MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012858	TCGAAC	2	12	429	440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666493
2	NC_012858	GGAGCC	2	12	1709	1720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666494
3	NC_012858	TCAAGC	2	12	5140	5151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666497
4	NC_012858	GGCTCC	2	12	6794	6805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666499
5	NC_012858	TCGACG	2	12	9359	9370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666502
6	NC_012858	GACGAT	2	12	9867	9878	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666502
7	NC_012858	GGACAA	2	12	13613	13624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666506
8	NC_012858	CGACCT	2	12	15901	15912	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666511
9	NC_012858	CGATGA	2	12	18016	18027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666511
10	NC_012858	ATGCTG	2	12	19083	19094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241666512
11	NC_012858	CGGCGC	2	12	19958	19969	0 %	0 %	50 %	50 %	241666512
12	NC_012858	TCGAGG	2	12	21065	21076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666513
13	NC_012858	GACAAT	2	12	21480	21491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012858	GGGCCG	2	12	22376	22387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666514
15	NC_012858	TCTGCG	2	12	24378	24389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012858	CCTTCA	2	12	27408	27419	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241666520
17	NC_012858	GCTGAC	2	12	29228	29239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666522
18	NC_012858	CGTCAA	2	12	30430	30441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666523
19	NC_012858	CCGCGA	2	12	31510	31521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666524
20	NC_012858	GGCTTC	2	12	31644	31655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666525
21	NC_012858	GGTCGC	2	12	34139	34150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666525
22	NC_012858	CGTTGG	2	12	38465	38476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241666530
23	NC_012858	CAGAAA	2	12	43550	43561	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	241666532
24	NC_012858	CCCGAT	2	12	45983	45994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666535
25	NC_012858	GCTTCT	2	12	47783	47794	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241666537
26	NC_012858	CCGGCA	2	12	54683	54694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666544
27	NC_012858	GCAGTT	2	12	56413	56424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012858	ATGCCC	2	12	61711	61722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666549
29	NC_012858	AACGGT	2	12	62015	62026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666549
30	NC_012858	CGCTGC	2	12	67646	67657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666554
31	NC_012858	TCTCGG	2	12	70462	70473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666557
32	NC_012858	AAGCGC	2	12	71833	71844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666558
33	NC_012858	TGGAAC	2	12	73478	73489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666560
34	NC_012858	ACGGCA	2	12	73536	73547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666560
35	NC_012858	CTGGCG	2	12	81321	81332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666567
36	NC_012858	CGGCAG	2	12	82660	82671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666567
37	NC_012858	GATCTG	2	12	83359	83370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241666568
38	NC_012858	CACGGC	2	12	88659	88670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666574
39	NC_012858	GTTGAG	2	12	91206	91217	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241666578
40	NC_012858	CCTCGA	2	12	93688	93699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666581
41	NC_012858	GCGCTG	2	12	95029	95040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666582
42	NC_012858	AGCCGA	2	12	97783	97794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666584
43	NC_012858	ATCAGG	2	12	99646	99657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666586
44	NC_012858	GAAGAC	2	12	100871	100882	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666587
45	NC_012858	CCGGCA	2	12	101017	101028	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666587
46	NC_012858	CGGCGT	2	12	105108	105119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666591
47	NC_012858	TGGTCG	2	12	106033	106044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241666592
48	NC_012858	AGGTCG	2	12	106955	106966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666593
49	NC_012858	CATCCT	2	12	107948	107959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012858	TCCGGC	2	12	109143	109154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666595
51	NC_012858	CAGCGC	2	12	110337	110348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666595
52	NC_012858	AGACCA	2	12	110979	110990	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241666596
53	NC_012858	TCGCCA	2	12	113101	113112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666598
54	NC_012858	GACGGC	2	12	116087	116098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666601
55	NC_012858	GCCATC	2	12	117472	117483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666602
56	NC_012858	CCTCGG	2	12	118321	118332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666603
57	NC_012858	TCGGCA	2	12	118446	118457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666603
58	NC_012858	CCAGCG	2	12	119825	119836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666605
59	NC_012858	TCGCCG	2	12	121140	121151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666607
60	NC_012858	GCAGCC	2	12	124385	124396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666610
61	NC_012858	CATCCT	2	12	130280	130291	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241666618
62	NC_012858	GAAGGA	2	12	132052	132063	50 %	0 %	50 %	0 %	241666620
63	NC_012858	CATCGC	2	12	134428	134439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666622
64	NC_012858	GCCGAG	2	12	135527	135538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666623
65	NC_012858	GTCCTC	2	12	137959	137970	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666625
66	NC_012858	CGAACG	2	12	138474	138485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666626
67	NC_012858	ACGGTG	2	12	138886	138897	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666626
68	NC_012858	TGCCGA	2	12	141477	141488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666628
69	NC_012858	CTGGCG	2	12	142138	142149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666629
70	NC_012858	CATCGT	2	12	142500	142511	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666629
71	NC_012858	ATCTTC	2	12	143103	143114	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241666630
72	NC_012858	ATCGGC	2	12	143325	143336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666630
73	NC_012858	TCGGCC	2	12	143878	143889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666630
74	NC_012858	TCGGCG	2	12	145109	145120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666632
75	NC_012858	TCCGTC	2	12	147938	147949	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666635
76	NC_012858	GCAACG	2	12	148299	148310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666635
77	NC_012858	CGATGC	2	12	151733	151744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666638
78	NC_012858	CTCTTC	2	12	152925	152936	0 %	50 %	0 %	50 %	241666638
79	NC_012858	GCCCTT	2	12	153218	153229	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666638
80	NC_012858	GCCGGC	2	12	155043	155054	0 %	0 %	50 %	50 %	241666640
81	NC_012858	GCCATC	2	12	156133	156144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666641
82	NC_012858	GGGAGA	2	12	157189	157200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012858	CGAGGC	2	12	159051	159062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666643
84	NC_012858	CCAGCG	2	12	160113	160124	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666645
85	NC_012858	CGAGGC	2	12	161051	161062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666646
86	NC_012858	GACGCC	2	12	168800	168811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666653
87	NC_012858	AGCATC	2	12	170037	170048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666653
88	NC_012858	TCGATC	2	12	172942	172953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666656
89	NC_012858	AGATCG	2	12	173191	173202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666656
90	NC_012858	ATCGGG	2	12	173307	173318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666656
91	NC_012858	TGTCGC	2	12	174960	174971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666657
92	NC_012858	CGGCCT	2	12	175255	175266	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666657
93	NC_012858	GCCGTC	2	12	177799	177810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666660
94	NC_012858	CATCGC	2	12	182082	182093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666664
95	NC_012858	GTCTAC	2	12	182212	182223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666664
96	NC_012858	GGCGCT	2	12	183282	183293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666664
97	NC_012858	CCGGCA	2	12	187904	187915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666668
98	NC_012858	GGTGTC	2	12	190760	190771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241666671
99	NC_012858	CCGGAA	2	12	191699	191710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012858	CCCGAA	2	12	192232	192243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241666672
101	NC_012858	GCATGG	2	12	192278	192289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666672
102	NC_012858	CCAGCG	2	12	194957	194968	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666675
103	NC_012858	CGAGCC	2	12	196540	196551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666676
104	NC_012858	ATCAGC	2	12	200096	200107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666680
105	NC_012858	GATCAG	2	12	201572	201583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666681
106	NC_012858	GCAGCG	2	12	203468	203479	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666683
107	NC_012858	GATAGG	2	12	203534	203545	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241666683
108	NC_012858	GAAAGG	2	12	204355	204366	50 %	0 %	50 %	0 %	241666684
109	NC_012858	TCGATC	2	12	207426	207437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666686
110	NC_012858	ACCGGC	2	12	207515	207526	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012858	TCGGTC	2	12	214816	214827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666695
112	NC_012858	AGCGAA	2	12	218803	218814	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666699
113	NC_012858	GTAAAA	2	12	219459	219470	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012858	TGAAAA	2	12	223555	223566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	241666702
115	NC_012858	ATTGTG	2	12	225723	225734	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	241666706
116	NC_012858	TCTCCT	2	12	228794	228805	0 %	50 %	0 %	50 %	241666706
117	NC_012858	GAATGC	2	12	232504	232515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666708
118	NC_012858	CACCGT	2	12	232922	232933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666708
119	NC_012858	GGCCGC	2	12	234115	234126	0 %	0 %	50 %	50 %	241666709
120	NC_012858	CCGGCG	2	12	237099	237110	0 %	0 %	50 %	50 %	241666712
121	NC_012858	GCCTCG	2	12	241503	241514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666717
122	NC_012858	AGCGAG	2	12	241647	241658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241666717
123	NC_012858	GCCGTC	2	12	242030	242041	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012858	AAAAAT	2	12	243167	243178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	241666718
125	NC_012858	TCCGGT	2	12	243210	243221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012858	CTCGAT	2	12	244677	244688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666719
127	NC_012858	GCAAGA	2	12	246213	246224	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666720
128	NC_012858	GCGTCG	2	12	252189	252200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666725
129	NC_012858	ACATCG	2	12	252954	252965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666725
130	NC_012858	CCGGCA	2	12	255299	255310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666726
131	NC_012858	CAGCTG	2	12	255970	255981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666726
132	NC_012858	CGGCGC	2	12	258224	258235	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
133	NC_012858	TGTCGA	2	12	261629	261640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241666733
134	NC_012858	GCTCGG	2	12	265658	265669	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666738
135	NC_012858	ATCCAG	2	12	273463	273474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666746
136	NC_012858	TGGACG	2	12	274728	274739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666747
137	NC_012858	ACGCGA	2	12	275506	275517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666747
138	NC_012858	GCCGTC	2	12	282771	282782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666753
139	NC_012858	ATGGCG	2	12	285446	285457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666755
140	NC_012858	GGGCTG	2	12	285491	285502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241666755
141	NC_012858	GTTCAC	2	12	286527	286538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666756
142	NC_012858	CGATCT	2	12	290273	290284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666761
143	NC_012858	CGCCGA	2	12	291126	291137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666762
144	NC_012858	CCCCCG	2	12	293852	293863	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	241666764
145	NC_012858	CATCGA	2	12	300383	300394	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666770
146	NC_012858	GCGCGA	2	12	303592	303603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666772
147	NC_012858	GCAGCG	2	12	307430	307441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012858	GTCGAT	2	12	308492	308503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241666774
149	NC_012858	TCGGCG	2	12	309632	309643	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012858	AGGAAG	3	18	311778	311795	50 %	0 %	50 %	0 %	241666775
151	NC_012858	TCTTGT	2	12	312585	312596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_012858	CGTCGG	2	12	318380	318391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666780
153	NC_012858	CTTCGT	2	12	321575	321586	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241666782
154	NC_012858	GGTCGA	2	12	324276	324287	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666785
155	NC_012858	ATGACG	2	12	325683	325694	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666786
156	NC_012858	GCGCTG	2	12	325880	325891	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666786
157	NC_012858	CGCTGG	2	12	326694	326705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666786
158	NC_012858	GCCTGC	2	12	329222	329233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666788
159	NC_012858	TAGCGG	2	12	333584	333595	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666791
160	NC_012858	CCGAGC	2	12	334422	334433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666792
161	NC_012858	CTTCGC	2	12	339069	339080	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666796
162	NC_012858	GCCTGC	2	12	339269	339280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666796
163	NC_012858	CGATGA	2	12	344224	344235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666802
164	NC_012858	GACGCC	2	12	344897	344908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666803
165	NC_012858	TCAGCG	2	12	345388	345399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666803
166	NC_012858	AGGACG	2	12	354466	354477	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241666814
167	NC_012858	GTCGAA	2	12	355733	355744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666815
168	NC_012858	GCCGAC	2	12	360424	360435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666818
169	NC_012858	GATCGG	2	12	363274	363285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666820
170	NC_012858	CAAGGA	2	12	363766	363777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666820
171	NC_012858	GAAGAT	2	12	367455	367466	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241666824
172	NC_012858	AGCCGA	2	12	368340	368351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666825
173	NC_012858	TCGCCC	2	12	368724	368735	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241666826
174	NC_012858	AGGTCG	2	12	368850	368861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666826
175	NC_012858	ATCGGC	2	12	372186	372197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666831
176	NC_012858	ATGGAT	2	12	373435	373446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666832
177	NC_012858	CAAGGC	2	12	374978	374989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666833
178	NC_012858	CGATCG	2	12	375220	375231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666833
179	NC_012858	GCGCCC	2	12	375349	375360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666833
180	NC_012858	CGCCTT	2	12	378902	378913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666836
181	NC_012858	GCCTGC	2	12	379534	379545	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666836
182	NC_012858	CCAGTC	2	12	385233	385244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
183	NC_012858	AGCCTG	2	12	388906	388917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666846
184	NC_012858	AAGCCG	2	12	390683	390694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666849
185	NC_012858	CGGCGA	2	12	391024	391035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_012858	TGCGGG	2	12	391062	391073	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
187	NC_012858	GGGTAT	2	12	392806	392817	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012858	GACGCC	2	12	395496	395507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666856
189	NC_012858	CGGATA	2	12	396035	396046	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666857
190	NC_012858	CGATGG	2	12	397027	397038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666858
191	NC_012858	TCTGGT	2	12	397727	397738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241666859
192	NC_012858	CCCTTG	2	12	399526	399537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
193	NC_012858	GCGAAT	2	12	399692	399703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
194	NC_012858	CCTGCC	2	12	401192	401203	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241666863
195	NC_012858	GCTTCG	2	12	401575	401586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666863
196	NC_012858	GCGGGC	2	12	402029	402040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666863
197	NC_012858	TCGCCG	2	12	405690	405701	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666866
198	NC_012858	GGTCAA	2	12	405799	405810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666866
199	NC_012858	ACGCGA	2	12	410706	410717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666871
200	NC_012858	GCGAAG	2	12	412033	412044	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241666873
201	NC_012858	TCGAAC	2	12	413579	413590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666875
202	NC_012858	CGCCAT	2	12	416050	416061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
203	NC_012858	CGATCT	2	12	417118	417129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666878
204	NC_012858	GGCCAA	2	12	417405	417416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666879
205	NC_012858	CTCTTG	2	12	418187	418198	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
206	NC_012858	CGGCGA	2	12	418342	418353	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
207	NC_012858	GAGCAC	2	12	419957	419968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666881
208	NC_012858	ATGGTG	2	12	420596	420607	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241666882
209	NC_012858	GACGGA	2	12	422163	422174	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241666884
210	NC_012858	TCGCCA	2	12	422213	422224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666884
211	NC_012858	CGATCA	2	12	423020	423031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666887
212	NC_012858	CGGCTT	2	12	426226	426237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666890
213	NC_012858	AGCCGC	2	12	428811	428822	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666895
214	NC_012858	GGACAA	2	12	429573	429584	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666897
215	NC_012858	CGGCTT	2	12	438481	438492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666908
216	NC_012858	CTTGGC	2	12	439156	439167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666909
217	NC_012858	GAACAG	2	12	440510	440521	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
218	NC_012858	CGTCCC	2	12	441171	441182	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
219	NC_012858	CGGCTT	2	12	445624	445635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
220	NC_012858	CTGTGA	2	12	449224	449235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
221	NC_012858	TGATCT	2	12	449489	449500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
222	NC_012858	CGTTTT	2	12	450055	450066	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
223	NC_012858	AACGGA	2	12	453088	453099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
224	NC_012858	CGACGG	2	12	457565	457576	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666928
225	NC_012858	TCGAGA	2	12	464427	464438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666936
226	NC_012858	TCGAGG	2	12	464505	464516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666936
227	NC_012858	ACTACG	2	12	464727	464738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666936
228	NC_012858	CCGAAG	2	12	464924	464935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666936
229	NC_012858	GCCAAT	2	12	465032	465043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666936
230	NC_012858	ATCGAC	2	12	465418	465429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666937
231	NC_012858	GCCAGT	2	12	466302	466313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_012858	TCGTTG	2	12	468593	468604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241666940
233	NC_012858	GCCTCG	2	12	471997	472008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666946
234	NC_012858	TGCCCG	2	12	472037	472048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666946
235	NC_012858	CAAGAA	2	12	474312	474323	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	241666948
236	NC_012858	CGTCTC	2	12	477095	477106	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241666951
237	NC_012858	CGTGTT	2	12	485468	485479	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241666958
238	NC_012858	TCACCG	2	12	492980	492991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666968
239	NC_012858	GGCGCA	2	12	493006	493017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666968
240	NC_012858	CGGCAA	2	12	493860	493871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666969
241	NC_012858	GAAATC	2	12	494420	494431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241666969
242	NC_012858	CGCGGT	2	12	496483	496494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666972
243	NC_012858	GGGACT	2	12	498846	498857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666974
244	NC_012858	CGTCGG	2	12	499962	499973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241666976
245	NC_012858	AGATTG	2	12	500669	500680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666977
246	NC_012858	TCGGCA	2	12	502718	502729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666979
247	NC_012858	CGCCGA	2	12	508755	508766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666985
248	NC_012858	TCAAGA	2	12	509757	509768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241666986
249	NC_012858	CGCAGG	2	12	510081	510092	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666986
250	NC_012858	AGCCGC	2	12	513316	513327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666990
251	NC_012858	CGCGAG	2	12	514829	514840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666991
252	NC_012858	GACGCT	2	12	519519	519530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666995
253	NC_012858	GAGGCG	2	12	520469	520480	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241666996
254	NC_012858	GGCGAG	2	12	523355	523366	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241666998
255	NC_012858	AGCGAA	2	12	523877	523888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241666998
256	NC_012858	GGCAGC	2	12	524287	524298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241666999
257	NC_012858	GCTGGC	2	12	525052	525063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667000
258	NC_012858	AGGCCA	2	12	525696	525707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667000
259	NC_012858	TCGACG	2	12	525885	525896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667000
260	NC_012858	GCGTCA	2	12	530564	530575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667007
261	NC_012858	AGCACC	2	12	530740	530751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241667007
262	NC_012858	GGCCGG	2	12	530933	530944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667007
263	NC_012858	CAGGCG	2	12	533111	533122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667008
264	NC_012858	CCGGCG	2	12	533426	533437	0 %	0 %	50 %	50 %	241667008
265	NC_012858	GCGCAA	2	12	535034	535045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667009
266	NC_012858	GCCAGC	2	12	535120	535131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667009
267	NC_012858	CTTCAC	2	12	535957	535968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241667010
268	NC_012858	TGCGCC	2	12	536712	536723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667010
269	NC_012858	CGGCCT	2	12	539511	539522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667012
270	NC_012858	AGCGTC	2	12	539569	539580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667012
271	NC_012858	TGCCGG	2	12	542377	542388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667015
272	NC_012858	GCCGAT	2	12	542463	542474	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667015
273	NC_012858	CTCGAC	2	12	543327	543338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667015
274	NC_012858	TTTCGA	2	12	545320	545331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241667016
275	NC_012858	CCGGCG	2	12	550616	550627	0 %	0 %	50 %	50 %	241667021
276	NC_012858	CCTTCC	2	12	551130	551141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667022
277	NC_012858	GCGTCG	2	12	551271	551282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667022
278	NC_012858	ATCTGG	2	12	551555	551566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241667022
279	NC_012858	TTCTGG	2	12	552089	552100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241667022
280	NC_012858	ACCGGC	2	12	552482	552493	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667022
281	NC_012858	GCCGAG	2	12	556612	556623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667027
282	NC_012858	GAGGGC	2	12	558863	558874	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241667028
283	NC_012858	ATCGGC	2	12	559651	559662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667029
284	NC_012858	CTCGAC	2	12	560158	560169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667029
285	NC_012858	GCCAGC	2	12	562605	562616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667030
286	NC_012858	CGCTGC	2	12	566945	566956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667034
287	NC_012858	GACATG	2	12	570621	570632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241667038
288	NC_012858	TTTCGC	2	12	570848	570859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241667039
289	NC_012858	AGCTGC	2	12	572386	572397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667039
290	NC_012858	TCGACC	2	12	573657	573668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667039
291	NC_012858	GCCAGC	2	12	574159	574170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667039
292	NC_012858	CGCTGA	2	12	575767	575778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667039
293	NC_012858	AGCACG	2	12	581159	581170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667042
294	NC_012858	CCATCG	2	12	588021	588032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667050
295	NC_012858	CATGTC	2	12	588417	588428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241667051
296	NC_012858	TCCTCA	2	12	591275	591286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241667054
297	NC_012858	GATCGA	2	12	594987	594998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241667057
298	NC_012858	CGCCAG	2	12	595018	595029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667057
299	NC_012858	GCCGGC	2	12	597504	597515	0 %	0 %	50 %	50 %	241667059
300	NC_012858	GCTGAC	2	12	597650	597661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667059
301	NC_012858	AGGAAT	2	12	597859	597870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241667059
302	NC_012858	GCTGGT	2	12	599193	599204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241667061
303	NC_012858	CAAGCG	2	12	600223	600234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667063
304	NC_012858	GGCAAC	2	12	604929	604940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_012858	GCTGAT	2	12	605636	605647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241667068
306	NC_012858	CGCCTT	2	12	606436	606447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241667070
307	NC_012858	CCATCG	2	12	609030	609041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241667072
308	NC_012858	CCTCGG	2	12	612167	612178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667075
309	NC_012858	CCGGGC	2	12	614122	614133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
310	NC_012858	GGCTGC	2	12	617498	617509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667078
311	NC_012858	CTTCCG	2	12	620248	620259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241667082
312	NC_012858	TCGGTC	2	12	620325	620336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667082
313	NC_012858	ATCGAC	2	12	620351	620362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241667082
314	NC_012858	TCAGCG	2	12	621177	621188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667083
315	NC_012858	CGATGC	2	12	622049	622060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667084
316	NC_012858	TGCCGA	2	12	625388	625399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667086
317	NC_012858	GGCGAA	2	12	625997	626008	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241667086
318	NC_012858	TCGATA	2	12	627334	627345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241667087
319	NC_012858	CGGCAG	2	12	629156	629167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667089
320	NC_012858	CCGAAG	2	12	631808	631819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667092
321	NC_012858	ACCGCA	2	12	633050	633061	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241667092
322	NC_012858	CTTTCG	2	12	633322	633333	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241667093
323	NC_012858	ACGGCG	2	12	633932	633943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667093
324	NC_012858	TGCCGA	2	12	634218	634229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667093
325	NC_012858	GCCTCG	2	12	635241	635252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667094
326	NC_012858	TCGGCG	2	12	639500	639511	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241667096
327	NC_012858	GCCAAG	2	12	640081	640092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667096
328	NC_012858	CGCCAG	2	12	641770	641781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667098
329	NC_012858	CGCCTG	2	12	643801	643812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667100
330	NC_012858	GGCGAA	2	12	646228	646239	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241667102
331	NC_012858	TTGAGC	2	12	646496	646507	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241667102
332	NC_012858	CAGCGT	2	12	647092	647103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241667102
333	NC_012858	CGGCCG	2	12	647777	647788	0 %	0 %	50 %	50 %	241667103
334	NC_012858	TCGCCG	2	12	648672	648683	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667104
335	NC_012858	GTCGCC	2	12	649443	649454	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241667105
336	NC_012858	AGCGCG	2	12	651311	651322	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241667106
337	NC_012858	CCGGCG	2	12	652017	652028	0 %	0 %	50 %	50 %	241667107
338	NC_012858	ATCAGC	2	12	652870	652881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241667109
339	NC_012858	CACCGG	2	12	654095	654106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241667111
340	NC_012858	GATCGA	2	12	655065	655076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241667112
341	NC_012858	GTTGAA	2	12	659601	659612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667115

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.