MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 4327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	CGG	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
2	NC_012854	CCG	2	6	252	257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554071
3	NC_012854	CGG	2	6	265	270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
4	NC_012854	CCT	2	6	277	282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554071
5	NC_012854	CGG	3	9	391	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
6	NC_012854	CTT	2	6	550	555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554071
7	NC_012854	CGT	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554071
8	NC_012854	CGG	2	6	732	737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
9	NC_012854	CAT	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554071
10	NC_012854	TGC	2	6	981	986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554071
11	NC_012854	ACA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554071
12	NC_012854	CGG	2	6	1014	1019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
13	NC_012854	CAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554071
14	NC_012854	TGC	2	6	1141	1146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554071
15	NC_012854	GCG	2	6	1208	1213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554071
16	NC_012854	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554072
17	NC_012854	CTC	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554072
18	NC_012854	TCC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554072
19	NC_012854	GCC	2	6	2847	2852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554072
20	NC_012854	GAA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554073
21	NC_012854	GGA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554073
22	NC_012854	GCG	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554073
23	NC_012854	CGA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554073
24	NC_012854	AAG	2	6	3908	3913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554074
25	NC_012854	TGA	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554074
26	NC_012854	CCG	2	6	4096	4101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554074
27	NC_012854	CAT	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554074
28	NC_012854	CTT	2	6	4118	4123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554074
29	NC_012854	CTC	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554074
30	NC_012854	TCG	2	6	4214	4219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554074
31	NC_012854	TAT	2	6	4379	4384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554074
32	NC_012854	ATT	2	6	4500	4505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554074
33	NC_012854	GGA	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554074
34	NC_012854	GAC	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554074
35	NC_012854	GCC	2	6	4590	4595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554074
36	NC_012854	AAG	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554074
37	NC_012854	AGC	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554074
38	NC_012854	TCG	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554074
39	NC_012854	TGA	2	6	4734	4739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554074
40	NC_012854	CGA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554074
41	NC_012854	GCA	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554074
42	NC_012854	CTT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554074
43	NC_012854	GAG	2	6	4922	4927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554074
44	NC_012854	ATG	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554074
45	NC_012854	GCA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554074
46	NC_012854	TGA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554074
47	NC_012854	GAC	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554075
48	NC_012854	CTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554076
49	NC_012854	CTG	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554076
50	NC_012854	ACG	2	6	5850	5855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554076
51	NC_012854	GCC	2	6	6183	6188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554076
52	NC_012854	CGA	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554076
53	NC_012854	ATC	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554076
54	NC_012854	GCG	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554076
55	NC_012854	TGA	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554077
56	NC_012854	GAA	2	6	6556	6561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554077
57	NC_012854	GCC	2	6	6666	6671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554077
58	NC_012854	CGA	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554077
59	NC_012854	CCA	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554077
60	NC_012854	CGC	2	6	6909	6914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554077
61	NC_012854	TCC	2	6	6920	6925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554077
62	NC_012854	CTG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554077
63	NC_012854	GTC	2	6	7144	7149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554077
64	NC_012854	GTC	2	6	7189	7194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554077
65	NC_012854	GGC	2	6	7206	7211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554077
66	NC_012854	CCA	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554077
67	NC_012854	CTT	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554077
68	NC_012854	AGG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554077
69	NC_012854	GAT	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554077
70	NC_012854	CCG	2	6	7514	7519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554077
71	NC_012854	AGG	2	6	7535	7540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554077
72	NC_012854	GTG	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554077
73	NC_012854	GCG	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554077
74	NC_012854	CGA	2	6	7878	7883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554077
75	NC_012854	CCA	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554078
76	NC_012854	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554078
77	NC_012854	CAT	2	6	8635	8640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554079
78	NC_012854	AGG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554079
79	NC_012854	TGA	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554079
80	NC_012854	GAC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554079
81	NC_012854	ACC	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554079
82	NC_012854	ACG	2	6	9259	9264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554079
83	NC_012854	CGT	2	6	9982	9987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554080
84	NC_012854	GGC	2	6	10085	10090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554080
85	NC_012854	CCA	2	6	10106	10111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554080
86	NC_012854	GCT	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554080
87	NC_012854	ACG	2	6	10339	10344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554080
88	NC_012854	GAT	2	6	10352	10357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554080
89	NC_012854	ATC	2	6	10569	10574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554080
90	NC_012854	CCG	2	6	10720	10725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554080
91	NC_012854	AAG	2	6	10776	10781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554080
92	NC_012854	TGC	2	6	10811	10816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554080
93	NC_012854	CCG	2	6	10882	10887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554080
94	NC_012854	CAC	2	6	10997	11002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554080
95	NC_012854	GAC	2	6	11055	11060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554080
96	NC_012854	AAG	2	6	11159	11164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554080
97	NC_012854	GAT	2	6	11213	11218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554080
98	NC_012854	GAT	2	6	11289	11294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554080
99	NC_012854	GGC	2	6	11478	11483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554080
100	NC_012854	GGA	2	6	11543	11548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554080
101	NC_012854	CTG	3	9	11896	11904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554081
102	NC_012854	TCT	2	6	12104	12109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554081
103	NC_012854	CAA	2	6	12190	12195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554081
104	NC_012854	TTC	2	6	12345	12350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554081
105	NC_012854	CGA	2	6	12396	12401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554081
106	NC_012854	TGC	2	6	12411	12416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554081
107	NC_012854	GAG	2	6	12436	12441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554081
108	NC_012854	CGC	2	6	12442	12447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554081
109	NC_012854	GCG	2	6	12518	12523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554081
110	NC_012854	GAG	2	6	12526	12531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554081
111	NC_012854	AGC	2	6	12561	12566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554081
112	NC_012854	GGT	2	6	12626	12631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554081
113	NC_012854	GAA	2	6	12648	12653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554081
114	NC_012854	GAC	2	6	12673	12678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554081
115	NC_012854	TCG	2	6	12843	12848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554081
116	NC_012854	GAG	2	6	12859	12864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554081
117	NC_012854	GAC	2	6	12865	12870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554081
118	NC_012854	ATT	2	6	13240	13245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554081
119	NC_012854	GCT	2	6	13320	13325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554081
120	NC_012854	ACG	2	6	13405	13410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554082
121	NC_012854	TGG	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554082
122	NC_012854	GCT	2	6	13590	13595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554082
123	NC_012854	CGT	2	6	13622	13627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554082
124	NC_012854	CTC	2	6	13653	13658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554082
125	NC_012854	CGC	2	6	13843	13848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554082
126	NC_012854	CGA	2	6	13871	13876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554082
127	NC_012854	GAG	2	6	13932	13937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554082
128	NC_012854	TGG	2	6	14023	14028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554082
129	NC_012854	GGA	2	6	14104	14109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554082
130	NC_012854	ACC	2	6	14197	14202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554082
131	NC_012854	TCA	2	6	14300	14305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554082
132	NC_012854	AAC	2	6	14325	14330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554082
133	NC_012854	GAA	2	6	14349	14354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554082
134	NC_012854	TTC	2	6	14380	14385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554082
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136	NC_012854	ATC	2	6	14487	14492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554082
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138	NC_012854	CCT	2	6	14708	14713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554082
139	NC_012854	CGG	2	6	14714	14719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554082
140	NC_012854	GTC	2	6	14742	14747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554082
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143	NC_012854	CGT	2	6	14925	14930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554082
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145	NC_012854	TGG	2	6	15085	15090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554083
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150	NC_012854	GCG	2	6	15639	15644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554083
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152	NC_012854	ACA	2	6	15897	15902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554083
153	NC_012854	TTG	2	6	15903	15908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554083
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157	NC_012854	CCG	2	6	16195	16200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554083
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159	NC_012854	GCG	2	6	16244	16249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554083
160	NC_012854	TGC	2	6	16280	16285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554083
161	NC_012854	CCG	2	6	16290	16295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554083
162	NC_012854	TGA	2	6	16438	16443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554083
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167	NC_012854	GGC	2	6	16652	16657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554084
168	NC_012854	GCG	2	6	16814	16819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554084
169	NC_012854	CCG	2	6	16993	16998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554084
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252	NC_012854	GCA	2	6	25095	25100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554090
253	NC_012854	TCC	2	6	25203	25208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554090
254	NC_012854	CGC	2	6	25273	25278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554090
255	NC_012854	CGA	2	6	25325	25330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554090
256	NC_012854	GCG	2	6	25350	25355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554090
257	NC_012854	CGG	2	6	25362	25367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554090
258	NC_012854	CGT	2	6	25429	25434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554090
259	NC_012854	GGA	2	6	25435	25440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554090
260	NC_012854	TCG	2	6	25551	25556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554090
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265	NC_012854	CGA	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554091
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271	NC_012854	CGC	2	6	26406	26411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554092
272	NC_012854	TGC	2	6	26468	26473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554092
273	NC_012854	AGG	2	6	26490	26495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554092
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275	NC_012854	GGA	2	6	26543	26548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554093
276	NC_012854	TTC	2	6	26624	26629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554093
277	NC_012854	CTT	2	6	26722	26727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554093
278	NC_012854	GAT	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554093
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281	NC_012854	TGC	2	6	26892	26897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554094
282	NC_012854	CCG	2	6	26905	26910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554094
283	NC_012854	ACA	2	6	26985	26990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554094
284	NC_012854	GCG	2	6	27041	27046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554094
285	NC_012854	GCG	2	6	27071	27076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554094
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362	NC_012854	TGA	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554100
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370	NC_012854	CGA	2	6	35083	35088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
371	NC_012854	GCC	3	9	35091	35099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554100
372	NC_012854	ACG	2	6	35101	35106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554100
373	NC_012854	TCC	2	6	35179	35184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554100
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375	NC_012854	ATC	2	6	35217	35222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554100
376	NC_012854	GTC	2	6	35286	35291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
377	NC_012854	TCG	2	6	35320	35325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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379	NC_012854	TTG	2	6	35347	35352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554100
380	NC_012854	TCG	2	6	35401	35406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554100
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497	NC_012854	ATC	2	6	41342	41347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554106
498	NC_012854	GTC	2	6	41378	41383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554106
499	NC_012854	GCG	2	6	41440	41445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554106
500	NC_012854	CGG	2	6	41554	41559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554106

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