MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	CTGG	2	8	529	536	0 %	25 %	50 %	25 %	241554071
2	NC_012854	TGCC	2	8	1560	1567	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012854	GCCA	2	8	1872	1879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012854	TCGC	2	8	1912	1919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012854	CCAT	2	8	2057	2064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012854	GAAG	2	8	2094	2101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012854	CCGT	2	8	2151	2158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012854	GATC	2	8	3269	3276	25 %	25 %	25 %	25 %	241554073
9	NC_012854	GCGG	2	8	3407	3414	0 %	0 %	75 %	25 %	241554073
10	NC_012854	AGCG	2	8	3455	3462	25 %	0 %	50 %	25 %	241554073
11	NC_012854	AAGC	2	8	3853	3860	50 %	0 %	25 %	25 %	241554074
12	NC_012854	GAGG	2	8	4153	4160	25 %	0 %	75 %	0 %	241554074
13	NC_012854	GAAA	2	8	4767	4774	75 %	0 %	25 %	0 %	241554074
14	NC_012854	GCGG	2	8	4777	4784	0 %	0 %	75 %	25 %	241554074
15	NC_012854	GCTA	2	8	5109	5116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012854	GTTG	2	8	5294	5301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012854	ACGG	2	8	5868	5875	25 %	0 %	50 %	25 %	241554076
18	NC_012854	CCGT	2	8	6988	6995	0 %	25 %	25 %	50 %	241554077
19	NC_012854	TTTC	2	8	7552	7559	0 %	75 %	0 %	25 %	241554077
20	NC_012854	TGAG	2	8	7987	7994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012854	GCTC	2	8	8726	8733	0 %	25 %	25 %	50 %	241554079
22	NC_012854	TCAC	2	8	8983	8990	25 %	25 %	0 %	50 %	241554079
23	NC_012854	CCAA	2	8	9389	9396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012854	AGAC	2	8	9463	9470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012854	GAGC	2	8	9504	9511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012854	TTCG	2	8	9516	9523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012854	CCGA	2	8	9897	9904	25 %	0 %	25 %	50 %	241554080
28	NC_012854	TCTT	2	8	10800	10807	0 %	75 %	0 %	25 %	241554080
29	NC_012854	TGGC	2	8	11136	11143	0 %	25 %	50 %	25 %	241554080
30	NC_012854	GACC	2	8	11346	11353	25 %	0 %	25 %	50 %	241554080
31	NC_012854	GGAC	2	8	11573	11580	25 %	0 %	50 %	25 %	241554080
32	NC_012854	TGAG	2	8	11738	11745	25 %	25 %	50 %	0 %	241554080
33	NC_012854	GCCA	2	8	12256	12263	25 %	0 %	25 %	50 %	241554081
34	NC_012854	ATCC	2	8	12957	12964	25 %	25 %	0 %	50 %	241554081
35	NC_012854	GCTC	2	8	13133	13140	0 %	25 %	25 %	50 %	241554081
36	NC_012854	GGAC	2	8	13700	13707	25 %	0 %	50 %	25 %	241554082
37	NC_012854	CGCT	2	8	14155	14162	0 %	25 %	25 %	50 %	241554082
38	NC_012854	CGTG	2	8	14499	14506	0 %	25 %	50 %	25 %	241554082
39	NC_012854	GCAC	2	8	15954	15961	25 %	0 %	25 %	50 %	241554083
40	NC_012854	CGGC	2	8	16133	16140	0 %	0 %	50 %	50 %	241554083
41	NC_012854	ATCG	2	8	16340	16347	25 %	25 %	25 %	25 %	241554083
42	NC_012854	ACGC	2	8	16961	16968	25 %	0 %	25 %	50 %	241554084
43	NC_012854	CCAG	2	8	17086	17093	25 %	0 %	25 %	50 %	241554084
44	NC_012854	CATT	2	8	17604	17611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012854	AAAG	2	8	18220	18227	75 %	0 %	25 %	0 %	241554085
46	NC_012854	CTGG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	241554085
47	NC_012854	TTCT	2	8	18691	18698	0 %	75 %	0 %	25 %	241554085
48	NC_012854	CTTC	2	8	18990	18997	0 %	50 %	0 %	50 %	241554086
49	NC_012854	GGTC	2	8	20365	20372	0 %	25 %	50 %	25 %	241554087
50	NC_012854	CAAT	2	8	20551	20558	50 %	25 %	0 %	25 %	241554087
51	NC_012854	TTGA	2	8	20952	20959	25 %	50 %	25 %	0 %	241554088
52	NC_012854	GGAT	2	8	21416	21423	25 %	25 %	50 %	0 %	241554088
53	NC_012854	GAGC	2	8	21802	21809	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
54	NC_012854	TGAC	2	8	23208	23215	25 %	25 %	25 %	25 %	241554089
55	NC_012854	AGCC	2	8	23350	23357	25 %	0 %	25 %	50 %	241554089
56	NC_012854	GCCG	2	8	23384	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	241554089
57	NC_012854	GCCG	2	8	23395	23402	0 %	0 %	50 %	50 %	241554089
58	NC_012854	CAGG	2	8	23524	23531	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
59	NC_012854	CGGA	2	8	23553	23560	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
60	NC_012854	CGTT	2	8	23795	23802	0 %	50 %	25 %	25 %	241554089
61	NC_012854	TTGC	2	8	23805	23812	0 %	50 %	25 %	25 %	241554089
62	NC_012854	GCCG	2	8	24922	24929	0 %	0 %	50 %	50 %	241554090
63	NC_012854	AGCA	2	8	25142	25149	50 %	0 %	25 %	25 %	241554090
64	NC_012854	GCCC	2	8	25520	25527	0 %	0 %	25 %	75 %	241554090
65	NC_012854	AGCG	2	8	26161	26168	25 %	0 %	50 %	25 %	241554092
66	NC_012854	GACG	2	8	26592	26599	25 %	0 %	50 %	25 %	241554093
67	NC_012854	CAGC	2	8	26692	26699	25 %	0 %	25 %	50 %	241554093
68	NC_012854	CAGG	2	8	26758	26765	25 %	0 %	50 %	25 %	241554093
69	NC_012854	GACC	2	8	26932	26939	25 %	0 %	25 %	50 %	241554094
70	NC_012854	CCAT	2	8	27570	27577	25 %	25 %	0 %	50 %	241554094
71	NC_012854	GCCA	2	8	27602	27609	25 %	0 %	25 %	50 %	241554094
72	NC_012854	CCGG	3	12	27630	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	241554094
73	NC_012854	CGAT	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	241554094
74	NC_012854	TCGG	2	8	27823	27830	0 %	25 %	50 %	25 %	241554094
75	NC_012854	AGAA	2	8	28052	28059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012854	AGGC	2	8	28571	28578	25 %	0 %	50 %	25 %	241554096
77	NC_012854	CGAT	2	8	28894	28901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012854	CTAT	2	8	29356	29363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012854	CGGC	2	8	29408	29415	0 %	0 %	50 %	50 %	241554097
80	NC_012854	ATGC	2	8	29536	29543	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
81	NC_012854	ATCG	2	8	29617	29624	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
82	NC_012854	GTTC	2	8	30482	30489	0 %	50 %	25 %	25 %	241554097
83	NC_012854	AAGC	2	8	31020	31027	50 %	0 %	25 %	25 %	241554098
84	NC_012854	GCCC	2	8	31173	31180	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
85	NC_012854	GGCC	2	8	31234	31241	0 %	0 %	50 %	50 %	241554098
86	NC_012854	GATC	2	8	31263	31270	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
87	NC_012854	TGTC	2	8	31308	31315	0 %	50 %	25 %	25 %	241554098
88	NC_012854	CCGC	2	8	31497	31504	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
89	NC_012854	GATC	2	8	31677	31684	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
90	NC_012854	TGGA	2	8	32683	32690	25 %	25 %	50 %	0 %	241554099
91	NC_012854	CGGC	2	8	32754	32761	0 %	0 %	50 %	50 %	241554099
92	NC_012854	ACAG	2	8	33193	33200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012854	AGGC	2	8	34390	34397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012854	CGTG	2	8	36297	36304	0 %	25 %	50 %	25 %	241554101
95	NC_012854	GAGG	2	8	37505	37512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012854	CCGA	2	8	38174	38181	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
97	NC_012854	CCGA	2	8	38213	38220	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
98	NC_012854	GGGC	2	8	38334	38341	0 %	0 %	75 %	25 %	241554103
99	NC_012854	AAGC	2	8	39060	39067	50 %	0 %	25 %	25 %	241554104
100	NC_012854	GCGT	2	8	39422	39429	0 %	25 %	50 %	25 %	241554104
101	NC_012854	CGGT	2	8	39898	39905	0 %	25 %	50 %	25 %	241554105
102	NC_012854	GCTC	2	8	40072	40079	0 %	25 %	25 %	50 %	241554105
103	NC_012854	GCTA	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	241554105
104	NC_012854	CGGC	2	8	40327	40334	0 %	0 %	50 %	50 %	241554105
105	NC_012854	ATGC	2	8	40512	40519	25 %	25 %	25 %	25 %	241554105
106	NC_012854	GGCG	2	8	40728	40735	0 %	0 %	75 %	25 %	241554105
107	NC_012854	TCTG	2	8	40951	40958	0 %	50 %	25 %	25 %	241554106
108	NC_012854	CGAA	2	8	41571	41578	50 %	0 %	25 %	25 %	241554106
109	NC_012854	GGCG	2	8	41816	41823	0 %	0 %	75 %	25 %	241554107
110	NC_012854	CGGG	2	8	41964	41971	0 %	0 %	75 %	25 %	241554107
111	NC_012854	TTGG	2	8	42519	42526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012854	GCAT	2	8	42900	42907	25 %	25 %	25 %	25 %	241554108
113	NC_012854	AAGC	2	8	43003	43010	50 %	0 %	25 %	25 %	241554108
114	NC_012854	GCCT	2	8	43316	43323	0 %	25 %	25 %	50 %	241554109
115	NC_012854	GCTC	2	8	43668	43675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012854	GGAC	2	8	43683	43690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012854	CTGG	2	8	43939	43946	0 %	25 %	50 %	25 %	241554110
118	NC_012854	TCCC	2	8	44291	44298	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_012854	CAGT	2	8	44370	44377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012854	TCGC	2	8	44461	44468	0 %	25 %	25 %	50 %	241554111
121	NC_012854	GTCG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	50 %	25 %	241554111
122	NC_012854	GAAA	2	8	45893	45900	75 %	0 %	25 %	0 %	241554112
123	NC_012854	CGAG	2	8	46280	46287	25 %	0 %	50 %	25 %	241554113
124	NC_012854	AGCG	2	8	47190	47197	25 %	0 %	50 %	25 %	241554113
125	NC_012854	CAGC	2	8	47585	47592	25 %	0 %	25 %	50 %	241554113
126	NC_012854	GCCT	2	8	47759	47766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012854	GCGG	2	8	47808	47815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012854	CGGG	2	8	47824	47831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012854	CGCC	2	8	48594	48601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_012854	CAAG	2	8	48646	48653	50 %	0 %	25 %	25 %	241554115
131	NC_012854	GCCC	2	8	50696	50703	0 %	0 %	25 %	75 %	241554120
132	NC_012854	CGAT	2	8	51186	51193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012854	CGAG	2	8	51237	51244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012854	AGGT	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	241554121
135	NC_012854	GACT	2	8	52036	52043	25 %	25 %	25 %	25 %	241554121
136	NC_012854	GGTC	2	8	53416	53423	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
137	NC_012854	GAGC	2	8	53545	53552	25 %	0 %	50 %	25 %	241554123
138	NC_012854	TCGG	2	8	53931	53938	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
139	NC_012854	ACCA	2	8	54413	54420	50 %	0 %	0 %	50 %	241554124
140	NC_012854	GGAT	2	8	54496	54503	25 %	25 %	50 %	0 %	241554124
141	NC_012854	TCGA	2	8	54635	54642	25 %	25 %	25 %	25 %	241554124
142	NC_012854	CGTC	2	8	54987	54994	0 %	25 %	25 %	50 %	241554124
143	NC_012854	AGAT	2	8	56047	56054	50 %	25 %	25 %	0 %	241554125
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