MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012854	AC	3	6	1316	1321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012854	GC	3	6	1641	1646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012854	GC	3	6	3136	3141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012854	GA	4	8	3151	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012854	CG	3	6	5193	5198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012854	CG	3	6	17631	17636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012854	AG	3	6	28731	28736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012854	GC	4	8	28993	29000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012854	CG	3	6	33646	33651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012854	GC	3	6	33755	33760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012854	CA	4	8	37664	37671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012854	GC	3	6	42549	42554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012854	CG	3	6	42619	42624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012854	AT	3	6	43606	43611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012854	CT	3	6	43644	43649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012854	AG	3	6	47886	47891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012854	TC	3	6	48145	48150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012854	GT	3	6	48618	48623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012854	CT	3	6	49361	49366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012854	GC	4	8	49733	49740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012854	TG	3	6	50501	50506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012854	GA	3	6	51280	51285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012854	GC	3	6	59902	59907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012854	TG	3	6	62960	62965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012854	TG	3	6	63892	63897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012854	GC	3	6	70237	70242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012854	TA	3	6	96317	96322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012854	GC	4	8	101688	101695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012854	CG	3	6	101719	101724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012854	AT	3	6	103623	103628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012854	AT	3	6	115354	115359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012854	AG	3	6	115363	115368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012854	AC	3	6	130983	130988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012854	CA	3	6	154376	154381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012854	GC	3	6	155341	155346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012854	CG	3	6	157794	157799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012854	GA	3	6	164785	164790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012854	TC	4	8	172194	172201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012854	GC	3	6	179260	179265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012854	GC	3	6	179271	179276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012854	CG	3	6	180938	180943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012854	GA	3	6	191521	191526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012854	AT	3	6	192682	192687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012854	AC	3	6	192753	192758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012854	GC	4	8	196620	196627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012854	CG	3	6	197784	197789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012854	TA	3	6	198574	198579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012854	AC	3	6	198921	198926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012854	GA	3	6	199116	199121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012854	CG	3	6	199169	199174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012854	AG	3	6	199222	199227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012854	GC	3	6	200727	200732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012854	GC	3	6	202867	202872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012854	CG	3	6	207427	207432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012854	CG	3	6	207573	207578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012854	TA	3	6	208938	208943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012854	AT	3	6	209517	209522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012854	GA	3	6	209593	209598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012854	GA	3	6	212098	212103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012854	TC	3	6	219076	219081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012854	GC	3	6	222399	222404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012854	TG	3	6	222456	222461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012854	AT	3	6	222904	222909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012854	AG	3	6	232835	232840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012854	GT	3	6	232927	232932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012854	TA	3	6	237927	237932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012854	TG	3	6	245211	245216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012854	GC	3	6	253968	253973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012854	CG	3	6	267221	267226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012854	AT	3	6	272209	272214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012854	GC	3	6	272275	272280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012854	TC	3	6	278458	278463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012854	TC	3	6	280680	280685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012854	CG	3	6	280919	280924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012854	CG	3	6	281199	281204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012854	CG	3	6	282356	282361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012854	CG	5	10	282411	282420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012854	GA	3	6	288347	288352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.