MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	A	6	6	8475	8480	100 %	0 %	0 %	0 %	241113010
2	NC_012848	T	6	6	10114	10119	0 %	100 %	0 %	0 %	241113010
3	NC_012848	T	6	6	18735	18740	0 %	100 %	0 %	0 %	241113016
4	NC_012848	T	6	6	18886	18891	0 %	100 %	0 %	0 %	241113016
5	NC_012848	C	6	6	23879	23884	0 %	0 %	0 %	100 %	241113020
6	NC_012848	A	6	6	24944	24949	100 %	0 %	0 %	0 %	241113022
7	NC_012848	T	6	6	35214	35219	0 %	100 %	0 %	0 %	241113031
8	NC_012848	A	7	7	39321	39327	100 %	0 %	0 %	0 %	241113033
9	NC_012848	C	6	6	44162	44167	0 %	0 %	0 %	100 %	241113039
10	NC_012848	T	6	6	53583	53588	0 %	100 %	0 %	0 %	241113048
11	NC_012848	A	6	6	76270	76275	100 %	0 %	0 %	0 %	241113065
12	NC_012848	C	6	6	76389	76394	0 %	0 %	0 %	100 %	241113065
13	NC_012848	T	6	6	76904	76909	0 %	100 %	0 %	0 %	241113066
14	NC_012848	G	6	6	78092	78097	0 %	0 %	100 %	0 %	241113067
15	NC_012848	G	6	6	78231	78236	0 %	0 %	100 %	0 %	241113067
16	NC_012848	T	6	6	81170	81175	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
17	NC_012848	T	6	6	81513	81518	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
18	NC_012848	A	6	6	82951	82956	100 %	0 %	0 %	0 %	241113071
19	NC_012848	T	6	6	93363	93368	0 %	100 %	0 %	0 %	241113081
20	NC_012848	G	6	6	106869	106874	0 %	0 %	100 %	0 %	241113095
21	NC_012848	C	6	6	127139	127144	0 %	0 %	0 %	100 %	241113112
22	NC_012848	A	6	6	164247	164252	100 %	0 %	0 %	0 %	241113149
23	NC_012848	C	6	6	170196	170201	0 %	0 %	0 %	100 %	241113155
24	NC_012848	G	6	6	180420	180425	0 %	0 %	100 %	0 %	241113165
25	NC_012848	T	7	7	180800	180806	0 %	100 %	0 %	0 %	241113165
26	NC_012848	A	6	6	185835	185840	100 %	0 %	0 %	0 %	241113169
27	NC_012848	T	6	6	186744	186749	0 %	100 %	0 %	0 %	241113169
28	NC_012848	G	6	6	190621	190626	0 %	0 %	100 %	0 %	241113172
29	NC_012848	T	6	6	198436	198441	0 %	100 %	0 %	0 %	241113177
30	NC_012848	G	6	6	200240	200245	0 %	0 %	100 %	0 %	241113180
31	NC_012848	G	6	6	211680	211685	0 %	0 %	100 %	0 %	241113191
32	NC_012848	T	6	6	212683	212688	0 %	100 %	0 %	0 %	241113191
33	NC_012848	A	6	6	214029	214034	100 %	0 %	0 %	0 %	241113193
34	NC_012848	A	6	6	226973	226978	100 %	0 %	0 %	0 %	241113203
35	NC_012848	C	8	8	227869	227876	0 %	0 %	0 %	100 %	241113204
36	NC_012848	T	6	6	228862	228867	0 %	100 %	0 %	0 %	241113205
37	NC_012848	C	6	6	236908	236913	0 %	0 %	0 %	100 %	241113213
38	NC_012848	G	6	6	243732	243737	0 %	0 %	100 %	0 %	241113217
39	NC_012848	C	6	6	244156	244161	0 %	0 %	0 %	100 %	241113218
40	NC_012848	G	6	6	246374	246379	0 %	0 %	100 %	0 %	241113219
41	NC_012848	G	6	6	251465	251470	0 %	0 %	100 %	0 %	241113224
42	NC_012848	C	6	6	260376	260381	0 %	0 %	0 %	100 %	241113233
43	NC_012848	G	6	6	260467	260472	0 %	0 %	100 %	0 %	241113233
44	NC_012848	A	6	6	261540	261545	100 %	0 %	0 %	0 %	241113233
45	NC_012848	T	6	6	262307	262312	0 %	100 %	0 %	0 %	241113233
46	NC_012848	C	6	6	263609	263614	0 %	0 %	0 %	100 %	241113234
47	NC_012848	T	7	7	274787	274793	0 %	100 %	0 %	0 %	241113240
48	NC_012848	A	6	6	279479	279484	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
49	NC_012848	A	7	7	279803	279809	100 %	0 %	0 %	0 %	241113246
50	NC_012848	A	6	6	287725	287730	100 %	0 %	0 %	0 %	241113253
51	NC_012848	A	7	7	288149	288155	100 %	0 %	0 %	0 %	241113253
52	NC_012848	A	6	6	295005	295010	100 %	0 %	0 %	0 %	241113260
53	NC_012848	C	6	6	301520	301525	0 %	0 %	0 %	100 %	241113268
54	NC_012848	T	6	6	301578	301583	0 %	100 %	0 %	0 %	241113268
55	NC_012848	A	6	6	310648	310653	100 %	0 %	0 %	0 %	241113275
56	NC_012848	A	6	6	310760	310765	100 %	0 %	0 %	0 %	241113275
57	NC_012848	T	6	6	320513	320518	0 %	100 %	0 %	0 %	241113283
58	NC_012848	C	7	7	326322	326328	0 %	0 %	0 %	100 %	241113288
59	NC_012848	T	6	6	327361	327366	0 %	100 %	0 %	0 %	241113288
60	NC_012848	A	7	7	329322	329328	100 %	0 %	0 %	0 %	241113290
61	NC_012848	T	7	7	329695	329701	0 %	100 %	0 %	0 %	241113290
62	NC_012848	T	7	7	331005	331011	0 %	100 %	0 %	0 %	241113292
63	NC_012848	T	6	6	331311	331316	0 %	100 %	0 %	0 %	241113292
64	NC_012848	A	6	6	332491	332496	100 %	0 %	0 %	0 %	241113294
65	NC_012848	C	6	6	335685	335690	0 %	0 %	0 %	100 %	241113296
66	NC_012848	G	6	6	340376	340381	0 %	0 %	100 %	0 %	241113300
67	NC_012848	A	6	6	345486	345491	100 %	0 %	0 %	0 %	241113305
68	NC_012848	T	6	6	348577	348582	0 %	100 %	0 %	0 %	241113307
69	NC_012848	T	6	6	372718	372723	0 %	100 %	0 %	0 %	241113329
70	NC_012848	G	6	6	374261	374266	0 %	0 %	100 %	0 %	241113330
71	NC_012848	A	6	6	383266	383271	100 %	0 %	0 %	0 %	241113339
72	NC_012848	T	7	7	383443	383449	0 %	100 %	0 %	0 %	241113339
73	NC_012848	G	6	6	401680	401685	0 %	0 %	100 %	0 %	241113356
74	NC_012848	C	6	6	404323	404328	0 %	0 %	0 %	100 %	241113359
75	NC_012848	C	6	6	410627	410632	0 %	0 %	0 %	100 %	241113363
76	NC_012848	T	6	6	413526	413531	0 %	100 %	0 %	0 %	241113365
77	NC_012848	T	6	6	419523	419528	0 %	100 %	0 %	0 %	241113372
78	NC_012848	A	6	6	420630	420635	100 %	0 %	0 %	0 %	241113373
79	NC_012848	C	6	6	432443	432448	0 %	0 %	0 %	100 %	241113388
80	NC_012848	C	6	6	438993	438998	0 %	0 %	0 %	100 %	241113394
81	NC_012848	T	6	6	441820	441825	0 %	100 %	0 %	0 %	241113397
82	NC_012848	T	6	6	442387	442392	0 %	100 %	0 %	0 %	241113399
83	NC_012848	C	6	6	456695	456700	0 %	0 %	0 %	100 %	241113413
84	NC_012848	A	6	6	471430	471435	100 %	0 %	0 %	0 %	241113423
85	NC_012848	C	6	6	484301	484306	0 %	0 %	0 %	100 %	241113432
86	NC_012848	G	6	6	496732	496737	0 %	0 %	100 %	0 %	241113438
87	NC_012848	A	6	6	515961	515966	100 %	0 %	0 %	0 %	241113452
88	NC_012848	T	6	6	521932	521937	0 %	100 %	0 %	0 %	241113461
89	NC_012848	G	6	6	558977	558982	0 %	0 %	100 %	0 %	241113490
90	NC_012848	G	6	6	560861	560866	0 %	0 %	100 %	0 %	241113492
91	NC_012848	C	6	6	566436	566441	0 %	0 %	0 %	100 %	241113496
92	NC_012848	T	6	6	568858	568863	0 %	100 %	0 %	0 %	241113499
93	NC_012848	A	6	6	569038	569043	100 %	0 %	0 %	0 %	241113499
94	NC_012848	G	6	6	571558	571563	0 %	0 %	100 %	0 %	241113501
95	NC_012848	T	6	6	573494	573499	0 %	100 %	0 %	0 %	241113502
96	NC_012848	T	6	6	573606	573611	0 %	100 %	0 %	0 %	241113502
97	NC_012848	T	6	6	576443	576448	0 %	100 %	0 %	0 %	241113505
98	NC_012848	C	6	6	581609	581614	0 %	0 %	0 %	100 %	241113510
99	NC_012848	T	7	7	591990	591996	0 %	100 %	0 %	0 %	241113518
100	NC_012848	G	6	6	593780	593785	0 %	0 %	100 %	0 %	241113520
101	NC_012848	A	6	6	598116	598121	100 %	0 %	0 %	0 %	241113525
102	NC_012848	C	6	6	603883	603888	0 %	0 %	0 %	100 %	241113527
103	NC_012848	A	6	6	606854	606859	100 %	0 %	0 %	0 %	241113529
104	NC_012848	G	6	6	607050	607055	0 %	0 %	100 %	0 %	241113529
105	NC_012848	T	6	6	615309	615314	0 %	100 %	0 %	0 %	241113538
106	NC_012848	A	6	6	622643	622648	100 %	0 %	0 %	0 %	241113545
107	NC_012848	A	6	6	634454	634459	100 %	0 %	0 %	0 %	241113556
108	NC_012848	T	6	6	636733	636738	0 %	100 %	0 %	0 %	241113558
109	NC_012848	A	6	6	643787	643792	100 %	0 %	0 %	0 %	241113565
110	NC_012848	T	7	7	665525	665531	0 %	100 %	0 %	0 %	241113585
111	NC_012848	T	6	6	682276	682281	0 %	100 %	0 %	0 %	241113604
112	NC_012848	T	6	6	682610	682615	0 %	100 %	0 %	0 %	241113605
113	NC_012848	A	6	6	691453	691458	100 %	0 %	0 %	0 %	241113615
114	NC_012848	T	6	6	695498	695503	0 %	100 %	0 %	0 %	241113619
115	NC_012848	A	6	6	699978	699983	100 %	0 %	0 %	0 %	241113623
116	NC_012848	A	6	6	709572	709577	100 %	0 %	0 %	0 %	241113636
117	NC_012848	G	6	6	710851	710856	0 %	0 %	100 %	0 %	241113637
118	NC_012848	T	6	6	711887	711892	0 %	100 %	0 %	0 %	241113638
119	NC_012848	T	6	6	735507	735512	0 %	100 %	0 %	0 %	241113657
120	NC_012848	C	6	6	740450	740455	0 %	0 %	0 %	100 %	241113664
121	NC_012848	C	6	6	741436	741441	0 %	0 %	0 %	100 %	241113665
122	NC_012848	A	6	6	746222	746227	100 %	0 %	0 %	0 %	241113669
123	NC_012848	T	6	6	747542	747547	0 %	100 %	0 %	0 %	241113670
124	NC_012848	A	6	6	747608	747613	100 %	0 %	0 %	0 %	241113670
125	NC_012848	T	6	6	747812	747817	0 %	100 %	0 %	0 %	241113670
126	NC_012848	T	7	7	749485	749491	0 %	100 %	0 %	0 %	241113670
127	NC_012848	A	6	6	751770	751775	100 %	0 %	0 %	0 %	241113672
128	NC_012848	C	6	6	753567	753572	0 %	0 %	0 %	100 %	241113673
129	NC_012848	T	6	6	765018	765023	0 %	100 %	0 %	0 %	241113682
130	NC_012848	T	6	6	770813	770818	0 %	100 %	0 %	0 %	241113690
131	NC_012848	A	6	6	772938	772943	100 %	0 %	0 %	0 %	241113692
132	NC_012848	G	6	6	775932	775937	0 %	0 %	100 %	0 %	241113695
133	NC_012848	T	6	6	777890	777895	0 %	100 %	0 %	0 %	241113697
134	NC_012848	T	6	6	778771	778776	0 %	100 %	0 %	0 %	241113697
135	NC_012848	C	6	6	779987	779992	0 %	0 %	0 %	100 %	241113698
136	NC_012848	A	6	6	798186	798191	100 %	0 %	0 %	0 %	241113714
137	NC_012848	T	6	6	799693	799698	0 %	100 %	0 %	0 %	241113716
138	NC_012848	A	6	6	811202	811207	100 %	0 %	0 %	0 %	241113724
139	NC_012848	T	6	6	816780	816785	0 %	100 %	0 %	0 %	241113729
140	NC_012848	T	7	7	820157	820163	0 %	100 %	0 %	0 %	241113732
141	NC_012848	A	6	6	826843	826848	100 %	0 %	0 %	0 %	241113739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.