MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	A	6	6	5092	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	241114104
2	NC_012849	A	7	7	9250	9256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012849	T	7	7	18574	18580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012849	A	6	6	28184	28189	100 %	0 %	0 %	0 %	241114125
5	NC_012849	T	6	6	29315	29320	0 %	100 %	0 %	0 %	241114127
6	NC_012849	G	7	7	30733	30739	0 %	0 %	100 %	0 %	241114130
7	NC_012849	C	6	6	32344	32349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_012849	C	6	6	32733	32738	0 %	0 %	0 %	100 %	241114133
9	NC_012849	C	6	6	39441	39446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_012849	G	7	7	42238	42244	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012849	C	6	6	49782	49787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_012849	C	6	6	60149	60154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_012849	G	6	6	63429	63434	0 %	0 %	100 %	0 %	241114163
14	NC_012849	T	6	6	67779	67784	0 %	100 %	0 %	0 %	241114166
15	NC_012849	C	6	6	69003	69008	0 %	0 %	0 %	100 %	241114169
16	NC_012849	T	7	7	73629	73635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012849	C	6	6	74332	74337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_012849	T	6	6	75760	75765	0 %	100 %	0 %	0 %	241114172
19	NC_012849	A	6	6	78243	78248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012849	T	6	6	85310	85315	0 %	100 %	0 %	0 %	241114183
21	NC_012849	A	7	7	86971	86977	100 %	0 %	0 %	0 %	241114184
22	NC_012849	T	7	7	89092	89098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012849	C	6	6	90293	90298	0 %	0 %	0 %	100 %	241114188
24	NC_012849	C	6	6	90637	90642	0 %	0 %	0 %	100 %	241114188
25	NC_012849	T	6	6	94367	94372	0 %	100 %	0 %	0 %	241114192
26	NC_012849	G	7	7	103353	103359	0 %	0 %	100 %	0 %	241114201
27	NC_012849	G	6	6	109801	109806	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012849	G	6	6	110523	110528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012849	T	8	8	113976	113983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012849	T	7	7	116154	116160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012849	G	6	6	117738	117743	0 %	0 %	100 %	0 %	241114217
32	NC_012849	T	7	7	120338	120344	0 %	100 %	0 %	0 %	241114220
33	NC_012849	G	6	6	127050	127055	0 %	0 %	100 %	0 %	241114227
34	NC_012849	A	6	6	135027	135032	100 %	0 %	0 %	0 %	241114235
35	NC_012849	T	6	6	138734	138739	0 %	100 %	0 %	0 %	241114240
36	NC_012849	G	6	6	139599	139604	0 %	0 %	100 %	0 %	241114241
37	NC_012849	A	6	6	139719	139724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012849	C	7	7	144574	144580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_012849	T	7	7	144617	144623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012849	T	8	8	146868	146875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012849	A	6	6	154202	154207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012849	G	6	6	156957	156962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012849	A	6	6	157899	157904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012849	C	6	6	157952	157957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_012849	C	6	6	158200	158205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_012849	T	7	7	158310	158316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012849	T	10	10	164441	164450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012849	A	7	7	164513	164519	100 %	0 %	0 %	0 %	241114274
49	NC_012849	T	6	6	169818	169823	0 %	100 %	0 %	0 %	241114277
50	NC_012849	G	6	6	170341	170346	0 %	0 %	100 %	0 %	241114277
51	NC_012849	A	6	6	170928	170933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012849	C	6	6	178070	178075	0 %	0 %	0 %	100 %	241114283
53	NC_012849	G	6	6	180219	180224	0 %	0 %	100 %	0 %	241114284
54	NC_012849	T	6	6	186035	186040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012849	G	6	6	193760	193765	0 %	0 %	100 %	0 %	241114298
56	NC_012849	C	6	6	199978	199983	0 %	0 %	0 %	100 %	241114303
57	NC_012849	T	6	6	203812	203817	0 %	100 %	0 %	0 %	241114309
58	NC_012849	T	7	7	204483	204489	0 %	100 %	0 %	0 %	241114309
59	NC_012849	T	7	7	207194	207200	0 %	100 %	0 %	0 %	241114311
60	NC_012849	G	6	6	212239	212244	0 %	0 %	100 %	0 %	241114316
61	NC_012849	T	7	7	216396	216402	0 %	100 %	0 %	0 %	241114321
62	NC_012849	G	6	6	217037	217042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012849	T	6	6	229925	229930	0 %	100 %	0 %	0 %	241114332
64	NC_012849	G	6	6	231847	231852	0 %	0 %	100 %	0 %	241114334
65	NC_012849	T	6	6	232368	232373	0 %	100 %	0 %	0 %	241114335
66	NC_012849	C	6	6	245161	245166	0 %	0 %	0 %	100 %	241114348
67	NC_012849	T	6	6	248939	248944	0 %	100 %	0 %	0 %	241114349
68	NC_012849	T	6	6	250767	250772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012849	C	6	6	260088	260093	0 %	0 %	0 %	100 %	241114362
70	NC_012849	C	6	6	260846	260851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_012849	C	7	7	262575	262581	0 %	0 %	0 %	100 %	241114364
72	NC_012849	A	7	7	264033	264039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012849	G	7	7	265367	265373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012849	G	6	6	265641	265646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012849	C	6	6	267186	267191	0 %	0 %	0 %	100 %	241114370
76	NC_012849	A	6	6	270630	270635	100 %	0 %	0 %	0 %	241114372
77	NC_012849	C	6	6	271619	271624	0 %	0 %	0 %	100 %	241114373
78	NC_012849	A	6	6	272212	272217	100 %	0 %	0 %	0 %	241114374
79	NC_012849	C	6	6	272299	272304	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_012849	G	9	9	272326	272334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012849	T	6	6	272569	272574	0 %	100 %	0 %	0 %	241114375

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.