MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	GGCCGG	2	12	75	86	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113004
2	NC_012848	GCGGGC	2	12	676	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113004
3	NC_012848	TCATCT	2	12	3210	3221	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241113006
4	NC_012848	CGATCT	2	12	4242	4253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113007
5	NC_012848	CCGTCG	2	12	9874	9885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113010
6	NC_012848	GCTGGG	2	12	10425	10436	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113010
7	NC_012848	CGACGT	2	12	11658	11669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113010
8	NC_012848	GCTCAA	2	12	12618	12629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113011
9	NC_012848	GGTCTT	2	12	13893	13904	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012848	GACGCG	2	12	15174	15185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113013
11	NC_012848	CCGATG	2	12	15917	15928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113014
12	NC_012848	GCAGCG	2	12	16080	16091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113014
13	NC_012848	TGTCGA	2	12	22434	22445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113019
14	NC_012848	TCGGCT	2	12	23252	23263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113020
15	NC_012848	GCCTCG	2	12	26989	27000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113024
16	NC_012848	ACCGAC	2	12	27894	27905	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113024
17	NC_012848	CCGGCA	2	12	31258	31269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113028
18	NC_012848	CCTGCG	2	12	31538	31549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113028
19	NC_012848	CGAGAT	2	12	31646	31657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113028
20	NC_012848	CGATTT	2	12	32369	32380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113028
21	NC_012848	CGGCAA	2	12	34860	34871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113031
22	NC_012848	TGTAGG	2	12	37531	37542	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113033
23	NC_012848	ATCGAA	2	12	38099	38110	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113033
24	NC_012848	CGGTCC	2	12	38284	38295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113033
25	NC_012848	ATCGCC	2	12	40665	40676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113036
26	NC_012848	GGATCC	2	12	42740	42751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113038
27	NC_012848	GGCGAT	2	12	44374	44385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113039
28	NC_012848	CCAGTT	2	12	47267	47278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113041
29	NC_012848	GCCTCG	2	12	47856	47867	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113042
30	NC_012848	CCGGCA	2	12	49088	49099	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113043
31	NC_012848	TCCGGC	2	12	50613	50624	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113045
32	NC_012848	AGCGCG	2	12	51106	51117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113045
33	NC_012848	GCCAGC	2	12	51946	51957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113046
34	NC_012848	GCGCCG	2	12	52369	52380	0 %	0 %	50 %	50 %	241113046
35	NC_012848	GAGACG	2	12	53660	53671	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113048
36	NC_012848	GTCATC	2	12	60360	60371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113053
37	NC_012848	ATCCGG	2	12	60739	60750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113054
38	NC_012848	GCTCAA	2	12	61671	61682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113055
39	NC_012848	CGGCGT	2	12	63087	63098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113056
40	NC_012848	GACGGT	2	12	65055	65066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012848	CGAAAG	2	12	67009	67020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113058
42	NC_012848	TCTTCC	2	12	72936	72947	0 %	50 %	0 %	50 %	241113063
43	NC_012848	AGTGCA	2	12	75276	75287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012848	CAGCGT	2	12	78771	78782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113068
45	NC_012848	GCCACC	2	12	83528	83539	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241113072
46	NC_012848	ACCGGC	2	12	86776	86787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113074
47	NC_012848	CCAGAT	2	12	87021	87032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113074
48	NC_012848	CGGCGA	2	12	91244	91255	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113079
49	NC_012848	CAGATC	2	12	91341	91352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113079
50	NC_012848	AGCTCG	2	12	95291	95302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113083
51	NC_012848	GCGAAC	2	12	96526	96537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113084
52	NC_012848	GCTGAC	2	12	97739	97750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113084
53	NC_012848	CTCGCA	2	12	97985	97996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113084
54	NC_012848	CCGTAT	2	12	99276	99287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113086
55	NC_012848	TCGGGC	2	12	99394	99405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113086
56	NC_012848	AGGAAA	2	12	101073	101084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113089
57	NC_012848	GCTCGA	2	12	101787	101798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113089
58	NC_012848	GACATC	2	12	101948	101959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113090
59	NC_012848	CGGCAA	2	12	102023	102034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113090
60	NC_012848	CCAGAT	2	12	108698	108709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113097
61	NC_012848	TCGGCC	2	12	111885	111896	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113098
62	NC_012848	TCGGCA	2	12	114325	114336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113100
63	NC_012848	TCGCCG	2	12	116574	116585	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113103
64	NC_012848	AGAACG	2	12	118980	118991	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113105
65	NC_012848	GCTCTT	2	12	120049	120060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113106
66	NC_012848	TGAAGG	2	12	120561	120572	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113106
67	NC_012848	CGAGGC	2	12	120705	120716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113106
68	NC_012848	ATCTCC	2	12	122074	122085	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241113108
69	NC_012848	TGAAGA	2	12	122240	122251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113108
70	NC_012848	CCTTGC	2	12	122576	122587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113108
71	NC_012848	CGAGTT	2	12	123882	123893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113109
72	NC_012848	CCATGG	2	12	129272	129283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113114
73	NC_012848	CCATAT	2	12	136460	136471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012848	TGCTGA	2	12	140846	140857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113124
75	NC_012848	TGCTGA	2	12	140979	140990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113125
76	NC_012848	CTGATC	2	12	142289	142300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113125
77	NC_012848	CCGGCA	2	12	144518	144529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113128
78	NC_012848	CCGGCG	2	12	146184	146195	0 %	0 %	50 %	50 %	241113129
79	NC_012848	TTGCCG	2	12	151854	151865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113134
80	NC_012848	CGACGG	2	12	153123	153134	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113135
81	NC_012848	CCGAGG	2	12	154291	154302	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113136
82	NC_012848	CGCCGA	2	12	154331	154342	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113136
83	NC_012848	GGCGAT	2	12	156081	156092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113138
84	NC_012848	CCGAGC	2	12	156116	156127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113138
85	NC_012848	GGTGAT	2	12	162128	162139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113146
86	NC_012848	ATGGCG	2	12	165474	165485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113150
87	NC_012848	GGCCGG	2	12	165769	165780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113150
88	NC_012848	CCGCAC	2	12	167251	167262	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241113152
89	NC_012848	CGATGC	2	12	169627	169638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113155
90	NC_012848	AGCGAA	2	12	169827	169838	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113155
91	NC_012848	AGCGCC	2	12	171459	171470	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113156
92	NC_012848	TCATTG	2	12	171864	171875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113157
93	NC_012848	GTCGAT	2	12	174828	174839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113159
94	NC_012848	GCGACG	2	12	175759	175770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113159
95	NC_012848	TTGCCT	2	12	180469	180480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113165
96	NC_012848	CCGGCG	2	12	183453	183464	0 %	0 %	50 %	50 %	241113167
97	NC_012848	GCAAGA	2	12	186663	186674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113169
98	NC_012848	CCGCGG	2	12	192458	192469	0 %	0 %	50 %	50 %	241113173
99	NC_012848	CCCGAA	2	12	196259	196270	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113175
100	NC_012848	TGCCGA	2	12	196864	196875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113176
101	NC_012848	CGATGG	2	12	196996	197007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113176
102	NC_012848	ATGCCA	2	12	202495	202506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113181
103	NC_012848	AGATCG	2	12	203237	203248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113182
104	NC_012848	GTCAAG	2	12	203491	203502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113182
105	NC_012848	CAGGGC	2	12	205707	205718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113185
106	NC_012848	GCCGGC	2	12	206256	206267	0 %	0 %	50 %	50 %	241113185
107	NC_012848	CTGCGA	2	12	206570	206581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113186
108	NC_012848	ACAAGA	2	12	213249	213260	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	241113192
109	NC_012848	CGCTGG	2	12	215304	215315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113194
110	NC_012848	ACCGCA	2	12	215321	215332	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113194
111	NC_012848	CGGCAC	2	12	217492	217503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113196
112	NC_012848	TTCGAA	2	12	219872	219883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241113198
113	NC_012848	GCCGGT	2	12	224628	224639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113202
114	NC_012848	CGATGC	2	12	224816	224827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113202
115	NC_012848	TTCTGG	2	12	230795	230806	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012848	ATCCTG	2	12	231211	231222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113207
117	NC_012848	GCCGAG	2	12	232541	232552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113209
118	NC_012848	ATCTTC	2	12	240374	240385	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241113214
119	NC_012848	GTCGCC	2	12	240643	240654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113215
120	NC_012848	CATGAT	2	12	246108	246119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241113219
121	NC_012848	TCCTGA	2	12	246407	246418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113219
122	NC_012848	TGGTCG	2	12	249976	249987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113223
123	NC_012848	TCGCCA	2	12	254933	254944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113227
124	NC_012848	ATGCCT	2	12	256216	256227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113228
125	NC_012848	TCCCAC	2	12	256848	256859	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012848	CTGCGG	2	12	258006	258017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113231
127	NC_012848	AAGACC	2	12	258427	258438	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241113231
128	NC_012848	CCAGCG	2	12	260161	260172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012848	TTGGAG	2	12	262135	262146	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113233
130	NC_012848	CGGAAG	2	12	263456	263467	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113234
131	NC_012848	TCGGTT	2	12	264565	264576	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241113235
132	NC_012848	GGATCC	2	12	267743	267754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012848	ATCGAT	2	12	283682	283693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_012848	GGTAGA	2	12	287461	287472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113253
135	NC_012848	GTAGAG	2	12	289333	289344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113255
136	NC_012848	CATTTT	2	12	314980	314991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	241113278
137	NC_012848	CGCGGA	2	12	316560	316571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012848	CTGGAC	2	12	318972	318983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113282
139	NC_012848	CCGTTG	2	12	322898	322909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113286
140	NC_012848	CGCTTT	2	12	327352	327363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113288
141	NC_012848	TGTTGC	2	12	330695	330706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_012848	GGCGAT	2	12	336293	336304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113298
143	NC_012848	TCGCTG	2	12	337470	337481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113298
144	NC_012848	GCGACG	2	12	337482	337493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113298
145	NC_012848	CGACGC	2	12	340421	340432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113300
146	NC_012848	GAATCG	2	12	341424	341435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113301
147	NC_012848	ATCTTG	2	12	355796	355807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113315
148	NC_012848	TGCCGG	2	12	357617	357628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113317
149	NC_012848	TGACCC	2	12	360329	360340	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113318
150	NC_012848	ACATGC	2	12	363734	363745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113319
151	NC_012848	TTCGGC	2	12	367412	367423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113323
152	NC_012848	GCCGCT	2	12	367705	367716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113323
153	NC_012848	CGTCAT	2	12	370246	370257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113326
154	NC_012848	CAGGAA	2	12	370446	370457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113327
155	NC_012848	GCCGAG	2	12	371764	371775	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113328
156	NC_012848	GGAGGC	2	12	375099	375110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241113331
157	NC_012848	GGCGAG	2	12	377082	377093	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241113333
158	NC_012848	GCCTTC	2	12	379725	379736	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113336
159	NC_012848	GCGCTT	2	12	380058	380069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113337
160	NC_012848	TGGAGG	2	12	380266	380277	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	241113337
161	NC_012848	CCGGCG	2	12	384073	384084	0 %	0 %	50 %	50 %	241113340
162	NC_012848	GGCCCG	2	12	388398	388409	0 %	0 %	50 %	50 %	241113343
163	NC_012848	TCAGGG	2	12	388631	388642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113343
164	NC_012848	TTCTTG	2	12	391603	391614	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	241113346
165	NC_012848	GCCGCG	2	12	393558	393569	0 %	0 %	50 %	50 %	241113348
166	NC_012848	GCACGC	2	12	394583	394594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113348
167	NC_012848	AGGCCG	3	18	396271	396288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113350
168	NC_012848	GTCGAG	2	12	398069	398080	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113352
169	NC_012848	GGCTGG	2	12	399653	399664	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113353
170	NC_012848	CAGATG	2	12	403751	403762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113359
171	NC_012848	CGCAGC	2	12	406096	406107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
172	NC_012848	TCGCGG	2	12	408322	408333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113362
173	NC_012848	CTTGTT	3	18	408528	408545	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	241113362
174	NC_012848	AGCGCC	2	12	411974	411985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113364
175	NC_012848	CTCTTG	2	12	413639	413650	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113366
176	NC_012848	ATCGGC	2	12	414265	414276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113366
177	NC_012848	TTCGGC	2	12	417025	417036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113369
178	NC_012848	CGACGC	2	12	424015	424026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113378
179	NC_012848	TTGATC	2	12	425567	425578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113379
180	NC_012848	ATAGCC	2	12	430161	430172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113387
181	NC_012848	CGATGT	2	12	432193	432204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113388
182	NC_012848	GTCCCA	2	12	432338	432349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113388
183	NC_012848	CGCCAG	2	12	432930	432941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113389
184	NC_012848	CCGGTT	2	12	434608	434619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113391
185	NC_012848	TCGCCA	2	12	434685	434696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113391
186	NC_012848	CCTTGC	2	12	435088	435099	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113391
187	NC_012848	GACGAG	2	12	436520	436531	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113393
188	NC_012848	CGAGAT	2	12	438029	438040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113394
189	NC_012848	TTGCCG	2	12	442993	443004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113400
190	NC_012848	CCGTCG	2	12	443801	443812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113400
191	NC_012848	CATGAT	2	12	444558	444569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241113401
192	NC_012848	TGCCCT	2	12	446083	446094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113403
193	NC_012848	GAGATC	2	12	447605	447616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113404
194	NC_012848	AAAGGC	2	12	450018	450029	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113408
195	NC_012848	CGAGCT	2	12	454706	454717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113411
196	NC_012848	CGCTTC	2	12	454974	454985	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113411
197	NC_012848	GAAAGA	2	12	459298	459309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113415
198	NC_012848	AGCGAA	2	12	459789	459800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113415
199	NC_012848	TTTTCA	2	12	461706	461717	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	241113416
200	NC_012848	GCCAGC	2	12	467296	467307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113420
201	NC_012848	GATCGC	2	12	468163	468174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113421
202	NC_012848	TTCCTG	2	12	469983	469994	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113422
203	NC_012848	CGACGG	2	12	475368	475379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113427
204	NC_012848	TCAAGG	2	12	475469	475480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113427
205	NC_012848	GCGCTG	2	12	478420	478431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113429
206	NC_012848	GCCTTC	2	12	486022	486033	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113433
207	NC_012848	CTGCGG	2	12	489974	489985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113436
208	NC_012848	TTCCGC	2	12	499601	499612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113441
209	NC_012848	GGGCTG	2	12	499695	499706	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113441
210	NC_012848	GCCATG	2	12	502936	502947	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113446
211	NC_012848	CGACGG	2	12	503088	503099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113447
212	NC_012848	TCGACG	2	12	504160	504171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113448
213	NC_012848	ATCCTC	2	12	508056	508067	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241113448
214	NC_012848	CGGCAT	2	12	508517	508528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113448
215	NC_012848	CGGCGC	2	12	508724	508735	0 %	0 %	50 %	50 %	241113448
216	NC_012848	GCCTTC	2	12	509139	509150	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113448
217	NC_012848	GGACCG	2	12	511388	511399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113449
218	NC_012848	CTGAAT	2	12	517645	517656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_012848	CGTTGC	2	12	522237	522248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113461
220	NC_012848	TCAGCC	2	12	526807	526818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113465
221	NC_012848	CACCTC	2	12	528376	528387	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	241113467
222	NC_012848	GCAGCG	2	12	532699	532710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113471
223	NC_012848	GCGACG	2	12	533594	533605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113471
224	NC_012848	AATGCC	2	12	536548	536559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113473
225	NC_012848	CGCGAC	2	12	538562	538573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113475
226	NC_012848	AGGAGC	2	12	539451	539462	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113475
227	NC_012848	GACCAC	2	12	541330	541341	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113478
228	NC_012848	CGGTCA	2	12	544530	544541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113480
229	NC_012848	GATGTC	2	12	545245	545256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241113481
230	NC_012848	TCGTAT	2	12	545453	545464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113481
231	NC_012848	TGTTAC	2	12	547062	547073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113483
232	NC_012848	ACAAGG	2	12	550552	550563	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
233	NC_012848	CGGTGT	2	12	552641	552652	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113485
234	NC_012848	CCAGCG	2	12	554206	554217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113487
235	NC_012848	TCACCG	2	12	556042	556053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113488
236	NC_012848	TCGGCG	2	12	558628	558639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113490
237	NC_012848	CGGCAT	2	12	559118	559129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113490
238	NC_012848	GATCAA	2	12	560524	560535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113492
239	NC_012848	CCGTTG	2	12	563027	563038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113494
240	NC_012848	GGCTGG	2	12	566832	566843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113497
241	NC_012848	CCGTCT	2	12	567628	567639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113497
242	NC_012848	CGGTGC	2	12	568960	568971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113499
243	NC_012848	CGCTGG	2	12	575399	575410	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113504
244	NC_012848	TCTTGC	2	12	576305	576316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113505
245	NC_012848	GCAATG	2	12	576753	576764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113506
246	NC_012848	CGAGAT	2	12	579119	579130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113508
247	NC_012848	CTTGGC	2	12	579249	579260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113508
248	NC_012848	ATCGTA	2	12	579264	579275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241113508
249	NC_012848	ATCGAA	2	12	581819	581830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113510
250	NC_012848	GCTTCG	2	12	583586	583597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113512
251	NC_012848	GGAACC	2	12	583693	583704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113512
252	NC_012848	CCAGCG	2	12	589742	589753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113516
253	NC_012848	TCGCGC	2	12	595189	595200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113522
254	NC_012848	TGTTCA	2	12	596067	596078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113523
255	NC_012848	CATGCC	2	12	596837	596848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113525
256	NC_012848	GCTCCC	2	12	598210	598221	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	241113525
257	NC_012848	TGACGA	2	12	604632	604643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113527
258	NC_012848	TCGAAA	2	12	606572	606583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113529
259	NC_012848	GCCGGC	2	12	610227	610238	0 %	0 %	50 %	50 %	241113532
260	NC_012848	GCTGGT	2	12	611014	611025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113533
261	NC_012848	CGGCAA	2	12	618046	618057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113540
262	NC_012848	TGCCGA	2	12	618302	618313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113540
263	NC_012848	CAGCGC	2	12	618841	618852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113541
264	NC_012848	AGCGCC	2	12	621380	621391	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113544
265	NC_012848	GTCAGC	2	12	622057	622068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113545
266	NC_012848	ACCATC	2	12	623508	623519	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	241113546
267	NC_012848	GATGCC	2	12	624080	624091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113547
268	NC_012848	ATTTCG	2	12	625375	625386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
269	NC_012848	GGAGGC	2	12	625896	625907	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241113548
270	NC_012848	GCCGGC	2	12	628178	628189	0 %	0 %	50 %	50 %	241113550
271	NC_012848	TGCCGA	2	12	632632	632643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113554
272	NC_012848	CCAGCG	2	12	633417	633428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113555
273	NC_012848	CGTGGA	2	12	634980	634991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113556
274	NC_012848	AGGGCC	2	12	637492	637503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113559
275	NC_012848	GTTTCC	2	12	638038	638049	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113560
276	NC_012848	CGCTGC	2	12	639506	639517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113561
277	NC_012848	TGCGCC	2	12	639958	639969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113561
278	NC_012848	GCCGAC	2	12	641712	641723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113563
279	NC_012848	TCCGGC	2	12	647275	647286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113568
280	NC_012848	GGCGCT	2	12	647646	647657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113568
281	NC_012848	ATCGCC	2	12	648119	648130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113569
282	NC_012848	GCGCTG	2	12	649106	649117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113570
283	NC_012848	ATGCCT	2	12	651952	651963	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113573
284	NC_012848	GGCGCG	2	12	651984	651995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113573
285	NC_012848	TCCATC	2	12	657808	657819	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241113578
286	NC_012848	CAGGCT	2	12	660626	660637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113582
287	NC_012848	TGTCGG	2	12	663595	663606	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113584
288	NC_012848	GTCATC	2	12	664925	664936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113585
289	NC_012848	CCGTCG	2	12	665118	665129	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113585
290	NC_012848	ATCGTC	2	12	665159	665170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113585
291	NC_012848	TAGGAA	2	12	665589	665600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113585
292	NC_012848	CTTCAA	2	12	667288	667299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113587
293	NC_012848	ACGATG	2	12	667797	667808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113587
294	NC_012848	TGGCGA	2	12	671308	671319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113589
295	NC_012848	AGCGTC	2	12	671856	671867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113590
296	NC_012848	TCGAGA	2	12	676199	676210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113596
297	NC_012848	CTTCGG	2	12	677488	677499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113597
298	NC_012848	CCCGCG	2	12	678249	678260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
299	NC_012848	GGGCTG	2	12	679076	679087	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241113599
300	NC_012848	AGCCGA	2	12	679946	679957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113600
301	NC_012848	TGCCGA	2	12	684412	684423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113607
302	NC_012848	GTCAAC	2	12	686568	686579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113610
303	NC_012848	GGCATA	2	12	689776	689787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241113614
304	NC_012848	AGCGCC	2	12	690278	690289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113614
305	NC_012848	CCGAGG	2	12	693766	693777	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113617
306	NC_012848	ATCTTC	2	12	694225	694236	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	241113617
307	NC_012848	TCGCCG	2	12	702838	702849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113626
308	NC_012848	TGGCGC	2	12	706201	706212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113631
309	NC_012848	TGGCCA	2	12	707707	707718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113633
310	NC_012848	CCCATG	2	12	708178	708189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241113633
311	NC_012848	TTGCGG	2	12	711630	711641	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113638
312	NC_012848	TGAGGA	2	12	714222	714233	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113641
313	NC_012848	TCGCCG	2	12	717047	717058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113643
314	NC_012848	TCAACA	2	12	720167	720178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	241113646
315	NC_012848	TCGCGT	2	12	722311	722322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113647
316	NC_012848	GCACGA	2	12	728149	728160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113652
317	NC_012848	ACCGGC	2	12	731027	731038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113654
318	NC_012848	GCCGCA	2	12	732182	732193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113654
319	NC_012848	CCGAAC	2	12	732254	732265	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113655
320	NC_012848	GAGGCC	2	12	733609	733620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113655
321	NC_012848	GCCGGC	2	12	735061	735072	0 %	0 %	50 %	50 %	241113657
322	NC_012848	ATCTCG	2	12	736857	736868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113659
323	NC_012848	CCTCGT	2	12	739081	739092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113661
324	NC_012848	AAGGAT	2	12	746482	746493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241113669
325	NC_012848	TGCGCA	2	12	749095	749106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113670
326	NC_012848	CGGCAT	2	12	752592	752603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113672
327	NC_012848	CTTGAT	2	12	758333	758344	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241113677
328	NC_012848	CGATGG	2	12	759450	759461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113678
329	NC_012848	GATCCG	3	18	761152	761169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113679
330	NC_012848	GGCCGA	2	12	762041	762052	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113680
331	NC_012848	GGATCG	2	12	762564	762575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113681
332	NC_012848	GCGCTG	2	12	762866	762877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113681
333	NC_012848	AGGACG	2	12	764560	764571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241113682
334	NC_012848	GTTCCC	2	12	765472	765483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241113683
335	NC_012848	CGAGAA	2	12	766681	766692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241113684
336	NC_012848	CGGCAG	2	12	769640	769651	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113689
337	NC_012848	CGTTGG	2	12	770013	770024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113689
338	NC_012848	ATCGAC	2	12	771920	771931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113691
339	NC_012848	TGGCGC	2	12	777028	777039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113696
340	NC_012848	CGCTCG	2	12	780775	780786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113699
341	NC_012848	CGAAAT	2	12	780797	780808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113699
342	NC_012848	GATCTC	2	12	781651	781662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113700
343	NC_012848	AGCGGC	2	12	782165	782176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113700
344	NC_012848	GAAATC	2	12	782182	782193	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241113700
345	NC_012848	CTTCGG	2	12	784549	784560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113703
346	NC_012848	GCGACG	2	12	785674	785685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113704
347	NC_012848	CAGAGC	2	12	787811	787822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113706
348	NC_012848	GCGTCG	2	12	789188	789199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241113707
349	NC_012848	GCGAAC	2	12	794231	794242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113711
350	NC_012848	CGACGG	2	12	796711	796722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113713
351	NC_012848	ACCAGA	2	12	799365	799376	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241113715
352	NC_012848	TGATCA	2	12	799407	799418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241113715
353	NC_012848	CCAGCG	2	12	800761	800772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113717
354	NC_012848	GCCTCG	2	12	805492	805503	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113720
355	NC_012848	CAGCCG	2	12	812986	812997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113726
356	NC_012848	GTGACC	2	12	815755	815766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113728
357	NC_012848	TGGGCA	2	12	824715	824726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113736
358	NC_012848	CGACGC	2	12	826326	826337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113738
359	NC_012848	GGCGCG	2	12	828279	828290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.