MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 82618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012850	GGC	2	6	7	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012850	GGC	2	6	46	51	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012850	GAC	2	6	72	77	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
4	NC_012850	GCG	2	6	136	141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
5	NC_012850	CGT	2	6	270	275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
6	NC_012850	CAA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202756
7	NC_012850	TCA	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202756
8	NC_012850	GCC	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
9	NC_012850	GCC	2	6	470	475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
10	NC_012850	CAG	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
11	NC_012850	GCC	2	6	529	534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
12	NC_012850	CGC	2	6	557	562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
13	NC_012850	CGC	2	6	572	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
14	NC_012850	TCG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
15	NC_012850	CTG	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
16	NC_012850	CGT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
17	NC_012850	ATG	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202756
18	NC_012850	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202756
19	NC_012850	GAC	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
20	NC_012850	GAT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202756
21	NC_012850	GTC	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
22	NC_012850	GCC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
23	NC_012850	GCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
24	NC_012850	CCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
25	NC_012850	CGA	2	6	1275	1280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
26	NC_012850	CCG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
27	NC_012850	CCG	2	6	1392	1397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
28	NC_012850	GCC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
29	NC_012850	CGG	2	6	1488	1493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
30	NC_012850	TGC	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
31	NC_012850	GGC	2	6	1793	1798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
32	NC_012850	GGC	2	6	1815	1820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
33	NC_012850	ACC	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202757
34	NC_012850	TCA	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202757
35	NC_012850	TCG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
36	NC_012850	CAT	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202757
37	NC_012850	GCA	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
38	NC_012850	CGT	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
39	NC_012850	CGG	2	6	2333	2338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
40	NC_012850	ACG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
41	NC_012850	CGG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
42	NC_012850	TGA	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202757
43	NC_012850	TCT	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202757
44	NC_012850	GCC	2	6	2531	2536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202757
45	NC_012850	TGT	2	6	2549	2554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202757
46	NC_012850	CGC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202757
47	NC_012850	GAC	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
48	NC_012850	CGT	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
49	NC_012850	CTG	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
50	NC_012850	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
51	NC_012850	AAG	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202757
52	NC_012850	GCG	2	6	2841	2846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012850	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012850	CGT	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012850	CGA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
56	NC_012850	TGC	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202758
57	NC_012850	CAG	3	9	3085	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
58	NC_012850	TCG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202758
59	NC_012850	CTC	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202758
60	NC_012850	CCT	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202758
61	NC_012850	CAT	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202758
62	NC_012850	TCA	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202758
63	NC_012850	GCC	3	9	3844	3852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
64	NC_012850	CCG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
65	NC_012850	TGG	2	6	3950	3955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202758
66	NC_012850	CGC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
67	NC_012850	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
68	NC_012850	CAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202759
69	NC_012850	CGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
70	NC_012850	GAC	2	6	4288	4293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
71	NC_012850	CGC	2	6	4308	4313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
72	NC_012850	TGA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202759
73	NC_012850	CGC	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
74	NC_012850	ACC	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202759
75	NC_012850	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202759
76	NC_012850	CGA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
77	NC_012850	CGG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202759
78	NC_012850	ACG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
79	NC_012850	GCC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202760
80	NC_012850	CGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202760
81	NC_012850	GAA	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202760
82	NC_012850	GGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202760
83	NC_012850	CGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
84	NC_012850	CCG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
85	NC_012850	GAG	2	6	5344	5349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202761
86	NC_012850	GGC	2	6	5406	5411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
87	NC_012850	GCC	2	6	5493	5498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
88	NC_012850	GCC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
89	NC_012850	CGA	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
90	NC_012850	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
91	NC_012850	CGG	2	6	5651	5656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
92	NC_012850	GCA	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
93	NC_012850	GGC	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
94	NC_012850	TTC	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202761
95	NC_012850	GGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012850	ATC	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012850	TCG	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
98	NC_012850	TCG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
99	NC_012850	GCG	2	6	6117	6122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
100	NC_012850	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202762
101	NC_012850	CGC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202762
102	NC_012850	CTT	2	6	6274	6279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202762
103	NC_012850	GCG	2	6	6357	6362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
104	NC_012850	GAT	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202762
105	NC_012850	TGT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202762
106	NC_012850	TCA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
107	NC_012850	TCG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
108	NC_012850	CAT	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
109	NC_012850	CGG	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
110	NC_012850	CCT	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202762
111	NC_012850	GGC	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
112	NC_012850	GAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202762
113	NC_012850	ATC	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
114	NC_012850	CTG	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
115	NC_012850	CGA	2	6	6841	6846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202762
116	NC_012850	GAA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202762
117	NC_012850	TCG	2	6	6953	6958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
118	NC_012850	TCG	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
119	NC_012850	TCG	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
120	NC_012850	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202762
121	NC_012850	TGG	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202762
122	NC_012850	CGC	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012850	CTT	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012850	ACG	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202763
125	NC_012850	GCG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
126	NC_012850	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202763
127	NC_012850	TGC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
128	NC_012850	AAC	2	6	7709	7714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202763
129	NC_012850	GTC	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
130	NC_012850	TGC	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
131	NC_012850	GGC	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
132	NC_012850	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
133	NC_012850	CGA	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202763
134	NC_012850	CAG	2	6	7941	7946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
135	NC_012850	CCA	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202764
136	NC_012850	CGA	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
137	NC_012850	CAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
138	NC_012850	CGA	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
139	NC_012850	CCG	2	6	8140	8145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
140	NC_012850	GAA	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202764
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143	NC_012850	GCC	2	6	8359	8364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
144	NC_012850	GCC	2	6	8376	8381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
145	NC_012850	GAA	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202764
146	NC_012850	GCC	3	9	8391	8399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
147	NC_012850	CAT	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202764
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151	NC_012850	CGT	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202764
152	NC_012850	ATG	2	6	8797	8802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202764
153	NC_012850	CGT	2	6	8810	8815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202764
154	NC_012850	GAT	3	9	8835	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202764
155	NC_012850	TTC	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_012850	GCA	2	6	8965	8970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_012850	CTC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_012850	TGC	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_012850	GCT	2	6	9168	9173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202765
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161	NC_012850	GAG	3	9	9319	9327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202765
162	NC_012850	GAG	2	6	9343	9348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202765
163	NC_012850	GCC	2	6	9368	9373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202765
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165	NC_012850	GAA	2	6	9480	9485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202765
166	NC_012850	GGA	2	6	9600	9605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012850	TGA	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202766
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170	NC_012850	CTT	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_012850	CCG	2	6	10044	10049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202767
172	NC_012850	CCT	2	6	10074	10079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202767
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177	NC_012850	CGG	2	6	10386	10391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_012850	TGT	2	6	10437	10442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012850	CGT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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226	NC_012850	TAG	2	6	13225	13230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
227	NC_012850	TGA	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_012850	GGC	2	6	13328	13333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_012850	GCG	2	6	13422	13427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202771
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241	NC_012850	CAT	2	6	14244	14249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202772
242	NC_012850	CCG	2	6	14345	14350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202772
243	NC_012850	CAG	2	6	14359	14364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202772
244	NC_012850	GCC	2	6	14389	14394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202772
245	NC_012850	CGA	2	6	14403	14408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202772
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248	NC_012850	TAG	2	6	14534	14539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202772
249	NC_012850	CGG	2	6	14542	14547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202772
250	NC_012850	GTC	2	6	14602	14607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202772
251	NC_012850	GAT	2	6	14683	14688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202772
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253	NC_012850	CGT	2	6	14766	14771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202772
254	NC_012850	CAC	2	6	14815	14820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202772
255	NC_012850	GGC	2	6	14893	14898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202772
256	NC_012850	CAT	2	6	15025	15030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202772
257	NC_012850	CAT	2	6	15043	15048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202772
258	NC_012850	GCG	2	6	15131	15136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202772
259	NC_012850	AGA	2	6	15159	15164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202772
260	NC_012850	GCC	2	6	15179	15184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202772
261	NC_012850	AGA	2	6	15192	15197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202772
262	NC_012850	TTC	2	6	15250	15255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202772
263	NC_012850	CAG	2	6	15265	15270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202772
264	NC_012850	CCA	2	6	15283	15288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202772
265	NC_012850	CGA	2	6	15297	15302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202772
266	NC_012850	GCC	3	9	15377	15385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202772
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269	NC_012850	GGC	2	6	15446	15451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202772
270	NC_012850	CGG	2	6	15474	15479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202772
271	NC_012850	CAG	2	6	15487	15492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202772
272	NC_012850	GCC	2	6	15704	15709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_012850	TTC	2	6	15735	15740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_012850	TCG	2	6	15787	15792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_012850	GCA	2	6	15869	15874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_012850	CAA	2	6	15894	15899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_012850	AAT	2	6	15928	15933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241202773
278	NC_012850	TGC	2	6	15939	15944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202773
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280	NC_012850	GGA	2	6	16161	16166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202773
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282	NC_012850	GCG	2	6	16277	16282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202773
283	NC_012850	ACT	2	6	16473	16478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202773
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291	NC_012850	CGG	2	6	16905	16910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202773
292	NC_012850	ACA	2	6	16962	16967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202773
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294	NC_012850	TCG	2	6	17281	17286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_012850	ACC	2	6	17389	17394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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298	NC_012850	CAT	2	6	17702	17707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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378	NC_012850	CGC	2	6	23036	23041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202779
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