MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 1490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	241195473
2	NC_012815	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	241195474
3	NC_012815	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	241195474
4	NC_012815	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	241195474
5	NC_012815	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	241195477
6	NC_012815	AAGGC	2	10	7644	7653	40 %	0 %	40 %	20 %	241195477
7	NC_012815	GCACG	2	10	14420	14429	20 %	0 %	40 %	40 %	241195482
8	NC_012815	GGTGG	2	10	15065	15074	0 %	20 %	80 %	0 %	241195482
9	NC_012815	GCGAG	2	10	15797	15806	20 %	0 %	60 %	20 %	241195483
10	NC_012815	CGTGC	2	10	15944	15953	0 %	20 %	40 %	40 %	241195483
11	NC_012815	GATTG	2	10	16718	16727	20 %	40 %	40 %	0 %	241195483
12	NC_012815	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	241195485
13	NC_012815	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	241195485
14	NC_012815	TCTGT	2	10	21384	21393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012815	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	241195492
16	NC_012815	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	241195492
17	NC_012815	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	241195492
18	NC_012815	GCCGT	2	10	26067	26076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012815	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	241195493
20	NC_012815	AGAGA	2	10	28163	28172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012815	CGGTT	2	10	28212	28221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012815	GAAGA	2	10	31023	31032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012815	TTCAC	2	10	31435	31444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012815	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	241195502
25	NC_012815	TTTTG	2	10	33987	33996	0 %	80 %	20 %	0 %	241195503
26	NC_012815	TGAGT	2	10	34473	34482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012815	GATGT	2	10	35032	35041	20 %	40 %	40 %	0 %	241195504
28	NC_012815	AAATC	2	10	36007	36016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012815	TATGC	2	10	38421	38430	20 %	40 %	20 %	20 %	241195506
30	NC_012815	AAAGC	2	10	39670	39679	60 %	0 %	20 %	20 %	241195506
31	NC_012815	CATCA	2	10	40475	40484	40 %	20 %	0 %	40 %	241195507
32	NC_012815	TGCTG	2	10	41065	41074	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012815	GAGAT	2	10	43617	43626	40 %	20 %	40 %	0 %	241195510
34	NC_012815	CAAGC	2	10	44321	44330	40 %	0 %	20 %	40 %	241195511
35	NC_012815	TTCGT	2	10	44833	44842	0 %	60 %	20 %	20 %	241195512
36	NC_012815	GATCG	2	10	45763	45772	20 %	20 %	40 %	20 %	241195515
37	NC_012815	GGAAG	2	10	45923	45932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012815	CGCCA	2	10	46431	46440	20 %	0 %	20 %	60 %	241195516
39	NC_012815	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	241195518
40	NC_012815	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	241195519
41	NC_012815	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	241195519
42	NC_012815	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	241195519
43	NC_012815	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	241195521
44	NC_012815	GCACG	2	10	53344	53353	20 %	0 %	40 %	40 %	241195521
45	NC_012815	ATTCA	2	10	55364	55373	40 %	40 %	0 %	20 %	241195523
46	NC_012815	TCCGC	2	10	55585	55594	0 %	20 %	20 %	60 %	241195523
47	NC_012815	TGAAT	2	10	56420	56429	40 %	40 %	20 %	0 %	241195523
48	NC_012815	GGATC	2	10	57076	57085	20 %	20 %	40 %	20 %	241195523
49	NC_012815	GGGAA	2	10	64393	64402	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012815	ATCGC	2	10	66393	66402	20 %	20 %	20 %	40 %	241195534
51	NC_012815	TGGGG	2	10	67092	67101	0 %	20 %	80 %	0 %	241195535
52	NC_012815	GGCGC	2	10	69592	69601	0 %	0 %	60 %	40 %	241195536
53	NC_012815	GCTCG	2	10	72756	72765	0 %	20 %	40 %	40 %	241195538
54	NC_012815	GCTGA	2	10	74919	74928	20 %	20 %	40 %	20 %	241195540
55	NC_012815	CATCG	2	10	76719	76728	20 %	20 %	20 %	40 %	241195540
56	NC_012815	TTGTA	2	10	77130	77139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012815	CGGTC	2	10	79327	79336	0 %	20 %	40 %	40 %	241195542
58	NC_012815	GCACG	2	10	80128	80137	20 %	0 %	40 %	40 %	241195542
59	NC_012815	CGGTG	2	10	80718	80727	0 %	20 %	60 %	20 %	241195543
60	NC_012815	TCATT	2	10	81634	81643	20 %	60 %	0 %	20 %	241195543
61	NC_012815	CCAAA	2	10	82117	82126	60 %	0 %	0 %	40 %	241195544
62	NC_012815	CCGGG	2	10	82610	82619	0 %	0 %	60 %	40 %	241195545
63	NC_012815	CGGCT	2	10	87776	87785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_012815	CGAAC	2	10	89401	89410	40 %	0 %	20 %	40 %	241195549
65	NC_012815	GAGAA	2	10	89865	89874	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012815	GCTCG	2	10	90882	90891	0 %	20 %	40 %	40 %	241195551
67	NC_012815	ATACA	2	10	91486	91495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012815	GGTGC	2	10	96163	96172	0 %	20 %	60 %	20 %	241195555
69	NC_012815	GTCTT	2	10	102629	102638	0 %	60 %	20 %	20 %	241195560
70	NC_012815	GCGCC	2	10	106948	106957	0 %	0 %	40 %	60 %	241195562
71	NC_012815	CGCCC	2	10	107436	107445	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_012815	GCCGC	2	10	107904	107913	0 %	0 %	40 %	60 %	241195563
73	NC_012815	AGGAA	2	10	108699	108708	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012815	TGTTT	2	10	111453	111462	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012815	GCAAA	2	10	111881	111890	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012815	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	241195569
77	NC_012815	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	241195569
78	NC_012815	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
79	NC_012815	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	241195569
80	NC_012815	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
81	NC_012815	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	241195569
82	NC_012815	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	241195570
83	NC_012815	GCCCG	2	10	117612	117621	0 %	0 %	40 %	60 %	241195570
84	NC_012815	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	241195570
85	NC_012815	GTGCG	2	10	118988	118997	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012815	TGGTG	2	10	121855	121864	0 %	40 %	60 %	0 %	241195573
87	NC_012815	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	241195575
88	NC_012815	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	241195576
89	NC_012815	AGGTG	2	10	125712	125721	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012815	TGGCA	2	10	128088	128097	20 %	20 %	40 %	20 %	241195580
91	NC_012815	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	241195580
92	NC_012815	TCGCG	2	10	129027	129036	0 %	20 %	40 %	40 %	241195581
93	NC_012815	GCGCC	2	10	133395	133404	0 %	0 %	40 %	60 %	241195585
94	NC_012815	TGGGT	2	10	134515	134524	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012815	CGCAT	2	10	135235	135244	20 %	20 %	20 %	40 %	241195588
96	NC_012815	TGGAT	2	10	136779	136788	20 %	40 %	40 %	0 %	241195590
97	NC_012815	TGAGG	2	10	138045	138054	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012815	TGCTC	2	10	139189	139198	0 %	40 %	20 %	40 %	241195593
99	NC_012815	CGGCT	2	10	141048	141057	0 %	20 %	40 %	40 %	241195595
100	NC_012815	TCTCA	2	10	144025	144034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012815	ATCTC	2	10	146938	146947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_012815	CTCGC	2	10	147203	147212	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_012815	AACAG	2	10	147357	147366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012815	CAAGA	2	10	147644	147653	60 %	0 %	20 %	20 %	241195600
105	NC_012815	GACAA	2	10	149868	149877	60 %	0 %	20 %	20 %	241195602
106	NC_012815	CCCGA	2	10	150045	150054	20 %	0 %	20 %	60 %	241195602
107	NC_012815	ATGAG	2	10	151762	151771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012815	CGACG	2	10	152524	152533	20 %	0 %	40 %	40 %	241195604
109	NC_012815	GCACC	2	10	155958	155967	20 %	0 %	20 %	60 %	241195606
110	NC_012815	GCTCG	2	10	156863	156872	0 %	20 %	40 %	40 %	241195607
111	NC_012815	CGGCA	2	10	157523	157532	20 %	0 %	40 %	40 %	241195607
112	NC_012815	CGACC	2	10	158592	158601	20 %	0 %	20 %	60 %	241195608
113	NC_012815	GCTCG	2	10	158912	158921	0 %	20 %	40 %	40 %	241195609
114	NC_012815	TCCCG	2	10	160046	160055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_012815	CACCG	2	10	161607	161616	20 %	0 %	20 %	60 %	241195611
116	NC_012815	TGGCA	2	10	162249	162258	20 %	20 %	40 %	20 %	241195611
117	NC_012815	GCGAA	2	10	163883	163892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012815	AGTGT	2	10	164380	164389	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012815	GCGCC	2	10	164850	164859	0 %	0 %	40 %	60 %	241195615
120	NC_012815	CCGCG	2	10	165534	165543	0 %	0 %	40 %	60 %	241195615
121	NC_012815	CGGCG	2	10	166541	166550	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012815	GTGCG	2	10	167678	167687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012815	GGAGG	2	10	171908	171917	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012815	TGCCG	2	10	174262	174271	0 %	20 %	40 %	40 %	241195620
125	NC_012815	TGCCC	2	10	177032	177041	0 %	20 %	20 %	60 %	241195623
126	NC_012815	CTCAT	2	10	177635	177644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_012815	TGCGC	2	10	178044	178053	0 %	20 %	40 %	40 %	241195624
128	NC_012815	GCGTG	2	10	178657	178666	0 %	20 %	60 %	20 %	241195625
129	NC_012815	CCACG	2	10	179563	179572	20 %	0 %	20 %	60 %	241195625
130	NC_012815	TGAGG	2	10	180061	180070	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012815	GCACC	2	10	181805	181814	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_012815	CTCGC	2	10	184344	184353	0 %	20 %	20 %	60 %	241195629
133	NC_012815	CGCCA	2	10	185952	185961	20 %	0 %	20 %	60 %	241195630
134	NC_012815	CGTGG	2	10	186643	186652	0 %	20 %	60 %	20 %	241195630
135	NC_012815	TCGCC	2	10	188684	188693	0 %	20 %	20 %	60 %	241195631
136	NC_012815	GTTCT	2	10	191421	191430	0 %	60 %	20 %	20 %	241195634
137	NC_012815	CAGCG	2	10	193032	193041	20 %	0 %	40 %	40 %	241195636
138	NC_012815	ATGGC	2	10	193253	193262	20 %	20 %	40 %	20 %	241195636
139	NC_012815	GCTCG	2	10	193591	193600	0 %	20 %	40 %	40 %	241195637
140	NC_012815	TCGAA	2	10	194751	194760	40 %	20 %	20 %	20 %	241195637
141	NC_012815	GCGAG	2	10	194904	194913	20 %	0 %	60 %	20 %	241195637
142	NC_012815	CGGCG	2	10	196254	196263	0 %	0 %	60 %	40 %	241195638
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148	NC_012815	GAAGT	2	10	200608	200617	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_012815	GCGTG	2	10	206345	206354	0 %	20 %	60 %	20 %	241195645
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165	NC_012815	CAGCA	2	10	229274	229283	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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177	NC_012815	CTCGA	2	10	238142	238151	20 %	20 %	20 %	40 %	241195670
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186	NC_012815	GCGCG	2	10	252253	252262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
187	NC_012815	CGTTG	2	10	254343	254352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_012815	TGCGG	2	10	338005	338014	0 %	20 %	60 %	20 %	241195737
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259	NC_012815	CGGCG	2	10	341214	341223	0 %	0 %	60 %	40 %	241195738
260	NC_012815	TGGCA	2	10	341605	341614	20 %	20 %	40 %	20 %	241195738
261	NC_012815	TGACG	2	10	344880	344889	20 %	20 %	40 %	20 %	241195741
262	NC_012815	GCGCA	2	10	348168	348177	20 %	0 %	40 %	40 %	241195745
263	NC_012815	ATGAG	2	10	348925	348934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_012815	CTGGG	2	10	348951	348960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_012815	CCGAG	2	10	349075	349084	20 %	0 %	40 %	40 %	241195747
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267	NC_012815	TCGGG	2	10	350020	350029	0 %	20 %	60 %	20 %	241195748
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399	NC_012815	GATGA	2	10	524777	524786	40 %	20 %	40 %	0 %	241195896
400	NC_012815	CGACC	2	10	525238	525247	20 %	0 %	20 %	60 %	241195896
401	NC_012815	ATGGC	2	10	525726	525735	20 %	20 %	40 %	20 %	241195897
402	NC_012815	GGAAG	2	10	527084	527093	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
403	NC_012815	ATGCG	2	10	528876	528885	20 %	20 %	40 %	20 %	241195899
404	NC_012815	GGTCA	2	10	529372	529381	20 %	20 %	40 %	20 %	241195899
405	NC_012815	GCGCC	2	10	530065	530074	0 %	0 %	40 %	60 %	241195900
406	NC_012815	CCGCG	2	10	534456	534465	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
407	NC_012815	GACCC	2	10	536144	536153	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
408	NC_012815	TCGGC	2	10	536368	536377	0 %	20 %	40 %	40 %	241195903
409	NC_012815	TGGCA	2	10	537678	537687	20 %	20 %	40 %	20 %	241195903
410	NC_012815	GCATC	2	10	540525	540534	20 %	20 %	20 %	40 %	241195906
411	NC_012815	TCGCA	2	10	541135	541144	20 %	20 %	20 %	40 %	241195906
412	NC_012815	GCAAT	2	10	544056	544065	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
413	NC_012815	TCGTC	2	10	544620	544629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
414	NC_012815	CATGC	2	10	544650	544659	20 %	20 %	20 %	40 %	241195911
415	NC_012815	TCGAT	2	10	545538	545547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
416	NC_012815	GAGAG	2	10	546356	546365	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
417	NC_012815	GCCGT	2	10	546547	546556	0 %	20 %	40 %	40 %	241195913
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420	NC_012815	CCGTG	2	10	549187	549196	0 %	20 %	40 %	40 %	241195915
421	NC_012815	AAGAG	2	10	549655	549664	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012815	GCGTC	2	10	551060	551069	0 %	20 %	40 %	40 %	241195917
423	NC_012815	GCGGA	2	10	551802	551811	20 %	0 %	60 %	20 %	241195917
424	NC_012815	AGGGA	2	10	552187	552196	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_012815	TGCCG	2	10	563996	564005	0 %	20 %	40 %	40 %	241195926
431	NC_012815	ATCGG	2	10	564476	564485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
432	NC_012815	GACCG	2	10	568887	568896	20 %	0 %	40 %	40 %	241195929
433	NC_012815	TATCG	2	10	569637	569646	20 %	40 %	20 %	20 %	241195929
434	NC_012815	GTCGT	2	10	572107	572116	0 %	40 %	40 %	20 %	241195931
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436	NC_012815	GATGC	2	10	572888	572897	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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439	NC_012815	TCGAG	2	10	579652	579661	20 %	20 %	40 %	20 %	241195939
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443	NC_012815	TGTGC	2	10	588319	588328	0 %	40 %	40 %	20 %	241195945
444	NC_012815	GGGCA	2	10	590658	590667	20 %	0 %	60 %	20 %	241195947
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447	NC_012815	CATGC	2	10	596642	596651	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
448	NC_012815	GTCTT	2	10	598291	598300	0 %	60 %	20 %	20 %	241195953
449	NC_012815	ACACG	2	10	599037	599046	40 %	0 %	20 %	40 %	241195954
450	NC_012815	CGCCA	2	10	599060	599069	20 %	0 %	20 %	60 %	241195954
451	NC_012815	GCGCT	2	10	600819	600828	0 %	20 %	40 %	40 %	241195956
452	NC_012815	CCGCA	2	10	602639	602648	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
453	NC_012815	GCCGC	2	10	605607	605616	0 %	0 %	40 %	60 %	241195960
454	NC_012815	CTTTC	2	10	606072	606081	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
455	NC_012815	CCGAA	2	10	606282	606291	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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479	NC_012815	AGCGT	2	10	630604	630613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_012815	GCACA	2	10	664568	664577	40 %	0 %	20 %	40 %	241196009

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