MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012858	T	6	6	14978	14983	0 %	100 %	0 %	0 %	241666509
2	NC_012858	T	6	6	15063	15068	0 %	100 %	0 %	0 %	241666509
3	NC_012858	T	6	6	21405	21410	0 %	100 %	0 %	0 %	241666513
4	NC_012858	A	6	6	21745	21750	100 %	0 %	0 %	0 %	241666514
5	NC_012858	T	7	7	33964	33970	0 %	100 %	0 %	0 %	241666525
6	NC_012858	T	6	6	54854	54859	0 %	100 %	0 %	0 %	241666544
7	NC_012858	T	6	6	78776	78781	0 %	100 %	0 %	0 %	241666564
8	NC_012858	T	6	6	81486	81491	0 %	100 %	0 %	0 %	241666567
9	NC_012858	T	6	6	84639	84644	0 %	100 %	0 %	0 %	241666569
10	NC_012858	A	6	6	91695	91700	100 %	0 %	0 %	0 %	241666578
11	NC_012858	C	6	6	113529	113534	0 %	0 %	0 %	100 %	241666599
12	NC_012858	A	6	6	114244	114249	100 %	0 %	0 %	0 %	241666600
13	NC_012858	A	6	6	115010	115015	100 %	0 %	0 %	0 %	241666601
14	NC_012858	T	6	6	123354	123359	0 %	100 %	0 %	0 %	241666610
15	NC_012858	T	7	7	129208	129214	0 %	100 %	0 %	0 %	241666616
16	NC_012858	T	6	6	133908	133913	0 %	100 %	0 %	0 %	241666621
17	NC_012858	A	6	6	144221	144226	100 %	0 %	0 %	0 %	241666631
18	NC_012858	A	6	6	146256	146261	100 %	0 %	0 %	0 %	241666633
19	NC_012858	T	6	6	150748	150753	0 %	100 %	0 %	0 %	241666637
20	NC_012858	C	6	6	156332	156337	0 %	0 %	0 %	100 %	241666641
21	NC_012858	T	6	6	158225	158230	0 %	100 %	0 %	0 %	241666642
22	NC_012858	C	6	6	159527	159532	0 %	0 %	0 %	100 %	241666644
23	NC_012858	T	6	6	160974	160979	0 %	100 %	0 %	0 %	241666646
24	NC_012858	A	7	7	163908	163914	100 %	0 %	0 %	0 %	241666648
25	NC_012858	C	6	6	164341	164346	0 %	0 %	0 %	100 %	241666648
26	NC_012858	A	6	6	167457	167462	100 %	0 %	0 %	0 %	241666651
27	NC_012858	T	6	6	174590	174595	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
28	NC_012858	T	6	6	174877	174882	0 %	100 %	0 %	0 %	241666657
29	NC_012858	G	6	6	175589	175594	0 %	0 %	100 %	0 %	241666658
30	NC_012858	A	7	7	179031	179037	100 %	0 %	0 %	0 %	241666661
31	NC_012858	T	6	6	203032	203037	0 %	100 %	0 %	0 %	241666682
32	NC_012858	A	6	6	213847	213852	100 %	0 %	0 %	0 %	241666693
33	NC_012858	C	6	6	220045	220050	0 %	0 %	0 %	100 %	241666700
34	NC_012858	C	6	6	225058	225063	0 %	0 %	0 %	100 %	241666704
35	NC_012858	C	6	6	227290	227295	0 %	0 %	0 %	100 %	241666706
36	NC_012858	A	6	6	231221	231226	100 %	0 %	0 %	0 %	241666707
37	NC_012858	C	6	6	231697	231702	0 %	0 %	0 %	100 %	241666707
38	NC_012858	T	6	6	232585	232590	0 %	100 %	0 %	0 %	241666708
39	NC_012858	A	6	6	232998	233003	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
40	NC_012858	A	6	6	233387	233392	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
41	NC_012858	A	6	6	235285	235290	100 %	0 %	0 %	0 %	241666710
42	NC_012858	T	6	6	238899	238904	0 %	100 %	0 %	0 %	241666714
43	NC_012858	G	6	6	240189	240194	0 %	0 %	100 %	0 %	241666715
44	NC_012858	A	6	6	244209	244214	100 %	0 %	0 %	0 %	241666719
45	NC_012858	T	6	6	248350	248355	0 %	100 %	0 %	0 %	241666722
46	NC_012858	T	7	7	251547	251553	0 %	100 %	0 %	0 %	241666725
47	NC_012858	A	6	6	260424	260429	100 %	0 %	0 %	0 %	241666732
48	NC_012858	A	6	6	263564	263569	100 %	0 %	0 %	0 %	241666735
49	NC_012858	A	6	6	268042	268047	100 %	0 %	0 %	0 %	241666740
50	NC_012858	A	6	6	273547	273552	100 %	0 %	0 %	0 %	241666746
51	NC_012858	T	6	6	277723	277728	0 %	100 %	0 %	0 %	241666750
52	NC_012858	C	6	6	278583	278588	0 %	0 %	0 %	100 %	241666750
53	NC_012858	A	6	6	279701	279706	100 %	0 %	0 %	0 %	241666750
54	NC_012858	A	7	7	280529	280535	100 %	0 %	0 %	0 %	241666751
55	NC_012858	A	6	6	286174	286179	100 %	0 %	0 %	0 %	241666756
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57	NC_012858	T	6	6	293360	293365	0 %	100 %	0 %	0 %	241666764
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60	NC_012858	T	6	6	311397	311402	0 %	100 %	0 %	0 %	241666775
61	NC_012858	C	7	7	311827	311833	0 %	0 %	0 %	100 %	241666775
62	NC_012858	T	6	6	318845	318850	0 %	100 %	0 %	0 %	241666780
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64	NC_012858	C	6	6	350196	350201	0 %	0 %	0 %	100 %	241666811
65	NC_012858	C	6	6	353530	353535	0 %	0 %	0 %	100 %	241666814
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93	NC_012858	A	7	7	491269	491275	100 %	0 %	0 %	0 %	241666965
94	NC_012858	A	7	7	496820	496826	100 %	0 %	0 %	0 %	241666972
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98	NC_012858	A	6	6	543582	543587	100 %	0 %	0 %	0 %	241667016
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100	NC_012858	G	6	6	570820	570825	0 %	0 %	100 %	0 %	241667039
101	NC_012858	G	6	6	587068	587073	0 %	0 %	100 %	0 %	241667048
102	NC_012858	C	6	6	589429	589434	0 %	0 %	0 %	100 %	241667053
103	NC_012858	T	6	6	592368	592373	0 %	100 %	0 %	0 %	241667055
104	NC_012858	G	6	6	599975	599980	0 %	0 %	100 %	0 %	241667062
105	NC_012858	G	6	6	600334	600339	0 %	0 %	100 %	0 %	241667063
106	NC_012858	A	6	6	607661	607666	100 %	0 %	0 %	0 %	241667071
107	NC_012858	T	6	6	627454	627459	0 %	100 %	0 %	0 %	241667087
108	NC_012858	A	6	6	639445	639450	100 %	0 %	0 %	0 %	241667096
109	NC_012858	A	7	7	643402	643408	100 %	0 %	0 %	0 %	241667099
110	NC_012858	T	6	6	651898	651903	0 %	100 %	0 %	0 %	241667107
111	NC_012858	C	6	6	655083	655088	0 %	0 %	0 %	100 %	241667112

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.