MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bartonella grahamii as4aup plasmid pBGR3

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012847	ATACC	2	10	1384	1393	40 %	20 %	0 %	40 %	240851423
2	NC_012847	TCCAA	2	10	2296	2305	40 %	20 %	0 %	40 %	240851424
3	NC_012847	TAAAA	2	10	2528	2537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012847	TTTCT	2	10	3946	3955	0 %	80 %	0 %	20 %	240851425
5	NC_012847	TAAAT	2	10	4497	4506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012847	TAATT	2	10	4522	4531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012847	ATTTA	4	20	4534	4553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012847	TTTGG	2	10	4555	4564	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012847	TTAAT	2	10	5228	5237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012847	TGGGG	2	10	5905	5914	0 %	20 %	80 %	0 %	240851427
11	NC_012847	GTTTT	2	10	6907	6916	0 %	80 %	20 %	0 %	240851428
12	NC_012847	TTTTA	2	10	7221	7230	20 %	80 %	0 %	0 %	240851428
13	NC_012847	AGACA	2	10	7545	7554	60 %	0 %	20 %	20 %	240851428
14	NC_012847	ATGAC	2	10	7750	7759	40 %	20 %	20 %	20 %	240851428
15	NC_012847	GGGAA	2	10	10568	10577	40 %	0 %	60 %	0 %	240851432
16	NC_012847	TTCAG	2	10	13085	13094	20 %	40 %	20 %	20 %	240851435
17	NC_012847	ATCAA	2	10	13233	13242	60 %	20 %	0 %	20 %	240851435
18	NC_012847	ACACA	2	10	13613	13622	60 %	0 %	0 %	40 %	240851436
19	NC_012847	CCTTA	2	10	16571	16580	20 %	40 %	0 %	40 %	240851440
20	NC_012847	CATAT	2	10	19233	19242	40 %	40 %	0 %	20 %	240851440
21	NC_012847	TTGCT	2	10	19318	19327	0 %	60 %	20 %	20 %	240851440
22	NC_012847	TTTTA	2	10	20347	20356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012847	TTTTA	2	10	20873	20882	20 %	80 %	0 %	0 %	240851442
24	NC_012847	ACATG	2	10	21305	21314	40 %	20 %	20 %	20 %	240851443
25	NC_012847	TTCTC	2	10	22365	22374	0 %	60 %	0 %	40 %	240851443
26	NC_012847	ATTTT	2	10	23191	23200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012847	ATTTA	2	10	24963	24972	40 %	60 %	0 %	0 %	240851447
28	NC_012847	TTTTA	2	10	25044	25053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012847	CAAAA	2	10	26694	26703	80 %	0 %	0 %	20 %	240851449
30	NC_012847	ATACG	2	10	27726	27735	40 %	20 %	20 %	20 %	240851451
31	NC_012847	TTCTG	2	10	27950	27959	0 %	60 %	20 %	20 %	240851451

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.