MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 1127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012855	AGTC	2	8	265	272	25 %	25 %	25 %	25 %	241589534
2	NC_012855	CGGT	2	8	664	671	0 %	25 %	50 %	25 %	241589535
3	NC_012855	GACG	2	8	976	983	25 %	0 %	50 %	25 %	241589535
4	NC_012855	CTGG	2	8	2304	2311	0 %	25 %	50 %	25 %	241589536
5	NC_012855	TGCA	2	8	2399	2406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012855	GGCG	2	8	2420	2427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012855	AGTC	2	8	2601	2608	25 %	25 %	25 %	25 %	241589537
8	NC_012855	GCAA	2	8	2684	2691	50 %	0 %	25 %	25 %	241589537
9	NC_012855	CCAA	2	8	3605	3612	50 %	0 %	0 %	50 %	241589538
10	NC_012855	ACGG	2	8	3682	3689	25 %	0 %	50 %	25 %	241589538
11	NC_012855	CGGG	2	8	3942	3949	0 %	0 %	75 %	25 %	241589538
12	NC_012855	ACGA	2	8	4112	4119	50 %	0 %	25 %	25 %	241589539
13	NC_012855	GTGG	2	8	4141	4148	0 %	25 %	75 %	0 %	241589539
14	NC_012855	GACA	2	8	4589	4596	50 %	0 %	25 %	25 %	241589540
15	NC_012855	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	241589540
16	NC_012855	TGAG	2	8	4905	4912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012855	CCCG	2	8	5091	5098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_012855	AGCG	2	8	5563	5570	25 %	0 %	50 %	25 %	241589541
19	NC_012855	GAAG	2	8	5750	5757	50 %	0 %	50 %	0 %	241589541
20	NC_012855	TCGC	2	8	5923	5930	0 %	25 %	25 %	50 %	241589541
21	NC_012855	GAAA	2	8	6320	6327	75 %	0 %	25 %	0 %	241589541
22	NC_012855	GCCG	2	8	6779	6786	0 %	0 %	50 %	50 %	241589541
23	NC_012855	GATC	2	8	7778	7785	25 %	25 %	25 %	25 %	241589541
24	NC_012855	GACG	2	8	8253	8260	25 %	0 %	50 %	25 %	241589542
25	NC_012855	CAAC	2	8	8262	8269	50 %	0 %	0 %	50 %	241589542
26	NC_012855	GCTG	2	8	8451	8458	0 %	25 %	50 %	25 %	241589542
27	NC_012855	ACGC	2	8	8551	8558	25 %	0 %	25 %	50 %	241589542
28	NC_012855	CTGA	2	8	8674	8681	25 %	25 %	25 %	25 %	241589542
29	NC_012855	GTGA	2	8	9162	9169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012855	GCGA	2	8	9291	9298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012855	CTAG	2	8	9376	9383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012855	TGCG	2	8	9501	9508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012855	TTTC	2	8	9574	9581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012855	GAAA	2	8	10013	10020	75 %	0 %	25 %	0 %	241589544
35	NC_012855	CTCG	2	8	10126	10133	0 %	25 %	25 %	50 %	241589544
36	NC_012855	TGTT	2	8	10380	10387	0 %	75 %	25 %	0 %	241589544
37	NC_012855	TCAA	2	8	10792	10799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012855	TCCC	2	8	11149	11156	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_012855	AAGG	2	8	11310	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	241589545
40	NC_012855	CAAG	2	8	11454	11461	50 %	0 %	25 %	25 %	241589545
41	NC_012855	GGAC	2	8	11520	11527	25 %	0 %	50 %	25 %	241589545
42	NC_012855	CCTT	2	8	11764	11771	0 %	50 %	0 %	50 %	241589546
43	NC_012855	TTTG	2	8	11875	11882	0 %	75 %	25 %	0 %	241589546
44	NC_012855	GGCA	2	8	12037	12044	25 %	0 %	50 %	25 %	241589546
45	NC_012855	CGAG	3	12	12690	12701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012855	GGCC	2	8	12797	12804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012855	GGGC	2	8	13213	13220	0 %	0 %	75 %	25 %	241589548
48	NC_012855	CGAG	2	8	13774	13781	25 %	0 %	50 %	25 %	241589548
49	NC_012855	GGCC	2	8	14107	14114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012855	GCGT	2	8	14591	14598	0 %	25 %	50 %	25 %	241589549
51	NC_012855	GATC	2	8	14849	14856	25 %	25 %	25 %	25 %	241589549
52	NC_012855	GGCA	2	8	15143	15150	25 %	0 %	50 %	25 %	241589549
53	NC_012855	GATG	2	8	15600	15607	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012855	AGCA	2	8	15638	15645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012855	CAGC	2	8	16061	16068	25 %	0 %	25 %	50 %	241589551
56	NC_012855	ATCG	2	8	16735	16742	25 %	25 %	25 %	25 %	241589552
57	NC_012855	ACCC	2	8	17643	17650	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_012855	AGCG	2	8	18279	18286	25 %	0 %	50 %	25 %	241589554
59	NC_012855	CAGG	2	8	18981	18988	25 %	0 %	50 %	25 %	241589555
60	NC_012855	GCCA	2	8	19138	19145	25 %	0 %	25 %	50 %	241589555
61	NC_012855	TTGC	2	8	19728	19735	0 %	50 %	25 %	25 %	241589555
62	NC_012855	ACCT	2	8	20027	20034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012855	GGGT	2	8	20036	20043	0 %	25 %	75 %	0 %	241589556
64	NC_012855	CGAT	2	8	20295	20302	25 %	25 %	25 %	25 %	241589556
65	NC_012855	CGGG	2	8	20353	20360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012855	TCAG	2	8	20677	20684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012855	TCCC	2	8	20930	20937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_012855	AATC	2	8	21402	21409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012855	TGCC	2	8	21455	21462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012855	CATG	2	8	21504	21511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012855	TTTA	2	8	21522	21529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012855	ATTT	2	8	21556	21563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012855	GCGT	2	8	23221	23228	0 %	25 %	50 %	25 %	241589558
74	NC_012855	AGCC	2	8	23621	23628	25 %	0 %	25 %	50 %	241589558
75	NC_012855	CATG	2	8	23794	23801	25 %	25 %	25 %	25 %	241589558
76	NC_012855	GCGG	2	8	23878	23885	0 %	0 %	75 %	25 %	241589558
77	NC_012855	GGCG	2	8	24203	24210	0 %	0 %	75 %	25 %	241589559
78	NC_012855	GCCC	2	8	24246	24253	0 %	0 %	25 %	75 %	241589559
79	NC_012855	TCGT	2	8	24603	24610	0 %	50 %	25 %	25 %	241589559
80	NC_012855	CGCA	2	8	25010	25017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012855	AAGC	2	8	25577	25584	50 %	0 %	25 %	25 %	241589560
82	NC_012855	GCAC	2	8	26483	26490	25 %	0 %	25 %	50 %	241589562
83	NC_012855	CACC	2	8	26589	26596	25 %	0 %	0 %	75 %	241589562
84	NC_012855	TCGA	2	8	26612	26619	25 %	25 %	25 %	25 %	241589562
85	NC_012855	GGGC	2	8	27174	27181	0 %	0 %	75 %	25 %	241589562
86	NC_012855	TCAC	2	8	27191	27198	25 %	25 %	0 %	50 %	241589562
87	NC_012855	GGTT	2	8	27827	27834	0 %	50 %	50 %	0 %	241589563
88	NC_012855	GGAA	2	8	28452	28459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012855	TCAA	2	8	29416	29423	50 %	25 %	0 %	25 %	241589565
90	NC_012855	GCGG	2	8	29811	29818	0 %	0 %	75 %	25 %	241589565
91	NC_012855	CAAA	2	8	30096	30103	75 %	0 %	0 %	25 %	241589565
92	NC_012855	TCGC	2	8	30147	30154	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
93	NC_012855	CAGA	2	8	30159	30166	50 %	0 %	25 %	25 %	241589565
94	NC_012855	CTGG	2	8	30270	30277	0 %	25 %	50 %	25 %	241589565
95	NC_012855	GCTC	2	8	30439	30446	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
96	NC_012855	CTGC	2	8	30696	30703	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
97	NC_012855	CGTG	2	8	30854	30861	0 %	25 %	50 %	25 %	241589565
98	NC_012855	TTGA	2	8	33530	33537	25 %	50 %	25 %	0 %	241589566
99	NC_012855	TGCT	2	8	34199	34206	0 %	50 %	25 %	25 %	241589568
100	NC_012855	CATG	2	8	34289	34296	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
101	NC_012855	GCGT	2	8	34368	34375	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
102	NC_012855	GCAT	2	8	34449	34456	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
103	NC_012855	GGTC	2	8	35044	35051	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
104	NC_012855	CGGC	2	8	35079	35086	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
105	NC_012855	GAGC	2	8	35087	35094	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
106	NC_012855	GCGA	2	8	35520	35527	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
107	NC_012855	GCAC	2	8	35633	35640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012855	CGGC	2	8	35824	35831	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
109	NC_012855	GCGA	2	8	35880	35887	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
110	NC_012855	GAAG	2	8	36791	36798	50 %	0 %	50 %	0 %	241589569
111	NC_012855	CGAA	2	8	36871	36878	50 %	0 %	25 %	25 %	241589569
112	NC_012855	ATTC	2	8	36987	36994	25 %	50 %	0 %	25 %	241589569
113	NC_012855	GCCA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
114	NC_012855	CGGC	2	8	37167	37174	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
115	NC_012855	CGAC	2	8	37400	37407	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
116	NC_012855	GTCC	2	8	37443	37450	0 %	25 %	25 %	50 %	241589569
117	NC_012855	AGGC	2	8	37783	37790	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
118	NC_012855	CGCT	2	8	39308	39315	0 %	25 %	25 %	50 %	241589570
119	NC_012855	GAAT	2	8	39749	39756	50 %	25 %	25 %	0 %	241589571
120	NC_012855	CTTG	2	8	39915	39922	0 %	50 %	25 %	25 %	241589571
121	NC_012855	CGGC	2	8	40557	40564	0 %	0 %	50 %	50 %	241589571
122	NC_012855	GACA	2	8	41621	41628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012855	CCGA	2	8	42541	42548	25 %	0 %	25 %	50 %	241589572
124	NC_012855	CAGA	2	8	43068	43075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012855	GCAA	2	8	44848	44855	50 %	0 %	25 %	25 %	241589575
126	NC_012855	GTCC	2	8	45014	45021	0 %	25 %	25 %	50 %	241589575
127	NC_012855	GCAG	2	8	45995	46002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012855	GTTC	2	8	46222	46229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012855	GTCG	2	8	46277	46284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012855	CTTA	2	8	46877	46884	25 %	50 %	0 %	25 %	241589576
131	NC_012855	AGGC	2	8	46886	46893	25 %	0 %	50 %	25 %	241589576
132	NC_012855	TAGC	2	8	46953	46960	25 %	25 %	25 %	25 %	241589576
133	NC_012855	ATTA	2	8	47899	47906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012855	AATT	2	8	47990	47997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012855	TGGC	2	8	48383	48390	0 %	25 %	50 %	25 %	241589577
136	NC_012855	GAGC	2	8	48516	48523	25 %	0 %	50 %	25 %	241589577
137	NC_012855	GGCC	2	8	48780	48787	0 %	0 %	50 %	50 %	241589577
138	NC_012855	TGCC	2	8	49245	49252	0 %	25 %	25 %	50 %	241589577
139	NC_012855	GATT	2	8	49312	49319	25 %	50 %	25 %	0 %	241589577
140	NC_012855	TCCG	2	8	49587	49594	0 %	25 %	25 %	50 %	241589577
141	NC_012855	GATG	2	8	49889	49896	25 %	25 %	50 %	0 %	241589577
142	NC_012855	AATG	2	8	49958	49965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_012855	CGTC	2	8	50492	50499	0 %	25 %	25 %	50 %	241589578
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