MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012857	ACCGCT	2	12	23242	23253	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012857	GCCGTC	2	12	34685	34696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012857	CGGGCA	2	12	44045	44056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012857	GAAGAT	2	12	123553	123564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012857	ACCCTG	2	12	137442	137453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012857	AGCGCG	2	12	165237	165248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012857	CGCCCG	2	12	168512	168523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012857	ACAACG	2	12	183808	183819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012857	CAAAAA	2	12	207559	207570	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012857	CCGCGC	2	12	238087	238098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012857	CGATCT	2	12	286825	286836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012857	CATTCC	2	12	296740	296751	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012857	GACCCC	2	12	308421	308432	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_012857	CCGATC	2	12	346239	346250	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012857	TCTCCT	2	12	370792	370803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012857	GTGCGG	2	12	384529	384540	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012857	GTGCAC	2	12	402929	402940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012857	GTTCAC	2	12	426945	426956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012857	GGCGAG	2	12	447857	447868	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012857	AATCGC	2	12	482249	482260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012857	GTGCCG	2	12	541240	541251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012857	CCCATC	2	12	571261	571272	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012857	TGTCGG	2	12	582777	582788	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012857	GCGCCG	2	12	584586	584597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012857	GCCGGA	2	12	584598	584609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012857	TCACGC	2	12	616176	616187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012857	CGCGTG	2	12	661012	661023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012857	ACGCCG	2	12	671502	671513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012857	GTTTTG	2	12	676904	676915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012857	ACCGAT	2	12	682725	682736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012857	GTTCAA	2	12	713433	713444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012857	AAGGGG	2	12	755785	755796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012857	GGAAAA	2	12	839980	839991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012857	CGTGCC	2	12	861772	861783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012857	AAAACG	2	12	863346	863357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012857	AGAGGA	2	12	877711	877722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012857	CGATGC	2	12	884518	884529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012857	ATCAAC	2	12	913758	913769	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012857	TGACGG	2	12	1009340	1009351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012857	GCGGCC	2	12	1015552	1015563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012857	GCCCTT	2	12	1029180	1029191	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012857	CGCCAC	2	12	1055742	1055753	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012857	GGCGCG	2	12	1194446	1194457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012857	TCAAAC	2	12	1228149	1228160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012857	ACCGCG	2	12	1311104	1311115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012857	ATCGGT	2	12	1312698	1312709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.