MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012815	T	6	6	1965	1970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012815	C	6	6	5654	5659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_012815	A	7	7	32816	32822	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
4	NC_012815	A	7	7	33145	33151	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
5	NC_012815	A	6	6	33416	33421	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
6	NC_012815	T	6	6	33537	33542	0 %	100 %	0 %	0 %	241195502
7	NC_012815	T	6	6	34264	34269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012815	A	6	6	45878	45883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012815	G	6	6	45936	45941	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012815	C	7	7	58453	58459	0 %	0 %	0 %	100 %	241195524
11	NC_012815	G	6	6	91638	91643	0 %	0 %	100 %	0 %	241195552
12	NC_012815	G	6	6	92435	92440	0 %	0 %	100 %	0 %	241195552
13	NC_012815	T	6	6	109084	109089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012815	A	6	6	111051	111056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012815	C	7	7	118972	118978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_012815	T	6	6	119135	119140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012815	G	6	6	119236	119241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012815	T	7	7	141891	141897	0 %	100 %	0 %	0 %	241195595
19	NC_012815	G	9	9	159526	159534	0 %	0 %	100 %	0 %	241195609
20	NC_012815	G	7	7	170191	170197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012815	G	7	7	171860	171866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012815	T	6	6	180030	180035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012815	G	7	7	184724	184730	0 %	0 %	100 %	0 %	241195629
24	NC_012815	T	6	6	192498	192503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012815	A	6	6	193370	193375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012815	T	6	6	215542	215547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012815	C	7	7	217394	217400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_012815	C	6	6	226350	226355	0 %	0 %	0 %	100 %	241195661
29	NC_012815	A	6	6	230106	230111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012815	A	6	6	233976	233981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012815	A	6	6	234824	234829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012815	A	6	6	236924	236929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012815	T	6	6	239853	239858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012815	A	6	6	239867	239872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012815	G	6	6	252472	252477	0 %	0 %	100 %	0 %	241195684
36	NC_012815	A	6	6	256911	256916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012815	C	6	6	258611	258616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_012815	T	6	6	263384	263389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012815	A	6	6	271208	271213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012815	G	6	6	272328	272333	0 %	0 %	100 %	0 %	241195694
41	NC_012815	T	6	6	274947	274952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012815	A	6	6	275224	275229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012815	T	6	6	284938	284943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012815	A	6	6	288026	288031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012815	G	11	11	291691	291701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012815	C	9	9	291721	291729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_012815	T	6	6	294855	294860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012815	A	6	6	304747	304752	100 %	0 %	0 %	0 %	241195719
49	NC_012815	G	6	6	316339	316344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012815	G	6	6	333817	333822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012815	T	6	6	337404	337409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012815	A	7	7	346616	346622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012815	G	6	6	397145	397150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012815	A	6	6	399990	399995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012815	G	6	6	413116	413121	0 %	0 %	100 %	0 %	241195793
56	NC_012815	C	6	6	419474	419479	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_012815	G	6	6	424107	424112	0 %	0 %	100 %	0 %	241195800
58	NC_012815	T	7	7	434160	434166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012815	T	6	6	446366	446371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012815	A	6	6	468699	468704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012815	A	6	6	478599	478604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012815	G	6	6	484649	484654	0 %	0 %	100 %	0 %	241195867
63	NC_012815	A	6	6	498857	498862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012815	A	6	6	505485	505490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012815	G	6	6	512670	512675	0 %	0 %	100 %	0 %	241195886
66	NC_012815	C	6	6	518402	518407	0 %	0 %	0 %	100 %	241195892
67	NC_012815	T	6	6	540158	540163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012815	G	6	6	565050	565055	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012815	G	6	6	573718	573723	0 %	0 %	100 %	0 %	241195934
70	NC_012815	G	6	6	589421	589426	0 %	0 %	100 %	0 %	241195946
71	NC_012815	C	8	8	627045	627052	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_012815	C	6	6	627325	627330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_012815	C	6	6	627332	627337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_012815	C	6	6	637239	637244	0 %	0 %	0 %	100 %	241195984
75	NC_012815	A	6	6	654364	654369	100 %	0 %	0 %	0 %	241196001
76	NC_012815	A	6	6	676763	676768	100 %	0 %	0 %	0 %	241196023
77	NC_012815	A	6	6	677833	677838	100 %	0 %	0 %	0 %	241196023
78	NC_012815	A	6	6	679214	679219	100 %	0 %	0 %	0 %	241196023
79	NC_012815	G	6	6	681113	681118	0 %	0 %	100 %	0 %	241196025
80	NC_012815	A	6	6	681943	681948	100 %	0 %	0 %	0 %	241196025
81	NC_012815	A	7	7	686966	686972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012815	G	6	6	687359	687364	0 %	0 %	100 %	0 %	241196031
83	NC_012815	T	6	6	691899	691904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012815	C	6	6	694980	694985	0 %	0 %	0 %	100 %	241196036
85	NC_012815	G	6	6	709562	709567	0 %	0 %	100 %	0 %	241196047
86	NC_012815	A	7	7	712072	712078	100 %	0 %	0 %	0 %	241196051
87	NC_012815	A	6	6	713554	713559	100 %	0 %	0 %	0 %	241196053
88	NC_012815	G	6	6	720675	720680	0 %	0 %	100 %	0 %	241196058
89	NC_012815	G	6	6	722516	722521	0 %	0 %	100 %	0 %	241196060
90	NC_012815	A	6	6	731650	731655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012815	G	6	6	738640	738645	0 %	0 %	100 %	0 %	241196073
92	NC_012815	G	6	6	749609	749614	0 %	0 %	100 %	0 %	241196082
93	NC_012815	A	6	6	757209	757214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012815	T	6	6	757653	757658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012815	C	7	7	769445	769451	0 %	0 %	0 %	100 %	241196100
96	NC_012815	G	6	6	779819	779824	0 %	0 %	100 %	0 %	241196110
97	NC_012815	G	6	6	783464	783469	0 %	0 %	100 %	0 %	241196112
98	NC_012815	A	6	6	784086	784091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012815	A	6	6	793944	793949	100 %	0 %	0 %	0 %	241196121
100	NC_012815	T	6	6	800658	800663	0 %	100 %	0 %	0 %	241196125
101	NC_012815	A	6	6	806724	806729	100 %	0 %	0 %	0 %	241196130
102	NC_012815	G	6	6	807587	807592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012815	A	6	6	810069	810074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012815	C	6	6	812168	812173	0 %	0 %	0 %	100 %	241196135
105	NC_012815	A	6	6	813181	813186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012815	G	6	6	823185	823190	0 %	0 %	100 %	0 %	241196142
107	NC_012815	A	6	6	839262	839267	100 %	0 %	0 %	0 %	241196157
108	NC_012815	G	6	6	859137	859142	0 %	0 %	100 %	0 %	241196173
109	NC_012815	G	9	9	871364	871372	0 %	0 %	100 %	0 %	241196183
110	NC_012815	G	6	6	889342	889347	0 %	0 %	100 %	0 %	241196200
111	NC_012815	G	6	6	893044	893049	0 %	0 %	100 %	0 %	241196203
112	NC_012815	T	6	6	895825	895830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012815	G	6	6	900806	900811	0 %	0 %	100 %	0 %	241196211
114	NC_012815	G	6	6	901229	901234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012815	G	6	6	902271	902276	0 %	0 %	100 %	0 %	241196213
116	NC_012815	C	6	6	907817	907822	0 %	0 %	0 %	100 %	241196218
117	NC_012815	G	6	6	914104	914109	0 %	0 %	100 %	0 %	241196226
118	NC_012815	T	6	6	924145	924150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012815	A	6	6	925486	925491	100 %	0 %	0 %	0 %	241196239
120	NC_012815	T	6	6	937054	937059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012815	T	6	6	937156	937161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012815	G	6	6	942337	942342	0 %	0 %	100 %	0 %	241196255
123	NC_012815	G	6	6	942612	942617	0 %	0 %	100 %	0 %	241196255
124	NC_012815	G	6	6	943546	943551	0 %	0 %	100 %	0 %	241196256
125	NC_012815	C	6	6	953403	953408	0 %	0 %	0 %	100 %	241196266
126	NC_012815	G	6	6	964540	964545	0 %	0 %	100 %	0 %	241196277
127	NC_012815	C	6	6	964551	964556	0 %	0 %	0 %	100 %	241196277
128	NC_012815	T	6	6	967544	967549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012815	C	6	6	971494	971499	0 %	0 %	0 %	100 %	241196283
130	NC_012815	G	6	6	982769	982774	0 %	0 %	100 %	0 %	241196292
131	NC_012815	G	6	6	984479	984484	0 %	0 %	100 %	0 %	241196292
132	NC_012815	C	6	6	993153	993158	0 %	0 %	0 %	100 %	241196300
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134	NC_012815	T	6	6	1047388	1047393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012815	G	6	6	1055578	1055583	0 %	0 %	100 %	0 %	241196354
136	NC_012815	G	6	6	1056087	1056092	0 %	0 %	100 %	0 %	241196354
137	NC_012815	T	6	6	1056509	1056514	0 %	100 %	0 %	0 %	241196354
138	NC_012815	C	6	6	1063599	1063604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_012815	C	6	6	1069726	1069731	0 %	0 %	0 %	100 %	241196368
140	NC_012815	T	6	6	1082315	1082320	0 %	100 %	0 %	0 %	241196380
141	NC_012815	C	6	6	1100400	1100405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_012815	T	6	6	1101093	1101098	0 %	100 %	0 %	0 %	241196402
143	NC_012815	A	6	6	1101636	1101641	100 %	0 %	0 %	0 %	241196402
144	NC_012815	A	6	6	1102563	1102568	100 %	0 %	0 %	0 %	241196402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.