MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 18788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012811	TTC	2	6	11	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141777
2	NC_012811	CAG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
3	NC_012811	GCG	2	6	123	128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141777
4	NC_012811	TCC	2	6	150	155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141777
5	NC_012811	TCG	2	6	156	161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141777
6	NC_012811	GCG	2	6	240	245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141777
7	NC_012811	TCG	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141777
8	NC_012811	CGG	2	6	259	264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141777
9	NC_012811	CGA	2	6	361	366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
10	NC_012811	GCC	2	6	381	386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141777
11	NC_012811	CGG	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141777
12	NC_012811	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
13	NC_012811	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141777
14	NC_012811	GGA	2	6	433	438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141777
15	NC_012811	ACG	2	6	513	518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
16	NC_012811	CGA	2	6	616	621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
17	NC_012811	GGA	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141777
18	NC_012811	CCG	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141777
19	NC_012811	GAT	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141777
20	NC_012811	GAC	2	6	785	790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141777
21	NC_012811	CTC	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141778
22	NC_012811	CGC	2	6	1112	1117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141778
23	NC_012811	TGG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141778
24	NC_012811	GGA	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141778
25	NC_012811	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141778
26	NC_012811	GGC	2	6	1364	1369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
27	NC_012811	GAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
28	NC_012811	CGA	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
29	NC_012811	CGG	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
30	NC_012811	TCA	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141778
31	NC_012811	CAG	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
32	NC_012811	GCC	2	6	1584	1589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141778
33	NC_012811	GTG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141778
34	NC_012811	GGT	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141778
35	NC_012811	GCC	2	6	1712	1717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141778
36	NC_012811	CGA	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
37	NC_012811	CAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
38	NC_012811	CGG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
39	NC_012811	CAT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141778
40	NC_012811	CGG	2	6	1834	1839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
41	NC_012811	GGC	2	6	1862	1867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
42	NC_012811	TCG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141778
43	NC_012811	CGG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141778
44	NC_012811	TCC	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141778
45	NC_012811	TGG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141778
46	NC_012811	CGT	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141778
47	NC_012811	TCG	3	9	2134	2142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141778
48	NC_012811	GCT	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141778
49	NC_012811	CGA	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141778
50	NC_012811	AGG	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141778
51	NC_012811	CTC	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141779
52	NC_012811	CAG	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141779
53	NC_012811	CTG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141779
54	NC_012811	AGA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141779
55	NC_012811	TCG	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141779
56	NC_012811	TTC	2	6	2914	2919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141779
57	NC_012811	GGC	3	9	2958	2966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141779
58	NC_012811	CGG	2	6	3002	3007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141779
59	NC_012811	CAG	2	6	3033	3038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141779
60	NC_012811	TTC	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141779
61	NC_012811	CTG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141779
62	NC_012811	CCG	2	6	3095	3100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141779
63	NC_012811	TGC	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141779
64	NC_012811	CCG	2	6	3169	3174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141780
65	NC_012811	GCC	2	6	3195	3200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141780
66	NC_012811	GGC	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141780
67	NC_012811	CGT	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141780
68	NC_012811	GTC	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141780
69	NC_012811	CTG	2	6	3357	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141780
70	NC_012811	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141780
71	NC_012811	GCG	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141780
72	NC_012811	GCC	3	9	4989	4997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141781
73	NC_012811	GCG	2	6	5079	5084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141781
74	NC_012811	TGC	2	6	5110	5115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141781
75	NC_012811	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141781
76	NC_012811	CCG	2	6	5137	5142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141781
77	NC_012811	GGA	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141781
78	NC_012811	GTC	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141781
79	NC_012811	ACG	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141781
80	NC_012811	CGT	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141781
81	NC_012811	CAA	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141781
82	NC_012811	CAG	2	6	8526	8531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
83	NC_012811	CGA	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
84	NC_012811	AGA	2	6	8600	8605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141782
85	NC_012811	AAC	2	6	8653	8658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141782
86	NC_012811	CTG	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141782
87	NC_012811	GGC	2	6	8768	8773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
88	NC_012811	CAT	2	6	8960	8965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141782
89	NC_012811	GGC	2	6	8990	8995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
90	NC_012811	GCA	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
91	NC_012811	CTG	2	6	9055	9060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141782
92	NC_012811	CGA	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
93	NC_012811	CCT	2	6	9186	9191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
94	NC_012811	GGA	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141782
95	NC_012811	CTT	2	6	9267	9272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141782
96	NC_012811	ACC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240141782
97	NC_012811	CGG	2	6	9376	9381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
98	NC_012811	TGT	2	6	9613	9618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240141782
99	NC_012811	GCG	2	6	9684	9689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
100	NC_012811	TAC	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141782
101	NC_012811	CGG	3	9	10006	10014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
102	NC_012811	CTC	2	6	10038	10043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
103	NC_012811	GCG	2	6	10158	10163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
104	NC_012811	CGG	2	6	10176	10181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
105	NC_012811	CCG	2	6	10261	10266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141782
106	NC_012811	CCT	2	6	10331	10336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
107	NC_012811	CGA	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
108	NC_012811	ACG	2	6	10374	10379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
109	NC_012811	CGG	2	6	10438	10443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
110	NC_012811	GCG	2	6	10446	10451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
111	NC_012811	GGA	2	6	10541	10546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141782
112	NC_012811	CTC	2	6	10669	10674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
113	NC_012811	GTG	2	6	10728	10733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141782
114	NC_012811	CGA	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
115	NC_012811	CGG	2	6	10847	10852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
116	NC_012811	GTC	2	6	10889	10894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141782
117	NC_012811	AGC	2	6	10924	10929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
118	NC_012811	GGC	2	6	11028	11033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
119	NC_012811	CGC	2	6	11120	11125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141782
120	NC_012811	TGG	2	6	11197	11202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141782
121	NC_012811	GCA	2	6	11221	11226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141782
122	NC_012811	GGC	2	6	11232	11237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
123	NC_012811	ACT	2	6	11238	11243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141782
124	NC_012811	CTC	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
125	NC_012811	CTT	2	6	11291	11296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141782
126	NC_012811	CCT	2	6	11592	11597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141782
127	NC_012811	CGG	2	6	11654	11659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
128	NC_012811	CGG	2	6	11684	11689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141782
129	NC_012811	CGC	2	6	11792	11797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141782
130	NC_012811	CGC	2	6	11833	11838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141782
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132	NC_012811	CGT	2	6	11900	11905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141782
133	NC_012811	GAT	2	6	11936	11941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141782
134	NC_012811	GCT	2	6	11961	11966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141782
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252	NC_012811	CGG	2	6	20067	20072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141784
253	NC_012811	CGT	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
254	NC_012811	CAA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141784
255	NC_012811	GAA	2	6	20143	20148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240141784
256	NC_012811	TGC	2	6	20204	20209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
257	NC_012811	CGG	2	6	20265	20270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141784
258	NC_012811	TCC	3	9	20299	20307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141784
259	NC_012811	GCG	2	6	20345	20350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141784
260	NC_012811	TCG	2	6	20375	20380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
261	NC_012811	ACG	2	6	20483	20488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141784
262	NC_012811	AGG	2	6	20489	20494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240141784
263	NC_012811	CAG	2	6	20602	20607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141784
264	NC_012811	ACA	2	6	20654	20659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240141784
265	NC_012811	CGT	2	6	20715	20720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
266	NC_012811	GCA	2	6	20732	20737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141784
267	NC_012811	TCA	2	6	20801	20806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141784
268	NC_012811	GTC	2	6	20887	20892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
269	NC_012811	ATG	2	6	20936	20941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141784
270	NC_012811	TGC	2	6	20981	20986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141784
271	NC_012811	ACT	2	6	20990	20995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141784
272	NC_012811	GTG	2	6	21039	21044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240141784
273	NC_012811	TGA	2	6	21083	21088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141784
274	NC_012811	GAT	2	6	21153	21158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240141784
275	NC_012811	CGA	2	6	21170	21175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141784
276	NC_012811	ATC	2	6	21295	21300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240141784
277	NC_012811	GAC	2	6	21318	21323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141784
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282	NC_012811	GCC	3	9	21765	21773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240141785
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284	NC_012811	CGG	2	6	21940	21945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141785
285	NC_012811	CCT	2	6	21955	21960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240141785
286	NC_012811	GGC	2	6	21972	21977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141785
287	NC_012811	GCA	2	6	22052	22057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141785
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291	NC_012811	GGC	2	6	22505	22510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141785
292	NC_012811	TTC	2	6	22516	22521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240141785
293	NC_012811	GCG	2	6	22689	22694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240141785
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303	NC_012811	CGT	2	6	23189	23194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240141785
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377	NC_012811	GAC	2	6	28782	28787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240141788
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