MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 3092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012856	CGACC	2	10	849	858	20 %	0 %	20 %	60 %	241661626
2	NC_012856	GCCGC	2	10	1141	1150	0 %	0 %	40 %	60 %	241661626
3	NC_012856	ACCAC	2	10	2096	2105	40 %	0 %	0 %	60 %	241661626
4	NC_012856	AGCGC	2	10	4030	4039	20 %	0 %	40 %	40 %	241661628
5	NC_012856	AGTTC	2	10	4810	4819	20 %	40 %	20 %	20 %	241661628
6	NC_012856	CTCGT	2	10	4836	4845	0 %	40 %	20 %	40 %	241661628
7	NC_012856	ATGCG	2	10	8745	8754	20 %	20 %	40 %	20 %	241661630
8	NC_012856	ACTTC	2	10	9066	9075	20 %	40 %	0 %	40 %	241661630
9	NC_012856	CGGTG	2	10	9990	9999	0 %	20 %	60 %	20 %	241661631
10	NC_012856	GAGGT	2	10	11553	11562	20 %	20 %	60 %	0 %	241661632
11	NC_012856	GAGGT	2	10	11606	11615	20 %	20 %	60 %	0 %	241661632
12	NC_012856	ATCGA	2	10	11912	11921	40 %	20 %	20 %	20 %	241661632
13	NC_012856	CGCAG	2	10	12561	12570	20 %	0 %	40 %	40 %	241661633
14	NC_012856	ATTCA	2	10	13723	13732	40 %	40 %	0 %	20 %	241661634
15	NC_012856	TCGCC	2	10	15466	15475	0 %	20 %	20 %	60 %	241661635
16	NC_012856	CGCAA	2	10	16474	16483	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012856	CGAGC	2	10	19586	19595	20 %	0 %	40 %	40 %	241661640
18	NC_012856	CAGGG	2	10	20626	20635	20 %	0 %	60 %	20 %	241661642
19	NC_012856	CGCGG	2	10	21938	21947	0 %	0 %	60 %	40 %	241661643
20	NC_012856	GCGCC	2	10	22149	22158	0 %	0 %	40 %	60 %	241661643
21	NC_012856	TCAGC	2	10	23050	23059	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_012856	GTTGT	2	10	23571	23580	0 %	60 %	40 %	0 %	241661644
23	NC_012856	TGCCG	2	10	23975	23984	0 %	20 %	40 %	40 %	241661644
24	NC_012856	TCGGT	2	10	26829	26838	0 %	40 %	40 %	20 %	241661647
25	NC_012856	GGCCG	2	10	30860	30869	0 %	0 %	60 %	40 %	241661650
26	NC_012856	CGCAG	2	10	30913	30922	20 %	0 %	40 %	40 %	241661650
27	NC_012856	GATGT	2	10	32526	32535	20 %	40 %	40 %	0 %	241661651
28	NC_012856	GGATT	2	10	33989	33998	20 %	40 %	40 %	0 %	241661652
29	NC_012856	ACGCA	2	10	37193	37202	40 %	0 %	20 %	40 %	241661655
30	NC_012856	CGCGT	2	10	38903	38912	0 %	20 %	40 %	40 %	241661657
31	NC_012856	GCGCG	2	10	38970	38979	0 %	0 %	60 %	40 %	241661657
32	NC_012856	TCGCA	2	10	39966	39975	20 %	20 %	20 %	40 %	241661658
33	NC_012856	CCGCC	2	10	40781	40790	0 %	0 %	20 %	80 %	241661659
34	NC_012856	CCAGC	2	10	44158	44167	20 %	0 %	20 %	60 %	241661663
35	NC_012856	GTGGC	2	10	46631	46640	0 %	20 %	60 %	20 %	241661666
36	NC_012856	GACGT	2	10	47065	47074	20 %	20 %	40 %	20 %	241661666
37	NC_012856	GCGCG	2	10	47531	47540	0 %	0 %	60 %	40 %	241661667
38	NC_012856	GCATC	2	10	50263	50272	20 %	20 %	20 %	40 %	241661669
39	NC_012856	GCCGC	2	10	50634	50643	0 %	0 %	40 %	60 %	241661669
40	NC_012856	GGCGC	2	10	51882	51891	0 %	0 %	60 %	40 %	241661671
41	NC_012856	AAATC	2	10	54585	54594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012856	GGCGC	2	10	55459	55468	0 %	0 %	60 %	40 %	241661674
43	NC_012856	GCGCA	2	10	55996	56005	20 %	0 %	40 %	40 %	241661675
44	NC_012856	GCTGC	2	10	56305	56314	0 %	20 %	40 %	40 %	241661675
45	NC_012856	GCTGC	2	10	57257	57266	0 %	20 %	40 %	40 %	241661676
46	NC_012856	ACGCG	2	10	57335	57344	20 %	0 %	40 %	40 %	241661676
47	NC_012856	CGCCA	2	10	59098	59107	20 %	0 %	20 %	60 %	241661678
48	NC_012856	CGCTC	2	10	59760	59769	0 %	20 %	20 %	60 %	241661679
49	NC_012856	ATCTG	2	10	61710	61719	20 %	40 %	20 %	20 %	241661681
50	NC_012856	CCAAC	2	10	63142	63151	40 %	0 %	0 %	60 %	241661682
51	NC_012856	CTTTC	2	10	64646	64655	0 %	60 %	0 %	40 %	241661684
52	NC_012856	CGAGC	2	10	66656	66665	20 %	0 %	40 %	40 %	241661687
53	NC_012856	GCTGA	2	10	67061	67070	20 %	20 %	40 %	20 %	241661687
54	NC_012856	TGGAT	2	10	68596	68605	20 %	40 %	40 %	0 %	241661687
55	NC_012856	CGGCA	2	10	69533	69542	20 %	0 %	40 %	40 %	241661689
56	NC_012856	CCGCG	2	10	73441	73450	0 %	0 %	40 %	60 %	241661691
57	NC_012856	ACGTC	2	10	73470	73479	20 %	20 %	20 %	40 %	241661691
58	NC_012856	CTTCG	2	10	74419	74428	0 %	40 %	20 %	40 %	241661692
59	NC_012856	CGACC	2	10	75389	75398	20 %	0 %	20 %	60 %	241661693
60	NC_012856	CCCCA	2	10	76462	76471	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_012856	GGCGT	2	10	77687	77696	0 %	20 %	60 %	20 %	241661694
62	NC_012856	TGCGC	2	10	77794	77803	0 %	20 %	40 %	40 %	241661694
63	NC_012856	CGTGG	2	10	78678	78687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012856	GCCAC	2	10	78947	78956	20 %	0 %	20 %	60 %	241661695
65	NC_012856	GCTGG	2	10	80485	80494	0 %	20 %	60 %	20 %	241661697
66	NC_012856	CGGCG	2	10	80767	80776	0 %	0 %	60 %	40 %	241661697
67	NC_012856	ATGCC	2	10	81508	81517	20 %	20 %	20 %	40 %	241661698
68	NC_012856	TGGAG	2	10	82241	82250	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012856	TGCCG	2	10	82433	82442	0 %	20 %	40 %	40 %	241661699
70	NC_012856	GCTCG	2	10	83389	83398	0 %	20 %	40 %	40 %	241661699
71	NC_012856	CGAGC	2	10	83913	83922	20 %	0 %	40 %	40 %	241661699
72	NC_012856	CCCGG	2	10	83954	83963	0 %	0 %	40 %	60 %	241661699
73	NC_012856	TGCCG	2	10	85196	85205	0 %	20 %	40 %	40 %	241661701
74	NC_012856	CCGAC	2	10	85315	85324	20 %	0 %	20 %	60 %	241661701
75	NC_012856	CACCG	2	10	87766	87775	20 %	0 %	20 %	60 %	241661705
76	NC_012856	GCCCG	2	10	88086	88095	0 %	0 %	40 %	60 %	241661706
77	NC_012856	CGCAA	2	10	88335	88344	40 %	0 %	20 %	40 %	241661707
78	NC_012856	GCCCG	2	10	89173	89182	0 %	0 %	40 %	60 %	241661708
79	NC_012856	GCCGG	2	10	89653	89662	0 %	0 %	60 %	40 %	241661708
80	NC_012856	TCGCT	2	10	92504	92513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012856	AGCGA	2	10	94077	94086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012856	ACCCC	2	10	94276	94285	20 %	0 %	0 %	80 %	241661712
83	NC_012856	AGGGC	2	10	94792	94801	20 %	0 %	60 %	20 %	241661712
84	NC_012856	CGCGC	2	10	95170	95179	0 %	0 %	40 %	60 %	241661712
85	NC_012856	CATGC	2	10	95621	95630	20 %	20 %	20 %	40 %	241661713
86	NC_012856	CGCGG	2	10	96528	96537	0 %	0 %	60 %	40 %	241661714
87	NC_012856	GCTGG	2	10	98824	98833	0 %	20 %	60 %	20 %	241661716
88	NC_012856	GCGTG	2	10	100569	100578	0 %	20 %	60 %	20 %	241661717
89	NC_012856	TGACC	2	10	101480	101489	20 %	20 %	20 %	40 %	241661717
90	NC_012856	TCATC	2	10	103431	103440	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_012856	CCGCC	2	10	104239	104248	0 %	0 %	20 %	80 %	241661718
92	NC_012856	GCCCG	2	10	104992	105001	0 %	0 %	40 %	60 %	241661719
93	NC_012856	CGCCC	2	10	108362	108371	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
94	NC_012856	GCGGT	2	10	110839	110848	0 %	20 %	60 %	20 %	241661725
95	NC_012856	ACGCC	2	10	112383	112392	20 %	0 %	20 %	60 %	241661727
96	NC_012856	CGCGG	2	10	113875	113884	0 %	0 %	60 %	40 %	241661729
97	NC_012856	CATGG	2	10	113965	113974	20 %	20 %	40 %	20 %	241661729
98	NC_012856	GGCCG	2	10	114124	114133	0 %	0 %	60 %	40 %	241661729
99	NC_012856	CCGTT	2	10	114524	114533	0 %	40 %	20 %	40 %	241661730
100	NC_012856	GGCGC	2	10	115404	115413	0 %	0 %	60 %	40 %	241661730
101	NC_012856	GCCCA	2	10	115758	115767	20 %	0 %	20 %	60 %	241661730
102	NC_012856	CGTCA	2	10	115806	115815	20 %	20 %	20 %	40 %	241661730
103	NC_012856	CCGCC	2	10	115982	115991	0 %	0 %	20 %	80 %	241661730
104	NC_012856	GCCGC	2	10	115993	116002	0 %	0 %	40 %	60 %	241661730
105	NC_012856	GCCGC	2	10	117218	117227	0 %	0 %	40 %	60 %	241661731
106	NC_012856	TCGCT	2	10	119602	119611	0 %	40 %	20 %	40 %	241661733
107	NC_012856	GTGAA	2	10	120403	120412	40 %	20 %	40 %	0 %	241661733
108	NC_012856	TTCGG	2	10	123361	123370	0 %	40 %	40 %	20 %	241661736
109	NC_012856	GCCGC	2	10	126121	126130	0 %	0 %	40 %	60 %	241661737
110	NC_012856	GAAGA	2	10	128581	128590	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012856	GCGTT	2	10	128860	128869	0 %	40 %	40 %	20 %	241661740
112	NC_012856	CGGGG	2	10	133648	133657	0 %	0 %	80 %	20 %	241661745
113	NC_012856	AGCGA	2	10	134865	134874	40 %	0 %	40 %	20 %	241661746
114	NC_012856	GCTTC	2	10	136560	136569	0 %	40 %	20 %	40 %	241661748
115	NC_012856	ACAGC	2	10	138455	138464	40 %	0 %	20 %	40 %	241661750
116	NC_012856	GCAGG	2	10	139130	139139	20 %	0 %	60 %	20 %	241661750
117	NC_012856	CGGCG	2	10	139286	139295	0 %	0 %	60 %	40 %	241661750
118	NC_012856	CGGGC	2	10	140090	140099	0 %	0 %	60 %	40 %	241661752
119	NC_012856	GTTGA	2	10	140318	140327	20 %	40 %	40 %	0 %	241661752
120	NC_012856	AGCGA	2	10	144977	144986	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012856	TTCCC	2	10	144991	145000	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_012856	CGCTG	2	10	146440	146449	0 %	20 %	40 %	40 %	241661758
123	NC_012856	GTATT	2	10	149154	149163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012856	GCCGC	2	10	150794	150803	0 %	0 %	40 %	60 %	241661761
125	NC_012856	GGTGT	2	10	152252	152261	0 %	40 %	60 %	0 %	241661763
126	NC_012856	CTGCG	2	10	153027	153036	0 %	20 %	40 %	40 %	241661764
127	NC_012856	GCGCG	2	10	153363	153372	0 %	0 %	60 %	40 %	241661765
128	NC_012856	CCTTG	2	10	153642	153651	0 %	40 %	20 %	40 %	241661765
129	NC_012856	GGCGT	2	10	153791	153800	0 %	20 %	60 %	20 %	241661765
130	NC_012856	TCATC	2	10	154099	154108	20 %	40 %	0 %	40 %	241661766
131	NC_012856	ACGCA	2	10	158700	158709	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_012856	CATGC	2	10	158747	158756	20 %	20 %	20 %	40 %	241661772
133	NC_012856	TTGCC	2	10	160758	160767	0 %	40 %	20 %	40 %	241661774
134	NC_012856	TGCGC	2	10	161707	161716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012856	TGTAA	2	10	162518	162527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012856	GGCCT	2	10	164878	164887	0 %	20 %	40 %	40 %	241661777
137	NC_012856	TTGGG	2	10	165590	165599	0 %	40 %	60 %	0 %	241661778
138	NC_012856	TTGGC	2	10	165710	165719	0 %	40 %	40 %	20 %	241661778
139	NC_012856	TGCTC	2	10	166570	166579	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_012856	GGCAA	2	10	167656	167665	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012856	GCCCG	2	10	171909	171918	0 %	0 %	40 %	60 %	241661785
142	NC_012856	GGCGT	2	10	172411	172420	0 %	20 %	60 %	20 %	241661785
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148	NC_012856	ACTGC	2	10	176682	176691	20 %	20 %	20 %	40 %	241661790
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150	NC_012856	GTCCG	2	10	178717	178726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012856	GCTCG	2	10	179785	179794	0 %	20 %	40 %	40 %	241661792
152	NC_012856	TCGAT	2	10	179840	179849	20 %	40 %	20 %	20 %	241661793
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159	NC_012856	GCTGG	2	10	182970	182979	0 %	20 %	60 %	20 %	241661796
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170	NC_012856	TGGCC	2	10	199007	199016	0 %	20 %	40 %	40 %	241661811
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172	NC_012856	GCGGG	2	10	199829	199838	0 %	0 %	80 %	20 %	241661811
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179	NC_012856	CTGGC	2	10	206004	206013	0 %	20 %	40 %	40 %	241661816
180	NC_012856	CGTTT	2	10	207166	207175	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
181	NC_012856	GCGTC	2	10	207818	207827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_012856	GCACG	2	10	208206	208215	20 %	0 %	40 %	40 %	241661819
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199	NC_012856	TCTTG	2	10	227576	227585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_012856	GTGTG	2	10	227720	227729	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
201	NC_012856	CCGCA	2	10	229963	229972	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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212	NC_012856	GGAAG	2	10	243262	243271	40 %	0 %	60 %	0 %	241661849
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216	NC_012856	GCGCA	2	10	247752	247761	20 %	0 %	40 %	40 %	241661855
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233	NC_012856	TGCCG	2	10	269159	269168	0 %	20 %	40 %	40 %	241661876
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242	NC_012856	CGGTG	2	10	283343	283352	0 %	20 %	60 %	20 %	241661890
243	NC_012856	CAACG	2	10	283495	283504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
244	NC_012856	GTGAG	2	10	285082	285091	20 %	20 %	60 %	0 %	241661893
245	NC_012856	GTCGC	2	10	285679	285688	0 %	20 %	40 %	40 %	241661894
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247	NC_012856	ACGCT	2	10	286505	286514	20 %	20 %	20 %	40 %	241661895
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249	NC_012856	GCGGG	2	10	288931	288940	0 %	0 %	80 %	20 %	241661898
250	NC_012856	TGGCC	2	10	289720	289729	0 %	20 %	40 %	40 %	241661899
251	NC_012856	CGTGT	2	10	292181	292190	0 %	40 %	40 %	20 %	241661900
252	NC_012856	GGTCG	2	10	292521	292530	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_012856	CGCGC	3	15	294621	294635	0 %	0 %	40 %	60 %	241661902
254	NC_012856	CGATG	2	10	296977	296986	20 %	20 %	40 %	20 %	241661904
255	NC_012856	GCAGC	2	10	298679	298688	20 %	0 %	40 %	40 %	241661906
256	NC_012856	CGCGC	2	10	299610	299619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_012856	GTTTC	2	10	300168	300177	0 %	60 %	20 %	20 %	241661908
258	NC_012856	AGGTC	2	10	303721	303730	20 %	20 %	40 %	20 %	241661912
259	NC_012856	CCGCG	2	10	304088	304097	0 %	0 %	40 %	60 %	241661913
260	NC_012856	GCTTG	2	10	305640	305649	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_012856	CACGC	2	10	310283	310292	20 %	0 %	20 %	60 %	241661919
262	NC_012856	TGCGC	2	10	312310	312319	0 %	20 %	40 %	40 %	241661921
263	NC_012856	TAGGT	2	10	315894	315903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_012856	CCCGG	2	10	316735	316744	0 %	0 %	40 %	60 %	241661924
265	NC_012856	CGGCG	2	10	317589	317598	0 %	0 %	60 %	40 %	241661924
266	NC_012856	ACAGC	2	10	317966	317975	40 %	0 %	20 %	40 %	241661924
267	NC_012856	CGTCA	2	10	319645	319654	20 %	20 %	20 %	40 %	241661927
268	NC_012856	TGGCT	2	10	320383	320392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_012856	GGCGT	2	10	323570	323579	0 %	20 %	60 %	20 %	241661932
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401	NC_012856	CTCCC	2	10	483559	483568	0 %	20 %	0 %	80 %	241662075
402	NC_012856	CAAGG	2	10	484257	484266	40 %	0 %	40 %	20 %	241662076
403	NC_012856	CCTTG	2	10	486724	486733	0 %	40 %	20 %	40 %	241662078
404	NC_012856	CCGAT	2	10	487089	487098	20 %	20 %	20 %	40 %	241662078
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426	NC_012856	TGCAT	2	10	505622	505631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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439	NC_012856	CGTGC	2	10	515332	515341	0 %	20 %	40 %	40 %	241662106
440	NC_012856	GCGGG	2	10	515874	515883	0 %	0 %	80 %	20 %	241662107
441	NC_012856	CAGCG	2	10	516224	516233	20 %	0 %	40 %	40 %	241662107
442	NC_012856	CGCGT	2	10	517856	517865	0 %	20 %	40 %	40 %	241662108
443	NC_012856	CGGTC	2	10	517934	517943	0 %	20 %	40 %	40 %	241662108
444	NC_012856	ATTTG	2	10	518231	518240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_012856	CGCGG	2	10	526218	526227	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
452	NC_012856	CGAGC	2	10	526543	526552	20 %	0 %	40 %	40 %	241662115
453	NC_012856	AGGCC	2	10	527250	527259	20 %	0 %	40 %	40 %	241662115
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498	NC_012856	TGGCT	2	10	573058	573067	0 %	40 %	40 %	20 %	241662157
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