MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 2826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012850	GCAGC	2	10	2947	2956	20 %	0 %	40 %	40 %	241202758
2	NC_012850	AGCCG	2	10	3114	3123	20 %	0 %	40 %	40 %	241202758
3	NC_012850	CGGGC	2	10	3540	3549	0 %	0 %	60 %	40 %	241202758
4	NC_012850	AGGCA	2	10	4341	4350	40 %	0 %	40 %	20 %	241202759
5	NC_012850	CGTGC	2	10	4951	4960	0 %	20 %	40 %	40 %	241202760
6	NC_012850	ATCGG	2	10	6917	6926	20 %	20 %	40 %	20 %	241202762
7	NC_012850	GGTCG	2	10	8121	8130	0 %	20 %	60 %	20 %	241202764
8	NC_012850	CGCTC	2	10	10195	10204	0 %	20 %	20 %	60 %	241202767
9	NC_012850	CGCGC	2	10	11285	11294	0 %	0 %	40 %	60 %	241202769
10	NC_012850	GCGTC	2	10	11591	11600	0 %	20 %	40 %	40 %	241202769
11	NC_012850	GTCCG	2	10	12410	12419	0 %	20 %	40 %	40 %	241202770
12	NC_012850	GATGG	2	10	19204	19213	20 %	20 %	60 %	0 %	241202775
13	NC_012850	GAATC	2	10	24982	24991	40 %	20 %	20 %	20 %	241202780
14	NC_012850	CGGCA	2	10	26413	26422	20 %	0 %	40 %	40 %	241202782
15	NC_012850	CGGGC	2	10	27144	27153	0 %	0 %	60 %	40 %	241202783
16	NC_012850	CCGCG	2	10	27934	27943	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
17	NC_012850	GCTGA	2	10	28139	28148	20 %	20 %	40 %	20 %	241202784
18	NC_012850	GCGCC	2	10	28244	28253	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
19	NC_012850	GAGCA	2	10	30818	30827	40 %	0 %	40 %	20 %	241202786
20	NC_012850	GAAAT	2	10	33198	33207	60 %	20 %	20 %	0 %	241202790
21	NC_012850	GCCGT	2	10	33300	33309	0 %	20 %	40 %	40 %	241202790
22	NC_012850	CGTCT	2	10	35613	35622	0 %	40 %	20 %	40 %	241202793
23	NC_012850	CCATT	2	10	36583	36592	20 %	40 %	0 %	40 %	241202795
24	NC_012850	TGGTC	2	10	38629	38638	0 %	40 %	40 %	20 %	241202797
25	NC_012850	ATCGA	2	10	45316	45325	40 %	20 %	20 %	20 %	241202801
26	NC_012850	CCGGC	2	10	46573	46582	0 %	0 %	40 %	60 %	241202802
27	NC_012850	ACGGC	2	10	46740	46749	20 %	0 %	40 %	40 %	241202802
28	NC_012850	CGATG	2	10	47542	47551	20 %	20 %	40 %	20 %	241202802
29	NC_012850	CGATC	2	10	47794	47803	20 %	20 %	20 %	40 %	241202802
30	NC_012850	GGCGC	2	10	48373	48382	0 %	0 %	60 %	40 %	241202802
31	NC_012850	CCGGC	2	10	48579	48588	0 %	0 %	40 %	60 %	241202802
32	NC_012850	CGATC	2	10	49989	49998	20 %	20 %	20 %	40 %	241202803
33	NC_012850	AAATT	2	10	50332	50341	60 %	40 %	0 %	0 %	241202804
34	NC_012850	GCATC	2	10	51005	51014	20 %	20 %	20 %	40 %	241202804
35	NC_012850	CGTGC	2	10	51085	51094	0 %	20 %	40 %	40 %	241202804
36	NC_012850	CGGGC	2	10	51584	51593	0 %	0 %	60 %	40 %	241202805
37	NC_012850	GATCG	2	10	51696	51705	20 %	20 %	40 %	20 %	241202805
38	NC_012850	GCGCT	2	10	51898	51907	0 %	20 %	40 %	40 %	241202805
39	NC_012850	AAGGC	2	10	53086	53095	40 %	0 %	40 %	20 %	241202805
40	NC_012850	GGCCA	2	10	53328	53337	20 %	0 %	40 %	40 %	241202805
41	NC_012850	TAGAA	2	10	53774	53783	60 %	20 %	20 %	0 %	241202806
42	NC_012850	AAGCG	2	10	53805	53814	40 %	0 %	40 %	20 %	241202806
43	NC_012850	CCGGC	2	10	56471	56480	0 %	0 %	40 %	60 %	241202809
44	NC_012850	GGCAT	2	10	60712	60721	20 %	20 %	40 %	20 %	241202816
45	NC_012850	CGCAG	2	10	60999	61008	20 %	0 %	40 %	40 %	241202816
46	NC_012850	GCGCC	2	10	67940	67949	0 %	0 %	40 %	60 %	241202824
47	NC_012850	GCAAG	2	10	69638	69647	40 %	0 %	40 %	20 %	241202825
48	NC_012850	GCGCC	2	10	69740	69749	0 %	0 %	40 %	60 %	241202825
49	NC_012850	GCCGC	2	10	70986	70995	0 %	0 %	40 %	60 %	241202826
50	NC_012850	CAACG	2	10	71469	71478	40 %	0 %	20 %	40 %	241202827
51	NC_012850	GCGCG	2	10	73172	73181	0 %	0 %	60 %	40 %	241202830
52	NC_012850	CGGCC	2	10	74756	74765	0 %	0 %	40 %	60 %	241202832
53	NC_012850	CGCGG	2	10	77256	77265	0 %	0 %	60 %	40 %	241202834
54	NC_012850	GCGTC	2	10	77995	78004	0 %	20 %	40 %	40 %	241202835
55	NC_012850	TCGCC	2	10	78876	78885	0 %	20 %	20 %	60 %	241202836
56	NC_012850	GCGCC	2	10	79638	79647	0 %	0 %	40 %	60 %	241202837
57	NC_012850	GAAGA	2	10	80329	80338	60 %	0 %	40 %	0 %	241202837
58	NC_012850	TCGAT	2	10	83071	83080	20 %	40 %	20 %	20 %	241202840
59	NC_012850	GACCG	2	10	83538	83547	20 %	0 %	40 %	40 %	241202841
60	NC_012850	CCGGT	2	10	84673	84682	0 %	20 %	40 %	40 %	241202842
61	NC_012850	AATTC	2	10	86499	86508	40 %	40 %	0 %	20 %	241202844
62	NC_012850	GTCCA	2	10	88143	88152	20 %	20 %	20 %	40 %	241202848
63	NC_012850	AGTTC	2	10	88535	88544	20 %	40 %	20 %	20 %	241202848
64	NC_012850	CATTG	2	10	91661	91670	20 %	40 %	20 %	20 %	241202852
65	NC_012850	TCGCC	2	10	93574	93583	0 %	20 %	20 %	60 %	241202852
66	NC_012850	ACCTC	2	10	94574	94583	20 %	20 %	0 %	60 %	241202853
67	NC_012850	GGGGA	2	10	96069	96078	20 %	0 %	80 %	0 %	241202854
68	NC_012850	ACATC	2	10	98375	98384	40 %	20 %	0 %	40 %	241202856
69	NC_012850	GCCTG	2	10	105211	105220	0 %	20 %	40 %	40 %	241202867
70	NC_012850	TGCGC	2	10	105382	105391	0 %	20 %	40 %	40 %	241202867
71	NC_012850	TCGGT	2	10	108605	108614	0 %	40 %	40 %	20 %	241202869
72	NC_012850	ATGGC	2	10	108834	108843	20 %	20 %	40 %	20 %	241202870
73	NC_012850	GGCGA	2	10	110153	110162	20 %	0 %	60 %	20 %	241202871
74	NC_012850	CGGCA	2	10	111036	111045	20 %	0 %	40 %	40 %	241202872
75	NC_012850	GGCCG	3	15	111561	111575	0 %	0 %	60 %	40 %	241202872
76	NC_012850	CTTGG	2	10	112233	112242	0 %	40 %	40 %	20 %	241202873
77	NC_012850	CGATC	2	10	113980	113989	20 %	20 %	20 %	40 %	241202874
78	NC_012850	TGACC	2	10	116344	116353	20 %	20 %	20 %	40 %	241202876
79	NC_012850	GCGCC	2	10	116492	116501	0 %	0 %	40 %	60 %	241202876
80	NC_012850	CGCCT	2	10	118033	118042	0 %	20 %	20 %	60 %	241202877
81	NC_012850	GCTCG	2	10	122900	122909	0 %	20 %	40 %	40 %	241202882
82	NC_012850	GGCCT	2	10	125653	125662	0 %	20 %	40 %	40 %	241202885
83	NC_012850	CCGTC	2	10	129174	129183	0 %	20 %	20 %	60 %	241202888
84	NC_012850	CGCTT	2	10	130611	130620	0 %	40 %	20 %	40 %	241202890
85	NC_012850	GCACT	2	10	132873	132882	20 %	20 %	20 %	40 %	241202893
86	NC_012850	CGGCG	2	10	133900	133909	0 %	0 %	60 %	40 %	241202894
87	NC_012850	TGCAT	2	10	134573	134582	20 %	40 %	20 %	20 %	241202895
88	NC_012850	CCATC	2	10	136486	136495	20 %	20 %	0 %	60 %	241202896
89	NC_012850	CGGTC	2	10	140516	140525	0 %	20 %	40 %	40 %	241202898
90	NC_012850	ATCGA	2	10	141657	141666	40 %	20 %	20 %	20 %	241202900
91	NC_012850	TGCGA	2	10	142204	142213	20 %	20 %	40 %	20 %	241202900
92	NC_012850	GGCAA	2	10	144747	144756	40 %	0 %	40 %	20 %	241202902
93	NC_012850	GAATG	2	10	149431	149440	40 %	20 %	40 %	0 %	241202906
94	NC_012850	GCGAG	2	10	152501	152510	20 %	0 %	60 %	20 %	241202909
95	NC_012850	CGGCG	2	10	153175	153184	0 %	0 %	60 %	40 %	241202909
96	NC_012850	TCGCT	2	10	153257	153266	0 %	40 %	20 %	40 %	241202910
97	NC_012850	GCATC	2	10	156303	156312	20 %	20 %	20 %	40 %	241202912
98	NC_012850	ACCGG	2	10	156851	156860	20 %	0 %	40 %	40 %	241202913
99	NC_012850	CGGCG	2	10	158893	158902	0 %	0 %	60 %	40 %	241202914
100	NC_012850	CTTGG	2	10	160882	160891	0 %	40 %	40 %	20 %	241202916
101	NC_012850	AGGCG	2	10	163273	163282	20 %	0 %	60 %	20 %	241202917
102	NC_012850	GCCAT	2	10	165318	165327	20 %	20 %	20 %	40 %	241202920
103	NC_012850	ATGCG	2	10	165989	165998	20 %	20 %	40 %	20 %	241202921
104	NC_012850	ACGCG	2	10	166902	166911	20 %	0 %	40 %	40 %	241202922
105	NC_012850	AGCGG	2	10	167130	167139	20 %	0 %	60 %	20 %	241202922
106	NC_012850	GCCGG	2	10	169449	169458	0 %	0 %	60 %	40 %	241202924
107	NC_012850	CCTTT	2	10	170735	170744	0 %	60 %	0 %	40 %	241202927
108	NC_012850	CGTTC	2	10	170787	170796	0 %	40 %	20 %	40 %	241202927
109	NC_012850	GCATT	2	10	177985	177994	20 %	40 %	20 %	20 %	241202933
110	NC_012850	CCGCG	2	10	180332	180341	0 %	0 %	40 %	60 %	241202934
111	NC_012850	GCCGG	2	10	182914	182923	0 %	0 %	60 %	40 %	241202937
112	NC_012850	GCCGC	2	10	184297	184306	0 %	0 %	40 %	60 %	241202939
113	NC_012850	CCGCG	2	10	184794	184803	0 %	0 %	40 %	60 %	241202939
114	NC_012850	GCCTC	2	10	185219	185228	0 %	20 %	20 %	60 %	241202939
115	NC_012850	CGGAT	2	10	188704	188713	20 %	20 %	40 %	20 %	241202943
116	NC_012850	GTGGC	2	10	189766	189775	0 %	20 %	60 %	20 %	241202944
117	NC_012850	CGGCG	2	10	195704	195713	0 %	0 %	60 %	40 %	241202948
118	NC_012850	CTCAT	2	10	196631	196640	20 %	40 %	0 %	40 %	241202948
119	NC_012850	GAGCT	2	10	198164	198173	20 %	20 %	40 %	20 %	241202950
120	NC_012850	AGGCG	2	10	200805	200814	20 %	0 %	60 %	20 %	241202952
121	NC_012850	GCGTC	2	10	201051	201060	0 %	20 %	40 %	40 %	241202952
122	NC_012850	CCGCC	2	10	202083	202092	0 %	0 %	20 %	80 %	241202952
123	NC_012850	TCGGC	2	10	202735	202744	0 %	20 %	40 %	40 %	241202953
124	NC_012850	CGGAT	2	10	203422	203431	20 %	20 %	40 %	20 %	241202953
125	NC_012850	CGCTC	2	10	207259	207268	0 %	20 %	20 %	60 %	241202955
126	NC_012850	GGAAT	2	10	207389	207398	40 %	20 %	40 %	0 %	241202955
127	NC_012850	AATAT	2	10	207553	207562	60 %	40 %	0 %	0 %	241202956
128	NC_012850	TTTCG	2	10	207642	207651	0 %	60 %	20 %	20 %	241202956
129	NC_012850	GCGCC	2	10	207942	207951	0 %	0 %	40 %	60 %	241202956
130	NC_012850	AGGCG	2	10	209835	209844	20 %	0 %	60 %	20 %	241202956
131	NC_012850	CGAGC	2	10	213185	213194	20 %	0 %	40 %	40 %	241202957
132	NC_012850	GCCTC	2	10	213327	213336	0 %	20 %	20 %	60 %	241202958
133	NC_012850	GCAAA	2	10	217968	217977	60 %	0 %	20 %	20 %	241202961
134	NC_012850	GCCGG	2	10	218043	218052	0 %	0 %	60 %	40 %	241202961
135	NC_012850	GGACG	2	10	219705	219714	20 %	0 %	60 %	20 %	241202962
136	NC_012850	GGATC	2	10	220789	220798	20 %	20 %	40 %	20 %	241202963
137	NC_012850	GCAGC	2	10	221869	221878	20 %	0 %	40 %	40 %	241202964
138	NC_012850	GCGAG	2	10	225955	225964	20 %	0 %	60 %	20 %	241202968
139	NC_012850	TTCCA	2	10	229062	229071	20 %	40 %	0 %	40 %	241202971
140	NC_012850	CGGCG	2	10	230208	230217	0 %	0 %	60 %	40 %	241202972
141	NC_012850	ATCAG	2	10	231152	231161	40 %	20 %	20 %	20 %	241202974
142	NC_012850	TCGCC	2	10	235657	235666	0 %	20 %	20 %	60 %	241202980
143	NC_012850	CGGTA	2	10	238482	238491	20 %	20 %	40 %	20 %	241202984
144	NC_012850	GCCTT	2	10	238945	238954	0 %	40 %	20 %	40 %	241202985
145	NC_012850	GCCGA	2	10	240077	240086	20 %	0 %	40 %	40 %	241202986
146	NC_012850	GCGCG	2	10	240673	240682	0 %	0 %	60 %	40 %	241202986
147	NC_012850	GATCT	2	10	241706	241715	20 %	40 %	20 %	20 %	241202986
148	NC_012850	GATCG	2	10	243761	243770	20 %	20 %	40 %	20 %	241202989
149	NC_012850	GGTCA	2	10	244676	244685	20 %	20 %	40 %	20 %	241202990
150	NC_012850	GGCGA	2	10	250680	250689	20 %	0 %	60 %	20 %	241202993
151	NC_012850	CCGCG	2	10	253233	253242	0 %	0 %	40 %	60 %	241202995
152	NC_012850	CGCAG	2	10	255356	255365	20 %	0 %	40 %	40 %	241202997
153	NC_012850	ATCTC	2	10	257145	257154	20 %	40 %	0 %	40 %	241202998
154	NC_012850	CCGAT	2	10	257759	257768	20 %	20 %	20 %	40 %	241202999
155	NC_012850	GCCGC	2	10	259104	259113	0 %	0 %	40 %	60 %	241203001
156	NC_012850	GGCGA	2	10	259357	259366	20 %	0 %	60 %	20 %	241203001
157	NC_012850	CCGCG	2	10	261350	261359	0 %	0 %	40 %	60 %	241203004
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159	NC_012850	GCGAA	2	10	273236	273245	40 %	0 %	40 %	20 %	241203012
160	NC_012850	CGTGC	2	10	274432	274441	0 %	20 %	40 %	40 %	241203012
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164	NC_012850	GGATT	2	10	280159	280168	20 %	40 %	40 %	0 %	241203021
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166	NC_012850	CCATC	2	10	289816	289825	20 %	20 %	0 %	60 %	241203032
167	NC_012850	AGCCG	2	10	290503	290512	20 %	0 %	40 %	40 %	241203033
168	NC_012850	ACTTC	2	10	291219	291228	20 %	40 %	0 %	40 %	241203034
169	NC_012850	GTCTT	2	10	291834	291843	0 %	60 %	20 %	20 %	241203035
170	NC_012850	ATCCA	2	10	292244	292253	40 %	20 %	0 %	40 %	241203036
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173	NC_012850	GAAAG	2	10	295692	295701	60 %	0 %	40 %	0 %	241203040
174	NC_012850	GATCT	2	10	298264	298273	20 %	40 %	20 %	20 %	241203042
175	NC_012850	GAGCG	2	10	299918	299927	20 %	0 %	60 %	20 %	241203044
176	NC_012850	CCCAT	2	10	300843	300852	20 %	20 %	0 %	60 %	241203045
177	NC_012850	TTGCG	2	10	302966	302975	0 %	40 %	40 %	20 %	241203047
178	NC_012850	CCTCG	2	10	303513	303522	0 %	20 %	20 %	60 %	241203047
179	NC_012850	GCGTT	2	10	304033	304042	0 %	40 %	40 %	20 %	241203048
180	NC_012850	CAAGG	2	10	308893	308902	40 %	0 %	40 %	20 %	241203053
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184	NC_012850	CCGCA	2	10	315236	315245	20 %	0 %	20 %	60 %	241203059
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188	NC_012850	CGACC	2	10	320388	320397	20 %	0 %	20 %	60 %	241203065
189	NC_012850	CCTGG	2	10	321617	321626	0 %	20 %	40 %	40 %	241203066
190	NC_012850	CCGGC	2	10	323080	323089	0 %	0 %	40 %	60 %	241203067
191	NC_012850	GCGTC	2	10	323171	323180	0 %	20 %	40 %	40 %	241203067
192	NC_012850	CGTGA	2	10	323268	323277	20 %	20 %	40 %	20 %	241203067
193	NC_012850	TGTGC	2	10	323859	323868	0 %	40 %	40 %	20 %	241203068
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195	NC_012850	CGCGT	2	10	325761	325770	0 %	20 %	40 %	40 %	241203070
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199	NC_012850	GGCCG	2	10	331433	331442	0 %	0 %	60 %	40 %	241203075
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202	NC_012850	ATCAG	2	10	338191	338200	40 %	20 %	20 %	20 %	241203081
203	NC_012850	TGCGC	2	10	338701	338710	0 %	20 %	40 %	40 %	241203081
204	NC_012850	CCGTG	2	10	340685	340694	0 %	20 %	40 %	40 %	241203084
205	NC_012850	CTGAC	2	10	340849	340858	20 %	20 %	20 %	40 %	241203084
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207	NC_012850	GCGCG	2	10	343011	343020	0 %	0 %	60 %	40 %	241203085
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228	NC_012850	CGATC	2	10	365127	365136	20 %	20 %	20 %	40 %	241203112
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240	NC_012850	CGATG	2	10	382488	382497	20 %	20 %	40 %	20 %	241203126
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242	NC_012850	GCTCG	2	10	387595	387604	0 %	20 %	40 %	40 %	241203133
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244	NC_012850	CATCG	2	10	390021	390030	20 %	20 %	20 %	40 %	241203137
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246	NC_012850	CGCGT	2	10	394130	394139	0 %	20 %	40 %	40 %	241203140
247	NC_012850	CCGAA	2	10	394188	394197	40 %	0 %	20 %	40 %	241203140
248	NC_012850	CTGGT	2	10	395469	395478	0 %	40 %	40 %	20 %	241203141
249	NC_012850	GCGCC	2	10	397483	397492	0 %	0 %	40 %	60 %	241203142
250	NC_012850	CGCGG	2	10	398763	398772	0 %	0 %	60 %	40 %	241203144
251	NC_012850	TCGAT	2	10	398956	398965	20 %	40 %	20 %	20 %	241203144
252	NC_012850	GACTG	2	10	400420	400429	20 %	20 %	40 %	20 %	241203145
253	NC_012850	CGGCG	2	10	402161	402170	0 %	0 %	60 %	40 %	241203147
254	NC_012850	GGATC	2	10	404846	404855	20 %	20 %	40 %	20 %	241203149
255	NC_012850	AGCGC	2	10	405620	405629	20 %	0 %	40 %	40 %	241203149
256	NC_012850	CGAGG	2	10	405729	405738	20 %	0 %	60 %	20 %	241203149
257	NC_012850	CCGTA	2	10	407163	407172	20 %	20 %	20 %	40 %	241203150
258	NC_012850	CGCGC	2	10	407962	407971	0 %	0 %	40 %	60 %	241203151
259	NC_012850	GTCGG	2	10	408711	408720	0 %	20 %	60 %	20 %	241203151
260	NC_012850	TCGCC	2	10	409736	409745	0 %	20 %	20 %	60 %	241203152
261	NC_012850	ACCCG	2	10	409773	409782	20 %	0 %	20 %	60 %	241203152
262	NC_012850	CGGCC	2	10	409919	409928	0 %	0 %	40 %	60 %	241203152
263	NC_012850	ACCGC	2	10	410209	410218	20 %	0 %	20 %	60 %	241203152
264	NC_012850	GATCA	2	10	412961	412970	40 %	20 %	20 %	20 %	241203154
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376	NC_012850	GCGCT	2	10	589634	589643	0 %	20 %	40 %	40 %	241203313
377	NC_012850	ATCGC	2	10	590009	590018	20 %	20 %	20 %	40 %	241203314
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379	NC_012850	GATGC	2	10	591256	591265	20 %	20 %	40 %	20 %	241203316
380	NC_012850	GTCGA	2	10	592508	592517	20 %	20 %	40 %	20 %	241203317
381	NC_012850	CTTTA	2	10	596001	596010	20 %	60 %	0 %	20 %	241203321
382	NC_012850	GGAGC	2	10	596370	596379	20 %	0 %	60 %	20 %	241203321
383	NC_012850	ATGGT	2	10	597068	597077	20 %	40 %	40 %	0 %	241203321
384	NC_012850	GCGCC	2	10	598028	598037	0 %	0 %	40 %	60 %	241203322
385	NC_012850	GATCG	2	10	601933	601942	20 %	20 %	40 %	20 %	241203325
386	NC_012850	CCGCG	2	10	603378	603387	0 %	0 %	40 %	60 %	241203326
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388	NC_012850	GCGAT	2	10	605426	605435	20 %	20 %	40 %	20 %	241203327
389	NC_012850	CAATG	2	10	606507	606516	40 %	20 %	20 %	20 %	241203328
390	NC_012850	GGTCA	2	10	606595	606604	20 %	20 %	40 %	20 %	241203328
391	NC_012850	GCGAT	2	10	607508	607517	20 %	20 %	40 %	20 %	241203328
392	NC_012850	CAGCG	2	10	610368	610377	20 %	0 %	40 %	40 %	241203330
393	NC_012850	CGGAG	2	10	610801	610810	20 %	0 %	60 %	20 %	241203330
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