MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012852	TTCA	2	8	1443	1450	25 %	50 %	0 %	25 %	241258601
2	NC_012852	CCCA	2	8	2166	2173	25 %	0 %	0 %	75 %	241258601
3	NC_012852	GCTC	2	8	2663	2670	0 %	25 %	25 %	50 %	241258601
4	NC_012852	CGGC	3	12	2758	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	241258602
5	NC_012852	GCTG	2	8	2982	2989	0 %	25 %	50 %	25 %	241258602
6	NC_012852	CATC	2	8	4814	4821	25 %	25 %	0 %	50 %	241258604
7	NC_012852	CCGG	2	8	5415	5422	0 %	0 %	50 %	50 %	241258604
8	NC_012852	CAGC	2	8	5736	5743	25 %	0 %	25 %	50 %	241258604
9	NC_012852	CAGG	2	8	7031	7038	25 %	0 %	50 %	25 %	241258605
10	NC_012852	GCCA	2	8	7323	7330	25 %	0 %	25 %	50 %	241258605
11	NC_012852	CCAT	2	8	8455	8462	25 %	25 %	0 %	50 %	241258606
12	NC_012852	GTCG	2	8	8650	8657	0 %	25 %	50 %	25 %	241258607
13	NC_012852	GATC	2	8	9532	9539	25 %	25 %	25 %	25 %	241258608
14	NC_012852	CAAA	2	8	9874	9881	75 %	0 %	0 %	25 %	241258608
15	NC_012852	TCGG	2	8	10085	10092	0 %	25 %	50 %	25 %	241258608
16	NC_012852	CAGT	2	8	10113	10120	25 %	25 %	25 %	25 %	241258608
17	NC_012852	GCCG	2	8	10419	10426	0 %	0 %	50 %	50 %	241258609
18	NC_012852	TGGC	2	8	10587	10594	0 %	25 %	50 %	25 %	241258609
19	NC_012852	CGGC	2	8	10662	10669	0 %	0 %	50 %	50 %	241258609
20	NC_012852	ATCA	2	8	10957	10964	50 %	25 %	0 %	25 %	241258609
21	NC_012852	TGCC	2	8	11688	11695	0 %	25 %	25 %	50 %	241258610
22	NC_012852	ATGG	2	8	12253	12260	25 %	25 %	50 %	0 %	241258610
23	NC_012852	CTCG	2	8	12351	12358	0 %	25 %	25 %	50 %	241258610
24	NC_012852	GATA	2	8	12375	12382	50 %	25 %	25 %	0 %	241258610
25	NC_012852	GCCG	2	8	13584	13591	0 %	0 %	50 %	50 %	241258611
26	NC_012852	CGGA	2	8	13686	13693	25 %	0 %	50 %	25 %	241258611
27	NC_012852	CGTT	2	8	14119	14126	0 %	50 %	25 %	25 %	241258612
28	NC_012852	ATCG	2	8	14351	14358	25 %	25 %	25 %	25 %	241258612
29	NC_012852	CGGT	2	8	14862	14869	0 %	25 %	50 %	25 %	241258612
30	NC_012852	ACCG	2	8	15031	15038	25 %	0 %	25 %	50 %	241258613
31	NC_012852	CCAG	2	8	15063	15070	25 %	0 %	25 %	50 %	241258613
32	NC_012852	GCCC	2	8	15466	15473	0 %	0 %	25 %	75 %	241258613
33	NC_012852	GCTG	2	8	16232	16239	0 %	25 %	50 %	25 %	241258614
34	NC_012852	GGCC	2	8	16836	16843	0 %	0 %	50 %	50 %	241258614
35	NC_012852	CGAT	2	8	17042	17049	25 %	25 %	25 %	25 %	241258615
36	NC_012852	GCCG	2	8	17536	17543	0 %	0 %	50 %	50 %	241258616
37	NC_012852	GCGA	2	8	17678	17685	25 %	0 %	50 %	25 %	241258616
38	NC_012852	GCCG	2	8	17698	17705	0 %	0 %	50 %	50 %	241258616
39	NC_012852	TGCT	2	8	18799	18806	0 %	50 %	25 %	25 %	241258617
40	NC_012852	AGGC	2	8	19756	19763	25 %	0 %	50 %	25 %	241258620
41	NC_012852	CGAT	2	8	20349	20356	25 %	25 %	25 %	25 %	241258621
42	NC_012852	TGCG	2	8	20440	20447	0 %	25 %	50 %	25 %	241258621
43	NC_012852	GGCC	2	8	22154	22161	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
44	NC_012852	GCCG	2	8	23594	23601	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
45	NC_012852	CGAG	2	8	23808	23815	25 %	0 %	50 %	25 %	241258624
46	NC_012852	GCCA	2	8	25003	25010	25 %	0 %	25 %	50 %	241258625
47	NC_012852	GGAC	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
48	NC_012852	GGCC	2	8	25808	25815	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
49	NC_012852	CGAC	2	8	25877	25884	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
50	NC_012852	CGAG	2	8	26081	26088	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
51	NC_012852	CGAC	2	8	26506	26513	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
52	NC_012852	GGCC	2	8	26913	26920	0 %	0 %	50 %	50 %	241258627
53	NC_012852	CGGT	2	8	28586	28593	0 %	25 %	50 %	25 %	241258628
54	NC_012852	CTTC	2	8	28832	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	241258628
55	NC_012852	AGGC	2	8	30079	30086	25 %	0 %	50 %	25 %	241258630
56	NC_012852	GAAG	2	8	30197	30204	50 %	0 %	50 %	0 %	241258630
57	NC_012852	CTTT	2	8	31363	31370	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
58	NC_012852	CTTT	2	8	31466	31473	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
59	NC_012852	CTGG	2	8	31676	31683	0 %	25 %	50 %	25 %	241258632
60	NC_012852	CCAT	2	8	31690	31697	25 %	25 %	0 %	50 %	241258632
61	NC_012852	GCTC	2	8	32162	32169	0 %	25 %	25 %	50 %	241258632
62	NC_012852	TTCT	2	8	32574	32581	0 %	75 %	0 %	25 %	241258633
63	NC_012852	TTCG	2	8	32948	32955	0 %	50 %	25 %	25 %	241258633
64	NC_012852	TCCC	2	8	33494	33501	0 %	25 %	0 %	75 %	241258633
65	NC_012852	GCCA	2	8	34202	34209	25 %	0 %	25 %	50 %	241258633
66	NC_012852	ATTG	2	8	34698	34705	25 %	50 %	25 %	0 %	241258634
67	NC_012852	CGAG	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	241258636
68	NC_012852	GTCG	2	8	36588	36595	0 %	25 %	50 %	25 %	241258636
69	NC_012852	CCGG	2	8	36609	36616	0 %	0 %	50 %	50 %	241258636
70	NC_012852	ATGA	2	8	36777	36784	50 %	25 %	25 %	0 %	241258636
71	NC_012852	AGGC	2	8	36840	36847	25 %	0 %	50 %	25 %	241258636
72	NC_012852	CCAC	2	8	36941	36948	25 %	0 %	0 %	75 %	241258636
73	NC_012852	GTCC	2	8	37061	37068	0 %	25 %	25 %	50 %	241258636
74	NC_012852	GCCT	2	8	37416	37423	0 %	25 %	25 %	50 %	241258637
75	NC_012852	CGCC	2	8	37779	37786	0 %	0 %	25 %	75 %	241258637
76	NC_012852	GCCG	2	8	37918	37925	0 %	0 %	50 %	50 %	241258637
77	NC_012852	TTGC	2	8	38444	38451	0 %	50 %	25 %	25 %	241258638
78	NC_012852	CGCC	2	8	38582	38589	0 %	0 %	25 %	75 %	241258638
79	NC_012852	GCCG	2	8	38692	38699	0 %	0 %	50 %	50 %	241258638
80	NC_012852	GCTC	2	8	39759	39766	0 %	25 %	25 %	50 %	241258639
81	NC_012852	GTCG	2	8	40455	40462	0 %	25 %	50 %	25 %	241258639
82	NC_012852	GAAC	2	8	41127	41134	50 %	0 %	25 %	25 %	241258639
83	NC_012852	GCGG	2	8	41366	41373	0 %	0 %	75 %	25 %	241258639
84	NC_012852	GGTT	2	8	41427	41434	0 %	50 %	50 %	0 %	241258639
85	NC_012852	GATG	2	8	42537	42544	25 %	25 %	50 %	0 %	241258640
86	NC_012852	GAGC	2	8	43394	43401	25 %	0 %	50 %	25 %	241258640
87	NC_012852	GCGA	2	8	44115	44122	25 %	0 %	50 %	25 %	241258641
88	NC_012852	CCGC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	25 %	75 %	241258642
89	NC_012852	CTTC	2	8	44996	45003	0 %	50 %	0 %	50 %	241258642
90	NC_012852	GCAA	2	8	45525	45532	50 %	0 %	25 %	25 %	241258643
91	NC_012852	TCGT	2	8	45958	45965	0 %	50 %	25 %	25 %	241258644
92	NC_012852	CCAG	2	8	46117	46124	25 %	0 %	25 %	50 %	241258644
93	NC_012852	GCCC	2	8	46303	46310	0 %	0 %	25 %	75 %	241258644
94	NC_012852	TCGC	2	8	46349	46356	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
95	NC_012852	GCCT	2	8	46409	46416	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
96	NC_012852	TGCC	2	8	46569	46576	0 %	25 %	25 %	50 %	241258644
97	NC_012852	GAAA	2	8	46652	46659	75 %	0 %	25 %	0 %	241258644
98	NC_012852	CCAA	2	8	46935	46942	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
99	NC_012852	GACC	2	8	46988	46995	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
100	NC_012852	GCCA	2	8	47017	47024	25 %	0 %	25 %	50 %	241258645
101	NC_012852	CTGT	2	8	48529	48536	0 %	50 %	25 %	25 %	241258645
102	NC_012852	GCGA	2	8	48540	48547	25 %	0 %	50 %	25 %	241258645
103	NC_012852	ACCA	2	8	48873	48880	50 %	0 %	0 %	50 %	241258645
104	NC_012852	CTCG	2	8	48966	48973	0 %	25 %	25 %	50 %	241258645
105	NC_012852	CCAT	2	8	49644	49651	25 %	25 %	0 %	50 %	241258646
106	NC_012852	TCGG	2	8	51224	51231	0 %	25 %	50 %	25 %	241258647
107	NC_012852	CACG	2	8	51308	51315	25 %	0 %	25 %	50 %	241258647
108	NC_012852	TCCA	2	8	52119	52126	25 %	25 %	0 %	50 %	241258648
109	NC_012852	TGCC	2	8	54194	54201	0 %	25 %	25 %	50 %	241258650
110	NC_012852	CTTC	2	8	54413	54420	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
111	NC_012852	GCGG	2	8	54500	54507	0 %	0 %	75 %	25 %	241258650
112	NC_012852	CCTT	2	8	54529	54536	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
113	NC_012852	GCAA	2	8	57328	57335	50 %	0 %	25 %	25 %	241258651
114	NC_012852	TCCA	2	8	58765	58772	25 %	25 %	0 %	50 %	241258653
115	NC_012852	GGTC	2	8	58793	58800	0 %	25 %	50 %	25 %	241258653
116	NC_012852	ACGG	2	8	59284	59291	25 %	0 %	50 %	25 %	241258654
117	NC_012852	TGGC	2	8	59801	59808	0 %	25 %	50 %	25 %	241258654
118	NC_012852	TCGA	2	8	59915	59922	25 %	25 %	25 %	25 %	241258654
119	NC_012852	GAAC	2	8	60003	60010	50 %	0 %	25 %	25 %	241258654
120	NC_012852	CGAT	2	8	60153	60160	25 %	25 %	25 %	25 %	241258654
121	NC_012852	ATCA	2	8	60274	60281	50 %	25 %	0 %	25 %	241258654
122	NC_012852	GCTT	2	8	60336	60343	0 %	50 %	25 %	25 %	241258654
123	NC_012852	GCCC	2	8	60740	60747	0 %	0 %	25 %	75 %	241258654
124	NC_012852	TCGA	2	8	61411	61418	25 %	25 %	25 %	25 %	241258655
125	NC_012852	GCGG	2	8	62980	62987	0 %	0 %	75 %	25 %	241258657
126	NC_012852	GCAT	2	8	63696	63703	25 %	25 %	25 %	25 %	241258658
127	NC_012852	CAGC	2	8	64148	64155	25 %	0 %	25 %	50 %	241258659
128	NC_012852	ATGA	2	8	64267	64274	50 %	25 %	25 %	0 %	241258659
129	NC_012852	ACCA	2	8	64467	64474	50 %	0 %	0 %	50 %	241258659
130	NC_012852	GATC	2	8	65205	65212	25 %	25 %	25 %	25 %	241258660
131	NC_012852	ATCG	2	8	65746	65753	25 %	25 %	25 %	25 %	241258660
132	NC_012852	CCCG	2	8	66635	66642	0 %	0 %	25 %	75 %	241258661
133	NC_012852	CGGC	2	8	66787	66794	0 %	0 %	50 %	50 %	241258661
134	NC_012852	AGCG	2	8	67237	67244	25 %	0 %	50 %	25 %	241258661
135	NC_012852	TCGC	2	8	67662	67669	0 %	25 %	25 %	50 %	241258661
136	NC_012852	GTCT	2	8	68418	68425	0 %	50 %	25 %	25 %	241258661
137	NC_012852	CGGC	2	8	68609	68616	0 %	0 %	50 %	50 %	241258661
138	NC_012852	TCGA	2	8	68870	68877	25 %	25 %	25 %	25 %	241258662
139	NC_012852	CCCA	2	8	69360	69367	25 %	0 %	0 %	75 %	241258662
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