MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012883	TCCTC	2	10	3055	3064	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_012883	TTTTA	2	10	42645	42654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012883	GAAAA	2	10	46577	46586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012883	ACATA	2	10	49886	49895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012883	GGAAA	2	10	50352	50361	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012883	AAGGA	2	10	59677	59686	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012883	ACTTA	2	10	67842	67851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012883	GAAAT	2	10	73555	73564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012883	AGGCT	2	10	80942	80951	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012883	CAGCC	2	10	80966	80975	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012883	AGCGA	2	10	83060	83069	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012883	ATTGC	2	10	83079	83088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012883	TTAAC	2	10	107872	107881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012883	GATTT	2	10	113259	113268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012883	GGGAA	2	10	114823	114832	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012883	GGCTC	2	10	115363	115372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012883	CGGGG	2	10	116145	116154	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012883	GGGAA	2	10	118307	118316	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012883	TTTTC	2	10	123262	123271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012883	CGGGG	2	10	128741	128750	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012883	CATTA	2	10	130334	130343	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012883	TCGTT	2	10	135480	135489	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012883	TTTTA	2	10	135491	135500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012883	TCATC	2	10	146696	146705	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012883	TTTTA	2	10	188400	188409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012883	AAGAA	2	10	188551	188560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012883	ACGGG	2	10	220248	220257	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012883	ATTTT	2	10	225695	225704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012883	AAAAG	2	10	261756	261765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012883	TATAA	2	10	277900	277909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012883	CTATT	2	10	313390	313399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012883	GTCCC	2	10	333170	333179	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_012883	GTGAT	2	10	348555	348564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012883	TCTTT	2	10	359966	359975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012883	TAGCC	2	10	370990	370999	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_012883	TAGCC	2	10	384913	384922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012883	AGGCG	2	10	385029	385038	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012883	TCTTT	2	10	405284	405293	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012883	AAGTT	2	10	410604	410613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012883	GGATA	2	10	414999	415008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012883	GTGAT	2	10	432574	432583	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012883	TCTTT	2	10	461941	461950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012883	AAAAT	2	10	463789	463798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012883	TTTTC	2	10	471566	471575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012883	AGAGG	2	10	476599	476608	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012883	TAGTT	2	10	494837	494846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012883	TCGTT	2	10	510264	510273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012883	ATGTA	2	10	512364	512373	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012883	AGCAA	2	10	514092	514101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012883	AATTT	2	10	516037	516046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012883	ATAGA	2	10	517870	517879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012883	GAAGA	2	10	531213	531222	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012883	TGAAA	2	10	531685	531694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012883	TTTTA	2	10	531843	531852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012883	TAATT	2	10	601477	601486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012883	TCTTA	2	10	608537	608546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012883	TAGAA	2	10	609542	609551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012883	TTTTC	2	10	620210	620219	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012883	AGATA	2	10	639444	639453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012883	CTTTT	2	10	647276	647285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012883	CAAGT	2	10	651016	651025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012883	GCTTT	2	10	651568	651577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012883	TAATT	2	10	659744	659753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012883	ACTTC	2	10	679987	679996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012883	CCTCC	2	10	682871	682880	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_012883	CAAAG	2	10	683125	683134	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012883	ATTTT	2	10	688193	688202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012883	TATAT	2	10	693585	693594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012883	CTTCA	2	10	719588	719597	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012883	AAGAT	2	10	722168	722177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012883	TTATA	2	10	723546	723555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012883	AGAGT	2	10	735042	735051	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012883	GTATT	2	10	736029	736038	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012883	GAAAA	2	10	743396	743405	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012883	TTAAA	2	10	759354	759363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012883	TAAAA	2	10	768129	768138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012883	TTTCT	2	10	777129	777138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012883	TCTTT	2	10	780440	780449	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012883	GATTG	2	10	787445	787454	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012883	GAAAG	2	10	787549	787558	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012883	AGAAA	2	10	788310	788319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012883	AATTT	2	10	794092	794101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012883	CAAGT	2	10	794465	794474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012883	GCTTT	2	10	795017	795026	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012883	TAACT	2	10	804651	804660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012883	ATTTT	2	10	805394	805403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012883	TAGAG	2	10	809619	809628	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012883	TCCCC	2	10	817272	817281	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_012883	CATTT	2	10	840171	840180	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012883	TTAAT	2	10	858760	858769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012883	AGAAA	2	10	905530	905539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012883	TTCAA	2	10	910293	910302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012883	AGAGA	2	10	916868	916877	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012883	TTCTT	2	10	932991	933000	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012883	AACTT	2	10	938877	938886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012883	ATGAA	2	10	945284	945293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012883	AGAAC	2	10	947835	947844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012883	CCCTG	2	10	952444	952453	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_012883	GTTCA	2	10	952527	952536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012883	TACAC	2	10	956761	956770	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012883	GCTTT	2	10	973201	973210	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012883	GAATT	2	10	990540	990549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012883	TTTAG	2	10	990567	990576	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012883	TTTGC	2	10	993340	993349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012883	AAAAG	2	10	1008906	1008915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012883	AAATC	2	10	1014941	1014950	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012883	GTAGA	2	10	1042608	1042617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012883	AAAAG	2	10	1052015	1052024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012883	CCTTT	2	10	1064729	1064738	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_012883	TTTTC	2	10	1074564	1074573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012883	TCTCC	2	10	1081518	1081527	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_012883	TTTTC	2	10	1081698	1081707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012883	AGGAA	2	10	1086708	1086717	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012883	ATGTG	2	10	1089305	1089314	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012883	CGTTT	2	10	1109105	1109114	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012883	AGAGA	2	10	1112491	1112500	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012883	TTTTC	2	10	1121242	1121251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012883	AAATA	2	10	1135580	1135589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012883	AAGAA	2	10	1138302	1138311	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012883	AAGTT	2	10	1149659	1149668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012883	GAGAA	2	10	1158893	1158902	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012883	GTCCC	2	10	1158958	1158967	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_012883	AGAAT	2	10	1159006	1159015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012883	TAAAA	2	10	1162062	1162071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012883	AGTAA	2	10	1170291	1170300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012883	AATTA	2	10	1178734	1178743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012883	AAGAA	2	10	1178957	1178966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012883	TACTC	2	10	1185556	1185565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_012883	TGTTT	2	10	1185854	1185863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012883	ATTAA	2	10	1213319	1213328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012883	TTTAT	2	10	1221706	1221715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012883	CTCTC	2	10	1225813	1225822	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_012883	CTTCT	2	10	1226140	1226149	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_012883	TTAAA	2	10	1230809	1230818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012883	TTTAA	2	10	1240581	1240590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012883	TTTAC	2	10	1244277	1244286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012883	CTTCT	2	10	1262529	1262538	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_012883	AAAGC	2	10	1294882	1294891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012883	AGTTT	2	10	1295392	1295401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012883	GTTGT	2	10	1298719	1298728	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012883	AATTT	2	10	1328565	1328574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012883	GAAAG	2	10	1329675	1329684	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012883	AAGCA	2	10	1342945	1342954	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012883	TAGCC	2	10	1344321	1344330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_012883	CCCCG	2	10	1344385	1344394	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
146	NC_012883	TTTAA	2	10	1381383	1381392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012883	AAAAG	2	10	1381422	1381431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012883	GAGAA	2	10	1383895	1383904	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012883	TTCTA	2	10	1389444	1389453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012883	AGGCT	2	10	1402524	1402533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_012883	TCAAG	2	10	1417139	1417148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012883	TGGGG	2	10	1437213	1437222	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012883	ATTTA	2	10	1437595	1437604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012883	ATTTT	2	10	1439268	1439277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012883	ATTTT	2	10	1439479	1439488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012883	ATTTT	2	10	1449934	1449943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012883	TAATT	2	10	1450720	1450729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012883	TCAGA	2	10	1458642	1458651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_012883	AATTT	2	10	1464174	1464183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012883	TTCTT	2	10	1466328	1466337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_012883	TTTCC	2	10	1469802	1469811	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_012883	CAAAT	2	10	1490510	1490519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_012883	GAAAA	2	10	1493577	1493586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012883	ATTAT	2	10	1524397	1524406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012883	TGGAA	2	10	1538078	1538087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012883	GAATG	2	10	1539134	1539143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012883	AAAAG	2	10	1540341	1540350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012883	GAAAT	2	10	1544105	1544114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012883	CCCTA	2	10	1550289	1550298	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
170	NC_012883	CAAAG	2	10	1554191	1554200	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
171	NC_012883	TTGCA	2	10	1570135	1570144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012883	AGCAA	2	10	1570202	1570211	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_012883	TTAAC	2	10	1571286	1571295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_012883	TTTCC	2	10	1571769	1571778	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_012883	AAAGA	2	10	1571961	1571970	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012883	ACAGA	2	10	1575753	1575762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_012883	TATAA	2	10	1583827	1583836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012883	TAAAA	2	10	1589872	1589881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012883	AATTA	2	10	1590016	1590025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012883	AAAAG	2	10	1595552	1595561	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_012883	AAAAT	2	10	1611134	1611143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012883	AGCTC	2	10	1631301	1631310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_012883	TTGTT	2	10	1638346	1638355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012883	GTTAG	2	10	1643705	1643714	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012883	TGAAA	2	10	1645685	1645694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012883	TTCTA	2	10	1663010	1663019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_012883	CAAAA	2	10	1680747	1680756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_012883	GATTT	2	10	1685100	1685109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
189	NC_012883	GAACC	2	10	1685149	1685158	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_012883	CTTTT	2	10	1694320	1694329	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_012883	AGAAA	2	10	1701813	1701822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012883	CCAAA	2	10	1702433	1702442	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_012883	AAAAG	2	10	1709252	1709261	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012883	TCACC	2	10	1731702	1731711	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
195	NC_012883	TTAAT	2	10	1736028	1736037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012883	AAAAT	2	10	1738775	1738784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_012883	ACTAA	2	10	1759821	1759830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_012883	CATGG	2	10	1768237	1768246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_012883	GAACA	2	10	1775061	1775070	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_012883	TACTC	2	10	1776069	1776078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_012883	AGAAA	2	10	1776378	1776387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012883	GAAAA	2	10	1788495	1788504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
203	NC_012883	GATTG	2	10	1821198	1821207	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
204	NC_012883	GTATA	2	10	1822773	1822782	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.