MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	ATGGGC	2	12	18926	18937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012815	GGTCGA	2	12	50664	50675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012815	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012815	TTCCAG	2	12	57736	57747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012815	CATGAG	2	12	60441	60452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012815	GGGCGG	2	12	108645	108656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012815	TACAAA	2	12	140075	140086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012815	CTGGCA	2	12	147190	147201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012815	GATAGG	2	12	166274	166285	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012815	GCATGG	2	12	166565	166576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012815	GGCGCG	2	12	201058	201069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012815	GCGCCC	2	12	225724	225735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012815	ACTATG	2	12	240039	240050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012815	GAGACG	2	12	286879	286890	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012815	AGAGGA	2	12	291621	291632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012815	GCTGTT	2	12	299252	299263	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012815	GCTTTT	2	12	361234	361245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012815	GTTGGC	2	12	412944	412955	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012815	CGCATC	2	12	445672	445683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012815	GCTGAA	2	12	482468	482479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012815	GCAGCC	2	12	495377	495388	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012815	TGAGAT	2	12	498641	498652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012815	AAGGTA	2	12	499172	499183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012815	TCCGCA	2	12	519554	519565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012815	CATGCA	2	12	531101	531112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012815	ATGCCG	2	12	564350	564361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012815	GCGCAC	2	12	570248	570259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012815	GGAATC	2	12	619395	619406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012815	TCGCTC	2	12	653806	653817	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012815	GATTGC	2	12	655744	655755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012815	TCGCTC	2	12	655801	655812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012815	CGACAA	2	12	669306	669317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012815	CATGCG	2	12	726562	726573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012815	ATGCCC	2	12	760230	760241	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012815	GCCACC	2	12	807080	807091	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012815	TTAGAC	2	12	862400	862411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012815	TGCGGC	2	12	884123	884134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012815	GCCCTT	2	12	898587	898598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012815	AAAAGG	2	12	916411	916422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012815	TATCGT	2	12	935438	935449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012815	CGCCTG	2	12	1016804	1016815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012815	GACATG	2	12	1091462	1091473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012815	CCCATA	2	12	1109362	1109373	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012815	ACTCAT	2	12	1114031	1114042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012815	TTCCCT	2	12	1231840	1231851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012815	GAGCGC	2	12	1266006	1266017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012815	GGCACG	2	12	1287494	1287505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012815	GGCGAT	2	12	1298499	1298510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012815	CGTAAG	2	12	1348210	1348221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012815	GGCCTT	2	12	1375967	1375978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012815	TTGAAG	2	12	1376022	1376033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012815	TCACAT	2	12	1406345	1406356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012815	GGCCAA	2	12	1424581	1424592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012815	TGGCTG	2	12	1463465	1463476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012815	CTCGTT	2	12	1464792	1464803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012815	TTGCAC	2	12	1477485	1477496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012815	CGCTTT	2	12	1494240	1494251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012815	GCCGTT	2	12	1512751	1512762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012815	CGCTTG	2	12	1580848	1580859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012815	AGAGAA	2	12	1656539	1656550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012815	GTCGAC	2	12	1687980	1687991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012815	ATCTTG	2	12	1749453	1749464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012815	CAAAAA	2	12	1755783	1755794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012815	CCTTTG	2	12	1809677	1809688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012815	GCAATC	2	12	1824237	1824248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012815	CATCTC	2	12	1836168	1836179	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012815	CAATCT	2	12	1836272	1836283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012815	ATGGGA	2	12	1861929	1861940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012815	CCTTTG	2	12	1885899	1885910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012815	ATCGAT	2	12	1911703	1911714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012815	CTATAC	2	12	1934413	1934424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.