MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	T	6	6	4823	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	241518170
2	NC_012853	T	7	7	5007	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	241518170
3	NC_012853	A	6	6	6764	6769	100 %	0 %	0 %	0 %	241518172
4	NC_012853	G	6	6	12249	12254	0 %	0 %	100 %	0 %	241518177
5	NC_012853	T	6	6	15338	15343	0 %	100 %	0 %	0 %	241518181
6	NC_012853	C	6	6	24852	24857	0 %	0 %	0 %	100 %	241518192
7	NC_012853	G	10	10	25200	25209	0 %	0 %	100 %	0 %	241518192
8	NC_012853	T	6	6	25345	25350	0 %	100 %	0 %	0 %	241518193
9	NC_012853	A	6	6	25908	25913	100 %	0 %	0 %	0 %	241518193
10	NC_012853	A	6	6	26392	26397	100 %	0 %	0 %	0 %	241518193
11	NC_012853	C	7	7	29222	29228	0 %	0 %	0 %	100 %	241518195
12	NC_012853	T	7	7	29660	29666	0 %	100 %	0 %	0 %	241518195
13	NC_012853	T	6	6	34876	34881	0 %	100 %	0 %	0 %	241518199
14	NC_012853	A	7	7	37557	37563	100 %	0 %	0 %	0 %	241518201
15	NC_012853	G	6	6	38270	38275	0 %	0 %	100 %	0 %	241518201
16	NC_012853	G	6	6	43316	43321	0 %	0 %	100 %	0 %	241518204
17	NC_012853	A	6	6	44470	44475	100 %	0 %	0 %	0 %	241518205
18	NC_012853	T	6	6	45561	45566	0 %	100 %	0 %	0 %	241518205
19	NC_012853	T	6	6	48473	48478	0 %	100 %	0 %	0 %	241518208
20	NC_012853	G	6	6	52216	52221	0 %	0 %	100 %	0 %	241518211
21	NC_012853	T	6	6	55044	55049	0 %	100 %	0 %	0 %	241518212
22	NC_012853	C	6	6	55980	55985	0 %	0 %	0 %	100 %	241518213
23	NC_012853	A	6	6	57304	57309	100 %	0 %	0 %	0 %	241518214
24	NC_012853	G	6	6	58748	58753	0 %	0 %	100 %	0 %	241518215
25	NC_012853	G	6	6	61992	61997	0 %	0 %	100 %	0 %	241518217
26	NC_012853	G	6	6	68888	68893	0 %	0 %	100 %	0 %	241518222
27	NC_012853	A	6	6	74648	74653	100 %	0 %	0 %	0 %	241518228
28	NC_012853	G	6	6	76617	76622	0 %	0 %	100 %	0 %	241518232
29	NC_012853	T	6	6	79684	79689	0 %	100 %	0 %	0 %	241518234
30	NC_012853	A	7	7	80883	80889	100 %	0 %	0 %	0 %	241518235
31	NC_012853	G	6	6	84716	84721	0 %	0 %	100 %	0 %	241518238
32	NC_012853	C	6	6	87878	87883	0 %	0 %	0 %	100 %	241518240
33	NC_012853	G	6	6	95292	95297	0 %	0 %	100 %	0 %	241518247
34	NC_012853	A	6	6	97769	97774	100 %	0 %	0 %	0 %	241518251
35	NC_012853	T	6	6	99206	99211	0 %	100 %	0 %	0 %	241518252
36	NC_012853	T	6	6	99953	99958	0 %	100 %	0 %	0 %	241518253
37	NC_012853	C	6	6	116167	116172	0 %	0 %	0 %	100 %	241518268
38	NC_012853	T	6	6	129396	129401	0 %	100 %	0 %	0 %	241518281
39	NC_012853	T	6	6	137093	137098	0 %	100 %	0 %	0 %	241518288
40	NC_012853	A	6	6	144555	144560	100 %	0 %	0 %	0 %	241518298
41	NC_012853	G	6	6	163151	163156	0 %	0 %	100 %	0 %	241518318
42	NC_012853	C	6	6	163814	163819	0 %	0 %	0 %	100 %	241518319
43	NC_012853	T	6	6	166260	166265	0 %	100 %	0 %	0 %	241518321
44	NC_012853	G	6	6	166838	166843	0 %	0 %	100 %	0 %	241518322
45	NC_012853	G	6	6	182233	182238	0 %	0 %	100 %	0 %	241518339
46	NC_012853	A	6	6	188431	188436	100 %	0 %	0 %	0 %	241518342
47	NC_012853	G	6	6	192081	192086	0 %	0 %	100 %	0 %	241518346
48	NC_012853	A	7	7	200041	200047	100 %	0 %	0 %	0 %	241518349
49	NC_012853	A	6	6	201872	201877	100 %	0 %	0 %	0 %	241518350
50	NC_012853	C	6	6	203573	203578	0 %	0 %	0 %	100 %	241518352
51	NC_012853	A	6	6	207423	207428	100 %	0 %	0 %	0 %	241518358
52	NC_012853	A	6	6	218710	218715	100 %	0 %	0 %	0 %	241518365
53	NC_012853	G	6	6	219213	219218	0 %	0 %	100 %	0 %	241518366
54	NC_012853	A	7	7	220755	220761	100 %	0 %	0 %	0 %	241518367
55	NC_012853	T	6	6	224584	224589	0 %	100 %	0 %	0 %	241518369
56	NC_012853	C	6	6	229889	229894	0 %	0 %	0 %	100 %	241518377
57	NC_012853	A	6	6	229947	229952	100 %	0 %	0 %	0 %	241518377
58	NC_012853	T	7	7	240717	240723	0 %	100 %	0 %	0 %	241518386
59	NC_012853	T	6	6	246599	246604	0 %	100 %	0 %	0 %	241518394
60	NC_012853	T	6	6	259999	260004	0 %	100 %	0 %	0 %	241518404
61	NC_012853	C	6	6	261239	261244	0 %	0 %	0 %	100 %	241518405
62	NC_012853	C	6	6	262690	262695	0 %	0 %	0 %	100 %	241518406
63	NC_012853	G	6	6	266723	266728	0 %	0 %	100 %	0 %	241518409
64	NC_012853	A	6	6	269093	269098	100 %	0 %	0 %	0 %	241518412
65	NC_012853	C	6	6	281067	281072	0 %	0 %	0 %	100 %	241518422
66	NC_012853	T	6	6	281825	281830	0 %	100 %	0 %	0 %	241518422
67	NC_012853	G	6	6	283360	283365	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
68	NC_012853	G	6	6	283866	283871	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
69	NC_012853	A	6	6	285789	285794	100 %	0 %	0 %	0 %	241518426
70	NC_012853	C	6	6	311118	311123	0 %	0 %	0 %	100 %	241518447
71	NC_012853	T	6	6	312101	312106	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
72	NC_012853	T	6	6	312397	312402	0 %	100 %	0 %	0 %	241518447
73	NC_012853	C	6	6	320516	320521	0 %	0 %	0 %	100 %	241518456
74	NC_012853	A	6	6	320666	320671	100 %	0 %	0 %	0 %	241518456
75	NC_012853	T	6	6	342219	342224	0 %	100 %	0 %	0 %	241518474
76	NC_012853	T	6	6	348273	348278	0 %	100 %	0 %	0 %	241518477
77	NC_012853	A	6	6	361139	361144	100 %	0 %	0 %	0 %	241518493
78	NC_012853	A	6	6	361879	361884	100 %	0 %	0 %	0 %	241518494
79	NC_012853	G	6	6	364880	364885	0 %	0 %	100 %	0 %	241518498
80	NC_012853	C	6	6	368186	368191	0 %	0 %	0 %	100 %	241518502
81	NC_012853	T	7	7	368359	368365	0 %	100 %	0 %	0 %	241518502
82	NC_012853	T	6	6	370096	370101	0 %	100 %	0 %	0 %	241518504
83	NC_012853	G	7	7	371304	371310	0 %	0 %	100 %	0 %	241518504
84	NC_012853	T	8	8	372537	372544	0 %	100 %	0 %	0 %	241518505
85	NC_012853	T	6	6	377003	377008	0 %	100 %	0 %	0 %	241518509
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88	NC_012853	A	6	6	402817	402822	100 %	0 %	0 %	0 %	241518532
89	NC_012853	T	6	6	406520	406525	0 %	100 %	0 %	0 %	241518537
90	NC_012853	C	6	6	407885	407890	0 %	0 %	0 %	100 %	241518538
91	NC_012853	A	6	6	410341	410346	100 %	0 %	0 %	0 %	241518541
92	NC_012853	T	6	6	411843	411848	0 %	100 %	0 %	0 %	241518543
93	NC_012853	T	6	6	423340	423345	0 %	100 %	0 %	0 %	241518555
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95	NC_012853	T	6	6	431815	431820	0 %	100 %	0 %	0 %	241518564
96	NC_012853	C	6	6	432987	432992	0 %	0 %	0 %	100 %	241518565
97	NC_012853	A	6	6	438723	438728	100 %	0 %	0 %	0 %	241518572
98	NC_012853	A	6	6	443459	443464	100 %	0 %	0 %	0 %	241518578
99	NC_012853	T	6	6	447370	447375	0 %	100 %	0 %	0 %	241518582
100	NC_012853	A	6	6	453004	453009	100 %	0 %	0 %	0 %	241518588
101	NC_012853	T	6	6	457588	457593	0 %	100 %	0 %	0 %	241518593
102	NC_012853	A	6	6	460724	460729	100 %	0 %	0 %	0 %	241518598
103	NC_012853	C	6	6	468074	468079	0 %	0 %	0 %	100 %	241518604
104	NC_012853	A	6	6	472582	472587	100 %	0 %	0 %	0 %	241518610
105	NC_012853	A	6	6	484315	484320	100 %	0 %	0 %	0 %	241518625
106	NC_012853	C	6	6	484750	484755	0 %	0 %	0 %	100 %	241518626
107	NC_012853	C	6	6	486309	486314	0 %	0 %	0 %	100 %	241518627
108	NC_012853	C	6	6	487065	487070	0 %	0 %	0 %	100 %	241518627
109	NC_012853	G	6	6	491420	491425	0 %	0 %	100 %	0 %	241518632
110	NC_012853	A	6	6	491687	491692	100 %	0 %	0 %	0 %	241518632
111	NC_012853	A	6	6	493743	493748	100 %	0 %	0 %	0 %	241518633
112	NC_012853	C	6	6	494251	494256	0 %	0 %	0 %	100 %	241518634
113	NC_012853	G	6	6	495106	495111	0 %	0 %	100 %	0 %	241518635
114	NC_012853	A	6	6	498029	498034	100 %	0 %	0 %	0 %	241518639
115	NC_012853	A	6	6	504927	504932	100 %	0 %	0 %	0 %	241518645
116	NC_012853	C	6	6	505528	505533	0 %	0 %	0 %	100 %	241518646
117	NC_012853	T	6	6	508502	508507	0 %	100 %	0 %	0 %	241518648
118	NC_012853	C	6	6	511660	511665	0 %	0 %	0 %	100 %	241518650

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.