MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 4022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	TGT	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012849	AAG	2	6	292	297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114101
3	NC_012849	GCA	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
4	NC_012849	CGT	2	6	341	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
5	NC_012849	TCC	2	6	367	372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114101
6	NC_012849	ACA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114101
7	NC_012849	CGC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114101
8	NC_012849	TCG	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
9	NC_012849	ATC	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114101
10	NC_012849	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114101
11	NC_012849	GGC	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114101
12	NC_012849	CCA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114101
13	NC_012849	CTG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
14	NC_012849	GGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114101
15	NC_012849	GCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
16	NC_012849	TGC	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
17	NC_012849	CGT	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
18	NC_012849	ACT	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114101
19	NC_012849	ACC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114101
20	NC_012849	TCC	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114101
21	NC_012849	CAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114101
22	NC_012849	GAC	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
23	NC_012849	TCC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114102
24	NC_012849	GCA	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114102
25	NC_012849	CGG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114102
26	NC_012849	CGC	2	6	1756	1761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114102
27	NC_012849	CGG	2	6	1770	1775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114102
28	NC_012849	TCG	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114102
29	NC_012849	CAA	3	9	2110	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114102
30	NC_012849	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114102
31	NC_012849	ACA	2	6	2175	2180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114102
32	NC_012849	TTA	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012849	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012849	TCA	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012849	GCA	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
36	NC_012849	GTG	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114103
37	NC_012849	TGC	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
38	NC_012849	CCA	3	9	2611	2619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114103
39	NC_012849	TGC	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
40	NC_012849	CAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
41	NC_012849	CAG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
42	NC_012849	ACT	2	6	3007	3012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
43	NC_012849	TCA	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
44	NC_012849	GGT	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114103
45	NC_012849	ATG	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114103
46	NC_012849	AAG	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114103
47	NC_012849	CGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
48	NC_012849	CAA	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114103
49	NC_012849	CGG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114103
50	NC_012849	TGC	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
51	NC_012849	TCG	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
52	NC_012849	CGC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114104
53	NC_012849	GGC	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
54	NC_012849	CCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114104
55	NC_012849	ATG	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114104
56	NC_012849	CGC	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114104
57	NC_012849	GAG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114104
58	NC_012849	ACG	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114104
59	NC_012849	GGC	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
60	NC_012849	TGC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114104
61	NC_012849	GGC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
62	NC_012849	ACC	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012849	AGG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012849	GCT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
65	NC_012849	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
66	NC_012849	CGC	2	6	5740	5745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
67	NC_012849	ACG	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114105
68	NC_012849	CGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
69	NC_012849	CGC	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
70	NC_012849	CGA	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114105
71	NC_012849	TCA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114105
72	NC_012849	TGA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114105
73	NC_012849	TCG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
74	NC_012849	GAC	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
75	NC_012849	ATC	2	6	6115	6120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114106
76	NC_012849	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114106
77	NC_012849	GCC	2	6	6231	6236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114106
78	NC_012849	AGC	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
79	NC_012849	ATG	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114106
80	NC_012849	GGC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
81	NC_012849	ATC	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114106
82	NC_012849	ACG	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
83	NC_012849	GCA	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
84	NC_012849	GGC	2	6	6560	6565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
85	NC_012849	GCT	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
86	NC_012849	CGT	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
87	NC_012849	CAA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114106
88	NC_012849	TGT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114106
89	NC_012849	GGC	2	6	6767	6772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
90	NC_012849	GCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
91	NC_012849	CGT	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
92	NC_012849	TGC	2	6	7119	7124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114107
93	NC_012849	AGA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012849	CAA	2	6	7515	7520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012849	GCC	2	6	7727	7732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_012849	GTA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012849	CGA	2	6	7762	7767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012849	CGC	2	6	7845	7850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012849	CCA	2	6	8030	8035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114108
100	NC_012849	GAC	2	6	8169	8174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
101	NC_012849	CGC	2	6	8252	8257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114108
102	NC_012849	GGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114108
103	NC_012849	TCG	2	6	8359	8364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
104	NC_012849	AGG	2	6	8393	8398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114108
105	NC_012849	GCG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114108
106	NC_012849	CAG	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
107	NC_012849	CAG	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
108	NC_012849	AGT	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114108
109	NC_012849	CAG	2	6	8694	8699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
110	NC_012849	CTG	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
111	NC_012849	GCA	2	6	8781	8786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
112	NC_012849	GCA	2	6	8798	8803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
113	NC_012849	GAT	2	6	8822	8827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114108
114	NC_012849	GCT	2	6	8906	8911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
115	NC_012849	ACC	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114108
116	NC_012849	GTC	3	9	9321	9329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012849	AGC	2	6	9345	9350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012849	TGC	2	6	9426	9431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012849	ACG	2	6	9464	9469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012849	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012849	CAA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012849	TGT	2	6	9866	9871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012849	TTG	2	6	9986	9991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114109
124	NC_012849	GTG	2	6	10025	10030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114109
125	NC_012849	CAT	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114109
126	NC_012849	CGC	2	6	10298	10303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114109
127	NC_012849	GGC	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114109
128	NC_012849	CAG	2	6	10552	10557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012849	GGC	2	6	10672	10677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012849	TCG	2	6	10709	10714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012849	TGA	2	6	10716	10721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012849	GGC	2	6	10808	10813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114110
133	NC_012849	GGC	2	6	10870	10875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114110
134	NC_012849	AGC	2	6	10950	10955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114110
135	NC_012849	ACT	2	6	11136	11141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114110
136	NC_012849	CGT	2	6	11168	11173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012849	GCC	3	9	11219	11227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
138	NC_012849	GCC	2	6	11288	11293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
139	NC_012849	TCT	2	6	11319	11324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114111
140	NC_012849	CGC	2	6	11341	11346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
141	NC_012849	TTC	2	6	11405	11410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114111
142	NC_012849	TCG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
143	NC_012849	CGT	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
144	NC_012849	CGT	2	6	11564	11569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
145	NC_012849	ACC	2	6	11603	11608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114111
146	NC_012849	TCA	2	6	11657	11662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114111
147	NC_012849	GCG	2	6	11663	11668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114111
148	NC_012849	GGC	2	6	11767	11772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114111
149	NC_012849	CTG	2	6	11863	11868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
150	NC_012849	GAT	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114111
151	NC_012849	TCA	2	6	12172	12177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012849	ACA	2	6	12200	12205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114112
153	NC_012849	TCG	2	6	12221	12226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
154	NC_012849	ACG	2	6	12284	12289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114112
155	NC_012849	GTT	2	6	12316	12321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114112
156	NC_012849	CTG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
157	NC_012849	TGG	2	6	12483	12488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114112
158	NC_012849	GCC	2	6	12566	12571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
159	NC_012849	CGA	2	6	12579	12584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114112
160	NC_012849	TGC	2	6	12618	12623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
161	NC_012849	CGC	2	6	12664	12669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
162	NC_012849	CGG	2	6	12792	12797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114112
163	NC_012849	TCG	2	6	12893	12898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
164	NC_012849	TGC	2	6	12915	12920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
165	NC_012849	GCC	2	6	12996	13001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
166	NC_012849	GGC	2	6	13178	13183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114112
167	NC_012849	CAT	2	6	13347	13352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_012849	ACT	2	6	13397	13402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114113
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171	NC_012849	CCA	3	9	13702	13710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114113
172	NC_012849	GTG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114113
173	NC_012849	CAC	2	6	13847	13852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114113
174	NC_012849	CAT	2	6	13904	13909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114113
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178	NC_012849	GAC	2	6	14085	14090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114113
179	NC_012849	AAG	2	6	14100	14105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114113
180	NC_012849	TGG	2	6	14107	14112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114113
181	NC_012849	CGC	2	6	14123	14128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114113
182	NC_012849	ATG	2	6	14130	14135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114113
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187	NC_012849	TGT	2	6	14414	14419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114114
188	NC_012849	CGC	2	6	14528	14533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114114
189	NC_012849	GCT	2	6	14574	14579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114114
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201	NC_012849	CAG	2	6	15147	15152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114115
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213	NC_012849	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114116
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218	NC_012849	CGC	2	6	16584	16589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
219	NC_012849	GAG	2	6	16614	16619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
220	NC_012849	ATG	2	6	16635	16640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114117
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230	NC_012849	GAC	2	6	17070	17075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_012849	AGG	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_012849	ACA	2	6	17110	17115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114118
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238	NC_012849	CGA	2	6	17835	17840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114118
239	NC_012849	AGC	2	6	17842	17847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114118
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241	NC_012849	CAA	3	9	18012	18020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114118
242	NC_012849	ACG	2	6	18129	18134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_012849	ACG	2	6	18163	18168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_012849	GGC	2	6	18197	18202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_012849	ACC	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
246	NC_012849	TGC	2	6	18307	18312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_012849	AGC	2	6	18316	18321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_012849	CCG	3	9	18330	18338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
249	NC_012849	GAT	2	6	18366	18371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_012849	GCC	2	6	18438	18443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
251	NC_012849	TGG	2	6	18511	18516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_012849	CAG	3	9	18517	18525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_012849	CAC	2	6	18581	18586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_012849	CAT	2	6	18612	18617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114119
255	NC_012849	GCT	2	6	18686	18691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114119
256	NC_012849	GTC	2	6	18692	18697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114119
257	NC_012849	GGC	2	6	18722	18727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114119
258	NC_012849	ACG	2	6	18823	18828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114119
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263	NC_012849	GGC	2	6	19066	19071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114120
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271	NC_012849	CGC	2	6	19974	19979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_012849	GTT	2	6	19997	20002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_012849	GCC	2	6	26935	26940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114122
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