MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012852	CGGTC	2	10	1109	1118	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012852	TCGCA	2	10	14012	14021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012852	CGCAT	2	10	18134	18143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012852	CTGTA	2	10	18382	18391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012852	TTTCG	2	10	28984	28993	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012852	AGGCC	2	10	44632	44641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012852	CTTCA	2	10	52674	52683	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012852	GTTCG	2	10	53674	53683	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012852	TCACT	2	10	66293	66302	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012852	TTTTA	2	10	66372	66381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012852	TCGCA	2	10	81432	81441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012852	TTCCG	2	10	83772	83781	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012852	CGGCG	2	10	85510	85519	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012852	CCTCC	2	10	86016	86025	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_012852	CGGAG	2	10	106345	106354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012852	ACAGC	2	10	107257	107266	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012852	GGCTT	2	10	116463	116472	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012852	ACCTC	2	10	118708	118717	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012852	TGAGA	2	10	118823	118832	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012852	GGCAC	2	10	127762	127771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012852	GCGGT	2	10	149077	149086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012852	GATCG	2	10	206757	206766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012852	TGGCA	2	10	228136	228145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012852	TTGGC	2	10	231761	231770	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012852	GGGGA	2	10	231798	231807	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012852	GAACG	2	10	242779	242788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012852	GATGC	2	10	245887	245896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012852	TGCAA	2	10	248772	248781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012852	GATCT	2	10	252971	252980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012852	ACCCG	2	10	264023	264032	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_012852	CATCT	2	10	292389	292398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012852	CGTCG	2	10	308858	308867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012852	TCCCA	2	10	318682	318691	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_012852	TCCGT	2	10	337952	337961	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.