MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bartonella grahamii as4aup plasmid pBGR3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012847	ATTT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012847	TATT	2	8	20	27	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012847	GTTT	2	8	800	807	0 %	75 %	25 %	0 %	240851422
4	NC_012847	CTTA	2	8	864	871	25 %	50 %	0 %	25 %	240851422
5	NC_012847	TGAG	2	8	873	880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012847	AATA	2	8	982	989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012847	ATAA	2	8	990	997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012847	ATTT	2	8	1003	1010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012847	AATA	2	8	1163	1170	75 %	25 %	0 %	0 %	240851423
10	NC_012847	TCCA	2	8	1427	1434	25 %	25 %	0 %	50 %	240851423
11	NC_012847	TAAT	2	8	2014	2021	50 %	50 %	0 %	0 %	240851424
12	NC_012847	AGTA	2	8	2187	2194	50 %	25 %	25 %	0 %	240851424
13	NC_012847	TCTT	2	8	2594	2601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012847	TAAA	2	8	2862	2869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012847	ATTT	2	8	3048	3055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012847	TATT	2	8	3186	3193	25 %	75 %	0 %	0 %	240851425
17	NC_012847	ATCA	2	8	3265	3272	50 %	25 %	0 %	25 %	240851425
18	NC_012847	GAAG	2	8	3542	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	240851425
19	NC_012847	TGTA	2	8	4916	4923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012847	ATTA	2	8	5141	5148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012847	GGAT	2	8	5206	5213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012847	CTTT	2	8	5549	5556	0 %	75 %	0 %	25 %	240851426
23	NC_012847	CTTG	2	8	5677	5684	0 %	50 %	25 %	25 %	240851427
24	NC_012847	AATG	2	8	5960	5967	50 %	25 %	25 %	0 %	240851427
25	NC_012847	TTGG	2	8	6685	6692	0 %	50 %	50 %	0 %	240851428
26	NC_012847	CAAA	2	8	6818	6825	75 %	0 %	0 %	25 %	240851428
27	NC_012847	GTTT	2	8	7259	7266	0 %	75 %	25 %	0 %	240851428
28	NC_012847	AGGG	2	8	7641	7648	25 %	0 %	75 %	0 %	240851428
29	NC_012847	GGGT	2	8	7692	7699	0 %	25 %	75 %	0 %	240851428
30	NC_012847	TGAT	2	8	7828	7835	25 %	50 %	25 %	0 %	240851428
31	NC_012847	ATTT	2	8	8028	8035	25 %	75 %	0 %	0 %	240851428
32	NC_012847	CAAA	2	8	8369	8376	75 %	0 %	0 %	25 %	240851429
33	NC_012847	CAAT	2	8	8639	8646	50 %	25 %	0 %	25 %	240851429
34	NC_012847	GAAA	2	8	8686	8693	75 %	0 %	25 %	0 %	240851429
35	NC_012847	CAAG	2	8	8755	8762	50 %	0 %	25 %	25 %	240851429
36	NC_012847	AGAA	2	8	8838	8845	75 %	0 %	25 %	0 %	240851429
37	NC_012847	TATG	2	8	9646	9653	25 %	50 %	25 %	0 %	240851431
38	NC_012847	AATA	2	8	9878	9885	75 %	25 %	0 %	0 %	240851431
39	NC_012847	TCTT	2	8	10469	10476	0 %	75 %	0 %	25 %	240851432
40	NC_012847	GAAA	2	8	10715	10722	75 %	0 %	25 %	0 %	240851432
41	NC_012847	ACCC	2	8	12415	12422	25 %	0 %	0 %	75 %	240851435
42	NC_012847	ACCC	2	8	12623	12630	25 %	0 %	0 %	75 %	240851435
43	NC_012847	AAAG	2	8	13144	13151	75 %	0 %	25 %	0 %	240851435
44	NC_012847	AAGC	2	8	13188	13195	50 %	0 %	25 %	25 %	240851435
45	NC_012847	ATTT	2	8	13484	13491	25 %	75 %	0 %	0 %	240851436
46	NC_012847	AACG	2	8	13669	13676	50 %	0 %	25 %	25 %	240851436
47	NC_012847	CAAA	2	8	14063	14070	75 %	0 %	0 %	25 %	240851436
48	NC_012847	AAAG	2	8	14299	14306	75 %	0 %	25 %	0 %	240851436
49	NC_012847	TAAA	2	8	14472	14479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012847	TCAT	2	8	14480	14487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012847	TTTG	2	8	14828	14835	0 %	75 %	25 %	0 %	240851438
52	NC_012847	ACTC	2	8	14898	14905	25 %	25 %	0 %	50 %	240851438
53	NC_012847	CAAG	2	8	15869	15876	50 %	0 %	25 %	25 %	240851438
54	NC_012847	ATTT	2	8	15934	15941	25 %	75 %	0 %	0 %	240851438
55	NC_012847	ACTC	2	8	16667	16674	25 %	25 %	0 %	50 %	240851440
56	NC_012847	TCTT	2	8	18258	18265	0 %	75 %	0 %	25 %	240851440
57	NC_012847	AAGA	2	8	18282	18289	75 %	0 %	25 %	0 %	240851440
58	NC_012847	TCTT	2	8	18874	18881	0 %	75 %	0 %	25 %	240851440
59	NC_012847	AATG	2	8	19556	19563	50 %	25 %	25 %	0 %	240851440
60	NC_012847	TCCT	2	8	19875	19882	0 %	50 %	0 %	50 %	240851440
61	NC_012847	AAAG	2	8	20484	20491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012847	AATA	2	8	21072	21079	75 %	25 %	0 %	0 %	240851443
63	NC_012847	GTTC	2	8	21121	21128	0 %	50 %	25 %	25 %	240851443
64	NC_012847	CTTT	2	8	21329	21336	0 %	75 %	0 %	25 %	240851443
65	NC_012847	AGCC	2	8	21601	21608	25 %	0 %	25 %	50 %	240851443
66	NC_012847	ATTC	2	8	22131	22138	25 %	50 %	0 %	25 %	240851443
67	NC_012847	TTCG	2	8	22921	22928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012847	GCTA	2	8	24460	24467	25 %	25 %	25 %	25 %	240851446
69	NC_012847	CAAA	2	8	24470	24477	75 %	0 %	0 %	25 %	240851446
70	NC_012847	ATTG	2	8	24928	24935	25 %	50 %	25 %	0 %	240851447
71	NC_012847	TTAT	2	8	25061	25068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012847	TTAT	2	8	25167	25174	25 %	75 %	0 %	0 %	240851448
73	NC_012847	CTTC	2	8	25701	25708	0 %	50 %	0 %	50 %	240851448
74	NC_012847	CAGT	2	8	26000	26007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012847	AAAG	2	8	26019	26026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012847	TCTT	2	8	26176	26183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012847	TGAG	2	8	26466	26473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012847	TGGT	2	8	27030	27037	0 %	50 %	50 %	0 %	240851449
79	NC_012847	TACA	2	8	27070	27077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012847	TATT	2	8	27150	27157	25 %	75 %	0 %	0 %	240851450
81	NC_012847	AATT	2	8	28048	28055	50 %	50 %	0 %	0 %	240851451

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.