MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012852	ATCC	2	8	25	32	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012852	TAAT	2	8	59	66	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012852	TCGC	2	8	1128	1135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012852	GCCC	2	8	1141	1148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_012852	TTCA	2	8	1443	1450	25 %	50 %	0 %	25 %	241258601
6	NC_012852	CCCA	2	8	2166	2173	25 %	0 %	0 %	75 %	241258601
7	NC_012852	GCTC	2	8	2663	2670	0 %	25 %	25 %	50 %	241258601
8	NC_012852	CGGC	3	12	2758	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	241258602
9	NC_012852	GCTG	2	8	2982	2989	0 %	25 %	50 %	25 %	241258602
10	NC_012852	CATC	2	8	4814	4821	25 %	25 %	0 %	50 %	241258604
11	NC_012852	CCGG	2	8	5415	5422	0 %	0 %	50 %	50 %	241258604
12	NC_012852	CAGC	2	8	5736	5743	25 %	0 %	25 %	50 %	241258604
13	NC_012852	CAGG	2	8	7031	7038	25 %	0 %	50 %	25 %	241258605
14	NC_012852	GCCA	2	8	7323	7330	25 %	0 %	25 %	50 %	241258605
15	NC_012852	CCAT	2	8	8455	8462	25 %	25 %	0 %	50 %	241258606
16	NC_012852	GTCG	2	8	8650	8657	0 %	25 %	50 %	25 %	241258607
17	NC_012852	GATC	2	8	9532	9539	25 %	25 %	25 %	25 %	241258608
18	NC_012852	CAAA	2	8	9874	9881	75 %	0 %	0 %	25 %	241258608
19	NC_012852	TCGG	2	8	10085	10092	0 %	25 %	50 %	25 %	241258608
20	NC_012852	CAGT	2	8	10113	10120	25 %	25 %	25 %	25 %	241258608
21	NC_012852	GCCG	2	8	10419	10426	0 %	0 %	50 %	50 %	241258609
22	NC_012852	TGGC	2	8	10587	10594	0 %	25 %	50 %	25 %	241258609
23	NC_012852	CGGC	2	8	10662	10669	0 %	0 %	50 %	50 %	241258609
24	NC_012852	ATCA	2	8	10957	10964	50 %	25 %	0 %	25 %	241258609
25	NC_012852	TGCC	2	8	11688	11695	0 %	25 %	25 %	50 %	241258610
26	NC_012852	ATGG	2	8	12253	12260	25 %	25 %	50 %	0 %	241258610
27	NC_012852	CTCG	2	8	12351	12358	0 %	25 %	25 %	50 %	241258610
28	NC_012852	GATA	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	241258610
29	NC_012852	GCCG	2	8	13584	13591	0 %	0 %	50 %	50 %	241258611
30	NC_012852	CGGA	2	8	13686	13693	25 %	0 %	50 %	25 %	241258611
31	NC_012852	CGTT	2	8	14119	14126	0 %	50 %	25 %	25 %	241258612
32	NC_012852	ATCG	2	8	14351	14358	25 %	25 %	25 %	25 %	241258612
33	NC_012852	CGGT	2	8	14862	14869	0 %	25 %	50 %	25 %	241258612
34	NC_012852	ACCG	2	8	15031	15038	25 %	0 %	25 %	50 %	241258613
35	NC_012852	CCAG	2	8	15063	15070	25 %	0 %	25 %	50 %	241258613
36	NC_012852	GCCC	2	8	15466	15473	0 %	0 %	25 %	75 %	241258613
37	NC_012852	GCTG	2	8	16232	16239	0 %	25 %	50 %	25 %	241258614
38	NC_012852	GGCC	2	8	16836	16843	0 %	0 %	50 %	50 %	241258614
39	NC_012852	CGAT	2	8	17042	17049	25 %	25 %	25 %	25 %	241258615
40	NC_012852	GCCG	2	8	17536	17543	0 %	0 %	50 %	50 %	241258616
41	NC_012852	GCGA	2	8	17678	17685	25 %	0 %	50 %	25 %	241258616
42	NC_012852	GCCG	2	8	17698	17705	0 %	0 %	50 %	50 %	241258616
43	NC_012852	ACGG	2	8	18093	18100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012852	GGGA	2	8	18604	18611	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012852	TGCT	2	8	18799	18806	0 %	50 %	25 %	25 %	241258617
46	NC_012852	GGGA	2	8	18867	18874	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012852	CGTC	2	8	19546	19553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012852	AGGC	2	8	19756	19763	25 %	0 %	50 %	25 %	241258620
49	NC_012852	CCGT	2	8	20226	20233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012852	CGAT	2	8	20349	20356	25 %	25 %	25 %	25 %	241258621
51	NC_012852	TGCG	2	8	20440	20447	0 %	25 %	50 %	25 %	241258621
52	NC_012852	GGCC	2	8	22154	22161	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
53	NC_012852	GCCG	2	8	23594	23601	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
54	NC_012852	CGAG	2	8	23808	23815	25 %	0 %	50 %	25 %	241258624
55	NC_012852	GACA	2	8	23898	23905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012852	GCCA	2	8	25003	25010	25 %	0 %	25 %	50 %	241258625
57	NC_012852	GGAC	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
58	NC_012852	GGCC	2	8	25808	25815	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
59	NC_012852	CGAC	2	8	25877	25884	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
60	NC_012852	CGAG	2	8	26081	26088	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
61	NC_012852	CGAC	2	8	26506	26513	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
62	NC_012852	GGCC	2	8	26913	26920	0 %	0 %	50 %	50 %	241258627
63	NC_012852	CGGT	2	8	28586	28593	0 %	25 %	50 %	25 %	241258628
64	NC_012852	CTTC	2	8	28832	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	241258628
65	NC_012852	GTTG	2	8	29975	29982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012852	AGGC	2	8	30079	30086	25 %	0 %	50 %	25 %	241258630
67	NC_012852	GAAG	2	8	30197	30204	50 %	0 %	50 %	0 %	241258630
68	NC_012852	GCAT	2	8	30739	30746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012852	GGCC	2	8	30863	30870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012852	CTTT	2	8	31363	31370	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
71	NC_012852	CTTT	2	8	31466	31473	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
72	NC_012852	CTGG	2	8	31676	31683	0 %	25 %	50 %	25 %	241258632
73	NC_012852	CCAT	2	8	31690	31697	25 %	25 %	0 %	50 %	241258632
74	NC_012852	GCTC	2	8	32162	32169	0 %	25 %	25 %	50 %	241258632
75	NC_012852	TTCT	2	8	32574	32581	0 %	75 %	0 %	25 %	241258633
76	NC_012852	TTCG	2	8	32948	32955	0 %	50 %	25 %	25 %	241258633
77	NC_012852	TCCC	2	8	33494	33501	0 %	25 %	0 %	75 %	241258633
78	NC_012852	GCCA	2	8	34202	34209	25 %	0 %	25 %	50 %	241258633
79	NC_012852	TATC	2	8	34462	34469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012852	ATTG	2	8	34698	34705	25 %	50 %	25 %	0 %	241258634
81	NC_012852	CGGA	2	8	35156	35163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012852	CAGC	2	8	35344	35351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012852	GGCC	2	8	36157	36164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012852	CGAG	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	241258636
85	NC_012852	GTCG	2	8	36588	36595	0 %	25 %	50 %	25 %	241258636
86	NC_012852	CCGG	2	8	36609	36616	0 %	0 %	50 %	50 %	241258636
87	NC_012852	ATGA	2	8	36777	36784	50 %	25 %	25 %	0 %	241258636
88	NC_012852	AGGC	2	8	36840	36847	25 %	0 %	50 %	25 %	241258636
89	NC_012852	CCAC	2	8	36941	36948	25 %	0 %	0 %	75 %	241258636
90	NC_012852	GTCC	2	8	37061	37068	0 %	25 %	25 %	50 %	241258636
91	NC_012852	GCCT	2	8	37416	37423	0 %	25 %	25 %	50 %	241258637
92	NC_012852	CGCC	2	8	37779	37786	0 %	0 %	25 %	75 %	241258637
93	NC_012852	GCCG	2	8	37918	37925	0 %	0 %	50 %	50 %	241258637
94	NC_012852	TTGC	2	8	38444	38451	0 %	50 %	25 %	25 %	241258638
95	NC_012852	CGCC	2	8	38582	38589	0 %	0 %	25 %	75 %	241258638
96	NC_012852	GCCG	2	8	38692	38699	0 %	0 %	50 %	50 %	241258638
97	NC_012852	GCTC	2	8	39759	39766	0 %	25 %	25 %	50 %	241258639
98	NC_012852	GTCG	2	8	40455	40462	0 %	25 %	50 %	25 %	241258639
99	NC_012852	GAAC	2	8	41127	41134	50 %	0 %	25 %	25 %	241258639
100	NC_012852	GCGG	2	8	41366	41373	0 %	0 %	75 %	25 %	241258639
101	NC_012852	GGTT	2	8	41427	41434	0 %	50 %	50 %	0 %	241258639
102	NC_012852	GATG	2	8	42537	42544	25 %	25 %	50 %	0 %	241258640
103	NC_012852	GAGC	2	8	43394	43401	25 %	0 %	50 %	25 %	241258640
104	NC_012852	GGGC	2	8	43664	43671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012852	GCGA	2	8	44115	44122	25 %	0 %	50 %	25 %	241258641
106	NC_012852	CCGC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	25 %	75 %	241258642
107	NC_012852	CTTC	2	8	44996	45003	0 %	50 %	0 %	50 %	241258642
108	NC_012852	GCAA	2	8	45525	45532	50 %	0 %	25 %	25 %	241258643
109	NC_012852	TCGT	2	8	45958	45965	0 %	50 %	25 %	25 %	241258644
110	NC_012852	CCAG	2	8	46117	46124	25 %	0 %	25 %	50 %	241258644
111	NC_012852	GCCC	2	8	46303	46310	0 %	0 %	25 %	75 %	241258644
112	NC_012852	TCGC	2	8	46349	46356	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
113	NC_012852	GCCT	2	8	46409	46416	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
114	NC_012852	TGCC	2	8	46569	46576	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
115	NC_012852	GAAA	2	8	46652	46659	75 %	0 %	25 %	0 %	241258644
116	NC_012852	CCAA	2	8	46935	46942	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
117	NC_012852	GACC	2	8	46988	46995	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
118	NC_012852	GCCA	2	8	47017	47024	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
119	NC_012852	CTGT	2	8	48529	48536	0 %	50 %	25 %	25 %	241258645
120	NC_012852	GCGA	2	8	48540	48547	25 %	0 %	50 %	25 %	241258645
121	NC_012852	ACCA	2	8	48873	48880	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
122	NC_012852	CTCG	2	8	48966	48973	0 %	25 %	25 %	50 %	241258645
123	NC_012852	CCAT	2	8	49644	49651	25 %	25 %	0 %	50 %	241258646
124	NC_012852	CGGA	2	8	50321	50328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012852	CTCA	2	8	50924	50931	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012852	CGCC	2	8	51002	51009	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_012852	TCGG	2	8	51224	51231	0 %	25 %	50 %	25 %	241258647
128	NC_012852	CACG	2	8	51308	51315	25 %	0 %	25 %	50 %	241258647
129	NC_012852	TCCA	2	8	52119	52126	25 %	25 %	0 %	50 %	241258648
130	NC_012852	GAAC	2	8	52654	52661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012852	TGCC	2	8	54194	54201	0 %	25 %	25 %	50 %	241258650
132	NC_012852	CTTC	2	8	54413	54420	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
133	NC_012852	GCGG	2	8	54500	54507	0 %	0 %	75 %	25 %	241258650
134	NC_012852	CCTT	2	8	54529	54536	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
135	NC_012852	GATT	2	8	55762	55769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012852	CGTC	2	8	56756	56763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012852	GCAA	2	8	57328	57335	50 %	0 %	25 %	25 %	241258651
138	NC_012852	TCCA	2	8	58765	58772	25 %	25 %	0 %	50 %	241258653
139	NC_012852	GGTC	2	8	58793	58800	0 %	25 %	50 %	25 %	241258653
140	NC_012852	ACGG	2	8	59284	59291	25 %	0 %	50 %	25 %	241258654
141	NC_012852	TGGC	2	8	59801	59808	0 %	25 %	50 %	25 %	241258654
142	NC_012852	TCGA	2	8	59915	59922	25 %	25 %	25 %	25 %	241258654
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