MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	T	8	8	2580	2587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012848	A	6	6	8475	8480	100 %	0 %	0 %	0 %	241113010
3	NC_012848	T	6	6	10114	10119	0 %	100 %	0 %	0 %	241113010
4	NC_012848	T	6	6	18735	18740	0 %	100 %	0 %	0 %	241113016
5	NC_012848	T	6	6	18886	18891	0 %	100 %	0 %	0 %	241113016
6	NC_012848	C	6	6	23879	23884	0 %	0 %	0 %	100 %	241113020
7	NC_012848	A	7	7	24923	24929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012848	A	6	6	24944	24949	100 %	0 %	0 %	0 %	241113022
9	NC_012848	T	6	6	35214	35219	0 %	100 %	0 %	0 %	241113031
10	NC_012848	A	7	7	39321	39327	100 %	0 %	0 %	0 %	241113033
11	NC_012848	A	6	6	42130	42135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012848	C	6	6	44162	44167	0 %	0 %	0 %	100 %	241113039
13	NC_012848	T	6	6	53583	53588	0 %	100 %	0 %	0 %	241113048
14	NC_012848	T	6	6	62660	62665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012848	A	6	6	76270	76275	100 %	0 %	0 %	0 %	241113065
16	NC_012848	C	6	6	76389	76394	0 %	0 %	0 %	100 %	241113065
17	NC_012848	T	6	6	76904	76909	0 %	100 %	0 %	0 %	241113066
18	NC_012848	G	6	6	78092	78097	0 %	0 %	100 %	0 %	241113067
19	NC_012848	G	6	6	78231	78236	0 %	0 %	100 %	0 %	241113067
20	NC_012848	T	6	6	81170	81175	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
21	NC_012848	T	6	6	81513	81518	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
22	NC_012848	A	6	6	82951	82956	100 %	0 %	0 %	0 %	241113071
23	NC_012848	T	6	6	93363	93368	0 %	100 %	0 %	0 %	241113081
24	NC_012848	T	6	6	95881	95886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012848	T	6	6	98156	98161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012848	C	6	6	99668	99673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_012848	G	6	6	106869	106874	0 %	0 %	100 %	0 %	241113095
28	NC_012848	C	9	9	110418	110426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_012848	G	6	6	112813	112818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012848	C	6	6	127139	127144	0 %	0 %	0 %	100 %	241113112
31	NC_012848	T	6	6	130935	130940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012848	A	6	6	149730	149735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012848	A	6	6	164247	164252	100 %	0 %	0 %	0 %	241113149
34	NC_012848	C	6	6	170196	170201	0 %	0 %	0 %	100 %	241113155
35	NC_012848	G	6	6	180420	180425	0 %	0 %	100 %	0 %	241113165
36	NC_012848	T	7	7	180800	180806	0 %	100 %	0 %	0 %	241113165
37	NC_012848	A	6	6	185835	185840	100 %	0 %	0 %	0 %	241113169
38	NC_012848	T	6	6	186744	186749	0 %	100 %	0 %	0 %	241113169
39	NC_012848	G	6	6	190621	190626	0 %	0 %	100 %	0 %	241113172
40	NC_012848	G	6	6	191973	191978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012848	T	6	6	198436	198441	0 %	100 %	0 %	0 %	241113177
42	NC_012848	G	6	6	200240	200245	0 %	0 %	100 %	0 %	241113180
43	NC_012848	G	6	6	202792	202797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012848	G	6	6	211680	211685	0 %	0 %	100 %	0 %	241113191
45	NC_012848	T	6	6	212683	212688	0 %	100 %	0 %	0 %	241113191
46	NC_012848	A	6	6	214029	214034	100 %	0 %	0 %	0 %	241113193
47	NC_012848	A	6	6	222645	222650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012848	A	6	6	226973	226978	100 %	0 %	0 %	0 %	241113203
49	NC_012848	C	8	8	227869	227876	0 %	0 %	0 %	100 %	241113204
50	NC_012848	T	6	6	228862	228867	0 %	100 %	0 %	0 %	241113205
51	NC_012848	G	7	7	234354	234360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012848	C	6	6	236908	236913	0 %	0 %	0 %	100 %	241113213
53	NC_012848	G	6	6	243732	243737	0 %	0 %	100 %	0 %	241113217
54	NC_012848	C	6	6	244156	244161	0 %	0 %	0 %	100 %	241113218
55	NC_012848	G	6	6	246374	246379	0 %	0 %	100 %	0 %	241113219
56	NC_012848	G	6	6	251465	251470	0 %	0 %	100 %	0 %	241113224
57	NC_012848	C	6	6	260376	260381	0 %	0 %	0 %	100 %	241113233
58	NC_012848	G	6	6	260467	260472	0 %	0 %	100 %	0 %	241113233
59	NC_012848	A	6	6	261540	261545	100 %	0 %	0 %	0 %	241113233
60	NC_012848	T	6	6	262307	262312	0 %	100 %	0 %	0 %	241113233
61	NC_012848	C	6	6	263609	263614	0 %	0 %	0 %	100 %	241113234
62	NC_012848	A	7	7	267980	267986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012848	T	6	6	271501	271506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012848	A	6	6	272974	272979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012848	T	7	7	274787	274793	0 %	100 %	0 %	0 %	241113240
66	NC_012848	A	7	7	277416	277422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012848	A	6	6	279479	279484	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
68	NC_012848	A	7	7	279803	279809	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
69	NC_012848	A	6	6	281759	281764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012848	A	6	6	281774	281779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012848	A	6	6	281879	281884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012848	A	6	6	287725	287730	100 %	0 %	0 %	0 %	241113253
73	NC_012848	A	7	7	288149	288155	100 %	0 %	0 %	0 %	241113253
74	NC_012848	A	6	6	295005	295010	100 %	0 %	0 %	0 %	241113260
75	NC_012848	T	6	6	301048	301053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012848	C	6	6	301520	301525	0 %	0 %	0 %	100 %	241113268
77	NC_012848	T	6	6	301578	301583	0 %	100 %	0 %	0 %	241113268
78	NC_012848	T	7	7	308093	308099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012848	A	6	6	310648	310653	100 %	0 %	0 %	0 %	241113275
80	NC_012848	A	6	6	310760	310765	100 %	0 %	0 %	0 %	241113275
81	NC_012848	A	6	6	311014	311019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012848	A	6	6	316484	316489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012848	T	6	6	320513	320518	0 %	100 %	0 %	0 %	241113283
84	NC_012848	T	6	6	324116	324121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012848	C	7	7	326322	326328	0 %	0 %	0 %	100 %	241113288
86	NC_012848	T	6	6	327361	327366	0 %	100 %	0 %	0 %	241113288
87	NC_012848	A	7	7	329322	329328	100 %	0 %	0 %	0 %	241113290
88	NC_012848	T	7	7	329695	329701	0 %	100 %	0 %	0 %	241113290
89	NC_012848	A	6	6	330822	330827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012848	T	7	7	331005	331011	0 %	100 %	0 %	0 %	241113292
91	NC_012848	T	6	6	331311	331316	0 %	100 %	0 %	0 %	241113292
92	NC_012848	A	6	6	332491	332496	100 %	0 %	0 %	0 %	241113294
93	NC_012848	C	6	6	335685	335690	0 %	0 %	0 %	100 %	241113296
94	NC_012848	G	6	6	340376	340381	0 %	0 %	100 %	0 %	241113300
95	NC_012848	A	6	6	345486	345491	100 %	0 %	0 %	0 %	241113305
96	NC_012848	T	6	6	346141	346146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012848	T	6	6	346220	346225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012848	T	6	6	348577	348582	0 %	100 %	0 %	0 %	241113307
99	NC_012848	A	6	6	349880	349885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012848	C	6	6	352630	352635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_012848	T	7	7	360050	360056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012848	T	6	6	372718	372723	0 %	100 %	0 %	0 %	241113329
103	NC_012848	G	6	6	374261	374266	0 %	0 %	100 %	0 %	241113330
104	NC_012848	A	6	6	383266	383271	100 %	0 %	0 %	0 %	241113339
105	NC_012848	T	7	7	383443	383449	0 %	100 %	0 %	0 %	241113339
106	NC_012848	T	7	7	386832	386838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012848	A	6	6	398852	398857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012848	G	6	6	401680	401685	0 %	0 %	100 %	0 %	241113356
109	NC_012848	C	6	6	404323	404328	0 %	0 %	0 %	100 %	241113359
110	NC_012848	C	6	6	410627	410632	0 %	0 %	0 %	100 %	241113363
111	NC_012848	T	6	6	413526	413531	0 %	100 %	0 %	0 %	241113365
112	NC_012848	G	6	6	417768	417773	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012848	T	6	6	419523	419528	0 %	100 %	0 %	0 %	241113372
114	NC_012848	A	6	6	420630	420635	100 %	0 %	0 %	0 %	241113373
115	NC_012848	T	6	6	420827	420832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012848	C	6	6	432443	432448	0 %	0 %	0 %	100 %	241113388
117	NC_012848	C	6	6	438993	438998	0 %	0 %	0 %	100 %	241113394
118	NC_012848	T	6	6	441820	441825	0 %	100 %	0 %	0 %	241113397
119	NC_012848	T	6	6	442387	442392	0 %	100 %	0 %	0 %	241113399
120	NC_012848	C	6	6	456695	456700	0 %	0 %	0 %	100 %	241113413
121	NC_012848	A	6	6	460350	460355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012848	A	6	6	471430	471435	100 %	0 %	0 %	0 %	241113423
123	NC_012848	C	6	6	484301	484306	0 %	0 %	0 %	100 %	241113432
124	NC_012848	A	7	7	484803	484809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012848	G	6	6	496732	496737	0 %	0 %	100 %	0 %	241113438
126	NC_012848	A	6	6	515961	515966	100 %	0 %	0 %	0 %	241113452
127	NC_012848	A	6	6	516289	516294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012848	T	6	6	518598	518603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012848	T	6	6	521932	521937	0 %	100 %	0 %	0 %	241113461
130	NC_012848	C	6	6	526939	526944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_012848	G	6	6	558977	558982	0 %	0 %	100 %	0 %	241113490
132	NC_012848	G	6	6	560861	560866	0 %	0 %	100 %	0 %	241113492
133	NC_012848	C	6	6	566436	566441	0 %	0 %	0 %	100 %	241113496
134	NC_012848	T	6	6	568858	568863	0 %	100 %	0 %	0 %	241113499
135	NC_012848	A	6	6	569038	569043	100 %	0 %	0 %	0 %	241113499
136	NC_012848	G	6	6	571558	571563	0 %	0 %	100 %	0 %	241113501
137	NC_012848	T	6	6	573494	573499	0 %	100 %	0 %	0 %	241113502
138	NC_012848	T	6	6	573606	573611	0 %	100 %	0 %	0 %	241113502
139	NC_012848	T	6	6	576443	576448	0 %	100 %	0 %	0 %	241113505
140	NC_012848	C	6	6	581609	581614	0 %	0 %	0 %	100 %	241113510
141	NC_012848	T	7	7	591990	591996	0 %	100 %	0 %	0 %	241113518
142	NC_012848	G	6	6	593780	593785	0 %	0 %	100 %	0 %	241113520
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.