MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	CAAGT	2	10	17639	17648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012854	CATGG	2	10	25694	25703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012854	CCCCT	2	10	28777	28786	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_012854	GAGCG	2	10	33511	33520	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012854	AGGGG	2	10	33653	33662	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012854	GGGGA	2	10	33899	33908	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012854	GCCAG	2	10	34005	34014	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012854	CCCGG	2	10	43100	43109	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012854	ACGCC	2	10	48476	48485	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_012854	GCCAT	2	10	49614	49623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_012854	CTTCA	2	10	73905	73914	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012854	TGTGT	2	10	107513	107522	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012854	GCGCC	2	10	111142	111151	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_012854	GCTTT	2	10	113086	113095	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012854	TCTCC	2	10	119780	119789	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_012854	GTCTC	2	10	126842	126851	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012854	CGCGC	2	10	129797	129806	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_012854	ATGAT	2	10	158540	158549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012854	GCGAC	2	10	189725	189734	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012854	GGGAA	2	10	200142	200151	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012854	TCAAT	2	10	200358	200367	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012854	GCATC	2	10	201443	201452	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012854	GCTCA	2	10	202769	202778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012854	CAACC	2	10	202950	202959	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_012854	GCGGA	2	10	232968	232977	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012854	CGCAG	2	10	279681	279690	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012854	ACCTT	2	10	282276	282285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.