158990	1159001	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
63	NC_012883	GGGCTT	2	12	1185501	1185512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012883	CAAAAA	2	12	1197934	1197945	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012883	AAAGAA	2	12	1208985	1208996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012883	TAAAAA	2	12	1223790	1223801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012883	AAAAAG	2	12	1234739	1234750	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012883	TATCAT	2	12	1240354	1240365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012883	ATTTAT	2	12	1291740	1291751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012883	AACATG	2	12	1308707	1308718	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012883	TTTGAG	2	12	1389457	1389468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012883	GGAAAT	2	12	1394629	1394640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012883	ATTAGG	2	12	1399295	1399306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012883	TACAAC	2	12	1407993	1408004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012883	CTTTTC	2	12	1440957	1440968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012883	TGGTGA	2	12	1446418	1446429	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012883	CCAATT	2	12	1446452	1446463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012883	AATTTT	2	12	1481900	1481911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012883	GAAAAA	2	12	1502100	1502111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012883	TTAAAA	2	12	1516945	1516956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012883	GAAAAA	2	12	1550312	1550323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012883	AAAAAT	2	12	1560341	1560352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012883	CTCACT	2	12	1603402	1603413	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012883	TTTTTG	2	12	1638357	1638368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012883	AACAAA	2	12	1656280	1656291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012883	GCTTAT	2	12	1663948	1663959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012883	CTTCTA	2	12	1664016	1664027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012883	AATTTT	2	12	1725221	1725232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012883	TAACTT	2	12	1764413	1764424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012883	AAAAGA	2	12	1776757	1776768	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012883	TCTTTT	2	12	1788127	1788138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012883	GAAAAA	2	12	1840478	1840489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.