MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012852	C	6	6	3741	3746	0 %	0 %	0 %	100 %	241258603
2	NC_012852	A	6	6	10051	10056	100 %	0 %	0 %	0 %	241258608
3	NC_012852	T	6	6	10258	10263	0 %	100 %	0 %	0 %	241258608
4	NC_012852	A	6	6	15644	15649	100 %	0 %	0 %	0 %	241258613
5	NC_012852	A	7	7	20756	20762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012852	G	6	6	23800	23805	0 %	0 %	100 %	0 %	241258624
7	NC_012852	A	6	6	35021	35026	100 %	0 %	0 %	0 %	241258634
8	NC_012852	C	6	6	43330	43335	0 %	0 %	0 %	100 %	241258640
9	NC_012852	A	6	6	43450	43455	100 %	0 %	0 %	0 %	241258640
10	NC_012852	A	6	6	44242	44247	100 %	0 %	0 %	0 %	241258641
11	NC_012852	A	6	6	44729	44734	100 %	0 %	0 %	0 %	241258642
12	NC_012852	C	6	6	44744	44749	0 %	0 %	0 %	100 %	241258642
13	NC_012852	C	6	6	50133	50138	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_012852	A	7	7	51578	51584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012852	G	6	6	51765	51770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012852	T	6	6	53381	53386	0 %	100 %	0 %	0 %	241258649
17	NC_012852	A	6	6	53393	53398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012852	T	7	7	55104	55110	0 %	100 %	0 %	0 %	241258650
19	NC_012852	A	6	6	75787	75792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012852	C	6	6	77310	77315	0 %	0 %	0 %	100 %	241258667
21	NC_012852	G	6	6	81907	81912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012852	T	6	6	86600	86605	0 %	100 %	0 %	0 %	241258676
23	NC_012852	A	6	6	88006	88011	100 %	0 %	0 %	0 %	241258677
24	NC_012852	A	6	6	89455	89460	100 %	0 %	0 %	0 %	241258678
25	NC_012852	G	6	6	100042	100047	0 %	0 %	100 %	0 %	241258687
26	NC_012852	A	6	6	102678	102683	100 %	0 %	0 %	0 %	241258690
27	NC_012852	G	6	6	104930	104935	0 %	0 %	100 %	0 %	241258693
28	NC_012852	G	6	6	106140	106145	0 %	0 %	100 %	0 %	241258694
29	NC_012852	A	6	6	107869	107874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012852	C	6	6	108054	108059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_012852	G	6	6	110076	110081	0 %	0 %	100 %	0 %	241258697
32	NC_012852	T	6	6	110091	110096	0 %	100 %	0 %	0 %	241258697
33	NC_012852	C	6	6	110776	110781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_012852	A	6	6	114247	114252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012852	A	6	6	115578	115583	100 %	0 %	0 %	0 %	241258703
36	NC_012852	T	6	6	116048	116053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012852	T	6	6	119429	119434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012852	T	6	6	127467	127472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012852	C	6	6	127573	127578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_012852	A	6	6	127834	127839	100 %	0 %	0 %	0 %	241258714
41	NC_012852	G	6	6	128862	128867	0 %	0 %	100 %	0 %	241258714
42	NC_012852	T	6	6	129606	129611	0 %	100 %	0 %	0 %	241258715
43	NC_012852	A	6	6	134241	134246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012852	T	6	6	150514	150519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012852	A	6	6	152315	152320	100 %	0 %	0 %	0 %	241258734
46	NC_012852	A	6	6	156124	156129	100 %	0 %	0 %	0 %	241258738
47	NC_012852	T	6	6	157849	157854	0 %	100 %	0 %	0 %	241258739
48	NC_012852	A	6	6	161443	161448	100 %	0 %	0 %	0 %	241258742
49	NC_012852	T	6	6	168532	168537	0 %	100 %	0 %	0 %	241258747
50	NC_012852	C	6	6	172161	172166	0 %	0 %	0 %	100 %	241258750
51	NC_012852	T	6	6	181390	181395	0 %	100 %	0 %	0 %	241258759
52	NC_012852	A	6	6	207907	207912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012852	G	6	6	212749	212754	0 %	0 %	100 %	0 %	241258788
54	NC_012852	C	6	6	221768	221773	0 %	0 %	0 %	100 %	241258798
55	NC_012852	T	6	6	227979	227984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012852	T	6	6	228092	228097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012852	A	7	7	228187	228193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012852	G	6	6	229527	229532	0 %	0 %	100 %	0 %	241258805
59	NC_012852	T	6	6	231605	231610	0 %	100 %	0 %	0 %	241258808
60	NC_012852	G	6	6	238867	238872	0 %	0 %	100 %	0 %	241258815
61	NC_012852	T	6	6	241768	241773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012852	A	7	7	243650	243656	100 %	0 %	0 %	0 %	241258820
63	NC_012852	T	6	6	250983	250988	0 %	100 %	0 %	0 %	241258828
64	NC_012852	T	6	6	252730	252735	0 %	100 %	0 %	0 %	241258829
65	NC_012852	T	6	6	270827	270832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012852	T	6	6	271241	271246	0 %	100 %	0 %	0 %	241258838
67	NC_012852	A	6	6	271521	271526	100 %	0 %	0 %	0 %	241258838
68	NC_012852	T	6	6	273262	273267	0 %	100 %	0 %	0 %	241258839
69	NC_012852	A	6	6	274611	274616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012852	C	6	6	278094	278099	0 %	0 %	0 %	100 %	241258843
71	NC_012852	A	8	8	283515	283522	100 %	0 %	0 %	0 %	241258847
72	NC_012852	C	8	8	285560	285567	0 %	0 %	0 %	100 %	241258849
73	NC_012852	C	6	6	285585	285590	0 %	0 %	0 %	100 %	241258849
74	NC_012852	T	6	6	289825	289830	0 %	100 %	0 %	0 %	241258852
75	NC_012852	A	6	6	291113	291118	100 %	0 %	0 %	0 %	241258853
76	NC_012852	G	6	6	300122	300127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012852	T	6	6	300234	300239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012852	T	7	7	317688	317694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012852	C	6	6	331209	331214	0 %	0 %	0 %	100 %	241258885
80	NC_012852	A	6	6	337993	337998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012852	T	6	6	341818	341823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012852	A	6	6	345960	345965	100 %	0 %	0 %	0 %	241258900

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.