MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 4525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	241195473
2	NC_012815	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	241195473
3	NC_012815	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	241195473
4	NC_012815	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	241195473
5	NC_012815	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	241195473
6	NC_012815	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	241195474
7	NC_012815	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	241195474
8	NC_012815	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	241195474
9	NC_012815	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012815	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	241195475
11	NC_012815	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	241195475
12	NC_012815	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	241195475
13	NC_012815	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	241195475
14	NC_012815	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	241195475
15	NC_012815	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	241195476
16	NC_012815	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	241195476
17	NC_012815	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	241195476
18	NC_012815	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	241195476
19	NC_012815	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	241195477
20	NC_012815	CGAG	2	8	7215	7222	25 %	0 %	50 %	25 %	241195477
21	NC_012815	CGGC	2	8	7536	7543	0 %	0 %	50 %	50 %	241195477
22	NC_012815	AACC	2	8	7973	7980	50 %	0 %	0 %	50 %	241195478
23	NC_012815	CGAT	2	8	8117	8124	25 %	25 %	25 %	25 %	241195478
24	NC_012815	GAGC	2	8	8179	8186	25 %	0 %	50 %	25 %	241195478
25	NC_012815	CCGC	2	8	8567	8574	0 %	0 %	25 %	75 %	241195478
26	NC_012815	TGCG	2	8	8825	8832	0 %	25 %	50 %	25 %	241195478
27	NC_012815	CATT	2	8	9143	9150	25 %	50 %	0 %	25 %	241195478
28	NC_012815	CGCC	2	8	9183	9190	0 %	0 %	25 %	75 %	241195478
29	NC_012815	GCAC	2	8	9749	9756	25 %	0 %	25 %	50 %	241195478
30	NC_012815	CGAC	2	8	10082	10089	25 %	0 %	25 %	50 %	241195478
31	NC_012815	GATG	2	8	10221	10228	25 %	25 %	50 %	0 %	241195478
32	NC_012815	ACCG	2	8	10987	10994	25 %	0 %	25 %	50 %	241195479
33	NC_012815	CGCC	2	8	11027	11034	0 %	0 %	25 %	75 %	241195479
34	NC_012815	CGGT	2	8	11158	11165	0 %	25 %	50 %	25 %	241195479
35	NC_012815	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012815	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012815	TTCA	2	8	11807	11814	25 %	50 %	0 %	25 %	241195480
38	NC_012815	TGCG	2	8	12064	12071	0 %	25 %	50 %	25 %	241195480
39	NC_012815	TTGC	2	8	12527	12534	0 %	50 %	25 %	25 %	241195480
40	NC_012815	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012815	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012815	GCGA	3	12	14744	14755	25 %	0 %	50 %	25 %	241195482
43	NC_012815	CGCC	2	8	14863	14870	0 %	0 %	25 %	75 %	241195482
44	NC_012815	GCCG	2	8	15218	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	241195482
45	NC_012815	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_012815	TCGG	2	8	16490	16497	0 %	25 %	50 %	25 %	241195483
47	NC_012815	GCCG	2	8	16677	16684	0 %	0 %	50 %	50 %	241195483
48	NC_012815	GCCG	2	8	17097	17104	0 %	0 %	50 %	50 %	241195485
49	NC_012815	TGGC	2	8	17348	17355	0 %	25 %	50 %	25 %	241195485
50	NC_012815	GATC	2	8	17549	17556	25 %	25 %	25 %	25 %	241195485
51	NC_012815	TTCC	2	8	17722	17729	0 %	50 %	0 %	50 %	241195485
52	NC_012815	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012815	GCGT	2	8	19316	19323	0 %	25 %	50 %	25 %	241195487
54	NC_012815	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012815	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012815	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012815	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012815	TCGA	2	8	20406	20413	25 %	25 %	25 %	25 %	241195488
59	NC_012815	ACTC	2	8	20597	20604	25 %	25 %	0 %	50 %	241195488
60	NC_012815	GGAA	2	8	20668	20675	50 %	0 %	50 %	0 %	241195488
61	NC_012815	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012815	CAGT	2	8	21817	21824	25 %	25 %	25 %	25 %	241195490
63	NC_012815	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012815	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012815	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012815	GAGC	2	8	23843	23850	25 %	0 %	50 %	25 %	241195492
67	NC_012815	CGCA	2	8	24440	24447	25 %	0 %	25 %	50 %	241195492
68	NC_012815	GTGA	2	8	24924	24931	25 %	25 %	50 %	0 %	241195492
69	NC_012815	GCGA	2	8	24972	24979	25 %	0 %	50 %	25 %	241195492
70	NC_012815	GCCT	2	8	25198	25205	0 %	25 %	25 %	50 %	241195492
71	NC_012815	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	241195492
72	NC_012815	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	241195492
73	NC_012815	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012815	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012815	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	241195494
76	NC_012815	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	241195494
77	NC_012815	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012815	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012815	GTCG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	241195495
80	NC_012815	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012815	GCAG	2	8	29438	29445	25 %	0 %	50 %	25 %	241195496
82	NC_012815	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	241195496
83	NC_012815	GACT	2	8	29949	29956	25 %	25 %	25 %	25 %	241195496
84	NC_012815	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012815	GCTT	2	8	31989	31996	0 %	50 %	25 %	25 %	241195500
86	NC_012815	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	241195502
87	NC_012815	TTTC	2	8	32914	32921	0 %	75 %	0 %	25 %	241195502
88	NC_012815	ATTT	2	8	33195	33202	25 %	75 %	0 %	0 %	241195502
89	NC_012815	ACGA	2	8	33211	33218	50 %	0 %	25 %	25 %	241195502
90	NC_012815	CTTG	2	8	33368	33375	0 %	50 %	25 %	25 %	241195502
91	NC_012815	TTTA	2	8	33384	33391	25 %	75 %	0 %	0 %	241195502
92	NC_012815	ATTC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	241195502
93	NC_012815	TGAT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	25 %	0 %	241195503
94	NC_012815	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012815	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012815	GAGC	2	8	34870	34877	25 %	0 %	50 %	25 %	241195504
97	NC_012815	GCCA	2	8	35688	35695	25 %	0 %	25 %	50 %	241195504
98	NC_012815	CTCG	2	8	36208	36215	0 %	25 %	25 %	50 %	241195505
99	NC_012815	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012815	TGCT	2	8	37689	37696	0 %	50 %	25 %	25 %	241195506
101	NC_012815	TGGG	2	8	37736	37743	0 %	25 %	75 %	0 %	241195506
102	NC_012815	AGCG	2	8	37778	37785	25 %	0 %	50 %	25 %	241195506
103	NC_012815	GAAA	2	8	38316	38323	75 %	0 %	25 %	0 %	241195506
104	NC_012815	CTTG	2	8	41618	41625	0 %	50 %	25 %	25 %	241195508
105	NC_012815	GCTT	2	8	41659	41666	0 %	50 %	25 %	25 %	241195508
106	NC_012815	TGAT	2	8	42022	42029	25 %	50 %	25 %	0 %	241195508
107	NC_012815	CAAT	2	8	42259	42266	50 %	25 %	0 %	25 %	241195508
108	NC_012815	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012815	AGTG	2	8	43586	43593	25 %	25 %	50 %	0 %	241195510
110	NC_012815	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012815	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012815	GTCG	2	8	44332	44339	0 %	25 %	50 %	25 %	241195511
113	NC_012815	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012815	TTTG	2	8	44880	44887	0 %	75 %	25 %	0 %	241195512
115	NC_012815	AAGG	2	8	45092	45099	50 %	0 %	50 %	0 %	241195513
116	NC_012815	GGAT	2	8	45700	45707	25 %	25 %	50 %	0 %	241195515
117	NC_012815	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012815	CGGT	2	8	46492	46499	0 %	25 %	50 %	25 %	241195516
119	NC_012815	GTGA	2	8	46759	46766	25 %	25 %	50 %	0 %	241195516
120	NC_012815	CGGT	2	8	47241	47248	0 %	25 %	50 %	25 %	241195517
121	NC_012815	GCTG	2	8	47728	47735	0 %	25 %	50 %	25 %	241195518
122	NC_012815	CGGC	2	8	48080	48087	0 %	0 %	50 %	50 %	241195519
123	NC_012815	GGGC	2	8	48486	48493	0 %	0 %	75 %	25 %	241195519
124	NC_012815	CCTG	2	8	48669	48676	0 %	25 %	25 %	50 %	241195519
125	NC_012815	CCCT	2	8	49234	49241	0 %	25 %	0 %	75 %	241195519
126	NC_012815	GTGC	2	8	49253	49260	0 %	25 %	50 %	25 %	241195519
127	NC_012815	CGGT	2	8	49796	49803	0 %	25 %	50 %	25 %	241195519
128	NC_012815	CGAA	2	8	49920	49927	50 %	0 %	25 %	25 %	241195519
129	NC_012815	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012815	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012815	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012815	TGGC	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	241195520
133	NC_012815	GAGG	2	8	52507	52514	25 %	0 %	75 %	0 %	241195521
134	NC_012815	GCTC	2	8	53889	53896	0 %	25 %	25 %	50 %	241195522
135	NC_012815	CAGG	2	8	54913	54920	25 %	0 %	50 %	25 %	241195522
136	NC_012815	GCAC	2	8	55205	55212	25 %	0 %	25 %	50 %	241195522
137	NC_012815	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012815	GCCG	2	8	55383	55390	0 %	0 %	50 %	50 %	241195523
139	NC_012815	AGGT	2	8	55553	55560	25 %	25 %	50 %	0 %	241195523
140	NC_012815	CCCA	2	8	55697	55704	25 %	0 %	0 %	75 %	241195523
141	NC_012815	CGAA	2	8	56409	56416	50 %	0 %	25 %	25 %	241195523
142	NC_012815	CTCG	2	8	56620	56627	0 %	25 %	25 %	50 %	241195523
143	NC_012815	GCGG	2	8	56662	56669	0 %	0 %	75 %	25 %	241195523
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