MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella grahamii as4aup

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012846	ATTTAT	2	12	9250	9261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012846	TTGAGT	2	12	16931	16942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012846	ATAAAG	2	12	44034	44045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012846	TCCTTT	2	12	53510	53521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012846	TATAAT	2	12	92436	92447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012846	GCTTTT	2	12	94709	94720	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012846	AGGAAT	2	12	100595	100606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012846	TTTCTG	2	12	102162	102173	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012846	TCAAAA	2	12	126926	126937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012846	AAGAAT	2	12	146072	146083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012846	CTTTAC	2	12	164998	165009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012846	ATAAAT	2	12	170326	170337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012846	ATTTTT	2	12	170795	170806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012846	TTTTCT	2	12	171082	171093	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012846	ATCTGT	2	12	187161	187172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012846	ACAAAT	2	12	189033	189044	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012846	AATATT	2	12	189075	189086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012846	TAGGGG	2	12	190752	190763	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012846	GATAGA	2	12	192745	192756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012846	CGTTGT	2	12	193526	193537	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012846	TACAAT	2	12	213951	213962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012846	ATAAGA	2	12	216043	216054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012846	ATAAAA	2	12	266382	266393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012846	AACTCT	2	12	279621	279632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012846	GATGAA	2	12	367777	367788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012846	AATGAA	2	12	369750	369761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012846	AATGAA	2	12	370573	370584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012846	AATTAT	2	12	381407	381418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012846	TTAAAT	2	12	394753	394764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012846	TATAAT	2	12	395186	395197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012846	CTTTTA	2	12	398221	398232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012846	GTTATC	2	12	401803	401814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012846	GTTTTT	2	12	410214	410225	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012846	TTTTCT	2	12	410298	410309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012846	TTCCAT	2	12	429497	429508	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012846	ATGATA	2	12	462303	462314	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012846	TTTTAG	2	12	478200	478211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012846	AATATT	2	12	480442	480453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012846	GAAAAA	2	12	481475	481486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012846	CATAAG	2	12	482838	482849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012846	ATTGCA	2	12	483179	483190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012846	AATAAA	2	12	519230	519241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012846	TTTTCA	2	12	520375	520386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012846	TTCAAA	2	12	521975	521986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012846	CGTTGT	2	12	563234	563245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012846	ATAAAA	2	12	581312	581323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012846	ATTTTT	2	12	584245	584256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012846	TACTTT	2	12	585121	585132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012846	ATATTA	2	12	586494	586505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012846	AAATAG	2	12	605258	605269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012846	ATTTTC	2	12	605638	605649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012846	GAAAAG	2	12	687544	687555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012846	ATTTTT	2	12	691568	691579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012846	GAATAG	2	12	696881	696892	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012846	AAGAAA	2	12	700622	700633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012846	ATAAAA	2	12	701135	701146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012846	ATTTTT	2	12	778412	778423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012846	ATTGGT	2	12	786536	786547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012846	AAAGAC	2	12	813300	813311	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012846	CATATA	2	12	887852	887863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012846	GCAATG	2	12	890268	890279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012846	CTTTTT	2	12	896084	896095	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012846	AAGGAA	2	12	915371	915382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012846	AAAATA	2	12	925135	925146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012846	TTTCAT	2	12	928738	928749	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012846	TTTTCA	2	12	960439	960450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012846	TAAAAT	2	12	960617	960628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012846	ATGAAC	2	12	978679	978690	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012846	TTTAGG	2	12	979265	979276	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012846	AATTTT	2	12	988213	988224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012846	TTCCAT	2	12	1034121	1034132	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012846	TTCTTT	2	12	1072586	1072597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012846	TAATTA	2	12	1074558	1074569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012846	GTTTTT	2	12	1078044	1078055	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012846	AAAATA	2	12	1079584	1079595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012846	CATGAT	2	12	1096508	1096519	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012846	CATGAT	2	12	1098979	1098990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012846	AATAAA	2	12	1102005	1102016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012846	CTTTGC	2	12	1115381	1115392	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012846	TTGAAG	2	12	1120749	1120760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012846	TTATAT	2	12	1126459	1126470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012846	AAAGGA	2	12	1170486	1170497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012846	AAAGAT	2	12	1188632	1188643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012846	AATATA	2	12	1198847	1198858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012846	AAGAGA	2	12	1200991	1201002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012846	TAATGA	2	12	1214709	1214720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012846	ACCTTA	2	12	1226651	1226662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012846	TTTATT	2	12	1227940	1227951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012846	TTTATA	2	12	1228053	1228064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012846	ATTTTG	2	12	1231562	1231573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012846	AATTAT	2	12	1241557	1241568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012846	TTTTTG	2	12	1297903	1297914	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012846	TGCTCA	2	12	1303696	1303707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012846	ATCTTT	2	12	1312660	1312671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012846	ATTTCT	2	12	1315428	1315439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012846	CATTTA	2	12	1325234	1325245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012846	AATCCA	2	12	1325657	1325668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012846	ACAATC	2	12	1346897	1346908	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012846	CATTTT	2	12	1350182	1350193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012846	AAAAAG	2	12	1350406	1350417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012846	AAATCA	2	12	1373198	1373209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012846	TTTTAA	2	12	1380940	1380951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012846	ATTTTC	2	12	1381023	1381034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012846	AACACC	2	12	1398596	1398607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012846	CCAATC	2	12	1403044	1403055	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012846	CATATA	2	12	1403499	1403510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012846	ACAATC	2	12	1403691	1403702	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012846	CCAAAC	2	12	1407259	1407270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012846	AATGCG	2	12	1407628	1407639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012846	TTAAAA	2	12	1411789	1411800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012846	CCTAAA	2	12	1413861	1413872	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012846	CCAACA	2	12	1414661	1414672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012846	AAAGCC	2	12	1414699	1414710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012846	CAATAA	2	12	1415368	1415379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012846	AAATGA	2	12	1420593	1420604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012846	TATATT	2	12	1431717	1431728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012846	AATTTT	2	12	1443481	1443492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012846	TTCAAA	2	12	1445485	1445496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012846	AACCAG	2	12	1446167	1446178	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012846	AAAGCC	2	12	1448007	1448018	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012846	AATTTA	2	12	1466702	1466713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012846	TTAAAA	2	12	1503063	1503074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012846	AAAAGC	2	12	1508298	1508309	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012846	AAAGCC	2	12	1511192	1511203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012846	TAATTT	2	12	1513901	1513912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012846	TAAATA	2	12	1516113	1516124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012846	ATATTT	2	12	1516204	1516215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012846	TCAACT	2	12	1519358	1519369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012846	CCATTT	2	12	1521043	1521054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.