MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012811	GGCTGG	2	12	33997	34008	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012811	GCTCCG	2	12	42221	42232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012811	CCAGCC	2	12	71341	71352	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012811	TAAAAA	2	12	78270	78281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012811	GGCGAT	2	12	96919	96930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012811	GGCCAT	2	12	97607	97618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012811	TTGCCA	2	12	102654	102665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012811	GCGGGC	2	12	110908	110919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012811	TGTTCC	2	12	117928	117939	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012811	ACGCCC	2	12	121432	121443	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012811	CGCGCC	2	12	124387	124398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012811	CGGTTC	2	12	131851	131862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012811	CGAGGA	2	12	141530	141541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012811	AGCCGC	2	12	141760	141771	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012811	GCGCCC	2	12	142342	142353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012811	GCTGCG	2	12	148599	148610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012811	CGTCAA	2	12	157116	157127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012811	TCATTC	2	12	174757	174768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012811	GGCCGT	2	12	175353	175364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012811	CCAAGC	2	12	179242	179253	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012811	GTCCTG	2	12	203801	203812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012811	CACCGG	2	12	207350	207361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012811	ACGCCA	2	12	209723	209734	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012811	TCTACC	2	12	213258	213269	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012811	CGGGAC	2	12	213385	213396	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012811	CTCCTT	2	12	217956	217967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012811	AATAAA	2	12	236221	236232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012811	TGGGTC	2	12	240361	240372	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012811	GATCGA	2	12	242345	242356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012811	CTGGCG	2	12	247871	247882	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012811	AAGCTC	2	12	250331	250342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012811	GCCAAC	2	12	254705	254716	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012811	TCCGCA	2	12	260339	260350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012811	CCGGTG	2	12	263416	263427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012811	ATCGGC	2	12	282052	282063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012811	CCGCGC	2	12	292349	292360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012811	CGGTCG	2	12	293332	293343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012811	CGGCCG	2	12	296031	296042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012811	TGCCGG	2	12	301418	301429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012811	CCGGGG	2	12	302530	302541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012811	TGCTGA	2	12	303462	303473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012811	TGCCGG	2	12	319477	319488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012811	CCGGGG	2	12	320589	320600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012811	GAGCTT	2	12	323780	323791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012811	CGGAAG	2	12	327875	327886	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012811	TGCCAC	2	12	351419	351430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012811	GGCGCC	2	12	393356	393367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012811	GGTCCG	2	12	415793	415804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012811	GTTCTG	2	12	426345	426356	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012811	GATCTT	2	12	456124	456135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012811	GATCTC	2	12	456276	456287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012811	CAAGCG	2	12	475951	475962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012811	ATTATG	2	12	509462	509473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012811	GCCTGG	2	12	520961	520972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012811	CAGAGG	2	12	585848	585859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012811	GAAGCC	2	12	586887	586898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012811	GCGGCC	2	12	589353	589364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012811	AGATCG	2	12	646757	646768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012811	GCCACG	2	12	719210	719221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012811	TCCGGC	2	12	722675	722686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012811	ACCTCG	2	12	722713	722724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012811	GAGCCG	2	12	735335	735346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012811	CGTCGA	2	12	767980	767991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012811	GCCGGC	2	12	779613	779624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012811	GCTCCC	2	12	803934	803945	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012811	TCCGTG	2	12	813324	813335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012811	ACGCCA	2	12	825877	825888	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012811	CGACGC	2	12	831085	831096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012811	TGCCGG	2	12	833985	833996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012811	CGCCAG	2	12	834046	834057	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012811	CTGGCG	2	12	855182	855193	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012811	AGGTGA	2	12	879377	879388	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012811	CGGCGT	2	12	879782	879793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012811	CACCGG	2	12	882352	882363	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012811	ACGCCA	2	12	883140	883151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012811	CCCCGG	2	12	890396	890407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012811	CCGGCA	2	12	891508	891519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012811	CCGCGC	2	12	899893	899904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_012811	GCCTTT	2	12	944331	944342	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012811	CCTCGA	2	12	950655	950666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012811	CGCCCC	2	12	952207	952218	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
82	NC_012811	CGACGC	2	12	965338	965349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012811	ATCGCA	2	12	968264	968275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012811	CGCAGG	2	12	972743	972754	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012811	CGCAGG	2	12	981767	981778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012811	CCGAGG	2	12	1006145	1006156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012811	AGGCCG	2	12	1006571	1006582	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012811	TGGCCT	2	12	1007540	1007551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012811	AAACGC	2	12	1019869	1019880	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012811	GGAGCA	2	12	1039549	1039560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012811	GCTTCG	2	12	1040373	1040384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012811	GGTGTG	2	12	1060207	1060218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012811	ACCAGA	2	12	1114160	1114171	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012811	CCGAGG	2	12	1115101	1115112	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012811	GTTCTG	2	12	1116471	1116482	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012811	CTATCA	2	12	1120507	1120518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012811	CCGGTG	2	12	1122679	1122690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012811	CGGCGT	2	12	1152253	1152264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012811	CGCCTG	2	12	1155299	1155310	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012811	CCAGCC	2	12	1157732	1157743	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012811	CCAGCC	2	12	1158672	1158683	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012811	CGGCGT	2	12	1183889	1183900	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012811	CGCGCC	2	12	1220275	1220286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012811	CGACCG	2	12	1247951	1247962	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012811	CGGCCG	2	12	1261215	1261226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.