MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012858	TCTT	2	8	783	790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012858	CCGG	2	8	3838	3845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012858	ACGG	2	8	5220	5227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012858	GAAG	2	8	5397	5404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012858	ATGC	2	8	6358	6365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012858	CGGG	2	8	6366	6373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012858	AAAT	2	8	6407	6414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012858	ACCC	2	8	18216	18223	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_012858	GTTC	2	8	20349	20356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012858	CAAT	2	8	21472	21479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012858	CCTG	2	8	21610	21617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012858	GCCT	2	8	23450	23457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012858	AATC	2	8	24445	24452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012858	CTTG	2	8	24797	24804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012858	CGAT	2	8	28813	28820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012858	GGAT	2	8	28963	28970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012858	GGAA	2	8	29040	29047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012858	AATC	2	8	40071	40078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012858	TTGA	2	8	41486	41493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012858	GGCC	2	8	48308	48315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012858	GATC	2	8	50845	50852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012858	TCGC	2	8	56238	56245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012858	TGAG	2	8	56339	56346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012858	GGCC	2	8	58530	58537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012858	ATTT	2	8	64124	64131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012858	AATT	2	8	64196	64203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012858	GCTG	2	8	64232	64239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012858	CCGG	2	8	64243	64250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012858	CAGC	2	8	64320	64327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012858	GGCA	2	8	74776	74783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012858	TGGT	2	8	86058	86065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012858	AGAT	2	8	92918	92925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012858	TACA	2	8	92963	92970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012858	GATC	2	8	101771	101778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012858	GACT	2	8	110697	110704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012858	GTCG	2	8	110766	110773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012858	GCCC	2	8	110949	110956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_012858	GCTC	2	8	113219	113226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012858	TCCG	2	8	122223	122230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012858	TTAC	2	8	129265	129272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012858	TTGA	2	8	138417	138424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012858	TCAA	2	8	139306	139313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012858	AGGG	2	8	149908	149915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012858	GAGC	2	8	162895	162902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012858	CAGC	2	8	163201	163208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012858	GCCT	2	8	174195	174202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012858	GATT	2	8	174291	174298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012858	ATCG	2	8	175864	175871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012858	TTCC	2	8	180997	181004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012858	CAGC	2	8	191606	191613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012858	CGGC	2	8	205065	205072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012858	GCCC	2	8	205641	205648	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_012858	AAGA	2	8	205685	205692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012858	TAGT	2	8	205769	205776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012858	AGAT	2	8	208425	208432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012858	CCGA	2	8	210457	210464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012858	ATCA	2	8	212906	212913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012858	CCGA	2	8	214691	214698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012858	GCCA	2	8	218335	218342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012858	GTTC	2	8	233574	233581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012858	CGTC	2	8	236780	236787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012858	AGGG	2	8	236940	236947	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012858	TCGG	2	8	241067	241074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012858	CATC	2	8	256692	256699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012858	CGCC	2	8	259487	259494	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_012858	CGCC	2	8	259504	259511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_012858	ATCG	2	8	259612	259619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012858	GAAG	2	8	259974	259981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012858	CTGC	2	8	260981	260988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012858	TCGC	2	8	261142	261149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012858	CGGC	2	8	261182	261189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012858	GCGA	2	8	261211	261218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012858	TTGC	2	8	262826	262833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012858	TCGC	2	8	262947	262954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012858	GTTT	2	8	268943	268950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012858	GGCG	2	8	269227	269234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012858	GGCC	2	8	269564	269571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012858	GGCT	2	8	271090	271097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012858	CCGG	2	8	271180	271187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012858	ACGA	2	8	273985	273992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012858	CCCG	2	8	274314	274321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_012858	AGCG	2	8	277356	277363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012858	CGCA	2	8	280193	280200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012858	ATCT	2	8	280278	280285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012858	CGAT	2	8	280497	280504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012858	GGCA	2	8	281298	281305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012858	CGAC	2	8	286977	286984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012858	AGGC	2	8	287026	287033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012858	TTGA	2	8	294872	294879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012858	CGTC	2	8	297175	297182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012858	ACCC	2	8	306973	306980	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_012858	GAAA	2	8	307155	307162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012858	GTCG	2	8	307527	307534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012858	ATCC	2	8	307589	307596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012858	CGAC	2	8	310332	310339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012858	CGTT	2	8	312857	312864	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012858	GCGT	2	8	313652	313659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012858	TGGT	2	8	313955	313962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012858	GCCT	2	8	313982	313989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012858	CGCT	2	8	314106	314113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012858	GTCC	2	8	314979	314986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012858	GTCG	2	8	315579	315586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012858	CGGG	2	8	317010	317017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012858	CCCG	2	8	317129	317136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_012858	GGGA	2	8	317867	317874	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012858	CGTT	2	8	319122	319129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012858	TTCC	2	8	320155	320162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012858	ATGA	2	8	322528	322535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012858	TGCC	2	8	322614	322621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012858	GGCA	2	8	322624	322631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012858	CCCT	2	8	322814	322821	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_012858	CAAG	2	8	323080	323087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012858	ATCA	2	8	327245	327252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012858	CGGC	2	8	329442	329449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012858	GGGA	2	8	329505	329512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012858	TCCC	2	8	331688	331695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_012858	TCAA	2	8	335429	335436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012858	GCCA	2	8	336830	336837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012858	AGGC	2	8	340603	340610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012858	GACC	2	8	345665	345672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012858	GCCT	2	8	347874	347881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012858	TCAT	2	8	348934	348941	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012858	AGGG	2	8	351330	351337	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012858	GCCT	2	8	361085	361092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012858	CCGT	2	8	368383	368390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012858	GGCC	2	8	368497	368504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012858	CAGA	2	8	370789	370796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012858	TCTT	2	8	374159	374166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012858	TCTG	2	8	382895	382902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012858	ACCT	2	8	388506	388513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012858	TTCA	2	8	389321	389328	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012858	GATT	2	8	390078	390085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012858	CGCC	2	8	391738	391745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_012858	TCAC	2	8	391897	391904	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012858	GAGT	2	8	392389	392396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012858	CGAT	2	8	392600	392607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012858	GCCT	2	8	393925	393932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012858	GGTG	2	8	398253	398260	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012858	ACGA	2	8	398796	398803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012858	GTCG	2	8	398882	398889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012858	TTCG	2	8	399225	399232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012858	GGCC	2	8	399752	399759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012858	TGGC	2	8	400608	400615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012858	GTCC	2	8	402159	402166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012858	TCGT	2	8	407847	407854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012858	TGGT	2	8	409295	409302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012858	GCCG	2	8	413185	413192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012858	CGGG	2	8	414376	414383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012858	TGGA	2	8	414417	414424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012858	GGCT	2	8	414846	414853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012858	CCCT	2	8	415312	415319	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.