MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	TGAGCA	2	12	10384	10395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012853	GTCTTC	2	12	30848	30859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012853	TCAAAC	2	12	78728	78739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012853	CGTGGC	2	12	96556	96567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012853	CAAACC	2	12	135149	135160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012853	CTCGCT	2	12	156345	156356	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012853	GCCTAG	2	12	177808	177819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012853	GGATGT	2	12	219017	219028	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012853	GAATTC	2	12	222600	222611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012853	TGGCGC	3	18	249778	249795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012853	CGAGCG	2	12	278505	278516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012853	TGCCGA	2	12	286253	286264	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012853	ATGAAA	2	12	289554	289565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012853	CTGGCT	2	12	319610	319621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012853	GTGTTG	2	12	320199	320210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012853	GACCGT	2	12	354311	354322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012853	CCCAGC	2	12	354423	354434	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012853	CGAGAT	2	12	354843	354854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012853	CCATCG	2	12	364219	364230	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012853	GCCCGT	2	12	364565	364576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012853	AGGAGT	2	12	364753	364764	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012853	CCGATC	2	12	374277	374288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012853	TCGGCC	2	12	386012	386023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012853	CGCCCG	2	12	415427	415438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_012853	TGGGCG	2	12	423937	423948	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012853	GGTTGA	2	12	436017	436028	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012853	CCGTTT	2	12	445516	445527	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012853	GCCAAG	2	12	459322	459333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012853	GCGTAA	2	12	471034	471045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012853	TTTCGG	2	12	471194	471205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012853	GCGCTG	2	12	475161	475172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012853	GATTGA	2	12	487569	487580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012853	TTTCTG	2	12	512908	512919	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012853	ATCCAT	2	12	514207	514218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.