MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 74757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012850	GAC	2	6	72	77	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
2	NC_012850	GCG	2	6	136	141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
3	NC_012850	CGT	2	6	270	275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
4	NC_012850	CAA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202756
5	NC_012850	TCA	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202756
6	NC_012850	GCC	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
7	NC_012850	GCC	2	6	470	475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
8	NC_012850	CAG	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
9	NC_012850	GCC	2	6	529	534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
10	NC_012850	CGC	2	6	557	562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
11	NC_012850	CGC	2	6	572	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
12	NC_012850	TCG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
13	NC_012850	CTG	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
14	NC_012850	CGT	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
15	NC_012850	ATG	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202756
16	NC_012850	ATC	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202756
17	NC_012850	GAC	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
18	NC_012850	GAT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202756
19	NC_012850	GTC	2	6	976	981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
20	NC_012850	GCC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
21	NC_012850	GCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
22	NC_012850	CCG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
23	NC_012850	CGA	2	6	1275	1280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202756
24	NC_012850	CCG	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
25	NC_012850	CCG	2	6	1392	1397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
26	NC_012850	GCC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202756
27	NC_012850	CGG	2	6	1488	1493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202756
28	NC_012850	TGC	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202756
29	NC_012850	GGC	2	6	1793	1798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
30	NC_012850	GGC	2	6	1815	1820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
31	NC_012850	ACC	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202757
32	NC_012850	TCA	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202757
33	NC_012850	TCG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
34	NC_012850	CAT	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202757
35	NC_012850	GCA	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
36	NC_012850	CGT	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
37	NC_012850	CGG	2	6	2333	2338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
38	NC_012850	ACG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
39	NC_012850	CGG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202757
40	NC_012850	TGA	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202757
41	NC_012850	TCT	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202757
42	NC_012850	GCC	2	6	2531	2536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202757
43	NC_012850	TGT	2	6	2549	2554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202757
44	NC_012850	CGC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202757
45	NC_012850	GAC	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
46	NC_012850	CGT	2	6	2684	2689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
47	NC_012850	CTG	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202757
48	NC_012850	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202757
49	NC_012850	AAG	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202757
50	NC_012850	CGA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
51	NC_012850	TGC	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202758
52	NC_012850	CAG	3	9	3085	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
53	NC_012850	TCG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202758
54	NC_012850	CTC	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202758
55	NC_012850	CCT	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202758
56	NC_012850	CAT	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202758
57	NC_012850	TCA	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202758
58	NC_012850	GCC	3	9	3844	3852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
59	NC_012850	CCG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
60	NC_012850	TGG	2	6	3950	3955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202758
61	NC_012850	CGC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202758
62	NC_012850	GCA	2	6	4047	4052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202758
63	NC_012850	CAA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202759
64	NC_012850	CGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
65	NC_012850	GAC	2	6	4288	4293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
66	NC_012850	CGC	2	6	4308	4313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
67	NC_012850	TGA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202759
68	NC_012850	CGC	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202759
69	NC_012850	ACC	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202759
70	NC_012850	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202759
71	NC_012850	CGA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
72	NC_012850	CGG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202759
73	NC_012850	ACG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202759
74	NC_012850	GCC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202760
75	NC_012850	CGC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202760
76	NC_012850	GAA	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202760
77	NC_012850	GGC	2	6	5062	5067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202760
78	NC_012850	CGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
79	NC_012850	CCG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
80	NC_012850	GAG	2	6	5344	5349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202761
81	NC_012850	GGC	2	6	5406	5411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
82	NC_012850	GCC	2	6	5493	5498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
83	NC_012850	GCC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
84	NC_012850	CGA	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
85	NC_012850	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202761
86	NC_012850	CGG	2	6	5651	5656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
87	NC_012850	GCA	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202761
88	NC_012850	GGC	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202761
89	NC_012850	TTC	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202761
90	NC_012850	TCG	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
91	NC_012850	TCG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
92	NC_012850	GCG	2	6	6117	6122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
93	NC_012850	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202762
94	NC_012850	CGC	2	6	6228	6233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202762
95	NC_012850	CTT	2	6	6274	6279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202762
96	NC_012850	GCG	2	6	6357	6362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
97	NC_012850	GAT	2	6	6379	6384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202762
98	NC_012850	TGT	2	6	6402	6407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202762
99	NC_012850	TCA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
100	NC_012850	TCG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
101	NC_012850	CAT	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
102	NC_012850	CGG	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
103	NC_012850	CCT	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202762
104	NC_012850	GGC	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202762
105	NC_012850	GAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202762
106	NC_012850	ATC	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202762
107	NC_012850	CTG	2	6	6833	6838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
108	NC_012850	CGA	2	6	6841	6846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202762
109	NC_012850	GAA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202762
110	NC_012850	TCG	2	6	6953	6958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
111	NC_012850	TCG	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
112	NC_012850	TCG	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202762
113	NC_012850	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241202762
114	NC_012850	TGG	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202762
115	NC_012850	ACG	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202763
116	NC_012850	GCG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
117	NC_012850	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202763
118	NC_012850	TGC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
119	NC_012850	AAC	2	6	7709	7714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202763
120	NC_012850	GTC	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
121	NC_012850	TGC	2	6	7761	7766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202763
122	NC_012850	GGC	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
123	NC_012850	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202763
124	NC_012850	CGA	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202763
125	NC_012850	CAG	2	6	7941	7946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
126	NC_012850	CCA	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202764
127	NC_012850	CGA	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
128	NC_012850	CAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
129	NC_012850	CGA	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202764
130	NC_012850	CCG	2	6	8140	8145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
131	NC_012850	GAA	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202764
132	NC_012850	CAT	2	6	8286	8291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202764
133	NC_012850	CGG	2	6	8324	8329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202764
134	NC_012850	GCC	2	6	8359	8364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
135	NC_012850	GCC	2	6	8376	8381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
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137	NC_012850	GCC	3	9	8391	8399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202764
138	NC_012850	CAT	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202764
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140	NC_012850	GAT	2	6	8526	8531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202764
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145	NC_012850	GAT	3	9	8835	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202764
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249	NC_012850	GAA	2	6	16253	16258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202773
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251	NC_012850	ACT	2	6	16473	16478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202773
252	NC_012850	TGC	2	6	16595	16600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202773
253	NC_012850	AGG	2	6	16649	16654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202773
254	NC_012850	TAC	2	6	16675	16680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202773
255	NC_012850	GGT	2	6	16711	16716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202773
256	NC_012850	TTC	2	6	16753	16758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202773
257	NC_012850	GGC	2	6	16779	16784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202773
258	NC_012850	CGC	2	6	16800	16805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202773
259	NC_012850	CGG	2	6	16905	16910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202773
260	NC_012850	ACA	2	6	16962	16967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202773
261	NC_012850	CTG	2	6	16993	16998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202773
262	NC_012850	TTG	2	6	17904	17909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202774
263	NC_012850	ATC	2	6	17940	17945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202774
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265	NC_012850	CTG	2	6	18044	18049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202774
266	NC_012850	GGC	2	6	18113	18118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202774
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268	NC_012850	CCT	2	6	18466	18471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202775
269	NC_012850	TCG	2	6	18491	18496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202775
270	NC_012850	ACG	2	6	18643	18648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202775
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272	NC_012850	TAC	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202775
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275	NC_012850	TGC	2	6	18826	18831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202775
276	NC_012850	ATC	2	6	19030	19035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202775
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282	NC_012850	GAC	2	6	19365	19370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202775
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499	NC_012850	CCG	2	6	35581	35586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202793
500	NC_012850	GCC	2	6	35623	35628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202793

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