MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 1

Total Repeats: 61574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012856	GTG	2	6	5	10	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012856	CCG	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012856	TGT	2	6	104	109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012856	CGA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012856	CTG	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012856	CCG	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012856	CAG	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012856	CGG	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012856	TCA	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012856	GCG	2	6	631	636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661626
11	NC_012856	CGC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
12	NC_012856	CGC	2	6	698	703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
13	NC_012856	ACT	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661626
14	NC_012856	GGC	2	6	873	878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661626
15	NC_012856	GCC	3	9	1042	1050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
16	NC_012856	CGC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
17	NC_012856	GCC	2	6	1107	1112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
18	NC_012856	CCG	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
19	NC_012856	GCC	2	6	1255	1260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
20	NC_012856	CAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661626
21	NC_012856	CTA	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661626
22	NC_012856	CTG	3	9	1489	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661626
23	NC_012856	TTC	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661626
24	NC_012856	GAA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661626
25	NC_012856	TTC	2	6	1546	1551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661626
26	NC_012856	TCA	3	9	1589	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661626
27	NC_012856	CGA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661626
28	NC_012856	GCC	2	6	1683	1688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661626
29	NC_012856	TGA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661626
30	NC_012856	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661626
31	NC_012856	CTG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661626
32	NC_012856	AGA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661626
33	NC_012856	ACA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661626
34	NC_012856	AAG	2	6	1987	1992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661626
35	NC_012856	AGA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661626
36	NC_012856	CGG	2	6	2085	2090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661626
37	NC_012856	TGC	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661626
38	NC_012856	CGA	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661626
39	NC_012856	CAG	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012856	ACA	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012856	CTG	2	6	2509	2514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
42	NC_012856	CTG	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
43	NC_012856	CAC	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661627
44	NC_012856	GCG	2	6	2657	2662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661627
45	NC_012856	CCA	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661627
46	NC_012856	GCC	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661627
47	NC_012856	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661627
48	NC_012856	AGA	2	6	2876	2881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661627
49	NC_012856	CTG	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
50	NC_012856	TAC	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661627
51	NC_012856	TGC	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
52	NC_012856	TGG	3	9	2960	2968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661627
53	NC_012856	GCG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661627
54	NC_012856	CGG	2	6	3054	3059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661627
55	NC_012856	TCA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661627
56	NC_012856	CTG	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
57	NC_012856	GCA	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661627
58	NC_012856	ACC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661627
59	NC_012856	CCA	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661627
60	NC_012856	GAA	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661627
61	NC_012856	GAA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661627
62	NC_012856	TCA	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661627
63	NC_012856	GAC	3	9	3550	3558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661627
64	NC_012856	CGT	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661627
65	NC_012856	CCG	2	6	3754	3759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
66	NC_012856	CGC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
67	NC_012856	CAC	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661628
68	NC_012856	CGA	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
69	NC_012856	GAC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
70	NC_012856	GGC	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661628
71	NC_012856	TGG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661628
72	NC_012856	CGC	2	6	4276	4281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
73	NC_012856	CAC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661628
74	NC_012856	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661628
75	NC_012856	CGA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
76	NC_012856	AAC	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661628
77	NC_012856	GAA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661628
78	NC_012856	GCG	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661628
79	NC_012856	CAA	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661628
80	NC_012856	TGC	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
81	NC_012856	TCT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661628
82	NC_012856	GCC	2	6	4545	4550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
83	NC_012856	ACG	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
84	NC_012856	CAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661628
85	NC_012856	CGG	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661628
86	NC_012856	TCA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
87	NC_012856	AAG	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661628
88	NC_012856	CGA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
89	NC_012856	GAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661628
90	NC_012856	GTC	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
91	NC_012856	CTG	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
92	NC_012856	ATC	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
93	NC_012856	GCC	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
94	NC_012856	CGC	2	6	4995	5000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
95	NC_012856	TCG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
96	NC_012856	TCA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
97	NC_012856	GAC	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
98	NC_012856	ACC	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661628
99	NC_012856	CAT	4	12	5294	5305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
100	NC_012856	GCT	3	9	5342	5350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
101	NC_012856	TTC	2	6	5355	5360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661628
102	NC_012856	ATC	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
103	NC_012856	GCC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
104	NC_012856	AGG	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241661628
105	NC_012856	GAC	2	6	5460	5465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
106	NC_012856	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
107	NC_012856	CCG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
108	NC_012856	CAG	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
109	NC_012856	CGG	2	6	5750	5755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661628
110	NC_012856	ACG	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
111	NC_012856	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661628
112	NC_012856	CAT	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661628
113	NC_012856	GTC	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
114	NC_012856	CGC	2	6	5820	5825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
115	NC_012856	CCG	2	6	5902	5907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
116	NC_012856	CGC	2	6	5996	6001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
117	NC_012856	GCT	2	6	6011	6016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
118	NC_012856	GCG	2	6	6031	6036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661628
119	NC_012856	GCC	2	6	6040	6045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
120	NC_012856	AGC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
121	NC_012856	ACC	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661628
122	NC_012856	GCC	2	6	6115	6120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661628
123	NC_012856	TGC	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661628
124	NC_012856	CAC	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661628
125	NC_012856	CGA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661628
126	NC_012856	TGG	2	6	6226	6231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661628
127	NC_012856	CGT	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012856	GCC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012856	GAA	2	6	6357	6362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012856	GTC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012856	GCG	2	6	6427	6432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661629
132	NC_012856	TCT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661629
133	NC_012856	TGG	2	6	6568	6573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661629
134	NC_012856	GCA	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661629
135	NC_012856	AGC	2	6	6637	6642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661629
136	NC_012856	CAT	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661629
137	NC_012856	AAG	3	9	6711	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661629
138	NC_012856	ACC	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661629
139	NC_012856	AAG	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661629
140	NC_012856	AAG	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241661629
141	NC_012856	TTG	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661629
142	NC_012856	TTC	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661629
143	NC_012856	GCG	2	6	7078	7083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661629
144	NC_012856	GCT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012856	GCG	2	6	7326	7331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012856	GCC	2	6	7335	7340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_012856	AGC	2	6	7374	7379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012856	ACC	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_012856	GCC	2	6	7410	7415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_012856	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_012856	CAC	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_012856	CGA	2	6	7477	7482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012856	TGG	2	6	7521	7526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012856	CAG	2	6	7676	7681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661630
155	NC_012856	TCG	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661630
156	NC_012856	GGT	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661630
157	NC_012856	GAC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661630
158	NC_012856	CCA	2	6	7987	7992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241661630
159	NC_012856	TTG	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661630
160	NC_012856	GTG	2	6	8186	8191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661630
161	NC_012856	TGA	2	6	8227	8232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661630
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163	NC_012856	GCG	2	6	8302	8307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661630
164	NC_012856	TGA	2	6	8335	8340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661630
165	NC_012856	CGT	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661630
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167	NC_012856	GTT	2	6	8662	8667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241661630
168	NC_012856	TCA	2	6	8717	8722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661630
169	NC_012856	TGC	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661630
170	NC_012856	CGA	2	6	8920	8925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661630
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172	NC_012856	GCC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661630
173	NC_012856	TGA	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241661630
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179	NC_012856	ACG	2	6	9426	9431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661630
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226	NC_012856	GCG	2	6	12886	12891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
227	NC_012856	TGT	2	6	12955	12960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_012856	GGA	2	6	13259	13264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_012856	AAC	2	6	14271	14276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_012856	CGA	2	6	14283	14288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_012856	CGT	2	6	14418	14423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_012856	ACC	2	6	14609	14614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
244	NC_012856	TGC	2	6	14646	14651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_012856	TCC	2	6	14738	14743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241661635
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251	NC_012856	GTG	3	9	14915	14923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661635
252	NC_012856	CGC	2	6	15006	15011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661635
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259	NC_012856	GCA	2	6	15445	15450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241661635
260	NC_012856	CTT	2	6	15562	15567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241661636
261	NC_012856	GGC	2	6	15583	15588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661636
262	NC_012856	GCG	2	6	15599	15604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661636
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264	NC_012856	GCC	2	6	15615	15620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661636
265	NC_012856	CCG	2	6	15692	15697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661636
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270	NC_012856	ACA	2	6	16068	16073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241661636
271	NC_012856	TCG	2	6	16131	16136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661636
272	NC_012856	GCT	2	6	16237	16242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661636
273	NC_012856	TCA	2	6	16260	16265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241661636
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275	NC_012856	CCG	2	6	16486	16491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_012856	CGG	3	9	16583	16591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661637
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279	NC_012856	CGG	2	6	16787	16792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661637
280	NC_012856	CGC	2	6	16847	16852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661637
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286	NC_012856	GCC	2	6	17209	17214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241661637
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288	NC_012856	GCT	2	6	17282	17287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661638
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333	NC_012856	TGC	2	6	19710	19715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661641
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379	NC_012856	GGC	2	6	23117	23122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661644
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381	NC_012856	GGT	2	6	23153	23158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241661644
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383	NC_012856	CGG	2	6	23221	23226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241661644
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497	NC_012856	GCA	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_012856	GGC	2	6	29407	29412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_012856	GAG	2	6	29510	29515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_012856	GCT	2	6	29580	29585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241661649

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