MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	ACGGA	2	10	1142	1151	40 %	0 %	40 %	20 %	241113004
2	NC_012848	CGCTC	2	10	3391	3400	0 %	20 %	20 %	60 %	241113006
3	NC_012848	GCCGG	2	10	5929	5938	0 %	0 %	60 %	40 %	241113008
4	NC_012848	CGCAA	2	10	6795	6804	40 %	0 %	20 %	40 %	241113009
5	NC_012848	CGGAC	2	10	10260	10269	20 %	0 %	40 %	40 %	241113010
6	NC_012848	CGCAG	2	10	10590	10599	20 %	0 %	40 %	40 %	241113010
7	NC_012848	CTTGC	2	10	15323	15332	0 %	40 %	20 %	40 %	241113013
8	NC_012848	CGGCT	2	10	18519	18528	0 %	20 %	40 %	40 %	241113016
9	NC_012848	CTTGC	2	10	19892	19901	0 %	40 %	20 %	40 %	241113017
10	NC_012848	GCCCC	2	10	20715	20724	0 %	0 %	20 %	80 %	241113018
11	NC_012848	CGAAG	2	10	20779	20788	40 %	0 %	40 %	20 %	241113018
12	NC_012848	ATCGG	2	10	21077	21086	20 %	20 %	40 %	20 %	241113019
13	NC_012848	CGCTC	2	10	30090	30099	0 %	20 %	20 %	60 %	241113027
14	NC_012848	GCATC	2	10	30157	30166	20 %	20 %	20 %	40 %	241113027
15	NC_012848	ATTGC	2	10	30212	30221	20 %	40 %	20 %	20 %	241113027
16	NC_012848	AGCTC	2	10	31142	31151	20 %	20 %	20 %	40 %	241113028
17	NC_012848	GGCCA	2	10	31275	31284	20 %	0 %	40 %	40 %	241113028
18	NC_012848	CGCTG	2	10	33657	33666	0 %	20 %	40 %	40 %	241113031
19	NC_012848	CGGTA	2	10	41812	41821	20 %	20 %	40 %	20 %	241113037
20	NC_012848	CGAAA	2	10	43260	43269	60 %	0 %	20 %	20 %	241113038
21	NC_012848	TCATC	2	10	43375	43384	20 %	40 %	0 %	40 %	241113038
22	NC_012848	GCAAC	2	10	43507	43516	40 %	0 %	20 %	40 %	241113038
23	NC_012848	CGCGG	2	10	45501	45510	0 %	0 %	60 %	40 %	241113040
24	NC_012848	CCGAT	2	10	45864	45873	20 %	20 %	20 %	40 %	241113040
25	NC_012848	CGCTG	2	10	46751	46760	0 %	20 %	40 %	40 %	241113041
26	NC_012848	CGATC	2	10	47785	47794	20 %	20 %	20 %	40 %	241113042
27	NC_012848	GAACT	2	10	49519	49528	40 %	20 %	20 %	20 %	241113043
28	NC_012848	GCTCG	2	10	49677	49686	0 %	20 %	40 %	40 %	241113044
29	NC_012848	GCCGA	2	10	50844	50853	20 %	0 %	40 %	40 %	241113045
30	NC_012848	GCGCC	2	10	50939	50948	0 %	0 %	40 %	60 %	241113045
31	NC_012848	GACGG	2	10	51696	51705	20 %	0 %	60 %	20 %	241113046
32	NC_012848	TCGTT	2	10	53961	53970	0 %	60 %	20 %	20 %	241113048
33	NC_012848	GACCC	2	10	54716	54725	20 %	0 %	20 %	60 %	241113049
34	NC_012848	TCGCT	2	10	54795	54804	0 %	40 %	20 %	40 %	241113049
35	NC_012848	GATCC	2	10	54914	54923	20 %	20 %	20 %	40 %	241113049
36	NC_012848	TCCGA	2	10	55823	55832	20 %	20 %	20 %	40 %	241113049
37	NC_012848	GACCT	2	10	62236	62245	20 %	20 %	20 %	40 %	241113055
38	NC_012848	TCTCG	2	10	63887	63896	0 %	40 %	20 %	40 %	241113057
39	NC_012848	TGCGA	2	10	66862	66871	20 %	20 %	40 %	20 %	241113058
40	NC_012848	GCCTT	2	10	69728	69737	0 %	40 %	20 %	40 %	241113061
41	NC_012848	TGCGG	2	10	72347	72356	0 %	20 %	60 %	20 %	241113063
42	NC_012848	GCTTC	2	10	74185	74194	0 %	40 %	20 %	40 %	241113064
43	NC_012848	GGTTC	2	10	77400	77409	0 %	40 %	40 %	20 %	241113066
44	NC_012848	ATTCC	2	10	80474	80483	20 %	40 %	0 %	40 %	241113069
45	NC_012848	CAGAA	2	10	81621	81630	60 %	0 %	20 %	20 %	241113070
46	NC_012848	CCCTG	2	10	87270	87279	0 %	20 %	20 %	60 %	241113075
47	NC_012848	CGCGG	2	10	88255	88264	0 %	0 %	60 %	40 %	241113076
48	NC_012848	TTGGC	2	10	89489	89498	0 %	40 %	40 %	20 %	241113077
49	NC_012848	ATCGC	2	10	90861	90870	20 %	20 %	20 %	40 %	241113078
50	NC_012848	AGCGG	2	10	92405	92414	20 %	0 %	60 %	20 %	241113080
51	NC_012848	TCGGC	2	10	93892	93901	0 %	20 %	40 %	40 %	241113081
52	NC_012848	GGCAA	2	10	95324	95333	40 %	0 %	40 %	20 %	241113083
53	NC_012848	GGCCG	2	10	98607	98616	0 %	0 %	60 %	40 %	241113085
54	NC_012848	ACCAG	2	10	100040	100049	40 %	0 %	20 %	40 %	241113087
55	NC_012848	GGAAG	2	10	100908	100917	40 %	0 %	60 %	0 %	241113089
56	NC_012848	GCAGC	2	10	101775	101784	20 %	0 %	40 %	40 %	241113089
57	NC_012848	ATTGC	2	10	101841	101850	20 %	40 %	20 %	20 %	241113089
58	NC_012848	CGGAG	2	10	102747	102756	20 %	0 %	60 %	20 %	241113091
59	NC_012848	GGGCA	2	10	112308	112317	20 %	0 %	60 %	20 %	241113098
60	NC_012848	CGACC	2	10	115670	115679	20 %	0 %	20 %	60 %	241113102
61	NC_012848	CGACC	2	10	116108	116117	20 %	0 %	20 %	60 %	241113102
62	NC_012848	CGCCA	2	10	122040	122049	20 %	0 %	20 %	60 %	241113108
63	NC_012848	GGCGA	2	10	122470	122479	20 %	0 %	60 %	20 %	241113108
64	NC_012848	CAGGG	2	10	124007	124016	20 %	0 %	60 %	20 %	241113109
65	NC_012848	CCGCG	2	10	124748	124757	0 %	0 %	40 %	60 %	241113110
66	NC_012848	CGGCT	2	10	126976	126985	0 %	20 %	40 %	40 %	241113112
67	NC_012848	CGGCA	2	10	130644	130653	20 %	0 %	40 %	40 %	241113115
68	NC_012848	GCCGA	2	10	131264	131273	20 %	0 %	40 %	40 %	241113116
69	NC_012848	CTTGC	2	10	131351	131360	0 %	40 %	20 %	40 %	241113116
70	NC_012848	GGCGA	2	10	131519	131528	20 %	0 %	60 %	20 %	241113116
71	NC_012848	GACGA	2	10	132635	132644	40 %	0 %	40 %	20 %	241113117
72	NC_012848	GGCCG	2	10	134199	134208	0 %	0 %	60 %	40 %	241113118
73	NC_012848	GGTCC	2	10	137535	137544	0 %	20 %	40 %	40 %	241113121
74	NC_012848	CGCGA	2	10	139093	139102	20 %	0 %	40 %	40 %	241113122
75	NC_012848	AAGAC	2	10	139678	139687	60 %	0 %	20 %	20 %	241113123
76	NC_012848	ACGGT	2	10	139882	139891	20 %	20 %	40 %	20 %	241113123
77	NC_012848	GAACG	2	10	143935	143944	40 %	0 %	40 %	20 %	241113127
78	NC_012848	TGGGG	2	10	144991	145000	0 %	20 %	80 %	0 %	241113128
79	NC_012848	GACCG	2	10	145375	145384	20 %	0 %	40 %	40 %	241113129
80	NC_012848	CGCGG	2	10	145432	145441	0 %	0 %	60 %	40 %	241113129
81	NC_012848	GCCGA	2	10	150547	150556	20 %	0 %	40 %	40 %	241113133
82	NC_012848	CGAGC	2	10	153049	153058	20 %	0 %	40 %	40 %	241113135
83	NC_012848	GGCCA	2	10	154815	154824	20 %	0 %	40 %	40 %	241113137
84	NC_012848	GCCGT	2	10	156319	156328	0 %	20 %	40 %	40 %	241113138
85	NC_012848	ATCGA	2	10	156729	156738	40 %	20 %	20 %	20 %	241113139
86	NC_012848	CCGTC	2	10	159839	159848	0 %	20 %	20 %	60 %	241113143
87	NC_012848	TCGTC	2	10	165070	165079	0 %	40 %	20 %	40 %	241113150
88	NC_012848	TCGCC	2	10	170104	170113	0 %	20 %	20 %	60 %	241113155
89	NC_012848	CGATG	2	10	171488	171497	20 %	20 %	40 %	20 %	241113156
90	NC_012848	TGGCC	2	10	172006	172015	0 %	20 %	40 %	40 %	241113157
91	NC_012848	GGGGA	2	10	173459	173468	20 %	0 %	80 %	0 %	241113158
92	NC_012848	CGACC	2	10	174103	174112	20 %	0 %	20 %	60 %	241113158
93	NC_012848	TTCGG	2	10	176162	176171	0 %	40 %	40 %	20 %	241113160
94	NC_012848	GGCGG	2	10	177047	177056	0 %	0 %	80 %	20 %	241113161
95	NC_012848	ATCGG	2	10	177150	177159	20 %	20 %	40 %	20 %	241113162
96	NC_012848	CAGCT	2	10	180339	180348	20 %	20 %	20 %	40 %	241113165
97	NC_012848	GGCGC	2	10	182099	182108	0 %	0 %	60 %	40 %	241113166
98	NC_012848	CGGGC	2	10	182914	182923	0 %	0 %	60 %	40 %	241113167
99	NC_012848	GCGAT	2	10	185229	185238	20 %	20 %	40 %	20 %	241113168
100	NC_012848	CGTGA	2	10	186623	186632	20 %	20 %	40 %	20 %	241113169
101	NC_012848	ACGGC	2	10	186984	186993	20 %	0 %	40 %	40 %	241113169
102	NC_012848	CAATA	2	10	189663	189672	60 %	20 %	0 %	20 %	241113170
103	NC_012848	GATCG	2	10	189777	189786	20 %	20 %	40 %	20 %	241113170
104	NC_012848	GGGCG	2	10	190633	190642	0 %	0 %	80 %	20 %	241113172
105	NC_012848	AATCC	2	10	191152	191161	40 %	20 %	0 %	40 %	241113172
106	NC_012848	GGCGC	2	10	193348	193357	0 %	0 %	60 %	40 %	241113174
107	NC_012848	GCGCC	2	10	194816	194825	0 %	0 %	40 %	60 %	241113174
108	NC_012848	ATCGT	2	10	197046	197055	20 %	40 %	20 %	20 %	241113176
109	NC_012848	CCATT	2	10	197339	197348	20 %	40 %	0 %	40 %	241113176
110	NC_012848	CCGGC	2	10	197628	197637	0 %	0 %	40 %	60 %	241113177
111	NC_012848	CGGCG	2	10	198715	198724	0 %	0 %	60 %	40 %	241113178
112	NC_012848	GATAG	2	10	199189	199198	40 %	20 %	40 %	0 %	241113178
113	NC_012848	GCCAA	2	10	199256	199265	40 %	0 %	20 %	40 %	241113178
114	NC_012848	GGGCG	2	10	201164	201173	0 %	0 %	80 %	20 %	241113180
115	NC_012848	GGGAA	2	10	202651	202660	40 %	0 %	60 %	0 %	241113181
116	NC_012848	GCTCG	2	10	204184	204193	0 %	20 %	40 %	40 %	241113183
117	NC_012848	TCGGA	2	10	207070	207079	20 %	20 %	40 %	20 %	241113186
118	NC_012848	TCCGC	2	10	208754	208763	0 %	20 %	20 %	60 %	241113188
119	NC_012848	GCTGG	2	10	212617	212626	0 %	20 %	60 %	20 %	241113191
120	NC_012848	CGGCG	2	10	214092	214101	0 %	0 %	60 %	40 %	241113193
121	NC_012848	CCGCT	2	10	218951	218960	0 %	20 %	20 %	60 %	241113198
122	NC_012848	GCCGG	2	10	220158	220167	0 %	0 %	60 %	40 %	241113198
123	NC_012848	CGGGG	2	10	220638	220647	0 %	0 %	80 %	20 %	241113199
124	NC_012848	AGATC	2	10	220820	220829	40 %	20 %	20 %	20 %	241113199
125	NC_012848	ATTGC	2	10	222820	222829	20 %	40 %	20 %	20 %	241113201
126	NC_012848	TCGCC	2	10	223802	223811	0 %	20 %	20 %	60 %	241113202
127	NC_012848	CAGGG	2	10	224203	224212	20 %	0 %	60 %	20 %	241113202
128	NC_012848	CACCG	2	10	224742	224751	20 %	0 %	20 %	60 %	241113202
129	NC_012848	CAGGT	2	10	225172	225181	20 %	20 %	40 %	20 %	241113202
130	NC_012848	CGGCC	2	10	228216	228225	0 %	0 %	40 %	60 %	241113204
131	NC_012848	AGGTT	2	10	229371	229380	20 %	40 %	40 %	0 %	241113205
132	NC_012848	GACGA	2	10	229426	229435	40 %	0 %	40 %	20 %	241113205
133	NC_012848	CTTTG	2	10	236289	236298	0 %	60 %	20 %	20 %	241113213
134	NC_012848	GGGCT	2	10	236322	236331	0 %	20 %	60 %	20 %	241113213
135	NC_012848	GGAAA	2	10	236706	236715	60 %	0 %	40 %	0 %	241113213
136	NC_012848	TCCGA	2	10	236832	236841	20 %	20 %	20 %	40 %	241113213
137	NC_012848	TCGCC	2	10	236923	236932	0 %	20 %	20 %	60 %	241113213
138	NC_012848	CCGGT	2	10	238576	238585	0 %	20 %	40 %	40 %	241113213
139	NC_012848	GCGCA	2	10	240356	240365	20 %	0 %	40 %	40 %	241113214
140	NC_012848	CTTTG	2	10	243738	243747	0 %	60 %	20 %	20 %	241113217
141	NC_012848	GCCTG	2	10	245709	245718	0 %	20 %	40 %	40 %	241113219
142	NC_012848	CGCGA	2	10	248696	248705	20 %	0 %	40 %	40 %	241113222
143	NC_012848	ACGAG	2	10	249178	249187	40 %	0 %	40 %	20 %	241113222
144	NC_012848	CACCT	2	10	249633	249642	20 %	20 %	0 %	60 %	241113222
145	NC_012848	ATGAC	2	10	252240	252249	40 %	20 %	20 %	20 %	241113225
146	NC_012848	TTTCC	2	10	253733	253742	0 %	60 %	0 %	40 %	241113226
147	NC_012848	GGACA	2	10	254953	254962	40 %	0 %	40 %	20 %	241113227
148	NC_012848	GCCGC	2	10	256328	256337	0 %	0 %	40 %	60 %	241113228
149	NC_012848	TGCAT	2	10	258026	258035	20 %	40 %	20 %	20 %	241113231
150	NC_012848	GGCTG	2	10	258171	258180	0 %	20 %	60 %	20 %	241113231
151	NC_012848	CACGC	2	10	259592	259601	20 %	0 %	20 %	60 %	241113232
152	NC_012848	GCCAG	2	10	260874	260883	20 %	0 %	40 %	40 %	241113233
153	NC_012848	GCGCA	2	10	261394	261403	20 %	0 %	40 %	40 %	241113233
154	NC_012848	CGAGA	2	10	261914	261923	40 %	0 %	40 %	20 %	241113233
155	NC_012848	CGTCT	2	10	261980	261989	0 %	40 %	20 %	40 %	241113233
156	NC_012848	CGTTT	2	10	262104	262113	0 %	60 %	20 %	20 %	241113233
157	NC_012848	CGGTC	2	10	270636	270645	0 %	20 %	40 %	40 %	241113238
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159	NC_012848	GCAGC	2	10	279487	279496	20 %	0 %	40 %	40 %	241113246
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161	NC_012848	TGAAG	2	10	280344	280353	40 %	20 %	40 %	0 %	241113247
162	NC_012848	GCTGT	2	10	282391	282400	0 %	40 %	40 %	20 %	241113249
163	NC_012848	GATGC	2	10	282859	282868	20 %	20 %	40 %	20 %	241113249
164	NC_012848	CGATC	2	10	283973	283982	20 %	20 %	20 %	40 %	241113250
165	NC_012848	TCGGC	2	10	284115	284124	0 %	20 %	40 %	40 %	241113250
166	NC_012848	CGGCG	2	10	284311	284320	0 %	0 %	60 %	40 %	241113250
167	NC_012848	GTCGC	2	10	285434	285443	0 %	20 %	40 %	40 %	241113250
168	NC_012848	GCACC	2	10	286139	286148	20 %	0 %	20 %	60 %	241113252
169	NC_012848	AATGA	2	10	291848	291857	60 %	20 %	20 %	0 %	241113256
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171	NC_012848	CTGAT	2	10	293223	293232	20 %	40 %	20 %	20 %	241113258
172	NC_012848	CTGAC	2	10	293316	293325	20 %	20 %	20 %	40 %	241113258
173	NC_012848	AAGGG	2	10	294711	294720	40 %	0 %	60 %	0 %	241113260
174	NC_012848	CATGC	2	10	296063	296072	20 %	20 %	20 %	40 %	241113261
175	NC_012848	CGGTG	2	10	297416	297425	0 %	20 %	60 %	20 %	241113263
176	NC_012848	CGCGC	2	10	297513	297522	0 %	0 %	40 %	60 %	241113263
177	NC_012848	CAGCG	2	10	303875	303884	20 %	0 %	40 %	40 %	241113269
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181	NC_012848	AAGCC	2	10	305240	305249	40 %	0 %	20 %	40 %	241113271
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196	NC_012848	GGATT	2	10	332340	332349	20 %	40 %	40 %	0 %	241113294
197	NC_012848	GACCG	2	10	332458	332467	20 %	0 %	40 %	40 %	241113294
198	NC_012848	CATGC	2	10	334262	334271	20 %	20 %	20 %	40 %	241113295
199	NC_012848	ATGAT	2	10	337716	337725	40 %	40 %	20 %	0 %	241113298
200	NC_012848	GATCA	2	10	341459	341468	40 %	20 %	20 %	20 %	241113301
201	NC_012848	TCCGG	2	10	342294	342303	0 %	20 %	40 %	40 %	241113303
202	NC_012848	TAAGG	2	10	343935	343944	40 %	20 %	40 %	0 %	241113304
203	NC_012848	ATGCG	2	10	349156	349165	20 %	20 %	40 %	20 %	241113308
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213	NC_012848	CGACG	2	10	358200	358209	20 %	0 %	40 %	40 %	241113317
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232	NC_012848	GACCG	2	10	396663	396672	20 %	0 %	40 %	40 %	241113350
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237	NC_012848	TTGAC	2	10	406277	406286	20 %	40 %	20 %	20 %	241113361
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242	NC_012848	CAGCG	2	10	409736	409745	20 %	0 %	40 %	40 %	241113363
243	NC_012848	AGCCC	2	10	409960	409969	20 %	0 %	20 %	60 %	241113363
244	NC_012848	CGGCT	2	10	410199	410208	0 %	20 %	40 %	40 %	241113363
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246	NC_012848	GGCGT	2	10	411317	411326	0 %	20 %	60 %	20 %	241113364
247	NC_012848	GCCGC	2	10	411812	411821	0 %	0 %	40 %	60 %	241113364
248	NC_012848	GATTG	2	10	412735	412744	20 %	40 %	40 %	0 %	241113365
249	NC_012848	CGCGT	2	10	413079	413088	0 %	20 %	40 %	40 %	241113365
250	NC_012848	GATCG	2	10	415622	415631	20 %	20 %	40 %	20 %	241113368
251	NC_012848	CGCGC	2	10	416477	416486	0 %	0 %	40 %	60 %	241113368
252	NC_012848	GCTCG	2	10	417175	417184	0 %	20 %	40 %	40 %	241113369
253	NC_012848	CCGGG	2	10	417528	417537	0 %	0 %	60 %	40 %	241113369
254	NC_012848	CCACG	2	10	417583	417592	20 %	0 %	20 %	60 %	241113369
255	NC_012848	CGTGA	2	10	422687	422696	20 %	20 %	40 %	20 %	241113375
256	NC_012848	GATCT	2	10	423564	423573	20 %	40 %	20 %	20 %	241113377
257	NC_012848	GAAGA	2	10	426264	426273	60 %	0 %	40 %	0 %	241113380
258	NC_012848	CATCG	2	10	428285	428294	20 %	20 %	20 %	40 %	241113385
259	NC_012848	GCGCA	2	10	429169	429178	20 %	0 %	40 %	40 %	241113386
260	NC_012848	GCGTG	2	10	429651	429660	0 %	20 %	60 %	20 %	241113387
261	NC_012848	CAGGG	2	10	430258	430267	20 %	0 %	60 %	20 %	241113387
262	NC_012848	ACGCC	2	10	430589	430598	20 %	0 %	20 %	60 %	241113387
263	NC_012848	GTCAT	2	10	431955	431964	20 %	40 %	20 %	20 %	241113388
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381	NC_012848	CAGGG	2	10	606510	606519	20 %	0 %	60 %	20 %	241113529
382	NC_012848	GAGGG	2	10	607293	607302	20 %	0 %	80 %	0 %	241113529
383	NC_012848	ACGGA	2	10	608454	608463	40 %	0 %	40 %	20 %	241113531
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385	NC_012848	GCCAG	2	10	611992	612001	20 %	0 %	40 %	40 %	241113534
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389	NC_012848	CCGAT	2	10	616873	616882	20 %	20 %	20 %	40 %	241113539
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