MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 1309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	TGGC	2	8	40	47	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012853	ACGA	2	8	881	888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012853	GGCG	2	8	1189	1196	0 %	0 %	75 %	25 %	241518163
4	NC_012853	TCAC	2	8	1517	1524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012853	ACCG	2	8	1633	1640	25 %	0 %	25 %	50 %	241518164
6	NC_012853	CGGG	2	8	2077	2084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012853	CCGA	2	8	2337	2344	25 %	0 %	25 %	50 %	241518165
8	NC_012853	TCGC	2	8	2611	2618	0 %	25 %	25 %	50 %	241518166
9	NC_012853	GAGC	2	8	2905	2912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012853	TTCC	2	8	3675	3682	0 %	50 %	0 %	50 %	241518169
11	NC_012853	AGAA	2	8	3683	3690	75 %	0 %	25 %	0 %	241518169
12	NC_012853	CGTG	2	8	3917	3924	0 %	25 %	50 %	25 %	241518169
13	NC_012853	GAAG	2	8	4464	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012853	TGGC	2	8	4842	4849	0 %	25 %	50 %	25 %	241518170
15	NC_012853	TGCG	2	8	5213	5220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012853	CGCC	2	8	5570	5577	0 %	0 %	25 %	75 %	241518171
17	NC_012853	GACC	2	8	6423	6430	25 %	0 %	25 %	50 %	241518172
18	NC_012853	CTGC	2	8	6472	6479	0 %	25 %	25 %	50 %	241518172
19	NC_012853	CCTT	2	8	7690	7697	0 %	50 %	0 %	50 %	241518172
20	NC_012853	GGCG	2	8	8176	8183	0 %	0 %	75 %	25 %	241518173
21	NC_012853	GAAA	2	8	8654	8661	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012853	CCCT	2	8	8745	8752	0 %	25 %	0 %	75 %	241518174
23	NC_012853	AAGC	2	8	10026	10033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012853	TGGC	2	8	10505	10512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012853	GCCG	2	8	10950	10957	0 %	0 %	50 %	50 %	241518175
26	NC_012853	GCCT	2	8	10965	10972	0 %	25 %	25 %	50 %	241518175
27	NC_012853	TGAA	2	8	11785	11792	50 %	25 %	25 %	0 %	241518176
28	NC_012853	GAAG	2	8	12384	12391	50 %	0 %	50 %	0 %	241518177
29	NC_012853	TGGG	2	8	12853	12860	0 %	25 %	75 %	0 %	241518177
30	NC_012853	GAAC	2	8	13309	13316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012853	CGGA	2	8	13421	13428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012853	ACGA	2	8	13490	13497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012853	CAGC	2	8	13742	13749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012853	ATCG	2	8	14417	14424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012853	GATG	2	8	15175	15182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012853	CCAG	2	8	16011	16018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012853	ATCG	2	8	16258	16265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012853	GCCG	2	8	16387	16394	0 %	0 %	50 %	50 %	241518182
39	NC_012853	CTGG	2	8	16904	16911	0 %	25 %	50 %	25 %	241518182
40	NC_012853	TGGC	2	8	16989	16996	0 %	25 %	50 %	25 %	241518182
41	NC_012853	GATG	2	8	17037	17044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012853	GGAA	2	8	17213	17220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012853	GCTG	2	8	17298	17305	0 %	25 %	50 %	25 %	241518183
44	NC_012853	GCTC	2	8	17652	17659	0 %	25 %	25 %	50 %	241518184
45	NC_012853	CTTT	2	8	18162	18169	0 %	75 %	0 %	25 %	241518184
46	NC_012853	GCTG	2	8	18197	18204	0 %	25 %	50 %	25 %	241518184
47	NC_012853	GCAG	2	8	18721	18728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012853	GCCG	2	8	19131	19138	0 %	0 %	50 %	50 %	241518185
49	NC_012853	CGGC	2	8	19395	19402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012853	CGGC	2	8	19556	19563	0 %	0 %	50 %	50 %	241518186
51	NC_012853	GAAA	2	8	20275	20282	75 %	0 %	25 %	0 %	241518187
52	NC_012853	CTCC	2	8	20552	20559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_012853	TGAT	2	8	21081	21088	25 %	50 %	25 %	0 %	241518188
54	NC_012853	ATTG	2	8	21550	21557	25 %	50 %	25 %	0 %	241518190
55	NC_012853	CGGG	2	8	21678	21685	0 %	0 %	75 %	25 %	241518190
56	NC_012853	TGAT	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	241518190
57	NC_012853	GCTT	2	8	22044	22051	0 %	50 %	25 %	25 %	241518190
58	NC_012853	TTCG	2	8	22198	22205	0 %	50 %	25 %	25 %	241518190
59	NC_012853	GGCT	2	8	23784	23791	0 %	25 %	50 %	25 %	241518191
60	NC_012853	GTCC	2	8	24132	24139	0 %	25 %	25 %	50 %	241518192
61	NC_012853	TTTC	2	8	24715	24722	0 %	75 %	0 %	25 %	241518192
62	NC_012853	CTGC	2	8	25074	25081	0 %	25 %	25 %	50 %	241518192
63	NC_012853	GTTC	2	8	25303	25310	0 %	50 %	25 %	25 %	241518192
64	NC_012853	TCGT	2	8	25505	25512	0 %	50 %	25 %	25 %	241518193
65	NC_012853	CCGC	2	8	26232	26239	0 %	0 %	25 %	75 %	241518193
66	NC_012853	CGCA	2	8	26524	26531	25 %	0 %	25 %	50 %	241518193
67	NC_012853	CCTT	2	8	27062	27069	0 %	50 %	0 %	50 %	241518194
68	NC_012853	CCCT	2	8	28368	28375	0 %	25 %	0 %	75 %	241518195
69	NC_012853	CGCT	2	8	28991	28998	0 %	25 %	25 %	50 %	241518195
70	NC_012853	CGGC	2	8	29047	29054	0 %	0 %	50 %	50 %	241518195
71	NC_012853	GGAC	2	8	29242	29249	25 %	0 %	50 %	25 %	241518195
72	NC_012853	TATC	2	8	29398	29405	25 %	50 %	0 %	25 %	241518195
73	NC_012853	CCGC	2	8	29417	29424	0 %	0 %	25 %	75 %	241518195
74	NC_012853	GACC	2	8	29465	29472	25 %	0 %	25 %	50 %	241518195
75	NC_012853	TCAC	2	8	30343	30350	25 %	25 %	0 %	50 %	241518196
76	NC_012853	CCTG	2	8	30546	30553	0 %	25 %	25 %	50 %	241518196
77	NC_012853	GATT	2	8	30703	30710	25 %	50 %	25 %	0 %	241518196
78	NC_012853	CATC	2	8	31437	31444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012853	GTTT	2	8	31456	31463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012853	GGAA	2	8	31764	31771	50 %	0 %	50 %	0 %	241518197
81	NC_012853	GCCG	2	8	32032	32039	0 %	0 %	50 %	50 %	241518197
82	NC_012853	GGGC	2	8	33003	33010	0 %	0 %	75 %	25 %	241518197
83	NC_012853	GGAA	2	8	33425	33432	50 %	0 %	50 %	0 %	241518198
84	NC_012853	GATC	2	8	33821	33828	25 %	25 %	25 %	25 %	241518198
85	NC_012853	CGAT	2	8	34300	34307	25 %	25 %	25 %	25 %	241518198
86	NC_012853	CGAT	2	8	34908	34915	25 %	25 %	25 %	25 %	241518199
87	NC_012853	GCTG	2	8	35890	35897	0 %	25 %	50 %	25 %	241518199
88	NC_012853	CAGC	2	8	36434	36441	25 %	0 %	25 %	50 %	241518200
89	NC_012853	GTTG	2	8	36551	36558	0 %	50 %	50 %	0 %	241518200
90	NC_012853	CGAC	2	8	36631	36638	25 %	0 %	25 %	50 %	241518200
91	NC_012853	CTGG	2	8	37688	37695	0 %	25 %	50 %	25 %	241518201
92	NC_012853	CATG	2	8	38318	38325	25 %	25 %	25 %	25 %	241518201
93	NC_012853	AACC	2	8	38571	38578	50 %	0 %	0 %	50 %	241518201
94	NC_012853	GCAA	2	8	38850	38857	50 %	0 %	25 %	25 %	241518201
95	NC_012853	GATC	2	8	39277	39284	25 %	25 %	25 %	25 %	241518201
96	NC_012853	GACG	2	8	39378	39385	25 %	0 %	50 %	25 %	241518201
97	NC_012853	CGAC	2	8	39604	39611	25 %	0 %	25 %	50 %	241518201
98	NC_012853	ATCC	2	8	40104	40111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012853	GCCA	2	8	40313	40320	25 %	0 %	25 %	50 %	241518203
100	NC_012853	CGAT	2	8	40491	40498	25 %	25 %	25 %	25 %	241518203
101	NC_012853	CAGC	2	8	40876	40883	25 %	0 %	25 %	50 %	241518203
102	NC_012853	ATCT	2	8	41270	41277	25 %	50 %	0 %	25 %	241518203
103	NC_012853	TCAT	2	8	41574	41581	25 %	50 %	0 %	25 %	241518203
104	NC_012853	CGAC	2	8	42269	42276	25 %	0 %	25 %	50 %	241518204
105	NC_012853	GGTC	2	8	42530	42537	0 %	25 %	50 %	25 %	241518204
106	NC_012853	ACGC	2	8	43069	43076	25 %	0 %	25 %	50 %	241518204
107	NC_012853	CAGA	2	8	43489	43496	50 %	0 %	25 %	25 %	241518204
108	NC_012853	GCAG	2	8	43690	43697	25 %	0 %	50 %	25 %	241518205
109	NC_012853	CAAA	2	8	43756	43763	75 %	0 %	0 %	25 %	241518205
110	NC_012853	TGCC	2	8	43898	43905	0 %	25 %	25 %	50 %	241518205
111	NC_012853	GACC	2	8	44058	44065	25 %	0 %	25 %	50 %	241518205
112	NC_012853	GGCT	2	8	44643	44650	0 %	25 %	50 %	25 %	241518205
113	NC_012853	CGTT	2	8	45043	45050	0 %	50 %	25 %	25 %	241518205
114	NC_012853	GTCG	2	8	45372	45379	0 %	25 %	50 %	25 %	241518205
115	NC_012853	TTTC	2	8	46117	46124	0 %	75 %	0 %	25 %	241518206
116	NC_012853	ATCC	2	8	46433	46440	25 %	25 %	0 %	50 %	241518206
117	NC_012853	TCGA	2	8	46538	46545	25 %	25 %	25 %	25 %	241518206
118	NC_012853	CCTC	2	8	47040	47047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_012853	CCGG	2	8	47052	47059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012853	CATC	2	8	47413	47420	25 %	25 %	0 %	50 %	241518207
121	NC_012853	TGGC	2	8	47434	47441	0 %	25 %	50 %	25 %	241518207
122	NC_012853	TCTT	2	8	47642	47649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012853	GCTT	2	8	47687	47694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012853	CATT	2	8	47934	47941	25 %	50 %	0 %	25 %	241518208
125	NC_012853	GTTC	2	8	48122	48129	0 %	50 %	25 %	25 %	241518208
126	NC_012853	GACA	2	8	48317	48324	50 %	0 %	25 %	25 %	241518208
127	NC_012853	CCCG	2	8	48714	48721	0 %	0 %	25 %	75 %	241518208
128	NC_012853	ACTC	2	8	48723	48730	25 %	25 %	0 %	50 %	241518208
129	NC_012853	TCGA	2	8	51527	51534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012853	AAGG	2	8	51914	51921	50 %	0 %	50 %	0 %	241518211
131	NC_012853	GCAG	2	8	52158	52165	25 %	0 %	50 %	25 %	241518211
132	NC_012853	ACCG	2	8	52200	52207	25 %	0 %	25 %	50 %	241518211
133	NC_012853	TCCG	2	8	52690	52697	0 %	25 %	25 %	50 %	241518211
134	NC_012853	TGTT	2	8	52768	52775	0 %	75 %	25 %	0 %	241518211
135	NC_012853	AGCC	2	8	52989	52996	25 %	0 %	25 %	50 %	241518211
136	NC_012853	GAGC	2	8	53321	53328	25 %	0 %	50 %	25 %	241518211
137	NC_012853	AGAA	2	8	53358	53365	75 %	0 %	25 %	0 %	241518211
138	NC_012853	CGGT	2	8	53418	53425	0 %	25 %	50 %	25 %	241518211
139	NC_012853	CGAA	2	8	54254	54261	50 %	0 %	25 %	25 %	241518212
140	NC_012853	AGTG	2	8	54429	54436	25 %	25 %	50 %	0 %	241518212
141	NC_012853	GCAG	2	8	55484	55491	25 %	0 %	50 %	25 %	241518212
142	NC_012853	CATA	2	8	55747	55754	50 %	25 %	0 %	25 %	241518212
143	NC_012853	GTTC	2	8	56418	56425	0 %	50 %	25 %	25 %	241518213
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