MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 1885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	TCGA	2	8	191	198	25 %	25 %	25 %	25 %	241113004
2	NC_012848	CGGT	2	8	306	313	0 %	25 %	50 %	25 %	241113004
3	NC_012848	TGCA	2	8	476	483	25 %	25 %	25 %	25 %	241113004
4	NC_012848	TCGA	2	8	547	554	25 %	25 %	25 %	25 %	241113004
5	NC_012848	CGCC	2	8	804	811	0 %	0 %	25 %	75 %	241113004
6	NC_012848	GGTC	2	8	936	943	0 %	25 %	50 %	25 %	241113004
7	NC_012848	GCCC	2	8	1026	1033	0 %	0 %	25 %	75 %	241113004
8	NC_012848	TTGC	2	8	1557	1564	0 %	50 %	25 %	25 %	241113005
9	NC_012848	ACCG	2	8	2225	2232	25 %	0 %	25 %	50 %	241113005
10	NC_012848	AACC	2	8	2446	2453	50 %	0 %	0 %	50 %	241113005
11	NC_012848	GCAG	2	8	2497	2504	25 %	0 %	50 %	25 %	241113005
12	NC_012848	CGGG	2	8	3198	3205	0 %	0 %	75 %	25 %	241113006
13	NC_012848	GGCC	2	8	3472	3479	0 %	0 %	50 %	50 %	241113006
14	NC_012848	CTCG	2	8	3631	3638	0 %	25 %	25 %	50 %	241113006
15	NC_012848	ATCT	2	8	4378	4385	25 %	50 %	0 %	25 %	241113007
16	NC_012848	CGGG	2	8	4466	4473	0 %	0 %	75 %	25 %	241113007
17	NC_012848	GCTG	2	8	4493	4500	0 %	25 %	50 %	25 %	241113007
18	NC_012848	TCCT	2	8	4885	4892	0 %	50 %	0 %	50 %	241113007
19	NC_012848	GCAG	2	8	5114	5121	25 %	0 %	50 %	25 %	241113008
20	NC_012848	ACCT	2	8	5637	5644	25 %	25 %	0 %	50 %	241113008
21	NC_012848	CGGT	2	8	6827	6834	0 %	25 %	50 %	25 %	241113009
22	NC_012848	GACC	2	8	7278	7285	25 %	0 %	25 %	50 %	241113010
23	NC_012848	ATCC	2	8	7313	7320	25 %	25 %	0 %	50 %	241113010
24	NC_012848	GGGC	2	8	7445	7452	0 %	0 %	75 %	25 %	241113010
25	NC_012848	GCCG	2	8	7551	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	241113010
26	NC_012848	CGAA	2	8	8331	8338	50 %	0 %	25 %	25 %	241113010
27	NC_012848	TTTC	2	8	8401	8408	0 %	75 %	0 %	25 %	241113010
28	NC_012848	TTTC	2	8	8457	8464	0 %	75 %	0 %	25 %	241113010
29	NC_012848	TCGA	2	8	9260	9267	25 %	25 %	25 %	25 %	241113010
30	NC_012848	GCTC	2	8	9360	9367	0 %	25 %	25 %	50 %	241113010
31	NC_012848	AGGC	2	8	9368	9375	25 %	0 %	50 %	25 %	241113010
32	NC_012848	TTCC	2	8	9946	9953	0 %	50 %	0 %	50 %	241113010
33	NC_012848	GATC	2	8	10668	10675	25 %	25 %	25 %	25 %	241113010
34	NC_012848	CCGA	2	8	10970	10977	25 %	0 %	25 %	50 %	241113010
35	NC_012848	GCCA	2	8	11053	11060	25 %	0 %	25 %	50 %	241113010
36	NC_012848	CCGA	2	8	11777	11784	25 %	0 %	25 %	50 %	241113010
37	NC_012848	CGAT	2	8	11819	11826	25 %	25 %	25 %	25 %	241113010
38	NC_012848	CTTT	2	8	12164	12171	0 %	75 %	0 %	25 %	241113010
39	NC_012848	TCGA	2	8	12277	12284	25 %	25 %	25 %	25 %	241113010
40	NC_012848	ATCC	2	8	14882	14889	25 %	25 %	0 %	50 %	241113012
41	NC_012848	AGCA	2	8	16048	16055	50 %	0 %	25 %	25 %	241113014
42	NC_012848	AGGA	2	8	16178	16185	50 %	0 %	50 %	0 %	241113014
43	NC_012848	CGAC	2	8	16479	16486	25 %	0 %	25 %	50 %	241113014
44	NC_012848	TGGT	2	8	16664	16671	0 %	50 %	50 %	0 %	241113014
45	NC_012848	GCCA	2	8	16817	16824	25 %	0 %	25 %	50 %	241113014
46	NC_012848	GCGG	2	8	17618	17625	0 %	0 %	75 %	25 %	241113015
47	NC_012848	GCAG	2	8	17659	17666	25 %	0 %	50 %	25 %	241113015
48	NC_012848	AGCA	2	8	19080	19087	50 %	0 %	25 %	25 %	241113016
49	NC_012848	CTGA	2	8	19480	19487	25 %	25 %	25 %	25 %	241113017
50	NC_012848	GAGC	2	8	19678	19685	25 %	0 %	50 %	25 %	241113017
51	NC_012848	AGCG	2	8	19804	19811	25 %	0 %	50 %	25 %	241113017
52	NC_012848	GACG	2	8	19924	19931	25 %	0 %	50 %	25 %	241113017
53	NC_012848	GCGA	2	8	19986	19993	25 %	0 %	50 %	25 %	241113018
54	NC_012848	GGCG	2	8	20132	20139	0 %	0 %	75 %	25 %	241113018
55	NC_012848	CTGC	2	8	20446	20453	0 %	25 %	25 %	50 %	241113018
56	NC_012848	GCGG	2	8	21250	21257	0 %	0 %	75 %	25 %	241113019
57	NC_012848	GAAG	2	8	21779	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	241113019
58	NC_012848	CCAG	2	8	21828	21835	25 %	0 %	25 %	50 %	241113019
59	NC_012848	GATC	2	8	21990	21997	25 %	25 %	25 %	25 %	241113019
60	NC_012848	CCGG	2	8	22266	22273	0 %	0 %	50 %	50 %	241113019
61	NC_012848	CCGC	2	8	22365	22372	0 %	0 %	25 %	75 %	241113019
62	NC_012848	CGAT	2	8	22527	22534	25 %	25 %	25 %	25 %	241113019
63	NC_012848	GACC	2	8	23061	23068	25 %	0 %	25 %	50 %	241113019
64	NC_012848	ATCG	2	8	23080	23087	25 %	25 %	25 %	25 %	241113019
65	NC_012848	GGTT	2	8	23088	23095	0 %	50 %	50 %	0 %	241113019
66	NC_012848	CCGA	2	8	23339	23346	25 %	0 %	25 %	50 %	241113020
67	NC_012848	GCCG	2	8	23740	23747	0 %	0 %	50 %	50 %	241113020
68	NC_012848	GCCC	2	8	23874	23881	0 %	0 %	25 %	75 %	241113020
69	NC_012848	CAGG	2	8	24396	24403	25 %	0 %	50 %	25 %	241113021
70	NC_012848	TGCA	2	8	24434	24441	25 %	25 %	25 %	25 %	241113021
71	NC_012848	GAAA	2	8	26421	26428	75 %	0 %	25 %	0 %	241113023
72	NC_012848	GCAG	2	8	27533	27540	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
73	NC_012848	TCGA	2	8	27663	27670	25 %	25 %	25 %	25 %	241113024
74	NC_012848	ACGG	2	8	27744	27751	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
75	NC_012848	GCCT	2	8	28298	28305	0 %	25 %	25 %	50 %	241113025
76	NC_012848	CTCC	2	8	29272	29279	0 %	25 %	0 %	75 %	241113026
77	NC_012848	CTGC	2	8	29433	29440	0 %	25 %	25 %	50 %	241113026
78	NC_012848	CGGC	3	12	29870	29881	0 %	0 %	50 %	50 %	241113027
79	NC_012848	GATC	2	8	29905	29912	25 %	25 %	25 %	25 %	241113027
80	NC_012848	CTCG	2	8	30508	30515	0 %	25 %	25 %	50 %	241113027
81	NC_012848	CGCC	2	8	30828	30835	0 %	0 %	25 %	75 %	241113027
82	NC_012848	ATCC	2	8	31341	31348	25 %	25 %	0 %	50 %	241113028
83	NC_012848	TGCG	2	8	31999	32006	0 %	25 %	50 %	25 %	241113028
84	NC_012848	ATCG	2	8	33401	33408	25 %	25 %	25 %	25 %	241113030
85	NC_012848	GCCT	2	8	33727	33734	0 %	25 %	25 %	50 %	241113031
86	NC_012848	GGAA	2	8	34527	34534	50 %	0 %	50 %	0 %	241113031
87	NC_012848	CTTC	2	8	34668	34675	0 %	50 %	0 %	50 %	241113031
88	NC_012848	TGAT	2	8	35126	35133	25 %	50 %	25 %	0 %	241113031
89	NC_012848	GCAG	2	8	36427	36434	25 %	0 %	50 %	25 %	241113032
90	NC_012848	GCCG	2	8	36713	36720	0 %	0 %	50 %	50 %	241113032
91	NC_012848	CCGA	2	8	37401	37408	25 %	0 %	25 %	50 %	241113033
92	NC_012848	CGAG	2	8	37615	37622	25 %	0 %	50 %	25 %	241113033
93	NC_012848	AGCG	2	8	38314	38321	25 %	0 %	50 %	25 %	241113033
94	NC_012848	TCGG	2	8	38748	38755	0 %	25 %	50 %	25 %	241113033
95	NC_012848	GCCG	2	8	38990	38997	0 %	0 %	50 %	50 %	241113033
96	NC_012848	CGAT	2	8	40087	40094	25 %	25 %	25 %	25 %	241113035
97	NC_012848	ATCG	2	8	40759	40766	25 %	25 %	25 %	25 %	241113036
98	NC_012848	TGCC	2	8	41709	41716	0 %	25 %	25 %	50 %	241113037
99	NC_012848	CGAA	2	8	42259	42266	50 %	0 %	25 %	25 %	241113038
100	NC_012848	GCTG	2	8	42350	42357	0 %	25 %	50 %	25 %	241113038
101	NC_012848	ACGA	2	8	43051	43058	50 %	0 %	25 %	25 %	241113038
102	NC_012848	ACCG	2	8	43230	43237	25 %	0 %	25 %	50 %	241113038
103	NC_012848	ACGC	2	8	43969	43976	25 %	0 %	25 %	50 %	241113039
104	NC_012848	GTCG	2	8	44260	44267	0 %	25 %	50 %	25 %	241113039
105	NC_012848	ACGA	2	8	44695	44702	50 %	0 %	25 %	25 %	241113039
106	NC_012848	CGTC	2	8	46447	46454	0 %	25 %	25 %	50 %	241113041
107	NC_012848	CCGG	2	8	47352	47359	0 %	0 %	50 %	50 %	241113041
108	NC_012848	TCCG	2	8	48164	48171	0 %	25 %	25 %	50 %	241113042
109	NC_012848	TCTG	2	8	48265	48272	0 %	50 %	25 %	25 %	241113042
110	NC_012848	AGCA	2	8	48386	48393	50 %	0 %	25 %	25 %	241113042
111	NC_012848	GGAC	2	8	49004	49011	25 %	0 %	50 %	25 %	241113043
112	NC_012848	TCGA	2	8	49261	49268	25 %	25 %	25 %	25 %	241113043
113	NC_012848	TCCT	2	8	49330	49337	0 %	50 %	0 %	50 %	241113043
114	NC_012848	CGAG	2	8	49688	49695	25 %	0 %	50 %	25 %	241113044
115	NC_012848	CCAG	2	8	49883	49890	25 %	0 %	25 %	50 %	241113044
116	NC_012848	CATC	2	8	50858	50865	25 %	25 %	0 %	50 %	241113045
117	NC_012848	GCCG	2	8	51192	51199	0 %	0 %	50 %	50 %	241113045
118	NC_012848	CGAT	2	8	51403	51410	25 %	25 %	25 %	25 %	241113045
119	NC_012848	TCCG	2	8	51510	51517	0 %	25 %	25 %	50 %	241113046
120	NC_012848	CCGC	2	8	51850	51857	0 %	0 %	25 %	75 %	241113046
121	NC_012848	CGTC	2	8	52762	52769	0 %	25 %	25 %	50 %	241113047
122	NC_012848	AACG	2	8	52857	52864	50 %	0 %	25 %	25 %	241113047
123	NC_012848	AAGG	2	8	53081	53088	50 %	0 %	50 %	0 %	241113047
124	NC_012848	GCCT	2	8	53117	53124	0 %	25 %	25 %	50 %	241113047
125	NC_012848	GCCG	2	8	53848	53855	0 %	0 %	50 %	50 %	241113048
126	NC_012848	CCAG	2	8	54825	54832	25 %	0 %	25 %	50 %	241113049
127	NC_012848	AGCG	2	8	55219	55226	25 %	0 %	50 %	25 %	241113049
128	NC_012848	CCGG	2	8	55390	55397	0 %	0 %	50 %	50 %	241113049
129	NC_012848	CGCT	2	8	56013	56020	0 %	25 %	25 %	50 %	241113049
130	NC_012848	CATC	2	8	56661	56668	25 %	25 %	0 %	50 %	241113050
131	NC_012848	ATGG	2	8	56858	56865	25 %	25 %	50 %	0 %	241113050
132	NC_012848	CATG	2	8	57201	57208	25 %	25 %	25 %	25 %	241113051
133	NC_012848	GCTC	2	8	57383	57390	0 %	25 %	25 %	50 %	241113051
134	NC_012848	GATC	2	8	57750	57757	25 %	25 %	25 %	25 %	241113051
135	NC_012848	GGCG	2	8	58068	58075	0 %	0 %	75 %	25 %	241113051
136	NC_012848	CGCC	2	8	58373	58380	0 %	0 %	25 %	75 %	241113051
137	NC_012848	CATC	2	8	58725	58732	25 %	25 %	0 %	50 %	241113052
138	NC_012848	CGGC	2	8	58967	58974	0 %	0 %	50 %	50 %	241113052
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140	NC_012848	GGAA	2	8	59677	59684	50 %	0 %	50 %	0 %	241113052
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