MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 7634

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	CGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012853	AGG	2	6	210	215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012853	GCG	2	6	226	231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518162
4	NC_012853	GCG	2	6	249	254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518162
5	NC_012853	GCC	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518162
6	NC_012853	TCT	2	6	351	356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518162
7	NC_012853	CTC	2	6	529	534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518162
8	NC_012853	GTG	2	6	581	586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518162
9	NC_012853	ACC	2	6	730	735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012853	TTC	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012853	CCG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012853	GAC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
13	NC_012853	GGC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518163
14	NC_012853	CAG	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
15	NC_012853	CAC	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518163
16	NC_012853	TCG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518163
17	NC_012853	GAC	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
18	NC_012853	GCT	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518163
19	NC_012853	ATT	2	6	1561	1566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012853	AGG	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012853	GCG	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518164
22	NC_012853	TCG	2	6	1666	1671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518164
23	NC_012853	GAC	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518164
24	NC_012853	TGA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518164
25	NC_012853	GTC	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518164
26	NC_012853	GAC	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518164
27	NC_012853	GAG	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518164
28	NC_012853	CAC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518165
29	NC_012853	CCG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518165
30	NC_012853	GTC	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012853	TCC	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518166
32	NC_012853	GAC	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518166
33	NC_012853	CCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518166
34	NC_012853	GCT	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518166
35	NC_012853	CGT	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518166
36	NC_012853	CGA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518166
37	NC_012853	TGC	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012853	CAC	2	6	2889	2894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012853	ACC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012853	CGT	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012853	GCG	2	6	3158	3163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012853	CAT	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012853	CGT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518168
44	NC_012853	GCC	3	9	3483	3491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518168
45	NC_012853	GAA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518169
46	NC_012853	TGA	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
47	NC_012853	CGC	2	6	3707	3712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518169
48	NC_012853	CGA	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518169
49	NC_012853	CGG	2	6	3738	3743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
50	NC_012853	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
51	NC_012853	ACG	2	6	3829	3834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518169
52	NC_012853	CGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518169
53	NC_012853	GGC	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
54	NC_012853	CGT	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518169
55	NC_012853	TGA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
56	NC_012853	TGG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518169
57	NC_012853	GAT	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
58	NC_012853	TGC	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012853	GCT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012853	CTT	2	6	4384	4389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012853	GGA	2	6	4442	4447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012853	GCC	2	6	4547	4552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
63	NC_012853	GCC	2	6	4786	4791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
64	NC_012853	CGC	2	6	4923	4928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
65	NC_012853	ACA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518170
66	NC_012853	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518170
67	NC_012853	CTT	2	6	5016	5021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012853	GAT	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012853	CGT	2	6	5239	5244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012853	TAA	2	6	5327	5332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012853	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012853	GTC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012853	ACT	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518171
74	NC_012853	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518171
75	NC_012853	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518171
76	NC_012853	TCG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518171
77	NC_012853	CCT	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_012853	GCG	2	6	5691	5696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012853	ACG	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012853	CGT	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012853	TTC	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012853	ACC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518172
83	NC_012853	CGC	2	6	5915	5920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
84	NC_012853	TCA	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
85	NC_012853	CAT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
86	NC_012853	CCT	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518172
87	NC_012853	GAG	2	6	6197	6202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518172
88	NC_012853	GCC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
89	NC_012853	GCT	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
90	NC_012853	GTA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518172
91	NC_012853	AAG	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518172
92	NC_012853	TGA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518172
93	NC_012853	CAT	2	6	6851	6856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
94	NC_012853	TCG	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
95	NC_012853	GGC	2	6	7028	7033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518172
96	NC_012853	GCT	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
97	NC_012853	CGA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
98	NC_012853	TGC	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
99	NC_012853	ACG	2	6	7497	7502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
100	NC_012853	ACG	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
101	NC_012853	TCG	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
102	NC_012853	GCA	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
103	NC_012853	GCG	2	6	7702	7707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518172
104	NC_012853	ACC	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518172
105	NC_012853	ACA	2	6	7738	7743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518172
106	NC_012853	CGC	2	6	7820	7825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
107	NC_012853	GAC	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
108	NC_012853	CGA	3	9	7864	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
109	NC_012853	TCG	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
110	NC_012853	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518172
111	NC_012853	CCG	2	6	8166	8171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518173
112	NC_012853	GTC	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518173
113	NC_012853	CAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518173
114	NC_012853	GCT	2	6	8363	8368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518173
115	NC_012853	TCA	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518173
116	NC_012853	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012853	TTC	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012853	TTC	2	6	8647	8652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012853	CCG	2	6	8672	8677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_012853	TCT	2	6	8725	8730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518174
121	NC_012853	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518174
122	NC_012853	TCA	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518174
123	NC_012853	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518174
124	NC_012853	CGG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518174
125	NC_012853	TCG	2	6	9226	9231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012853	CGG	2	6	9281	9286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012853	TTC	2	6	9446	9451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012853	CTT	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012853	TGT	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012853	TGG	2	6	9579	9584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012853	CGC	2	6	9650	9655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012853	CCT	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012853	TGG	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012853	CGA	2	6	9797	9802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012853	TGG	2	6	9883	9888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012853	CGA	2	6	9956	9961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012853	CTG	2	6	10005	10010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012853	CGT	2	6	10073	10078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012853	GAA	2	6	10146	10151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012853	TGG	2	6	10202	10207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012853	CTT	2	6	10357	10362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012853	TTC	2	6	10448	10453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012853	CGG	2	6	10490	10495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012853	GCG	2	6	10516	10521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012853	CGC	2	6	10705	10710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_012853	AGT	2	6	10774	10779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518175
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155	NC_012853	CGC	2	6	11269	11274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_012853	GAC	2	6	11409	11414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_012853	GCT	2	6	11430	11435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_012853	CCG	2	6	11593	11598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_012853	GCC	2	6	11635	11640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518176
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162	NC_012853	CCG	2	6	12084	12089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_012853	TGT	2	6	19854	19859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012853	CAA	2	6	19881	19886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_012853	TTG	2	6	19924	19929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_012853	TCC	2	6	19975	19980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_012853	AGG	2	6	20100	20105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_012853	GGA	2	6	20111	20116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_012853	CTG	2	6	20138	20143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_012853	CAG	2	6	20290	20295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518187
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272	NC_012853	TCG	2	6	20484	20489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_012853	GAG	2	6	20675	20680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_012853	GCG	2	6	22505	22510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518190
292	NC_012853	ACC	2	6	22543	22548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_012853	AGC	2	6	22588	22593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_012853	ACC	2	6	22615	22620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_012853	ATT	2	6	22664	22669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_012853	CGG	2	6	22844	22849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_012853	TGA	2	6	22933	22938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_012853	CGG	2	6	22952	22957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_012853	ACC	2	6	29746	29751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518196
382	NC_012853	TCA	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518196
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