MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	GGC	2	6	104	109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012854	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012854	GTC	2	6	1389	1394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012854	GCC	2	6	1464	1469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012854	GAT	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012854	AAG	2	6	1623	1628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012854	CGC	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012854	GGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012854	GCG	2	6	1710	1715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012854	GGC	2	6	1887	1892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012854	ACC	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012854	TGA	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012854	TCA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012854	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012854	GAG	2	6	2304	2309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012854	AAC	2	6	2335	2340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012854	GAG	3	9	2347	2355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012854	CGC	2	6	2356	2361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012854	GAG	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012854	GAG	2	6	2422	2427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012854	TGC	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012854	TCG	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012854	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012854	GCC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_012854	GAC	2	6	3230	3235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012854	CCG	2	6	5134	5139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012854	CCG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012854	TGC	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012854	TGA	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012854	TCA	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012854	GTG	2	6	8093	8098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012854	GGC	2	6	9531	9536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012854	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012854	CCT	2	6	9578	9583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012854	TGA	3	9	9618	9626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012854	ACC	2	6	13350	13355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012854	TCG	2	6	17667	17672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012854	AGC	2	6	21675	21680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012854	GTG	2	6	21758	21763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012854	GTG	2	6	24468	24473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012854	TAG	2	6	25671	25676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012854	TTA	2	6	25678	25683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012854	ATT	2	6	28006	28011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012854	GAA	2	6	28028	28033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012854	GTT	2	6	28813	28818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012854	TGG	2	6	28838	28843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012854	CTT	2	6	28863	28868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012854	GCG	2	6	28944	28949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012854	GGC	2	6	29100	29105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012854	AGC	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012854	TCG	2	6	29304	29309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012854	AGC	2	6	29326	29331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012854	GCC	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012854	GGC	2	6	33260	33265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012854	ACA	2	6	33320	33325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012854	CGG	2	6	33426	33431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012854	GCC	2	6	33600	33605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012854	GGC	2	6	33703	33708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012854	CGC	2	6	33715	33720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012854	AGA	2	6	33746	33751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012854	TGC	3	9	33881	33889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012854	TCA	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012854	ATC	2	6	34137	34142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012854	GCA	2	6	34153	34158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012854	GCC	2	6	34228	34233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012854	TCT	2	6	34235	34240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012854	CTT	2	6	34282	34287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012854	CGG	2	6	34320	34325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012854	GCG	2	6	35524	35529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012854	GTC	2	6	36428	36433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012854	GTG	2	6	36491	36496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012854	ACG	2	6	36503	36508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012854	GGA	3	9	36579	36587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012854	GAG	3	9	37515	37523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012854	CCG	2	6	37606	37611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012854	CAG	2	6	37647	37652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012854	GAG	2	6	37685	37690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012854	ACC	2	6	38790	38795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012854	GAA	2	6	40933	40938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012854	GGC	2	6	42503	42508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012854	TCC	2	6	42543	42548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012854	CCG	2	6	44379	44384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012854	TGT	2	6	46160	46165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012854	CTC	2	6	47681	47686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012854	CCA	2	6	47774	47779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012854	GAA	2	6	47853	47858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012854	AGC	2	6	47894	47899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012854	GCG	2	6	47983	47988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012854	GGC	2	6	48006	48011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012854	CAC	2	6	48212	48217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012854	GAA	2	6	48243	48248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012854	TCC	2	6	48457	48462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012854	GCG	2	6	48608	48613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012854	ATT	2	6	48631	48636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012854	AAC	2	6	49419	49424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012854	TAC	2	6	49432	49437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012854	AAT	2	6	49506	49511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012854	CGA	2	6	49966	49971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012854	TGG	2	6	50271	50276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012854	ACG	2	6	51099	51104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012854	TGG	2	6	51154	51159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012854	TGT	2	6	52810	52815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012854	GGT	2	6	52916	52921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012854	TGG	2	6	52995	53000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012854	CGA	2	6	53009	53014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012854	ATC	2	6	53075	53080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012854	GCC	3	9	53096	53104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012854	ACG	2	6	53175	53180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012854	CGG	2	6	58565	58570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012854	GCA	2	6	61940	61945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012854	CGC	2	6	61946	61951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_012854	GCC	2	6	61956	61961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012854	GCG	2	6	61978	61983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012854	CGG	2	6	63907	63912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012854	TCC	2	6	64421	64426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012854	CGT	2	6	64506	64511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012854	TGT	2	6	64580	64585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012854	CGC	3	9	70240	70248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012854	GGC	3	9	70253	70261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012854	CTA	2	6	70300	70305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012854	ATA	2	6	72663	72668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012854	GAG	2	6	73847	73852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012854	CGA	2	6	73854	73859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012854	AGG	2	6	74035	74040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012854	CGT	2	6	74683	74688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012854	AGG	2	6	78751	78756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012854	ATG	2	6	80845	80850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012854	CAT	2	6	80879	80884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012854	GCT	2	6	81869	81874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012854	GCA	2	6	81891	81896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012854	TCT	2	6	81923	81928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012854	CAG	2	6	81930	81935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012854	CAA	3	9	82021	82029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012854	CGG	2	6	85957	85962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012854	CCG	2	6	85970	85975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_012854	GAC	2	6	86674	86679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012854	GCC	2	6	86734	86739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012854	TAT	2	6	86794	86799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012854	GCG	2	6	89070	89075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012854	CGG	2	6	97346	97351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012854	AGA	2	6	97377	97382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012854	GTC	2	6	97396	97401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012854	TCC	2	6	97524	97529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_012854	CCA	2	6	99902	99907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_012854	GCG	2	6	101715	101720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012854	GGA	2	6	101744	101749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012854	GGC	2	6	103729	103734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012854	GGC	2	6	103751	103756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012854	CGG	3	9	105193	105201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012854	AAT	2	6	108420	108425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_012854	ACC	2	6	111169	111174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_012854	GGA	2	6	111217	111222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012854	GCC	2	6	111292	111297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_012854	CCG	2	6	111342	111347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_012854	GGT	2	6	115457	115462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012854	TCC	2	6	118128	118133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_012854	CTC	2	6	127627	127632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_012854	GCC	2	6	132058	132063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_012854	ATG	2	6	134912	134917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012854	GGA	2	6	141424	141429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_012854	GCC	3	9	143191	143199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_012854	GAC	2	6	203271	203276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_012854	TGC	2	6	203850	203855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_012854	GTT	3	9	281086	281094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
405	NC_012854	CAC	2	6	281165	281170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
406	NC_012854	GCA	2	6	281262	281267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_012854	AGT	2	6	281354	281359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012854	AGA	2	6	281409	281414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_012854	CCT	2	6	282210	282215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_012854	AGC	2	6	282219	282224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_012854	AAT	2	6	282296	282301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_012854	TCC	2	6	283970	283975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_012854	ATC	2	6	284900	284905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_012854	GAG	2	6	284949	284954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012854	GAA	2	6	286453	286458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012854	TTC	2	6	286462	286467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_012854	TTG	2	6	286587	286592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_012854	CTC	2	6	286670	286675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
419	NC_012854	TCG	2	6	286691	286696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_012854	CAT	2	6	286736	286741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_012854	GCG	2	6	286781	286786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_012854	TCC	2	6	287888	287893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
423	NC_012854	CGG	3	9	287916	287924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_012854	TGC	2	6	287930	287935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_012854	CAG	2	6	287949	287954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_012854	GAG	2	6	288026	288031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
427	NC_012854	CCA	2	6	288092	288097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_012854	CAA	2	6	288204	288209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_012854	GAC	2	6	288356	288361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_012854	GCC	2	6	288462	288467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_012854	GCT	2	6	294534	294539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_012854	TCG	2	6	294559	294564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_012854	ACG	2	6	294585	294590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.