MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 2659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012856	CGACC	2	10	849	858	20 %	0 %	20 %	60 %	241661626
2	NC_012856	GCCGC	2	10	1141	1150	0 %	0 %	40 %	60 %	241661626
3	NC_012856	ACCAC	2	10	2096	2105	40 %	0 %	0 %	60 %	241661626
4	NC_012856	AGCGC	2	10	4030	4039	20 %	0 %	40 %	40 %	241661628
5	NC_012856	AGTTC	2	10	4810	4819	20 %	40 %	20 %	20 %	241661628
6	NC_012856	CTCGT	2	10	4836	4845	0 %	40 %	20 %	40 %	241661628
7	NC_012856	ATGCG	2	10	8745	8754	20 %	20 %	40 %	20 %	241661630
8	NC_012856	ACTTC	2	10	9066	9075	20 %	40 %	0 %	40 %	241661630
9	NC_012856	CGGTG	2	10	9990	9999	0 %	20 %	60 %	20 %	241661631
10	NC_012856	GAGGT	2	10	11553	11562	20 %	20 %	60 %	0 %	241661632
11	NC_012856	GAGGT	2	10	11606	11615	20 %	20 %	60 %	0 %	241661632
12	NC_012856	ATCGA	2	10	11912	11921	40 %	20 %	20 %	20 %	241661632
13	NC_012856	CGCAG	2	10	12561	12570	20 %	0 %	40 %	40 %	241661633
14	NC_012856	ATTCA	2	10	13723	13732	40 %	40 %	0 %	20 %	241661634
15	NC_012856	TCGCC	2	10	15466	15475	0 %	20 %	20 %	60 %	241661635
16	NC_012856	CGAGC	2	10	19586	19595	20 %	0 %	40 %	40 %	241661640
17	NC_012856	CAGGG	2	10	20626	20635	20 %	0 %	60 %	20 %	241661642
18	NC_012856	CGCGG	2	10	21938	21947	0 %	0 %	60 %	40 %	241661643
19	NC_012856	GCGCC	2	10	22149	22158	0 %	0 %	40 %	60 %	241661643
20	NC_012856	GTTGT	2	10	23571	23580	0 %	60 %	40 %	0 %	241661644
21	NC_012856	TGCCG	2	10	23975	23984	0 %	20 %	40 %	40 %	241661644
22	NC_012856	TCGGT	2	10	26829	26838	0 %	40 %	40 %	20 %	241661647
23	NC_012856	GGCCG	2	10	30860	30869	0 %	0 %	60 %	40 %	241661650
24	NC_012856	CGCAG	2	10	30913	30922	20 %	0 %	40 %	40 %	241661650
25	NC_012856	GATGT	2	10	32526	32535	20 %	40 %	40 %	0 %	241661651
26	NC_012856	GGATT	2	10	33989	33998	20 %	40 %	40 %	0 %	241661652
27	NC_012856	ACGCA	2	10	37193	37202	40 %	0 %	20 %	40 %	241661655
28	NC_012856	CGCGT	2	10	38903	38912	0 %	20 %	40 %	40 %	241661657
29	NC_012856	GCGCG	2	10	38970	38979	0 %	0 %	60 %	40 %	241661657
30	NC_012856	TCGCA	2	10	39966	39975	20 %	20 %	20 %	40 %	241661658
31	NC_012856	CCGCC	2	10	40781	40790	0 %	0 %	20 %	80 %	241661659
32	NC_012856	CCAGC	2	10	44158	44167	20 %	0 %	20 %	60 %	241661663
33	NC_012856	GTGGC	2	10	46631	46640	0 %	20 %	60 %	20 %	241661666
34	NC_012856	GACGT	2	10	47065	47074	20 %	20 %	40 %	20 %	241661666
35	NC_012856	GCGCG	2	10	47531	47540	0 %	0 %	60 %	40 %	241661667
36	NC_012856	GCATC	2	10	50263	50272	20 %	20 %	20 %	40 %	241661669
37	NC_012856	GCCGC	2	10	50634	50643	0 %	0 %	40 %	60 %	241661669
38	NC_012856	GGCGC	2	10	51882	51891	0 %	0 %	60 %	40 %	241661671
39	NC_012856	GGCGC	2	10	55459	55468	0 %	0 %	60 %	40 %	241661674
40	NC_012856	GCGCA	2	10	55996	56005	20 %	0 %	40 %	40 %	241661675
41	NC_012856	GCTGC	2	10	56305	56314	0 %	20 %	40 %	40 %	241661675
42	NC_012856	GCTGC	2	10	57257	57266	0 %	20 %	40 %	40 %	241661676
43	NC_012856	ACGCG	2	10	57335	57344	20 %	0 %	40 %	40 %	241661676
44	NC_012856	CGCCA	2	10	59098	59107	20 %	0 %	20 %	60 %	241661678
45	NC_012856	CGCTC	2	10	59760	59769	0 %	20 %	20 %	60 %	241661679
46	NC_012856	ATCTG	2	10	61710	61719	20 %	40 %	20 %	20 %	241661681
47	NC_012856	CCAAC	2	10	63142	63151	40 %	0 %	0 %	60 %	241661682
48	NC_012856	CTTTC	2	10	64646	64655	0 %	60 %	0 %	40 %	241661684
49	NC_012856	CGAGC	2	10	66656	66665	20 %	0 %	40 %	40 %	241661687
50	NC_012856	GCTGA	2	10	67061	67070	20 %	20 %	40 %	20 %	241661687
51	NC_012856	TGGAT	2	10	68596	68605	20 %	40 %	40 %	0 %	241661687
52	NC_012856	CGGCA	2	10	69533	69542	20 %	0 %	40 %	40 %	241661689
53	NC_012856	CCGCG	2	10	73441	73450	0 %	0 %	40 %	60 %	241661691
54	NC_012856	ACGTC	2	10	73470	73479	20 %	20 %	20 %	40 %	241661691
55	NC_012856	CTTCG	2	10	74419	74428	0 %	40 %	20 %	40 %	241661692
56	NC_012856	CGACC	2	10	75389	75398	20 %	0 %	20 %	60 %	241661693
57	NC_012856	GGCGT	2	10	77687	77696	0 %	20 %	60 %	20 %	241661694
58	NC_012856	TGCGC	2	10	77794	77803	0 %	20 %	40 %	40 %	241661694
59	NC_012856	GCCAC	2	10	78947	78956	20 %	0 %	20 %	60 %	241661695
60	NC_012856	GCTGG	2	10	80485	80494	0 %	20 %	60 %	20 %	241661697
61	NC_012856	CGGCG	2	10	80767	80776	0 %	0 %	60 %	40 %	241661697
62	NC_012856	ATGCC	2	10	81508	81517	20 %	20 %	20 %	40 %	241661698
63	NC_012856	TGCCG	2	10	82433	82442	0 %	20 %	40 %	40 %	241661699
64	NC_012856	GCTCG	2	10	83389	83398	0 %	20 %	40 %	40 %	241661699
65	NC_012856	CGAGC	2	10	83913	83922	20 %	0 %	40 %	40 %	241661699
66	NC_012856	CCCGG	2	10	83954	83963	0 %	0 %	40 %	60 %	241661699
67	NC_012856	TGCCG	2	10	85196	85205	0 %	20 %	40 %	40 %	241661701
68	NC_012856	CCGAC	2	10	85315	85324	20 %	0 %	20 %	60 %	241661701
69	NC_012856	CACCG	2	10	87766	87775	20 %	0 %	20 %	60 %	241661705
70	NC_012856	GCCCG	2	10	88086	88095	0 %	0 %	40 %	60 %	241661706
71	NC_012856	CGCAA	2	10	88335	88344	40 %	0 %	20 %	40 %	241661707
72	NC_012856	GCCCG	2	10	89173	89182	0 %	0 %	40 %	60 %	241661708
73	NC_012856	GCCGG	2	10	89653	89662	0 %	0 %	60 %	40 %	241661708
74	NC_012856	ACCCC	2	10	94276	94285	20 %	0 %	0 %	80 %	241661712
75	NC_012856	AGGGC	2	10	94792	94801	20 %	0 %	60 %	20 %	241661712
76	NC_012856	CGCGC	2	10	95170	95179	0 %	0 %	40 %	60 %	241661712
77	NC_012856	CATGC	2	10	95621	95630	20 %	20 %	20 %	40 %	241661713
78	NC_012856	CGCGG	2	10	96528	96537	0 %	0 %	60 %	40 %	241661714
79	NC_012856	GCTGG	2	10	98824	98833	0 %	20 %	60 %	20 %	241661716
80	NC_012856	GCGTG	2	10	100569	100578	0 %	20 %	60 %	20 %	241661717
81	NC_012856	TGACC	2	10	101480	101489	20 %	20 %	20 %	40 %	241661717
82	NC_012856	CCGCC	2	10	104239	104248	0 %	0 %	20 %	80 %	241661718
83	NC_012856	GCCCG	2	10	104992	105001	0 %	0 %	40 %	60 %	241661719
84	NC_012856	GCGGT	2	10	110839	110848	0 %	20 %	60 %	20 %	241661725
85	NC_012856	ACGCC	2	10	112383	112392	20 %	0 %	20 %	60 %	241661727
86	NC_012856	CGCGG	2	10	113875	113884	0 %	0 %	60 %	40 %	241661729
87	NC_012856	CATGG	2	10	113965	113974	20 %	20 %	40 %	20 %	241661729
88	NC_012856	GGCCG	2	10	114124	114133	0 %	0 %	60 %	40 %	241661729
89	NC_012856	CCGTT	2	10	114524	114533	0 %	40 %	20 %	40 %	241661730
90	NC_012856	GGCGC	2	10	115404	115413	0 %	0 %	60 %	40 %	241661730
91	NC_012856	GCCCA	2	10	115758	115767	20 %	0 %	20 %	60 %	241661730
92	NC_012856	CGTCA	2	10	115806	115815	20 %	20 %	20 %	40 %	241661730
93	NC_012856	CCGCC	2	10	115982	115991	0 %	0 %	20 %	80 %	241661730
94	NC_012856	GCCGC	2	10	115993	116002	0 %	0 %	40 %	60 %	241661730
95	NC_012856	GCCGC	2	10	117218	117227	0 %	0 %	40 %	60 %	241661731
96	NC_012856	TCGCT	2	10	119602	119611	0 %	40 %	20 %	40 %	241661733
97	NC_012856	GTGAA	2	10	120403	120412	40 %	20 %	40 %	0 %	241661733
98	NC_012856	TTCGG	2	10	123361	123370	0 %	40 %	40 %	20 %	241661736
99	NC_012856	GCCGC	2	10	126121	126130	0 %	0 %	40 %	60 %	241661737
100	NC_012856	GCGTT	2	10	128860	128869	0 %	40 %	40 %	20 %	241661740
101	NC_012856	CGGGG	2	10	133648	133657	0 %	0 %	80 %	20 %	241661745
102	NC_012856	AGCGA	2	10	134865	134874	40 %	0 %	40 %	20 %	241661746
103	NC_012856	GCTTC	2	10	136560	136569	0 %	40 %	20 %	40 %	241661748
104	NC_012856	ACAGC	2	10	138455	138464	40 %	0 %	20 %	40 %	241661750
105	NC_012856	GCAGG	2	10	139130	139139	20 %	0 %	60 %	20 %	241661750
106	NC_012856	CGGCG	2	10	139286	139295	0 %	0 %	60 %	40 %	241661750
107	NC_012856	CGGGC	2	10	140090	140099	0 %	0 %	60 %	40 %	241661752
108	NC_012856	GTTGA	2	10	140318	140327	20 %	40 %	40 %	0 %	241661752
109	NC_012856	CGCTG	2	10	146440	146449	0 %	20 %	40 %	40 %	241661758
110	NC_012856	GCCGC	2	10	150794	150803	0 %	0 %	40 %	60 %	241661761
111	NC_012856	GGTGT	2	10	152252	152261	0 %	40 %	60 %	0 %	241661763
112	NC_012856	CTGCG	2	10	153027	153036	0 %	20 %	40 %	40 %	241661764
113	NC_012856	GCGCG	2	10	153363	153372	0 %	0 %	60 %	40 %	241661765
114	NC_012856	CCTTG	2	10	153642	153651	0 %	40 %	20 %	40 %	241661765
115	NC_012856	GGCGT	2	10	153791	153800	0 %	20 %	60 %	20 %	241661765
116	NC_012856	TCATC	2	10	154099	154108	20 %	40 %	0 %	40 %	241661766
117	NC_012856	CATGC	2	10	158747	158756	20 %	20 %	20 %	40 %	241661772
118	NC_012856	TTGCC	2	10	160758	160767	0 %	40 %	20 %	40 %	241661774
119	NC_012856	GGCCT	2	10	164878	164887	0 %	20 %	40 %	40 %	241661777
120	NC_012856	TTGGG	2	10	165590	165599	0 %	40 %	60 %	0 %	241661778
121	NC_012856	TTGGC	2	10	165710	165719	0 %	40 %	40 %	20 %	241661778
122	NC_012856	GCCCG	2	10	171909	171918	0 %	0 %	40 %	60 %	241661785
123	NC_012856	GGCGT	2	10	172411	172420	0 %	20 %	60 %	20 %	241661785
124	NC_012856	GCTGC	2	10	174346	174355	0 %	20 %	40 %	40 %	241661787
125	NC_012856	CGGCC	2	10	175259	175268	0 %	0 %	40 %	60 %	241661788
126	NC_012856	GCCGC	2	10	175895	175904	0 %	0 %	40 %	60 %	241661789
127	NC_012856	GCCCA	2	10	176516	176525	20 %	0 %	20 %	60 %	241661789
128	NC_012856	ACTGC	2	10	176682	176691	20 %	20 %	20 %	40 %	241661790
129	NC_012856	ACGTT	2	10	177150	177159	20 %	40 %	20 %	20 %	241661790
130	NC_012856	GCTCG	2	10	179785	179794	0 %	20 %	40 %	40 %	241661792
131	NC_012856	TCGAT	2	10	179840	179849	20 %	40 %	20 %	20 %	241661793
132	NC_012856	GTTTT	2	10	179855	179864	0 %	80 %	20 %	0 %	241661793
133	NC_012856	GGCGA	2	10	181151	181160	20 %	0 %	60 %	20 %	241661794
134	NC_012856	CAGCG	2	10	181375	181384	20 %	0 %	40 %	40 %	241661795
135	NC_012856	GCCGG	2	10	181880	181889	0 %	0 %	60 %	40 %	241661795
136	NC_012856	CTGCG	2	10	182165	182174	0 %	20 %	40 %	40 %	241661796
137	NC_012856	CAGGC	2	10	182876	182885	20 %	0 %	40 %	40 %	241661796
138	NC_012856	GCTGG	2	10	182970	182979	0 %	20 %	60 %	20 %	241661796
139	NC_012856	GCCCG	2	10	183465	183474	0 %	0 %	40 %	60 %	241661797
140	NC_012856	GATGC	2	10	183942	183951	20 %	20 %	40 %	20 %	241661797
141	NC_012856	TCCGA	2	10	185896	185905	20 %	20 %	20 %	40 %	241661799
142	NC_012856	CGCCT	2	10	186412	186421	0 %	20 %	20 %	60 %	241661800
143	NC_012856	GCGCG	2	10	187928	187937	0 %	0 %	60 %	40 %	241661801
144	NC_012856	GCTGC	2	10	188331	188340	0 %	20 %	40 %	40 %	241661802
145	NC_012856	GTGTC	2	10	190437	190446	0 %	40 %	40 %	20 %	241661803
146	NC_012856	CGCAG	2	10	191264	191273	20 %	0 %	40 %	40 %	241661803
147	NC_012856	CGTCG	2	10	195916	195925	0 %	20 %	40 %	40 %	241661806
148	NC_012856	TGGCC	2	10	199007	199016	0 %	20 %	40 %	40 %	241661811
149	NC_012856	GGTCG	2	10	199260	199269	0 %	20 %	60 %	20 %	241661811
150	NC_012856	GCGGG	2	10	199829	199838	0 %	0 %	80 %	20 %	241661811
151	NC_012856	GACCG	2	10	200855	200864	20 %	0 %	40 %	40 %	241661813
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154	NC_012856	ACGCG	2	10	203833	203842	20 %	0 %	40 %	40 %	241661815
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156	NC_012856	CGGCT	2	10	205735	205744	0 %	20 %	40 %	40 %	241661816
157	NC_012856	CTGGC	2	10	206004	206013	0 %	20 %	40 %	40 %	241661816
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165	NC_012856	GTCGG	2	10	215878	215887	0 %	20 %	60 %	20 %	241661826
166	NC_012856	GAAGC	2	10	216438	216447	40 %	0 %	40 %	20 %	241661826
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168	NC_012856	CAGAG	2	10	218009	218018	40 %	0 %	40 %	20 %	241661828
169	NC_012856	GCGCC	2	10	218989	218998	0 %	0 %	40 %	60 %	241661828
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171	NC_012856	AGCTG	2	10	219981	219990	20 %	20 %	40 %	20 %	241661828
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174	NC_012856	CGCGG	2	10	231258	231267	0 %	0 %	60 %	40 %	241661837
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177	NC_012856	GGACT	2	10	234161	234170	20 %	20 %	40 %	20 %	241661839
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179	NC_012856	CGTAC	2	10	237564	237573	20 %	20 %	20 %	40 %	241661843
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189	NC_012856	CGTCG	2	10	251237	251246	0 %	20 %	40 %	40 %	241661858
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261	NC_012856	CTGGT	2	10	363646	363655	0 %	40 %	40 %	20 %	241661969
262	NC_012856	GTTCG	2	10	366230	366239	0 %	40 %	40 %	20 %	241661971
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394	NC_012856	TCCGA	2	10	532277	532286	20 %	20 %	20 %	40 %	241662120
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