MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012815	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012815	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012815	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012815	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012815	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012815	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012815	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012815	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012815	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012815	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012815	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012815	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012815	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012815	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012815	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012815	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012815	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012815	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012815	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012815	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012815	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012815	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012815	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012815	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012815	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012815	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012815	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012815	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012815	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012815	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012815	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012815	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012815	TACG	2	8	60419	60426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012815	CAAA	2	8	61992	61999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012815	TCGC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012815	AAGG	2	8	65509	65516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012815	GGTC	2	8	66895	66902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012815	GGGC	2	8	71414	71421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012815	TTCC	2	8	73037	73044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012815	TGCG	2	8	81707	81714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012815	TATC	2	8	85922	85929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012815	GTCT	2	8	89939	89946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012815	GCCA	2	8	89987	89994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012815	AGCG	2	8	92722	92729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012815	CTTC	2	8	92765	92772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012815	TGCC	2	8	92921	92928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012815	TGCC	2	8	111542	111549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012815	CCCG	2	8	112118	112125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_012815	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012815	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012815	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012815	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012815	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012815	TGTT	2	8	138033	138040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012815	CGTG	2	8	143580	143587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012815	GGCC	2	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012815	CATG	2	8	143987	143994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012815	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012815	GGGA	2	8	164221	164228	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012815	GCGT	2	8	164399	164406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012815	TGAG	2	8	164641	164648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012815	AGAA	2	8	164802	164809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012815	ATCT	2	8	166320	166327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012815	GCGT	2	8	166435	166442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012815	GCAT	2	8	167729	167736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012815	GTTT	2	8	167878	167885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012815	GCAT	2	8	168160	168167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012815	GGGT	2	8	170295	170302	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012815	CTTT	2	8	171747	171754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012815	GCGG	2	8	171897	171904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012815	AGTA	2	8	171950	171957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012815	AATG	2	8	171958	171965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012815	TGCT	2	8	176873	176880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012815	AGTG	2	8	177648	177655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012815	CTTG	2	8	179696	179703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012815	TAAG	2	8	179825	179832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012815	CGGT	2	8	183515	183522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012815	TGAA	2	8	192660	192667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012815	GTAA	2	8	192682	192689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012815	GATA	2	8	195356	195363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012815	GCAA	2	8	201553	201560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012815	AAAC	2	8	201978	201985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012815	ACGG	2	8	203402	203409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012815	TGGT	2	8	203565	203572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012815	CGGT	2	8	203845	203852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012815	GGCG	2	8	211197	211204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012815	ATGA	2	8	215488	215495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012815	ATTC	2	8	217231	217238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012815	CACG	2	8	223495	223502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012815	TGCA	2	8	223712	223719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012815	TCAT	2	8	225749	225756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012815	AGGC	2	8	227745	227752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012815	AGGG	2	8	232894	232901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012815	TTGT	2	8	234698	234705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012815	CCGG	2	8	235098	235105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012815	GGGC	2	8	239756	239763	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012815	CGTC	2	8	243801	243808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012815	GGCA	2	8	245154	245161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012815	GACA	2	8	249341	249348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012815	CGGT	2	8	251092	251099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012815	GTTC	2	8	251131	251138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012815	GCCG	2	8	254388	254395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012815	GCCG	2	8	256973	256980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012815	CTGG	2	8	257005	257012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012815	TGAC	2	8	266771	266778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012815	TCCC	2	8	271024	271031	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_012815	CCAT	2	8	274198	274205	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012815	TGAT	2	8	274931	274938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012815	AGGG	2	8	275034	275041	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012815	GCTT	2	8	276829	276836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012815	GCGG	2	8	277016	277023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012815	TTCG	2	8	278015	278022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012815	GCGG	2	8	278069	278076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012815	GAAA	2	8	278315	278322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012815	CGGA	2	8	279470	279477	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012815	AAAG	2	8	281170	281177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012815	GGCT	2	8	284624	284631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012815	TGAG	2	8	285028	285035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012815	TGGC	2	8	286758	286765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012815	ATGT	2	8	286947	286954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012815	GACA	2	8	288091	288098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012815	AGCG	2	8	288114	288121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012815	TACC	2	8	290408	290415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012815	ACTC	2	8	291166	291173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012815	ATGA	2	8	291271	291278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012815	TGAA	2	8	291282	291289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012815	AGGA	2	8	291613	291620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012815	GCGG	2	8	293153	293160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012815	TGCT	2	8	294691	294698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012815	TTTG	2	8	295038	295045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012815	CGCT	2	8	296250	296257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012815	AGCG	2	8	296477	296484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012815	CCCG	2	8	297520	297527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_012815	CATG	2	8	299150	299157	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012815	TTGC	2	8	300432	300439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012815	GTTT	2	8	300544	300551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012815	GCGG	2	8	300569	300576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012815	GGTT	2	8	310161	310168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012815	CAGG	2	8	313608	313615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012815	CTGT	2	8	324785	324792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012815	ACAG	2	8	325161	325168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012815	GTGG	2	8	326806	326813	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012815	CGTT	2	8	332007	332014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012815	GCAT	2	8	332143	332150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012815	TCTT	2	8	333637	333644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012815	TCTG	2	8	336847	336854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012815	CTGG	2	8	337064	337071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012815	GGGC	2	8	337229	337236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012815	AGAT	2	8	337286	337293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012815	AGGG	2	8	337707	337714	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012815	CGCA	2	8	339398	339405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012815	TGAA	2	8	342569	342576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012815	GCAT	2	8	342606	342613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012815	TGGG	2	8	346560	346567	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012815	TTCG	2	8	346874	346881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_012815	CTTG	2	8	347548	347555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_012815	TGGC	2	8	348883	348890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_012815	CTGT	2	8	349334	349341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_012815	TTCG	2	8	352931	352938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_012815	GCTG	2	8	360506	360513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_012815	GGTC	2	8	360576	360583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_012815	GCGG	2	8	361246	361253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_012815	GCAC	2	8	366631	366638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_012815	TGCA	2	8	366666	366673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_012815	CTGG	2	8	366686	366693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
168	NC_012815	ATGC	2	8	366715	366722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012815	GTCT	2	8	368042	368049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_012815	GGGA	2	8	368195	368202	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012815	CGGG	2	8	371685	371692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_012815	TGCG	2	8	371932	371939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
173	NC_012815	TCGG	2	8	372382	372389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_012815	TTGA	2	8	372582	372589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012815	CGTG	2	8	372609	372616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_012815	AGTG	2	8	375199	375206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012815	TGCA	2	8	377697	377704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_012815	TTCC	2	8	409630	409637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_012815	TGGG	2	8	409646	409653	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012815	TGCG	2	8	409747	409754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_012815	CGGT	2	8	410938	410945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_012815	TGGG	2	8	412741	412748	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_012815	TTGG	2	8	427026	427033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_012815	GCCG	2	8	444986	444993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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231	NC_012815	GCGG	2	8	564490	564497	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_012815	GGTC	2	8	634665	634672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_012815	TTCT	2	8	655983	655990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_012815	ATTT	2	8	680914	680921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_012815	GCCT	2	8	689737	689744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_012815	GCAT	2	8	1338515	1338522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_012815	GGAA	2	8	1338673	1338680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012815	TCAC	2	8	1339592	1339599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_012815	TTCA	2	8	1342613	1342620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_012815	GAGT	2	8	1342675	1342682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_012815	AATG	2	8	1364407	1364414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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