MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 1205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	241195473
2	NC_012815	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	241195474
3	NC_012815	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	241195474
4	NC_012815	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	241195474
5	NC_012815	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	241195477
6	NC_012815	AAGGC	2	10	7644	7653	40 %	0 %	40 %	20 %	241195477
7	NC_012815	GCACG	2	10	14420	14429	20 %	0 %	40 %	40 %	241195482
8	NC_012815	GGTGG	2	10	15065	15074	0 %	20 %	80 %	0 %	241195482
9	NC_012815	GCGAG	2	10	15797	15806	20 %	0 %	60 %	20 %	241195483
10	NC_012815	CGTGC	2	10	15944	15953	0 %	20 %	40 %	40 %	241195483
11	NC_012815	GATTG	2	10	16718	16727	20 %	40 %	40 %	0 %	241195483
12	NC_012815	TTCGA	2	10	17127	17136	20 %	40 %	20 %	20 %	241195485
13	NC_012815	ACCGA	2	10	17784	17793	40 %	0 %	20 %	40 %	241195485
14	NC_012815	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	241195492
15	NC_012815	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	241195492
16	NC_012815	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	241195492
17	NC_012815	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	241195493
18	NC_012815	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	241195502
19	NC_012815	TTTTG	2	10	33987	33996	0 %	80 %	20 %	0 %	241195503
20	NC_012815	GATGT	2	10	35032	35041	20 %	40 %	40 %	0 %	241195504
21	NC_012815	TATGC	2	10	38421	38430	20 %	40 %	20 %	20 %	241195506
22	NC_012815	AAAGC	2	10	39670	39679	60 %	0 %	20 %	20 %	241195506
23	NC_012815	CATCA	2	10	40475	40484	40 %	20 %	0 %	40 %	241195507
24	NC_012815	GAGAT	2	10	43617	43626	40 %	20 %	40 %	0 %	241195510
25	NC_012815	CAAGC	2	10	44321	44330	40 %	0 %	20 %	40 %	241195511
26	NC_012815	TTCGT	2	10	44833	44842	0 %	60 %	20 %	20 %	241195512
27	NC_012815	GATCG	2	10	45763	45772	20 %	20 %	40 %	20 %	241195515
28	NC_012815	CGCCA	2	10	46431	46440	20 %	0 %	20 %	60 %	241195516
29	NC_012815	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	241195518
30	NC_012815	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	241195519
31	NC_012815	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	241195519
32	NC_012815	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	241195519
33	NC_012815	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	241195521
34	NC_012815	GCACG	2	10	53344	53353	20 %	0 %	40 %	40 %	241195521
35	NC_012815	ATTCA	2	10	55364	55373	40 %	40 %	0 %	20 %	241195523
36	NC_012815	TCCGC	2	10	55585	55594	0 %	20 %	20 %	60 %	241195523
37	NC_012815	TGAAT	2	10	56420	56429	40 %	40 %	20 %	0 %	241195523
38	NC_012815	GGATC	2	10	57076	57085	20 %	20 %	40 %	20 %	241195523
39	NC_012815	ATCGC	2	10	66393	66402	20 %	20 %	20 %	40 %	241195534
40	NC_012815	TGGGG	2	10	67092	67101	0 %	20 %	80 %	0 %	241195535
41	NC_012815	GGCGC	2	10	69592	69601	0 %	0 %	60 %	40 %	241195536
42	NC_012815	GCTCG	2	10	72756	72765	0 %	20 %	40 %	40 %	241195538
43	NC_012815	GCTGA	2	10	74919	74928	20 %	20 %	40 %	20 %	241195540
44	NC_012815	CATCG	2	10	76719	76728	20 %	20 %	20 %	40 %	241195540
45	NC_012815	CGGTC	2	10	79327	79336	0 %	20 %	40 %	40 %	241195542
46	NC_012815	GCACG	2	10	80128	80137	20 %	0 %	40 %	40 %	241195542
47	NC_012815	CGGTG	2	10	80718	80727	0 %	20 %	60 %	20 %	241195543
48	NC_012815	TCATT	2	10	81634	81643	20 %	60 %	0 %	20 %	241195543
49	NC_012815	CCAAA	2	10	82117	82126	60 %	0 %	0 %	40 %	241195544
50	NC_012815	CCGGG	2	10	82610	82619	0 %	0 %	60 %	40 %	241195545
51	NC_012815	CGAAC	2	10	89401	89410	40 %	0 %	20 %	40 %	241195549
52	NC_012815	GCTCG	2	10	90882	90891	0 %	20 %	40 %	40 %	241195551
53	NC_012815	GGTGC	2	10	96163	96172	0 %	20 %	60 %	20 %	241195555
54	NC_012815	GTCTT	2	10	102629	102638	0 %	60 %	20 %	20 %	241195560
55	NC_012815	GCGCC	2	10	106948	106957	0 %	0 %	40 %	60 %	241195562
56	NC_012815	GCCGC	2	10	107904	107913	0 %	0 %	40 %	60 %	241195563
57	NC_012815	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	241195569
58	NC_012815	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	241195569
59	NC_012815	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
60	NC_012815	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	241195569
61	NC_012815	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
62	NC_012815	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	241195569
63	NC_012815	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	241195570
64	NC_012815	GCCCG	2	10	117612	117621	0 %	0 %	40 %	60 %	241195570
65	NC_012815	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	241195570
66	NC_012815	TGGTG	2	10	121855	121864	0 %	40 %	60 %	0 %	241195573
67	NC_012815	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	241195575
68	NC_012815	TCGAA	2	10	125602	125611	40 %	20 %	20 %	20 %	241195576
69	NC_012815	TGGCA	2	10	128088	128097	20 %	20 %	40 %	20 %	241195580
70	NC_012815	GCCGA	2	10	128127	128136	20 %	0 %	40 %	40 %	241195580
71	NC_012815	TCGCG	2	10	129027	129036	0 %	20 %	40 %	40 %	241195581
72	NC_012815	GCGCC	2	10	133395	133404	0 %	0 %	40 %	60 %	241195585
73	NC_012815	CGCAT	2	10	135235	135244	20 %	20 %	20 %	40 %	241195588
74	NC_012815	TGGAT	2	10	136779	136788	20 %	40 %	40 %	0 %	241195590
75	NC_012815	TGCTC	2	10	139189	139198	0 %	40 %	20 %	40 %	241195593
76	NC_012815	CGGCT	2	10	141048	141057	0 %	20 %	40 %	40 %	241195595
77	NC_012815	CAAGA	2	10	147644	147653	60 %	0 %	20 %	20 %	241195600
78	NC_012815	GACAA	2	10	149868	149877	60 %	0 %	20 %	20 %	241195602
79	NC_012815	CCCGA	2	10	150045	150054	20 %	0 %	20 %	60 %	241195602
80	NC_012815	CGACG	2	10	152524	152533	20 %	0 %	40 %	40 %	241195604
81	NC_012815	GCACC	2	10	155958	155967	20 %	0 %	20 %	60 %	241195606
82	NC_012815	GCTCG	2	10	156863	156872	0 %	20 %	40 %	40 %	241195607
83	NC_012815	CGGCA	2	10	157523	157532	20 %	0 %	40 %	40 %	241195607
84	NC_012815	CGACC	2	10	158592	158601	20 %	0 %	20 %	60 %	241195608
85	NC_012815	GCTCG	2	10	158912	158921	0 %	20 %	40 %	40 %	241195609
86	NC_012815	CACCG	2	10	161607	161616	20 %	0 %	20 %	60 %	241195611
87	NC_012815	TGGCA	2	10	162249	162258	20 %	20 %	40 %	20 %	241195611
88	NC_012815	GCGCC	2	10	164850	164859	0 %	0 %	40 %	60 %	241195615
89	NC_012815	CCGCG	2	10	165534	165543	0 %	0 %	40 %	60 %	241195615
90	NC_012815	TGCCG	2	10	174262	174271	0 %	20 %	40 %	40 %	241195620
91	NC_012815	TGCCC	2	10	177032	177041	0 %	20 %	20 %	60 %	241195623
92	NC_012815	TGCGC	2	10	178044	178053	0 %	20 %	40 %	40 %	241195624
93	NC_012815	GCGTG	2	10	178657	178666	0 %	20 %	60 %	20 %	241195625
94	NC_012815	CCACG	2	10	179563	179572	20 %	0 %	20 %	60 %	241195625
95	NC_012815	CTCGC	2	10	184344	184353	0 %	20 %	20 %	60 %	241195629
96	NC_012815	CGCCA	2	10	185952	185961	20 %	0 %	20 %	60 %	241195630
97	NC_012815	CGTGG	2	10	186643	186652	0 %	20 %	60 %	20 %	241195630
98	NC_012815	TCGCC	2	10	188684	188693	0 %	20 %	20 %	60 %	241195631
99	NC_012815	GTTCT	2	10	191421	191430	0 %	60 %	20 %	20 %	241195634
100	NC_012815	CAGCG	2	10	193032	193041	20 %	0 %	40 %	40 %	241195636
101	NC_012815	ATGGC	2	10	193253	193262	20 %	20 %	40 %	20 %	241195636
102	NC_012815	GCTCG	2	10	193591	193600	0 %	20 %	40 %	40 %	241195637
103	NC_012815	TCGAA	2	10	194751	194760	40 %	20 %	20 %	20 %	241195637
104	NC_012815	GCGAG	2	10	194904	194913	20 %	0 %	60 %	20 %	241195637
105	NC_012815	CGGCG	2	10	196254	196263	0 %	0 %	60 %	40 %	241195638
106	NC_012815	TGCCG	2	10	196831	196840	0 %	20 %	40 %	40 %	241195638
107	NC_012815	TGTGT	2	10	198691	198700	0 %	60 %	40 %	0 %	241195639
108	NC_012815	TGCCC	2	10	198736	198745	0 %	20 %	20 %	60 %	241195639
109	NC_012815	GCCGC	2	10	202292	202301	0 %	0 %	40 %	60 %	241195643
110	NC_012815	ACTGC	2	10	202983	202992	20 %	20 %	20 %	40 %	241195643
111	NC_012815	TCGTC	2	10	205520	205529	0 %	40 %	20 %	40 %	241195645
112	NC_012815	GCGTG	2	10	206345	206354	0 %	20 %	60 %	20 %	241195645
113	NC_012815	TCGAC	2	10	207058	207067	20 %	20 %	20 %	40 %	241195646
114	NC_012815	GCCGG	2	10	210007	210016	0 %	0 %	60 %	40 %	241195647
115	NC_012815	CACGC	2	10	213194	213203	20 %	0 %	20 %	60 %	241195650
116	NC_012815	CCGTG	2	10	213832	213841	0 %	20 %	40 %	40 %	241195650
117	NC_012815	CGGAA	2	10	214881	214890	40 %	0 %	40 %	20 %	241195651
118	NC_012815	AAGAC	2	10	221029	221038	60 %	0 %	20 %	20 %	241195656
119	NC_012815	TGGCG	2	10	221886	221895	0 %	20 %	60 %	20 %	241195657
120	NC_012815	GGTGG	2	10	225518	225527	0 %	20 %	80 %	0 %	241195659
121	NC_012815	GCGCA	2	10	227065	227074	20 %	0 %	40 %	40 %	241195661
122	NC_012815	AGCAA	2	10	229335	229344	60 %	0 %	20 %	20 %	241195663
123	NC_012815	CGGCA	2	10	232271	232280	20 %	0 %	40 %	40 %	241195665
124	NC_012815	GCCCG	2	10	233160	233169	0 %	0 %	40 %	60 %	241195666
125	NC_012815	CGTGG	2	10	233850	233859	0 %	20 %	60 %	20 %	241195666
126	NC_012815	TGCTC	2	10	235219	235228	0 %	40 %	20 %	40 %	241195668
127	NC_012815	GGGGC	2	10	235763	235772	0 %	0 %	80 %	20 %	241195668
128	NC_012815	CGTTT	2	10	236152	236161	0 %	60 %	20 %	20 %	241195669
129	NC_012815	CTCAC	2	10	236473	236482	20 %	20 %	0 %	60 %	241195669
130	NC_012815	CTCGA	2	10	237220	237229	20 %	20 %	20 %	40 %	241195670
131	NC_012815	TCCGG	2	10	237275	237284	0 %	20 %	40 %	40 %	241195670
132	NC_012815	GCGCG	2	10	237595	237604	0 %	0 %	60 %	40 %	241195670
133	NC_012815	CTCGA	2	10	238142	238151	20 %	20 %	20 %	40 %	241195670
134	NC_012815	TCGTC	2	10	239052	239061	0 %	40 %	20 %	40 %	241195670
135	NC_012815	ACCCG	2	10	241962	241971	20 %	0 %	20 %	60 %	241195672
136	NC_012815	TCGGC	2	10	242999	243008	0 %	20 %	40 %	40 %	241195673
137	NC_012815	GCGAT	2	10	245012	245021	20 %	20 %	40 %	20 %	241195677
138	NC_012815	GGCGA	2	10	245959	245968	20 %	0 %	60 %	20 %	241195678
139	NC_012815	CCGCA	2	10	247568	247577	20 %	0 %	20 %	60 %	241195678
140	NC_012815	CGGCC	2	10	255982	255991	0 %	0 %	40 %	60 %	241195685
141	NC_012815	GCGCG	2	10	256830	256839	0 %	0 %	60 %	40 %	241195685
142	NC_012815	AGCCA	2	10	260409	260418	40 %	0 %	20 %	40 %	241195688
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144	NC_012815	CTCGC	2	10	261515	261524	0 %	20 %	20 %	60 %	241195688
145	NC_012815	GGCGA	2	10	261587	261596	20 %	0 %	60 %	20 %	241195688
146	NC_012815	TTCGG	2	10	262052	262061	0 %	40 %	40 %	20 %	241195688
147	NC_012815	ATGGC	2	10	265868	265877	20 %	20 %	40 %	20 %	241195691
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149	NC_012815	CTGAC	2	10	268112	268121	20 %	20 %	20 %	40 %	241195692
150	NC_012815	GCAAG	2	10	269727	269736	40 %	0 %	40 %	20 %	241195693
151	NC_012815	GCCAT	2	10	270698	270707	20 %	20 %	20 %	40 %	241195693
152	NC_012815	AGGTG	2	10	271964	271973	20 %	20 %	60 %	0 %	241195694
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154	NC_012815	GGTGA	2	10	272519	272528	20 %	20 %	60 %	0 %	241195694
155	NC_012815	CCTGC	2	10	273577	273586	0 %	20 %	20 %	60 %	241195695
156	NC_012815	TGGCC	2	10	274533	274542	0 %	20 %	40 %	40 %	241195696
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159	NC_012815	GCACG	2	10	282429	282438	20 %	0 %	40 %	40 %	241195702
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161	NC_012815	GCTGG	2	10	283727	283736	0 %	20 %	60 %	20 %	241195703
162	NC_012815	TTCCG	2	10	284150	284159	0 %	40 %	20 %	40 %	241195703
163	NC_012815	AAGCC	2	10	285055	285064	40 %	0 %	20 %	40 %	241195704
164	NC_012815	GACGA	2	10	288412	288421	40 %	0 %	40 %	20 %	241195706
165	NC_012815	GATTC	2	10	289291	289300	20 %	40 %	20 %	20 %	241195706
166	NC_012815	TCGCG	2	10	289902	289911	0 %	20 %	40 %	40 %	241195707
167	NC_012815	GAGGC	2	10	290304	290313	20 %	0 %	60 %	20 %	241195707
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169	NC_012815	TGCCG	2	10	294449	294458	0 %	20 %	40 %	40 %	241195710
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172	NC_012815	GTCGT	2	10	302205	302214	0 %	40 %	40 %	20 %	241195716
173	NC_012815	GTGCG	2	10	302670	302679	0 %	20 %	60 %	20 %	241195717
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183	NC_012815	CCGAC	2	10	316769	316778	20 %	0 %	20 %	60 %	241195726
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191	NC_012815	ACCGA	2	10	328764	328773	40 %	0 %	20 %	40 %	241195733
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201	NC_012815	CGGCG	2	10	341214	341223	0 %	0 %	60 %	40 %	241195738
202	NC_012815	TGGCA	2	10	341605	341614	20 %	20 %	40 %	20 %	241195738
203	NC_012815	TGACG	2	10	344880	344889	20 %	20 %	40 %	20 %	241195741
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209	NC_012815	GCCGT	2	10	351781	351790	0 %	20 %	40 %	40 %	241195749
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244	NC_012815	TCCGA	2	10	397373	397382	20 %	20 %	20 %	40 %	241195781
245	NC_012815	CATGG	2	10	397719	397728	20 %	20 %	40 %	20 %	241195781
246	NC_012815	TTCTG	2	10	398015	398024	0 %	60 %	20 %	20 %	241195781
247	NC_012815	GGTCT	2	10	401506	401515	0 %	40 %	40 %	20 %	241195784
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249	NC_012815	CAAGT	2	10	403486	403495	40 %	20 %	20 %	20 %	241195785
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251	NC_012815	GACAT	2	10	404147	404156	40 %	20 %	20 %	20 %	241195786
252	NC_012815	GCAGG	2	10	405332	405341	20 %	0 %	60 %	20 %	241195786
253	NC_012815	ACCGT	2	10	407509	407518	20 %	20 %	20 %	40 %	241195788
254	NC_012815	ACCGG	2	10	407663	407672	20 %	0 %	40 %	40 %	241195788
255	NC_012815	TCACG	2	10	407724	407733	20 %	20 %	20 %	40 %	241195788
256	NC_012815	CCCGA	2	10	410333	410342	20 %	0 %	20 %	60 %	241195791
257	NC_012815	CCGCC	2	10	410719	410728	0 %	0 %	20 %	80 %	241195791
258	NC_012815	ACTCG	2	10	410734	410743	20 %	20 %	20 %	40 %	241195791
259	NC_012815	GCGCG	2	10	411287	411296	0 %	0 %	60 %	40 %	241195792
260	NC_012815	TGCAT	2	10	411500	411509	20 %	40 %	20 %	20 %	241195792
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262	NC_012815	CGGCC	2	10	413772	413781	0 %	0 %	40 %	60 %	241195793
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